Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46446227

Identifier: 46446227

GI number: 46446227

Start: 730554

End: 732146

Strand: Reverse

Name: 46446227

Synonym: pc0593

Alternate gene names: NA

Gene position: 732146-730554 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46446241

Following gene: 46446226

Centisome position: 30.32

GC content: 32.58

Gene sequence:

>1593_bases
ATGAATTCTAATTTACCTTTGTCATCCTCATATTCTCAAATTGACAAGATGGCTCAAACATTGGAAAGTCGAGGAATTAA
GGTCAATATCGATAAAGAGTCTAATAAAGGAATTATTGATGCCAATGGACGCAAATTCGCTGTCTCTCTTATTAATGTCA
ACAGTGAACATCCTTTAGATGCAGATACAATGACGCAAATTGCGACAAGAGTTGCTTATATGATATTTGCTAAAAATTTA
ATTAGCGAGGAGTTTCAAGGCGCTAAAATTGATCAACAAGGTATTCAAATTAACGACAAAAACTTGACTCATGAAGAAGC
AAATACTAAAGAGCTTTATCAAGATATACAATCTATTATGCAAAACAAATTATCTAAGCAAAATGCTGATATAGCTGAAG
CCCAAATCGGAGTAAACACAAATACAAAGCAACCTATTCAAAAGGAATTTAACCCACCTCTACATCCTTATCTATCTCAA
TTTACTTCAGATCAATTAGATGCCATTAATAAGTACGGAGCTAATAAAGTAATGGTTGGCGGCCAATTTAGTCAAAGCAA
ATTGGACGCACTCCAACAAGCTGAAGTTAAAGCAGTGGCAAAAGGTAAAGTTAAACCAGTGAAAAAAGAAAGGGTAACAA
GGAAAAATGGATTTATAGAAGCGAAAAATGGATTTATAGAAGCGGTAAAAACAAAAGTAAAAACAACAAAAAAAGATAAA
TCTAAATTGCAGACAATTTCTAATCAAAAACTCCAAGAAAAATTAACAAAAATTCAATTTACTCTTTCTGATTACGCTAA
AAATTTACTTCTTTTAGAACAAGCTCGGGAAGATTTAGATAAAATGCTTAATCATGGTGCTTCAAAAGGAGAAATAGATG
CAACAAAAGCCACAATTTCCAGTAAAGAAAAAATCTCTAAAGAACAATTGAAAGAACTTCAAAGCGCAAAAAATGAGTTG
GCGAGTTTTAAATTAGAAAAAAATAAACCACTTTTAAACGAAATACGTCGCATTATTCACGACATGCAAAATTTATTAAA
TGCTTCTAATACAAAAACTGCTAGCCACGCTTTTCTAGAAAAATACAAAACAAAACAGGAAGTTCAGCAAGGAATTGGAA
ATGCTTATACAGCGGCATGGTCAGAGAAATATGCTTTTCGTAATCCTGAGAATCCTGGTTCATTAATCAACGGACATAAT
AATTTAATTGCAAGAGACCCAGCTAATAAAAATAGCTATGAAAATTTAGTTTCTATTTTAGGGGAAGTTCATCAAGCTTT
ACAAGAAGCTAGCACAACTTTTGGACCTCTATTTATTAGAGAAGCTGGCCTTATGAATGCAAGTCATAAAATTAAACCAG
ATACAGCCAAAACACTAGCAATAAGCGCAGCTCAAAAAAAACTTTTTGATAAACTTGAGGAGTTAAAGCAAAAAGCGAAA
AGTCTTACTTTTGAAACAAACTCTCAAAATGAACTTCAAGGGGTAGGTAATTTTGGAGAATACAGCAAACTCACTCTTGA
TATTACTTTGTCCAAAATCCAAAAAGAACTACAAGAATTTGATGCATTACCTCTACCAGAAGCGAAAACTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATTGTATATGTTTAATTAAAATTAAAAATAATACTATAATTAATTATTATAAAGTAAATTTAATAATTAACAAACTA
CAAGAAAAGGATTATAAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAACAAATTTTTACCCATCACTCTTAAAATTTATTCTCCTATTAAAAGCGATAATGGATTAAAATAAAATTAACAAACA
CAATAAATTAAAAATTAGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 530; Mature: 530

Protein sequence:

>530_residues
MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLDADTMTQIATRVAYMIFAKNL
ISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIMQNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQ
FTSDQLDAINKYGANKVMVGGQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK
SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATISSKEKISKEQLKELQSAKNEL
ASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLEKYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHN
NLIARDPANKNSYENLVSILGEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK
SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT

Sequences:

>Translated_530_residues
MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLDADTMTQIATRVAYMIFAKNL
ISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIMQNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQ
FTSDQLDAINKYGANKVMVGGQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK
SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATISSKEKISKEQLKELQSAKNEL
ASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLEKYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHN
NLIARDPANKNSYENLVSILGEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK
SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT
>Mature_530_residues
MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLDADTMTQIATRVAYMIFAKNL
ISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIMQNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQ
FTSDQLDAINKYGANKVMVGGQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK
SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATISSKEKISKEQLKELQSAKNEL
ASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLEKYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHN
NLIARDPANKNSYENLVSILGEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK
SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59180; Mature: 59180

Theoretical pI: Translated: 9.92; Mature: 9.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLD
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCC
ADTMTQIATRVAYMIFAKNLISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
QNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQFTSDQLDAINKYGANKVMVG
HHHHHHCCCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCEEEEC
GQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
SKEKISKEQLKELQSAKNELASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
KYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHNNLIARDPANKNSYENLVSIL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHH
GEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT
HCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLD
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCC
ADTMTQIATRVAYMIFAKNLISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
QNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQFTSDQLDAINKYGANKVMVG
HHHHHHCCCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCEEEEC
GQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
SKEKISKEQLKELQSAKNELASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
KYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHNNLIARDPANKNSYENLVSIL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHH
GEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT
HCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA