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The map label for this gene is 46447101

Identifier: 46447101

GI number: 46447101

Start: 1742079

End: 1744181

Strand: Reverse

Name: 46447101

Synonym: pc1467

Alternate gene names: NA

Gene position: 1744181-1742079 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46447112

Following gene: 46447100

Centisome position: 72.24

GC content: 30.58

Gene sequence:

>2103_bases
ATGTATATTCCTACTGATGATTATAAACCTTCTTTAACTGAAAGTACGAGTTCTCAACCTAGTGAAGTTCACACATCTTC
ACAACAAGTCAAAAGTCCAACTGAAGAAACTATTGGAAAAATTGCCAGTAAATCACTGCCGGCTACAGAAGAAGAGACAA
AGACAATATCCTTTTCCGAAAAATCAACTAAATTTTCTAAAGGAAGATTTTTATGTTCTTATAATAGGAGAGATTTAAAA
ACTTCAATTTTACAAACAAATGATCTACAAAAGAAAATTTATATTAAGCTAAATGAAAAAATTGAAAAGAAATTTATTAC
AAAAACTAAAAAATTATGGATACAATTATGTAGCCAAAGTAAGTTGGAAAGTTTAGTTAAGCTAACTCTATCTTGTGAAA
ATAAAACCGTCGACATTCTAAATGACAAAACATTAAGCAAAATAAGTCGAGATTATCAAGAAGTTCAAACAGAATTAGAT
GAAAAAAAAATGGAATTAAAGGGTTTAAACGAGCGCTTAACTAATATAAAAAAAAGACCTTATGCAGTTAAAATAAAGGA
ATTAGGATTATTAAAAGAATTAGACAGTCCTATAAAAACAATTGATGCTTTTTTACTAAGATTTGAACAGTTTTTAGAAA
AATATCAAGAAATTGATGTGAAAAAACTAACAACAGAGGAGATCGAATTTTTAAAAACAGAACATAGTGAATTTGAAAAA
GGCTATAACAATCTTAAAAGAATAATACCAGGCACTATTCAAAAACTAAGCAAGCATGTGAAATCAATTAAGGGTGCTTT
ACCAAAAAACATTGAAACGATTTTAAAAGGTATTAATACTGCTCTTCAAGGAAAAAAAGTCGAAAATTTAGACGATTCTA
TAAAGCAATTCAAAACAATTAAAACATCTTTCGAAGAAGCTTCAGCGGCTTATCTCGGCAAATTGAATCAAGTTCAGCAA
GAGTTCGATGAAACTTGTCCTCCTTACATGAAAATTTTCCAGGAAATAGAAGAGGGAAATTTAGAAAGATATCCTGATTT
TATTCAAGAGATTAAAGAAATTTTAATTAATGCTAGCCGTGATCCTGTCGCTTATAAAGACGCTTTGGAAACACTAGCAG
ATAAGGTTATTCCCTCTATTCAATCTCAGGTACTGGGAATAATTAATGAACTCAGAGAGAGACTAAACAGAAAAAAAGAT
GTAGAAATTATTACTATAGATGATTGTGTTGCTCTAAAAACATACATTGAAGAATATTTAAAACCTCTTTTGGCGTTGAC
AGAACCAATGGCAAACGGAACAGCACCCGTATTCGAAGAACAATTTAAAAATTTATTTAATCTACTTCCTAATTCTGGTA
AGGAGACGACTGCCCAAGAAATTGTATCAAAGCTTAATTCATTTTCTTTCTCAGAGGGTTCTTTGGGAGTTTATCGGAGT
TTTATCAATAAAAATGTGGTTGAAATAGAAAAAGAATTGAAACAAGAAACTAAGATTAAAAAAGAGATTGAAGACCTAAC
AAATTTATTAAAAGAATTAAAAGGAAAAAAGGCTGATATTTTAGAAAGTTTTTTTAACGAACTTATGGAAAAAGAAAAAA
ACAACATCTCTGAATTATTAACTGGTGGTGTTGAGCAAGTTCAAAAATTTGTAGATATTTTTTTAGGCCATTACCTTGTT
CATTCTCAAGAACGTTTTCCCAAACTTTTAGAAAGCCATCGAGACTTTGCTGTTAGAGTTTTTGACATGTTCGAACTAGT
AAAGGATCATTTATCTGAGGAGCAATTAGGTGAAATCAAATTAGTTTTAAATGACTTTTTAACTCATCATATTACAAATC
AAACAGGTGAGATTGAAAAAAGTTTAGGTACATCTCTTCATCAAAGTCAAAAAAGTTCGGAAAAGGTTACTAAACCTGCA
AAACCTTTATATAGAAAGGTTCAGGGTGCGCATGAATTTGAGGATGATTTTTCAATAAAATGCCAACATGTTTGCAAACA
AGTCGAAGCACTTTTACCTTTGGTTATTTGGGAAAGGATTTGTTGCTTCGCCTCAAGCCGCGCATTTAGTCCCTTTCCCT
GGAATAGTTTCTTGGGATGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAATTATTTATTAATAAATAAATATATAATTAATATGATACAATTAATTATATAGTGATATTGTATTTAATGTAATAAT
TTAATTATTAAGGATTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTATCTATCCACACTTTTTAAGACAAGGCTTGGATTAGATCTAAGTCAAAAAGAAGTGGAAGATCGTTTAGAATTATTCA
ATAAAAATGTTGAGCCTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 700; Mature: 700

Protein sequence:

>700_residues
MYIPTDDYKPSLTESTSSQPSEVHTSSQQVKSPTEETIGKIASKSLPATEEETKTISFSEKSTKFSKGRFLCSYNRRDLK
TSILQTNDLQKKIYIKLNEKIEKKFITKTKKLWIQLCSQSKLESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKISRDYQEVQTELD
EKKMELKGLNERLTNIKKRPYAVKIKELGLLKELDSPIKTIDAFLLRFEQFLEKYQEIDVKKLTTEEIEFLKTEHSEFEK
GYNNLKRIIPGTIQKLSKHVKSIKGALPKNIETILKGINTALQGKKVENLDDSIKQFKTIKTSFEEASAAYLGKLNQVQQ
EFDETCPPYMKIFQEIEEGNLERYPDFIQEIKEILINASRDPVAYKDALETLADKVIPSIQSQVLGIINELRERLNRKKD
VEIITIDDCVALKTYIEEYLKPLLALTEPMANGTAPVFEEQFKNLFNLLPNSGKETTAQEIVSKLNSFSFSEGSLGVYRS
FINKNVVEIEKELKQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNNISELLTGGVEQVQKFVDIFLGHYLV
HSQERFPKLLESHRDFAVRVFDMFELVKDHLSEEQLGEIKLVLNDFLTHHITNQTGEIEKSLGTSLHQSQKSSEKVTKPA
KPLYRKVQGAHEFEDDFSIKCQHVCKQVEALLPLVIWERICCFASSRAFSPFPWNSFLGC

Sequences:

>Translated_700_residues
MYIPTDDYKPSLTESTSSQPSEVHTSSQQVKSPTEETIGKIASKSLPATEEETKTISFSEKSTKFSKGRFLCSYNRRDLK
TSILQTNDLQKKIYIKLNEKIEKKFITKTKKLWIQLCSQSKLESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKISRDYQEVQTELD
EKKMELKGLNERLTNIKKRPYAVKIKELGLLKELDSPIKTIDAFLLRFEQFLEKYQEIDVKKLTTEEIEFLKTEHSEFEK
GYNNLKRIIPGTIQKLSKHVKSIKGALPKNIETILKGINTALQGKKVENLDDSIKQFKTIKTSFEEASAAYLGKLNQVQQ
EFDETCPPYMKIFQEIEEGNLERYPDFIQEIKEILINASRDPVAYKDALETLADKVIPSIQSQVLGIINELRERLNRKKD
VEIITIDDCVALKTYIEEYLKPLLALTEPMANGTAPVFEEQFKNLFNLLPNSGKETTAQEIVSKLNSFSFSEGSLGVYRS
FINKNVVEIEKELKQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNNISELLTGGVEQVQKFVDIFLGHYLV
HSQERFPKLLESHRDFAVRVFDMFELVKDHLSEEQLGEIKLVLNDFLTHHITNQTGEIEKSLGTSLHQSQKSSEKVTKPA
KPLYRKVQGAHEFEDDFSIKCQHVCKQVEALLPLVIWERICCFASSRAFSPFPWNSFLGC
>Mature_700_residues
MYIPTDDYKPSLTESTSSQPSEVHTSSQQVKSPTEETIGKIASKSLPATEEETKTISFSEKSTKFSKGRFLCSYNRRDLK
TSILQTNDLQKKIYIKLNEKIEKKFITKTKKLWIQLCSQSKLESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKISRDYQEVQTELD
EKKMELKGLNERLTNIKKRPYAVKIKELGLLKELDSPIKTIDAFLLRFEQFLEKYQEIDVKKLTTEEIEFLKTEHSEFEK
GYNNLKRIIPGTIQKLSKHVKSIKGALPKNIETILKGINTALQGKKVENLDDSIKQFKTIKTSFEEASAAYLGKLNQVQQ
EFDETCPPYMKIFQEIEEGNLERYPDFIQEIKEILINASRDPVAYKDALETLADKVIPSIQSQVLGIINELRERLNRKKD
VEIITIDDCVALKTYIEEYLKPLLALTEPMANGTAPVFEEQFKNLFNLLPNSGKETTAQEIVSKLNSFSFSEGSLGVYRS
FINKNVVEIEKELKQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNNISELLTGGVEQVQKFVDIFLGHYLV
HSQERFPKLLESHRDFAVRVFDMFELVKDHLSEEQLGEIKLVLNDFLTHHITNQTGEIEKSLGTSLHQSQKSSEKVTKPA
KPLYRKVQGAHEFEDDFSIKCQHVCKQVEALLPLVIWERICCFASSRAFSPFPWNSFLGC

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80522; Mature: 80522

Theoretical pI: Translated: 6.94; Mature: 6.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYIPTDDYKPSLTESTSSQPSEVHTSSQQVKSPTEETIGKIASKSLPATEEETKTISFSE
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCEEECCH
KSTKFSKGRFLCSYNRRDLKTSILQTNDLQKKIYIKLNEKIEKKFITKTKKLWIQLCSQS
HHCHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKISRDYQEVQTELDEKKMELKGLNERLTNIKKRP
HHHHHHHHHHHCCCCCEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YAVKIKELGLLKELDSPIKTIDAFLLRFEQFLEKYQEIDVKKLTTEEIEFLKTEHSEFEK
CEEEHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYNNLKRIIPGTIQKLSKHVKSIKGALPKNIETILKGINTALQGKKVENLDDSIKQFKTI
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KTSFEEASAAYLGKLNQVQQEFDETCPPYMKIFQEIEEGNLERYPDFIQEIKEILINASR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHCCCC
DPVAYKDALETLADKVIPSIQSQVLGIINELRERLNRKKDVEIITIDDCVALKTYIEEYL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHH
KPLLALTEPMANGTAPVFEEQFKNLFNLLPNSGKETTAQEIVSKLNSFSFSEGSLGVYRS
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
FINKNVVEIEKELKQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNNISELL
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGGVEQVQKFVDIFLGHYLVHSQERFPKLLESHRDFAVRVFDMFELVKDHLSEEQLGEIK
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
LVLNDFLTHHITNQTGEIEKSLGTSLHQSQKSSEKVTKPAKPLYRKVQGAHEFEDDFSIK
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
CQHVCKQVEALLPLVIWERICCFASSRAFSPFPWNSFLGC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MYIPTDDYKPSLTESTSSQPSEVHTSSQQVKSPTEETIGKIASKSLPATEEETKTISFSE
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCEEECCH
KSTKFSKGRFLCSYNRRDLKTSILQTNDLQKKIYIKLNEKIEKKFITKTKKLWIQLCSQS
HHCHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKISRDYQEVQTELDEKKMELKGLNERLTNIKKRP
HHHHHHHHHHHCCCCCEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YAVKIKELGLLKELDSPIKTIDAFLLRFEQFLEKYQEIDVKKLTTEEIEFLKTEHSEFEK
CEEEHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYNNLKRIIPGTIQKLSKHVKSIKGALPKNIETILKGINTALQGKKVENLDDSIKQFKTI
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KTSFEEASAAYLGKLNQVQQEFDETCPPYMKIFQEIEEGNLERYPDFIQEIKEILINASR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHCCCC
DPVAYKDALETLADKVIPSIQSQVLGIINELRERLNRKKDVEIITIDDCVALKTYIEEYL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHH
KPLLALTEPMANGTAPVFEEQFKNLFNLLPNSGKETTAQEIVSKLNSFSFSEGSLGVYRS
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
FINKNVVEIEKELKQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNNISELL
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGGVEQVQKFVDIFLGHYLVHSQERFPKLLESHRDFAVRVFDMFELVKDHLSEEQLGEIK
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
LVLNDFLTHHITNQTGEIEKSLGTSLHQSQKSSEKVTKPAKPLYRKVQGAHEFEDDFSIK
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
CQHVCKQVEALLPLVIWERICCFASSRAFSPFPWNSFLGC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA