Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
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Accession | NC_005861 |
Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46446227
Identifier: 46446227
GI number: 46446227
Start: 730554
End: 732146
Strand: Reverse
Name: 46446227
Synonym: pc0593
Alternate gene names: NA
Gene position: 732146-730554 (Counterclockwise)
Preceding gene: 46446241
Following gene: 46446226
Centisome position: 30.32
GC content: 32.58
Gene sequence:
>1593_bases ATGAATTCTAATTTACCTTTGTCATCCTCATATTCTCAAATTGACAAGATGGCTCAAACATTGGAAAGTCGAGGAATTAA GGTCAATATCGATAAAGAGTCTAATAAAGGAATTATTGATGCCAATGGACGCAAATTCGCTGTCTCTCTTATTAATGTCA ACAGTGAACATCCTTTAGATGCAGATACAATGACGCAAATTGCGACAAGAGTTGCTTATATGATATTTGCTAAAAATTTA ATTAGCGAGGAGTTTCAAGGCGCTAAAATTGATCAACAAGGTATTCAAATTAACGACAAAAACTTGACTCATGAAGAAGC AAATACTAAAGAGCTTTATCAAGATATACAATCTATTATGCAAAACAAATTATCTAAGCAAAATGCTGATATAGCTGAAG CCCAAATCGGAGTAAACACAAATACAAAGCAACCTATTCAAAAGGAATTTAACCCACCTCTACATCCTTATCTATCTCAA TTTACTTCAGATCAATTAGATGCCATTAATAAGTACGGAGCTAATAAAGTAATGGTTGGCGGCCAATTTAGTCAAAGCAA ATTGGACGCACTCCAACAAGCTGAAGTTAAAGCAGTGGCAAAAGGTAAAGTTAAACCAGTGAAAAAAGAAAGGGTAACAA GGAAAAATGGATTTATAGAAGCGAAAAATGGATTTATAGAAGCGGTAAAAACAAAAGTAAAAACAACAAAAAAAGATAAA TCTAAATTGCAGACAATTTCTAATCAAAAACTCCAAGAAAAATTAACAAAAATTCAATTTACTCTTTCTGATTACGCTAA AAATTTACTTCTTTTAGAACAAGCTCGGGAAGATTTAGATAAAATGCTTAATCATGGTGCTTCAAAAGGAGAAATAGATG CAACAAAAGCCACAATTTCCAGTAAAGAAAAAATCTCTAAAGAACAATTGAAAGAACTTCAAAGCGCAAAAAATGAGTTG GCGAGTTTTAAATTAGAAAAAAATAAACCACTTTTAAACGAAATACGTCGCATTATTCACGACATGCAAAATTTATTAAA TGCTTCTAATACAAAAACTGCTAGCCACGCTTTTCTAGAAAAATACAAAACAAAACAGGAAGTTCAGCAAGGAATTGGAA ATGCTTATACAGCGGCATGGTCAGAGAAATATGCTTTTCGTAATCCTGAGAATCCTGGTTCATTAATCAACGGACATAAT AATTTAATTGCAAGAGACCCAGCTAATAAAAATAGCTATGAAAATTTAGTTTCTATTTTAGGGGAAGTTCATCAAGCTTT ACAAGAAGCTAGCACAACTTTTGGACCTCTATTTATTAGAGAAGCTGGCCTTATGAATGCAAGTCATAAAATTAAACCAG ATACAGCCAAAACACTAGCAATAAGCGCAGCTCAAAAAAAACTTTTTGATAAACTTGAGGAGTTAAAGCAAAAAGCGAAA AGTCTTACTTTTGAAACAAACTCTCAAAATGAACTTCAAGGGGTAGGTAATTTTGGAGAATACAGCAAACTCACTCTTGA TATTACTTTGTCCAAAATCCAAAAAGAACTACAAGAATTTGATGCATTACCTCTACCAGAAGCGAAAACTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAATTGTATATGTTTAATTAAAATTAAAAATAATACTATAATTAATTATTATAAAGTAAATTTAATAATTAACAAACTA CAAGAAAAGGATTATAAAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAACAAATTTTTACCCATCACTCTTAAAATTTATTCTCCTATTAAAAGCGATAATGGATTAAAATAAAATTAACAAACA CAATAAATTAAAAATTAGAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 530; Mature: 530
Protein sequence:
>530_residues MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLDADTMTQIATRVAYMIFAKNL ISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIMQNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQ FTSDQLDAINKYGANKVMVGGQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATISSKEKISKEQLKELQSAKNEL ASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLEKYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHN NLIARDPANKNSYENLVSILGEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT
Sequences:
>Translated_530_residues MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLDADTMTQIATRVAYMIFAKNL ISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIMQNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQ FTSDQLDAINKYGANKVMVGGQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATISSKEKISKEQLKELQSAKNEL ASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLEKYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHN NLIARDPANKNSYENLVSILGEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT >Mature_530_residues MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLDADTMTQIATRVAYMIFAKNL ISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIMQNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQ FTSDQLDAINKYGANKVMVGGQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATISSKEKISKEQLKELQSAKNEL ASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLEKYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHN NLIARDPANKNSYENLVSILGEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59180; Mature: 59180
Theoretical pI: Translated: 9.92; Mature: 9.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLD CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCC ADTMTQIATRVAYMIFAKNLISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH QNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQFTSDQLDAINKYGANKVMVG HHHHHHCCCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCEEEEC GQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH SKEKISKEQLKELQSAKNELASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH KYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHNNLIARDPANKNSYENLVSIL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHH GEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT HCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNSNLPLSSSYSQIDKMAQTLESRGIKVNIDKESNKGIIDANGRKFAVSLINVNSEHPLD CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCC ADTMTQIATRVAYMIFAKNLISEEFQGAKIDQQGIQINDKNLTHEEANTKELYQDIQSIM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH QNKLSKQNADIAEAQIGVNTNTKQPIQKEFNPPLHPYLSQFTSDQLDAINKYGANKVMVG HHHHHHCCCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCEEEEC GQFSQSKLDALQQAEVKAVAKGKVKPVKKERVTRKNGFIEAKNGFIEAVKTKVKTTKKDK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH SKLQTISNQKLQEKLTKIQFTLSDYAKNLLLLEQAREDLDKMLNHGASKGEIDATKATIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH SKEKISKEQLKELQSAKNELASFKLEKNKPLLNEIRRIIHDMQNLLNASNTKTASHAFLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH KYKTKQEVQQGIGNAYTAAWSEKYAFRNPENPGSLINGHNNLIARDPANKNSYENLVSIL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHH GEVHQALQEASTTFGPLFIREAGLMNASHKIKPDTAKTLAISAAQKKLFDKLEELKQKAK HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLTFETNSQNELQGVGNFGEYSKLTLDITLSKIQKELQEFDALPLPEAKT HCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA