Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46446916

Identifier: 46446916

GI number: 46446916

Start: 1535907

End: 1539155

Strand: Reverse

Name: 46446916

Synonym: pc1282

Alternate gene names: NA

Gene position: 1539155-1535907 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46446921

Following gene: 46446914

Centisome position: 63.75

GC content: 37.58

Gene sequence:

>3249_bases
TTGAATATTCATAATCCAAGAGTTAATCCTAGTAATCTCCTCGTTAACGCAGATACCCATTCTTATTTTCGATCGAACAA
TTATTTAAAATTTTCTGAACGAATTGGTTTGCTGTGTAAAACAATTTTCCAGAGCTTCCTCAACTTATTCTTTAATTATC
TCGAAAAAGAACAGCTTCAGTCTCAATGGAGAGAAATTTTTTGGGGGCAAAAAGAAATTACGATTCCCAAATTTATTGCA
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GCGCACTCAGGAAACTATGGATGATCTTGAGGATGAAAATAGGCCTTTATTAAGTCCCTTAACTAACCTAGAAGAATTAA
ATGCTTTAAAAGGCACTTCCCCAAAGGAAATTGAGTCCTCCACACAACCTTCAGGTTTTTTCTCTTCACCTCAGGAACAT
AGAAGAACGCTCACTCAGGAAACTATTGATAAACTTGAGGATGAAAACAAGCTTTTATTAAATCTTTTAACTAACCTAGA
AGCATTAAATGCTTTAGAGGACCCTTTCCCAAAGAAAATTGAATCATCCCCACAACCTTCAGGTTTTTTCTCTTCACCTC
AGGAACATAGAAGAACGCTCACTCAGGAAACTATTGATAAACTTGAGGATGAAAACAAGCTTTTATTAAATCTTTTAACT
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TTCACCCCGGAAACTTAGAAGAGCGCGTACTCAGGAAACTATTGATAATCTTGAGGATGAAAACAAGCTTTTATTAAATT
CTTTAGCTAACCCAGAAGCATTAAATGCTTTAGAGGACCCTTTCCCAAAGAAAATTGAGTCCTCCCCACAACCTTCAGTT
TGTTTCTCTTCACCCCGGGAACTTAGAAGAGCGCGTACTCAGGAAACTATTGATAATCTTGAGGATGAAAACAAACTTTT
ATTAAATCTTTTAACTAACCTAGAAGCATTAAATGCTTTGGAGGACCCTTCCCCAAAGGAAATTGAGTCCTCCACACAAC
CCTCAGTTTGTTTCTCTTCACCTCAGGAACTTAGAAGAGCGCGTACTCAGGAAACTATTGATAATCTTGAGGATGAAAAC
AAGCTTTTATTAAATCCTTTAACTAACCTAGAAGCATTAAATGCTTTAAAAGGCACTTCCCCAAAGGAAATTGAGTCCTC
CACACAACCTTCAGTTTGTTTCTCTTCACCTCAGGAACTTAGAAGAACGCTCACTCAGGAAACTATTGATAATCTTGAGG
ATGAAAACAAACTTTTATTAAATCCTTTAACTAACCCAGAAGCATTAAATGCTTCAGAGGACACTTCCTCAAAGAAAATA
AAATCATCCACAACTCCACAATCTTCGGATCTTTTCCCTTCATCCCAGGAACTTAGAAGAGCGCGCGCTCAGGAAACTAT
TGATAATCTTGAGGATGAAAACAAGCTTTTATTAAATTCTTTAGCTAACCCAGAAGCATTAAATGCTTTAAAGGACCCTT
CCCCAAAAGAAATTGAGTCCTCCACACAACCTTTAGGCTTTTTCTCTTCACCTCAGGAACTTAGAAGAACGCTCACTCAG
GAAACTATGGATAATCTTGAGGATGAAAACAAACTTTTATTAAATCCTTTAACTAACCCAGAAGAATTAAATGCTTCAGA
GGACACTTCCTCAAAGAAAATAAAATCATCCACAACTCCACAATCTTCGGATCTTTTCCCTTCATCCCAGGAATTTAAAC
TGAGATTTCAGGATGAAACTTCACTAAATATATCGTATTCTCAACTAGCTTTGTTAAGGGAAAAATCGCCCTATTTTAAA
AGTCTTTGGTCAGGAAATTTTCGAGAAACCCTTCAAGATCCTCTCACTTTGACGCAAACAGAGTTTACTCATTTGCTCGA
TTGCCTGAAATATTCTTTTCCTTTTGTTCCTTTGGAAGATATCCTTTCTTTCATTCAACTAGCCGATTATTATCAACTGT
CAGAAGTTGAGAAAAAATTAGAAAAACAGCTGATTGAGGCGTATAAATCCCAAAAATTGGAACCGTTTAACTCCAGCGAA
GATAGTTTAGTGGAATTAAAAGCACTTTTAAATTTTGCGCAGCAGTATCGATTAAATGTTTTAAAAAGCTATTTGGTGGA
TTCCTTATTAAACCAGACCTCTCAGTTAACCGAATTTGAAAAAGTTTTAAAGTATTTTTCAAATGAGATAGAAGAACTCA
ATTTTTCAAAGAACATCTTTTTGACTGATGCCCATCTGTTAGCGTTAAAAAATTGTAAAAATTTAAAAGCACTACATCTC
CAAGAATGTCCCAATCTCACCGATGCTGGATTAGCGCATTTGACATCTTTAGTGACTTTACAGCATTTAGATCTGAGCTA
TTGTAGCAATTTCACGGATGCTGGATTAGCGCATTTGAGACCTTTAGTGGCTTTAACGCATTTGAATCTGAGGTGGTGCA
GAAATCTTACTGACGCCGGATTAGCCCATTTGACACCTTTGGTGGCTTTAAAATATTTGGATCTGAGCTATTGTAGCAAT
TTCACGGATGCTGGACTAACGCATTTGACACCTTTAGTGACTTTACAGCATTTAGATCTGAGCTGTTGTAGCAATTTCAC
GGATGCTGGATTAGCGCATTTGAGACCTTTAGTGGCTTTAACGCATTTGAATCTGAGGTGGTGCCATAATTTCACAGATG
CTGGATTGGCACATTTAACTCCCTTAGTGGCTTTGCAGCATTTAAATCTGAACCTATGCTGGAAACTCACTGATGCTGGA
TTAGCCCATTTGAGACCTTTAGTGGCTTTGCAGAATTTGGATCTGAGCTATTGTAGCAATTTCACGGATGCTGGATTAGC
GCATTTGACACCTTTAGTGGTTTTACAGCATTTAGATCTGAGTTCGTGCAAAAAACTCACGGATGCTGGATTGGCGCATT
TGACACCTTTAGTGGCCTTGCAGCATTTAGATCTGAGTTGGTGCAATCATCTTACTGACGCTGGATTGAGGCATTTAACG
CCTTTACTGGCTTTGCAAGATTTGTATTTGTACTCTTGCGAAAATTTCACCGAAGTTGGATTGGCGCATTTTAAATCCTC
AGTAGCTTCACTTCATTTAAATCTGAAGTGGTGCAAACGTTTTCAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTCATTACTATTGCCATGATATTTATTTATATATTATAATTTTCAAAAATATATATAGATAATTTAAAAATTATTT
AACTAATTTGGAAGGTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGTTGACTAAAAAAATATTATTTGCTTTGGAAAAGTTAATAAAATTATAGAGCTCTCAGTGTCGCAATTCTGTAGACTAA
TAACCTGAATTTTGGACTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1082; Mature: 1082

Protein sequence:

>1082_residues
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SRLASSDISLTSSSQTLCDAPLFSTRTRTQETMDDLEDENRPLLSPLTNLEELNALKGTSPKEIESSTQPSGFFSSPQEH
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CFSSPRELRRARTQETIDNLEDENKLLLNLLTNLEALNALEDPSPKEIESSTQPSVCFSSPQELRRARTQETIDNLEDEN
KLLLNPLTNLEALNALKGTSPKEIESSTQPSVCFSSPQELRRTLTQETIDNLEDENKLLLNPLTNPEALNASEDTSSKKI
KSSTTPQSSDLFPSSQELRRARAQETIDNLEDENKLLLNSLANPEALNALKDPSPKEIESSTQPLGFFSSPQELRRTLTQ
ETMDNLEDENKLLLNPLTNPEELNASEDTSSKKIKSSTTPQSSDLFPSSQEFKLRFQDETSLNISYSQLALLREKSPYFK
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PLLALQDLYLYSCENFTEVGLAHFKSSVASLHLNLKWCKRFQ

Sequences:

>Translated_1082_residues
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SRLASSDISLTSSSQTLCDAPLFSTRTRTQETMDDLEDENRPLLSPLTNLEELNALKGTSPKEIESSTQPSGFFSSPQEH
RRTLTQETIDKLEDENKLLLNLLTNLEALNALEDPFPKKIESSPQPSGFFSSPQEHRRTLTQETIDKLEDENKLLLNLLT
NLEALNALEDPFPKKIESSPQPSVCFSSPRKLRRARTQETIDNLEDENKLLLNSLANPEALNALEDPFPKKIESSPQPSV
CFSSPRELRRARTQETIDNLEDENKLLLNLLTNLEALNALEDPSPKEIESSTQPSVCFSSPQELRRARTQETIDNLEDEN
KLLLNPLTNLEALNALKGTSPKEIESSTQPSVCFSSPQELRRTLTQETIDNLEDENKLLLNPLTNPEALNASEDTSSKKI
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ETMDNLEDENKLLLNPLTNPEELNASEDTSSKKIKSSTTPQSSDLFPSSQEFKLRFQDETSLNISYSQLALLREKSPYFK
SLWSGNFRETLQDPLTLTQTEFTHLLDCLKYSFPFVPLEDILSFIQLADYYQLSEVEKKLEKQLIEAYKSQKLEPFNSSE
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PLLALQDLYLYSCENFTEVGLAHFKSSVASLHLNLKWCKRFQ
>Mature_1082_residues
MNIHNPRVNPSNLLVNADTHSYFRSNNYLKFSERIGLLCKTIFQSFLNLFFNYLEKEQLQSQWREIFWGQKEITIPKFIA
SRLASSDISLTSSSQTLCDAPLFSTRTRTQETMDDLEDENRPLLSPLTNLEELNALKGTSPKEIESSTQPSGFFSSPQEH
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PLLALQDLYLYSCENFTEVGLAHFKSSVASLHLNLKWCKRFQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI22748931, Length=294, Percent_Identity=34.0136054421769, Blast_Score=131, Evalue=3e-30,
Organism=Homo sapiens, GI284447308, Length=323, Percent_Identity=32.8173374613003, Blast_Score=114, Evalue=4e-25,
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Organism=Homo sapiens, GI161333854, Length=404, Percent_Identity=23.7623762376238, Blast_Score=83, Evalue=1e-15,
Organism=Homo sapiens, GI6912466, Length=234, Percent_Identity=29.9145299145299, Blast_Score=80, Evalue=1e-14,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151694, Length=333, Percent_Identity=27.027027027027, Blast_Score=84, Evalue=5e-16,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI25151696, Length=333, Percent_Identity=27.027027027027, Blast_Score=83, Evalue=9e-16,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322549, Length=358, Percent_Identity=26.2569832402235, Blast_Score=85, Evalue=5e-17,
Organism=Drosophila melanogaster, GI17647819, Length=272, Percent_Identity=35.2941176470588, Blast_Score=125, Evalue=1e-28,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076545, Length=394, Percent_Identity=28.6802030456853, Blast_Score=96, Evalue=1e-19,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24652783, Length=394, Percent_Identity=28.6802030456853, Blast_Score=94, Evalue=6e-19,
Organism=Drosophila melanogaster, GI21357913, Length=272, Percent_Identity=32.7205882352941, Blast_Score=93, Evalue=9e-19,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24662818, Length=234, Percent_Identity=35.042735042735, Blast_Score=92, Evalue=2e-18,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076547, Length=376, Percent_Identity=28.4574468085106, Blast_Score=92, Evalue=3e-18,
Organism=Drosophila melanogaster, GI161076549, Length=376, Percent_Identity=28.4574468085106, Blast_Score=91, Evalue=3e-18,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 122344; Mature: 122344

Theoretical pI: Translated: 4.94; Mature: 4.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
0.3 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
0.3 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNIHNPRVNPSNLLVNADTHSYFRSNNYLKFSERIGLLCKTIFQSFLNLFFNYLEKEQLQ
CCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQWREIFWGQKEITIPKFIASRLASSDISLTSSSQTLCDAPLFSTRTRTQETMDDLEDEN
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HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
NLEALNALEDPFPKKIESSPQPSVCFSSPRKLRRARTQETIDNLEDENKLLLNSLANPEA
HHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHH
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CHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHH
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HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCHHHHC
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CCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHH
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HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
DSLVELKALLNFAQQYRLNVLKSYLVDSLLNQTSQLTEFEKVLKYFSNEIEELNFSKNIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
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EEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
PLVALTHLNLRWCRNLTDAGLAHLTPLVALKYLDLSYCSNFTDAGLTHLTPLVTLQHLDL
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCH
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HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHCC
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HHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QHLDLSWCNHLTDAGLRHLTPLLALQDLYLYSCENFTEVGLAHFKSSVASLHLNLKWCKR
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FQ
CC
>Mature Secondary Structure
MNIHNPRVNPSNLLVNADTHSYFRSNNYLKFSERIGLLCKTIFQSFLNLFFNYLEKEQLQ
CCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQWREIFWGQKEITIPKFIASRLASSDISLTSSSQTLCDAPLFSTRTRTQETMDDLEDEN
HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
NLLTNLEALNALEDPFPKKIESSPQPSGFFSSPQEHRRTLTQETIDKLEDENKLLLNLLT
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
NLEALNALEDPFPKKIESSPQPSVCFSSPRKLRRARTQETIDNLEDENKLLLNSLANPEA
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PKEIESSTQPSVCFSSPQELRRTLTQETIDNLEDENKLLLNPLTNPEALNASEDTSSKKI
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HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCHHHHC
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DSLVELKALLNFAQQYRLNVLKSYLVDSLLNQTSQLTEFEKVLKYFSNEIEELNFSKNIF
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LTDAHLLALKNCKNLKALHLQECPNLTDAGLAHLTSLVTLQHLDLSYCSNFTDAGLAHLR
EEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
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HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FQ
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA