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The map label for this gene is 45657170

Identifier: 45657170

GI number: 45657170

Start: 1589281

End: 1591587

Strand: Direct

Name: 45657170

Synonym: LIC11289

Alternate gene names: NA

Gene position: 1589281-1591587 (Clockwise)

Preceding gene: 45657169

Following gene: 45657171

Centisome position: 37.16

GC content: 32.16

Gene sequence:

>2307_bases
ATGCAAATCATACAGAGGAAATGGAAAATTCCTCACGCGGCCAGAAAACCTCTCGTATTTTTTTTAGTTTTTTTATTTTT
ATCTGTACAATTTCGATTTTTATTTTCGGATCAAGTACCCGATTTCGTATCCTTACAAAACCAATATCTAATCGCTCAGG
ATTATCAGATCCTATTTAAGAATTTTCTTTCTTCTGGATACGATCGTTCCTTACAAGGGGGCAGTCCCATTTTTTATTTC
CAAGCCCCTTTTTTCTTTTTTTTGGTTTCTTTTCTTCACACGTTTATTTTATTTTTTCTTCCCTTTGGAGTTTCTTTTAA
TTTAGGAATTTTGCTTGGACTGTTTTTATTTTCATACGCGTTTTTAAAATTAGGATTTTTATTTCTTACAGAAACAAATC
TCAGTCCAGGAAATACTTTACTTACTATAACTGGACTTATGTTTTATTTTTTATATCCGGGAGACCGTGTTGTAGGTGCA
GGAATTGTAGGGGTTTTTCAAAATTCAATTTCGTTTTCGGTAGGACTTGCGATTGCGTTGCTTTCTATTTATTATCTGGA
AAAATTTCGTTATACCGGAAAAGTCTCTTCCTTTTTTAAAAATCTGATCGCTGGAACTCTCGTATTTTATACACACTACG
AAACTTCTTTGTTTTATTTGATAGCATTAGGTATCTATTTTCTTTTTTATAAAGACGAATTTGAAATTCTTGAGATCTTA
TTGATTTTTCTAGTTCCTCTTCTTTTTGCCTTTCCTATATTATGGAATTATTTTGCGTATATTTCATTTCAGCAAAATCC
TCCTGTTTCTTTTCCGATTAACGGACTTTTATCTCTTTTAGGAGAAGAGTTTTCAAATTCAATTGCAAGGCCAGAGAAAA
TTTTAGATCTAATAAAACAGATTTTAATGGATCAATATTGGATTCATCTATTGTTTCCAATTTTATTTGTGATCGGAATT
CGGCTGTTGTTTATCAGAAAACTATTACCTCCAATTTCTAGATTTCTAATATTTGGAGCCTTGTTTTTTTATTGGATGGC
TACGGATTCTTCTTTATCTATGATTTTTCCTTGGTTACATGCAAAATGGCATACGGCCTTAAACGTATCTTTGGTCTTTC
TGACTCTTTCTTCACTTGTAACTGCCAGATTCTTTTTAAAAAACCTTCCGCCCGGAAAATGGAAATTATGGAGTGGTTTG
ATTTTATTCATATTAGGATTATATCGATTTATTGTAACAATTCCGGGGCCAGCCACTGGGATAGAAACTTTTACAGATAA
TCCTTCTGTAATCTGGAAACAGAAAGAAGAGTGGATTCGTGTTTTTGAAAAAACTTCTTATGGAGCTTTGATTGCATCCG
AAGAAATATTAGAAGAAAAAGATTTTGCGGACTCTCGTTGGGCCTCTGTACTAATCCGACAATCCATTAGACGAAATATC
ACTTTGAAGAATCGTTTTGAAAAATCGTTTCCTGCTTCGATTGAAGAAATCATTAGACTGTTTCCGGAACAAGGAACAAA
GACTTTTTTAAACAAAGAAGAGAAACAAATAAATTTTCATCCTGCTCTTGAAAGAGAAAAACTTTCAGAATTATTTTCTA
AATTACTTTCCGAAAGAGGGGTTTCCTACGTATTGCTTGGTTCGGATTCTTTGAATCAATTGGCGATTGTGTCTCCTAAA
TATTTTTATAAGATAGATCAAAAAGGAAAATGGATTTTATGGAAATTGAATTCTTCTCGATCTTTTATGGAGCTACTTCC
TAAAAAGCCGATTGCTATTTTAATTGAAGATTTTTCACTTCAAAAACTTAAATTAGAATCCGTCTTAGATCTAAAATTTG
AACAAAATCTCACTTTGATTCCTGTTTCCAAAGAAGAATTTAAATCAGATCAAAATTCTTTTTCGGACGTTTGCGAAGTA
TCTTCTTGTTTTAGGGAAAAGGTCAAAGAAAAAGAAAGTTTTCAAAATAAAACAGGAACTAAAACAGATTTAGTTGGTTT
ACCTACAGAAATTTGGCCGGTTACTTGGAGCGATTCCGAAATCAGATGGGAGATTTCAAAAGAAAAACAATCCGAGGTAT
GTTTTCCTACACTTGTTCATTCCAGTTTTTTCCCTCTTTGGAAACTTGTATCAGGAGAAAAAGTTTATCGGACTTTGGAA
GATCAATTTTATTTTTGTTCTAAAGAAAGAAAAAATGAATTCATATTTTATGATATTCGAACATACTTAATTACGTTTGT
TCAACTTTTACTTCCTCTTGCTTTTTTGGGAGCCACATTCTTAACACGTAGGAAAGTATCTAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAACGCGAAGGAAGAATAATTTTTCTTGGAGCAGAATTGAAAGGGAATTTAGAACGCCCGTTTTGCTTGTCAGGAAATCG
GGTTTCGTAAGAATCATCCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGTTCTTTACAAAAGATCTACGGAAAACTCCTTTTAGAAAAAGACAAACCCTTTCTAATTCTATTTTGATAGGATTTTCT
GCGGCGATACTTTTTATTCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 768; Mature: 768

Protein sequence:

>768_residues
MQIIQRKWKIPHAARKPLVFFLVFLFLSVQFRFLFSDQVPDFVSLQNQYLIAQDYQILFKNFLSSGYDRSLQGGSPIFYF
QAPFFFFLVSFLHTFILFFLPFGVSFNLGILLGLFLFSYAFLKLGFLFLTETNLSPGNTLLTITGLMFYFLYPGDRVVGA
GIVGVFQNSISFSVGLAIALLSIYYLEKFRYTGKVSSFFKNLIAGTLVFYTHYETSLFYLIALGIYFLFYKDEFEILEIL
LIFLVPLLFAFPILWNYFAYISFQQNPPVSFPINGLLSLLGEEFSNSIARPEKILDLIKQILMDQYWIHLLFPILFVIGI
RLLFIRKLLPPISRFLIFGALFFYWMATDSSLSMIFPWLHAKWHTALNVSLVFLTLSSLVTARFFLKNLPPGKWKLWSGL
ILFILGLYRFIVTIPGPATGIETFTDNPSVIWKQKEEWIRVFEKTSYGALIASEEILEEKDFADSRWASVLIRQSIRRNI
TLKNRFEKSFPASIEEIIRLFPEQGTKTFLNKEEKQINFHPALEREKLSELFSKLLSERGVSYVLLGSDSLNQLAIVSPK
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SSCFREKVKEKESFQNKTGTKTDLVGLPTEIWPVTWSDSEIRWEISKEKQSEVCFPTLVHSSFFPLWKLVSGEKVYRTLE
DQFYFCSKERKNEFIFYDIRTYLITFVQLLLPLAFLGATFLTRRKVSN

Sequences:

>Translated_768_residues
MQIIQRKWKIPHAARKPLVFFLVFLFLSVQFRFLFSDQVPDFVSLQNQYLIAQDYQILFKNFLSSGYDRSLQGGSPIFYF
QAPFFFFLVSFLHTFILFFLPFGVSFNLGILLGLFLFSYAFLKLGFLFLTETNLSPGNTLLTITGLMFYFLYPGDRVVGA
GIVGVFQNSISFSVGLAIALLSIYYLEKFRYTGKVSSFFKNLIAGTLVFYTHYETSLFYLIALGIYFLFYKDEFEILEIL
LIFLVPLLFAFPILWNYFAYISFQQNPPVSFPINGLLSLLGEEFSNSIARPEKILDLIKQILMDQYWIHLLFPILFVIGI
RLLFIRKLLPPISRFLIFGALFFYWMATDSSLSMIFPWLHAKWHTALNVSLVFLTLSSLVTARFFLKNLPPGKWKLWSGL
ILFILGLYRFIVTIPGPATGIETFTDNPSVIWKQKEEWIRVFEKTSYGALIASEEILEEKDFADSRWASVLIRQSIRRNI
TLKNRFEKSFPASIEEIIRLFPEQGTKTFLNKEEKQINFHPALEREKLSELFSKLLSERGVSYVLLGSDSLNQLAIVSPK
YFYKIDQKGKWILWKLNSSRSFMELLPKKPIAILIEDFSLQKLKLESVLDLKFEQNLTLIPVSKEEFKSDQNSFSDVCEV
SSCFREKVKEKESFQNKTGTKTDLVGLPTEIWPVTWSDSEIRWEISKEKQSEVCFPTLVHSSFFPLWKLVSGEKVYRTLE
DQFYFCSKERKNEFIFYDIRTYLITFVQLLLPLAFLGATFLTRRKVSN
>Mature_768_residues
MQIIQRKWKIPHAARKPLVFFLVFLFLSVQFRFLFSDQVPDFVSLQNQYLIAQDYQILFKNFLSSGYDRSLQGGSPIFYF
QAPFFFFLVSFLHTFILFFLPFGVSFNLGILLGLFLFSYAFLKLGFLFLTETNLSPGNTLLTITGLMFYFLYPGDRVVGA
GIVGVFQNSISFSVGLAIALLSIYYLEKFRYTGKVSSFFKNLIAGTLVFYTHYETSLFYLIALGIYFLFYKDEFEILEIL
LIFLVPLLFAFPILWNYFAYISFQQNPPVSFPINGLLSLLGEEFSNSIARPEKILDLIKQILMDQYWIHLLFPILFVIGI
RLLFIRKLLPPISRFLIFGALFFYWMATDSSLSMIFPWLHAKWHTALNVSLVFLTLSSLVTARFFLKNLPPGKWKLWSGL
ILFILGLYRFIVTIPGPATGIETFTDNPSVIWKQKEEWIRVFEKTSYGALIASEEILEEKDFADSRWASVLIRQSIRRNI
TLKNRFEKSFPASIEEIIRLFPEQGTKTFLNKEEKQINFHPALEREKLSELFSKLLSERGVSYVLLGSDSLNQLAIVSPK
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SSCFREKVKEKESFQNKTGTKTDLVGLPTEIWPVTWSDSEIRWEISKEKQSEVCFPTLVHSSFFPLWKLVSGEKVYRTLE
DQFYFCSKERKNEFIFYDIRTYLITFVQLLLPLAFLGATFLTRRKVSN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89522; Mature: 89522

Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQIIQRKWKIPHAARKPLVFFLVFLFLSVQFRFLFSDQVPDFVSLQNQYLIAQDYQILFK
CCCHHHHCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEHHHHHHHHH
NFLSSGYDRSLQGGSPIFYFQAPFFFFLVSFLHTFILFFLPFGVSFNLGILLGLFLFSYA
HHHCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FLKLGFLFLTETNLSPGNTLLTITGLMFYFLYPGDRVVGAGIVGVFQNSISFSVGLAIAL
HHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSIYYLEKFRYTGKVSSFFKNLIAGTLVFYTHYETSLFYLIALGIYFLFYKDEFEILEIL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LIFLVPLLFAFPILWNYFAYISFQQNPPVSFPINGLLSLLGEEFSNSIARPEKILDLIKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
ILMDQYWIHLLFPILFVIGIRLLFIRKLLPPISRFLIFGALFFYWMATDSSLSMIFPWLH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
AKWHTALNVSLVFLTLSSLVTARFFLKNLPPGKWKLWSGLILFILGLYRFIVTIPGPATG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCC
IETFTDNPSVIWKQKEEWIRVFEKTSYGALIASEEILEEKDFADSRWASVLIRQSIRRNI
CCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
TLKNRFEKSFPASIEEIIRLFPEQGTKTFLNKEEKQINFHPALEREKLSELFSKLLSERG
CHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
VSYVLLGSDSLNQLAIVSPKYFYKIDQKGKWILWKLNSSRSFMELLPKKPIAILIEDFSL
CEEEEECCCCCCCEEEECCHHEEEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHCCCCCEEEEEECCCH
QKLKLESVLDLKFEQNLTLIPVSKEEFKSDQNSFSDVCEVSSCFREKVKEKESFQNKTGT
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
KTDLVGLPTEIWPVTWSDSEIRWEISKEKQSEVCFPTLVHSSFFPLWKLVSGEKVYRTLE
CCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
DQFYFCSKERKNEFIFYDIRTYLITFVQLLLPLAFLGATFLTRRKVSN
HHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCHHHHCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEHHHHHHHHH
NFLSSGYDRSLQGGSPIFYFQAPFFFFLVSFLHTFILFFLPFGVSFNLGILLGLFLFSYA
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HHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA