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The map label for this gene is 45657175

Identifier: 45657175

GI number: 45657175

Start: 1600588

End: 1602522

Strand: Direct

Name: 45657175

Synonym: LIC11295

Alternate gene names: NA

Gene position: 1600588-1602522 (Clockwise)

Preceding gene: 45657173

Following gene: 304570491

Centisome position: 37.42

GC content: 34.78

Gene sequence:

>1935_bases
ATGGGGTTTATTTTTCTCATACTAAGTTTCTACGGTTATTTAATTTTTCTAATTCGTTATAGTAAATGGTCCACGGCAAG
TATGCCTTTGTTTATTATATCAACGGAAATTATCATACTTTTTGCTTCTGGTTTTGTTGATCTTTTGCTGCCAACTTTAT
GGTGTTTTATAGGTCTTGGAATATGTTTAGGGTTTATAAGTCTGTATGCCGCGCGCAGAAATTTGATTCAACTGTTAACG
AGTCTTTTAGAGCCTGGGCCGGTGATCTTTTTCCTTTTAGCGTGTTTTTTTTACATTAAGTTATCTGGAGCATTGTTTGA
AGGATGGGATGAGTTTACGCATTGGGGTTTTTCGGCTAAGGAAATGTTTCATTTAAATTCATTTACCAAAGCGAACAGTC
CTCTTATGTTTAAGAGTTATCCACCCGGGACCGCATTGTTTCAATATTGGATAACAAAAAGTATAGGTTGGTCCGAAGGA
AATACATATTGGGCACAATCTTTATTGGTTTTAGCAGGTGCGGTGGCTATTTTAGAAGGATTAACCTGGCGCCAATGGTT
TCGAATTGTTTTGACTTTGAATGTTGTTTTTCTTGCGGTTTTTATATTTGGTTACAGTTTACAAAGTCTTTATGTAGATC
ATGTGCTTGGGTTTCTTTGTGGAGCTTCCGTTATATCTTGTATTCGCTCCAATACTTCGGCTCCTATAACAATTGTAAGA
CTACTTCCAACTTTATTCATTTTACCAATTATAAAAGCAGTCGGTTTGATGTTGGGAATTTTTATCTCGATTATTTTTGT
ATTTGATCAGATTTTCAAAGAGAGGAATACTTTTTCAGGTAGTCAGCCACTTAAGCAAAAACTTATATTCGGTTTTCTTG
TGATTCTAATTCTTGCTACACCTATAATTTCAGCTCGGATATGGGGTTGGCACGTAAAAAAGTCTGGTTTTTCTCAGGTA
TTTGAAACTTCGTTTTCGATTTCTCAGATAAAAAAAAGTTTTTCTTCAACAGAAGCAACAGATCGAGATAAAGAAACGAT
TTCTACCTTTAAGAAAGCATTTCAGACCTATCAGATAAATCCTGAAAATATACTTCAAATATTTTCCAGAAGATTTGTTT
TAAAGCTAACTCCCCTTAAATCTTTACTGTTTTTAATGGTTTTTGGTATTGCAGCCATTGTGATAGAAACCAGGCGACAG
GAGAGACGTATTGCAATTGTAGGTTTCTTAACCATGTTTTTAGGTTATACTGTATATTCATTTGGTCTTTTGCTCATGTA
TTTATATTCTTTTGGTTCTTATGAAGGAACTAGAGTTGCGTCTTTTACGCGTTATATGGGAATTTTTCTTCTCGCGTGGA
CCGTAGTAACCTGGGGATTTATGCTTAGCACTGGTGAACAGAAAGAAAAGAATTCACCTAAAATTGTCCAGGGTCTTTTC
GTTATTTTCATTTTGTTTTTGACTCCTATAAAATCGGCCTTATTCGCATTGACTCAACCTAAACCGTTACCTGTACGAAT
GGAGATTAAGAAAATCCTTTCCAATACGATTCCAAATCTGAAAAGAGGTGAAAGAGTTTATGTAATTTGGCAGAATACAA
CAGGTTTTGAACCTTGGATCATTTCGTATGAATTATCACCCCGAAATTCTACGAGTGTGGCTAGTTCAGGGTGGTCACTT
GGTCGTCCATATTATGAAGGTGATGTTTGGACTAGTGATATAGATCCAAAAACTTGGAGTGAGAATATATTAGTAAATTA
TGATTTTCTATTGTTAGCTTCGGTGGATGAATACTTTTGGTCTAGATACGCCTCCGTTTTTAAATCTACTTTAAATCTAA
AAAGTAATAAGTTGTTTCGCGTAGTAAAAAAAGAAAATGGTAAAATTGACTTGGAGGTAGTTGATTTAACTTCAAATCCT
AAATCCGAGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTTCAGAAGAGTCATTGATTGAGTTTTTTATTTGCTCAGATTTTCTAATGTTAGATTCACATTCTTTAAAATTAGAAGT
ATCTTGTCTGGAGTTATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCGATATTACATTTGTTTATATTCGTAGAATTTCTTGGTTCTTGGATATGTAAAATTGAGAACAATAGATTGAAACGTT
TCTCTTTGGTCTTTTTCTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 644; Mature: 643

Protein sequence:

>644_residues
MGFIFLILSFYGYLIFLIRYSKWSTASMPLFIISTEIIILFASGFVDLLLPTLWCFIGLGICLGFISLYAARRNLIQLLT
SLLEPGPVIFFLLACFFYIKLSGALFEGWDEFTHWGFSAKEMFHLNSFTKANSPLMFKSYPPGTALFQYWITKSIGWSEG
NTYWAQSLLVLAGAVAILEGLTWRQWFRIVLTLNVVFLAVFIFGYSLQSLYVDHVLGFLCGASVISCIRSNTSAPITIVR
LLPTLFILPIIKAVGLMLGIFISIIFVFDQIFKERNTFSGSQPLKQKLIFGFLVILILATPIISARIWGWHVKKSGFSQV
FETSFSISQIKKSFSSTEATDRDKETISTFKKAFQTYQINPENILQIFSRRFVLKLTPLKSLLFLMVFGIAAIVIETRRQ
ERRIAIVGFLTMFLGYTVYSFGLLLMYLYSFGSYEGTRVASFTRYMGIFLLAWTVVTWGFMLSTGEQKEKNSPKIVQGLF
VIFILFLTPIKSALFALTQPKPLPVRMEIKKILSNTIPNLKRGERVYVIWQNTTGFEPWIISYELSPRNSTSVASSGWSL
GRPYYEGDVWTSDIDPKTWSENILVNYDFLLLASVDEYFWSRYASVFKSTLNLKSNKLFRVVKKENGKIDLEVVDLTSNP
KSEN

Sequences:

>Translated_644_residues
MGFIFLILSFYGYLIFLIRYSKWSTASMPLFIISTEIIILFASGFVDLLLPTLWCFIGLGICLGFISLYAARRNLIQLLT
SLLEPGPVIFFLLACFFYIKLSGALFEGWDEFTHWGFSAKEMFHLNSFTKANSPLMFKSYPPGTALFQYWITKSIGWSEG
NTYWAQSLLVLAGAVAILEGLTWRQWFRIVLTLNVVFLAVFIFGYSLQSLYVDHVLGFLCGASVISCIRSNTSAPITIVR
LLPTLFILPIIKAVGLMLGIFISIIFVFDQIFKERNTFSGSQPLKQKLIFGFLVILILATPIISARIWGWHVKKSGFSQV
FETSFSISQIKKSFSSTEATDRDKETISTFKKAFQTYQINPENILQIFSRRFVLKLTPLKSLLFLMVFGIAAIVIETRRQ
ERRIAIVGFLTMFLGYTVYSFGLLLMYLYSFGSYEGTRVASFTRYMGIFLLAWTVVTWGFMLSTGEQKEKNSPKIVQGLF
VIFILFLTPIKSALFALTQPKPLPVRMEIKKILSNTIPNLKRGERVYVIWQNTTGFEPWIISYELSPRNSTSVASSGWSL
GRPYYEGDVWTSDIDPKTWSENILVNYDFLLLASVDEYFWSRYASVFKSTLNLKSNKLFRVVKKENGKIDLEVVDLTSNP
KSEN
>Mature_643_residues
GFIFLILSFYGYLIFLIRYSKWSTASMPLFIISTEIIILFASGFVDLLLPTLWCFIGLGICLGFISLYAARRNLIQLLTS
LLEPGPVIFFLLACFFYIKLSGALFEGWDEFTHWGFSAKEMFHLNSFTKANSPLMFKSYPPGTALFQYWITKSIGWSEGN
TYWAQSLLVLAGAVAILEGLTWRQWFRIVLTLNVVFLAVFIFGYSLQSLYVDHVLGFLCGASVISCIRSNTSAPITIVRL
LPTLFILPIIKAVGLMLGIFISIIFVFDQIFKERNTFSGSQPLKQKLIFGFLVILILATPIISARIWGWHVKKSGFSQVF
ETSFSISQIKKSFSSTEATDRDKETISTFKKAFQTYQINPENILQIFSRRFVLKLTPLKSLLFLMVFGIAAIVIETRRQE
RRIAIVGFLTMFLGYTVYSFGLLLMYLYSFGSYEGTRVASFTRYMGIFLLAWTVVTWGFMLSTGEQKEKNSPKIVQGLFV
IFILFLTPIKSALFALTQPKPLPVRMEIKKILSNTIPNLKRGERVYVIWQNTTGFEPWIISYELSPRNSTSVASSGWSLG
RPYYEGDVWTSDIDPKTWSENILVNYDFLLLASVDEYFWSRYASVFKSTLNLKSNKLFRVVKKENGKIDLEVVDLTSNPK
SEN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 73497; Mature: 73366

Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGFIFLILSFYGYLIFLIRYSKWSTASMPLFIISTEIIILFASGFVDLLLPTLWCFIGLG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICLGFISLYAARRNLIQLLTSLLEPGPVIFFLLACFFYIKLSGALFEGWDEFTHWGFSAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHCCCCHH
EMFHLNSFTKANSPLMFKSYPPGTALFQYWITKSIGWSEGNTYWAQSLLVLAGAVAILEG
HHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LTWRQWFRIVLTLNVVFLAVFIFGYSLQSLYVDHVLGFLCGASVISCIRSNTSAPITIVR
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
LLPTLFILPIIKAVGLMLGIFISIIFVFDQIFKERNTFSGSQPLKQKLIFGFLVILILAT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PIISARIWGWHVKKSGFSQVFETSFSISQIKKSFSSTEATDRDKETISTFKKAFQTYQIN
HHHHHHHHCEEECHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PENILQIFSRRFVLKLTPLKSLLFLMVFGIAAIVIETRRQERRIAIVGFLTMFLGYTVYS
HHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGLLLMYLYSFGSYEGTRVASFTRYMGIFLLAWTVVTWGFMLSTGEQKEKNSPKIVQGLF
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
VIFILFLTPIKSALFALTQPKPLPVRMEIKKILSNTIPNLKRGERVYVIWQNTTGFEPWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEE
ISYELSPRNSTSVASSGWSLGRPYYEGDVWTSDIDPKTWSENILVNYDFLLLASVDEYFW
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHEEHHHHHHHH
SRYASVFKSTLNLKSNKLFRVVKKENGKIDLEVVDLTSNPKSEN
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GFIFLILSFYGYLIFLIRYSKWSTASMPLFIISTEIIILFASGFVDLLLPTLWCFIGLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICLGFISLYAARRNLIQLLTSLLEPGPVIFFLLACFFYIKLSGALFEGWDEFTHWGFSAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHCCCCHH
EMFHLNSFTKANSPLMFKSYPPGTALFQYWITKSIGWSEGNTYWAQSLLVLAGAVAILEG
HHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LTWRQWFRIVLTLNVVFLAVFIFGYSLQSLYVDHVLGFLCGASVISCIRSNTSAPITIVR
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
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PIISARIWGWHVKKSGFSQVFETSFSISQIKKSFSSTEATDRDKETISTFKKAFQTYQIN
HHHHHHHHCEEECHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PENILQIFSRRFVLKLTPLKSLLFLMVFGIAAIVIETRRQERRIAIVGFLTMFLGYTVYS
HHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGLLLMYLYSFGSYEGTRVASFTRYMGIFLLAWTVVTWGFMLSTGEQKEKNSPKIVQGLF
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VIFILFLTPIKSALFALTQPKPLPVRMEIKKILSNTIPNLKRGERVYVIWQNTTGFEPWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEE
ISYELSPRNSTSVASSGWSLGRPYYEGDVWTSDIDPKTWSENILVNYDFLLLASVDEYFW
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHEEHHHHHHHH
SRYASVFKSTLNLKSNKLFRVVKKENGKIDLEVVDLTSNPKSEN
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA