| Definition | Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome chromosome I, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_005823 |
| Length | 4,277,185 |
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The map label for this gene is tolB [H]
Identifier: 45656912
GI number: 45656912
Start: 1260519
End: 1268285
Strand: Direct
Name: tolB [H]
Synonym: LIC11028
Alternate gene names: 45656912
Gene position: 1260519-1268285 (Clockwise)
Preceding gene: 45656911
Following gene: 45656915
Centisome position: 29.47
GC content: 34.49
Gene sequence:
>7767_bases ATGGTTCGATTTGGAATCTGCTTCTTTAGTTTTTTCTTTTTTTATCATTGTTCTATTTTTCGAGCGGCTTCCAGAATTAA ACCTTTGGAATTCAATTATACTTCTATCGCCGTAAATTATTTTACTCCTGAAAATGAAAAACCGTTTCCTCTTACTGTGC AGCGAGGAAATAATTTATACAATTCTACCACGGCAGACGGAAGTTATCTTTTTTATACAACCGGTCAAAAGGGAAACTAC GATATTTGGTTTAGGGATTTGAAAAGTTCGATTACGGTTCCGGTTACTACTCATCCCGCTCCTGAATATAAACCTGCAAT CAGTCCAGACGGAAAGAAGTTGGTCTTCGTGTCCGAACAATACGATTCTTCGGGAGATTTAATTTTACTTAAAATGAATC CGGGTTTGTGGGCGGATAAGATCCTTCAAGGAAAAAGATTTATAAATTCGGACTTTATAATATTAACAAATTCTAATTTT TCTGATACAGGTAAAAAAGATTCTTATGTAGATACGGATCCTTTTTTTGCACCGGATGGGCGTCATTTGGTGTTTTCCAC GGATCGTCTGACTCCAGGAATTCAGAATTTAGTCGTTTTGGATACGGAAGGCAAGGAGCCGATGAAATTGCTGACTCAAA AGGGAGGGGCTTCTCCGTTTTGGTCCAAAGACGGTAAATCGATCGTTTATATTTCGTATCAAGACGGAGTTTTTGGAGAT GTGTATCTTTTGGATCTTTCTTCTGGTAAAAACGAAAGACTTACCAAAGATTCTTATCTAAATTTTTCTCCGTCTCTTTC GGAGGATAAACGGTATTTGTATTATACTTCAATTCAAAACGATACAAATCGCAATGGTCGTTTGGACGAAAGAGACAATA GTTTAATCGTAAGAAAGGATCTAAAAACGGGTGTGGTTCGTAGGTTGACGTCTGGTAATGATTCTTTATTTGATTCTAGA 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Upstream 100 bases:
>100_bases AGAAAAGTCAGAACATTTAAAACTAACTTGGTATCGACTTGTAGAAAAAGGTGAATACTATGAAAAGTCTCCTGGCAAGT GGATTCGTAAGGAGTAGATT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTTAGATAAGGCTAAAGAATACATTTTAGGGGTGTTATTTTTATTACGCGCTTGTCCCAGAGCCGTCCTATGTGGTAA CTACTACGAAAATTTAACGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2588; Mature: 2588
Protein sequence:
>2588_residues MVRFGICFFSFFFFYHCSIFRAASRIKPLEFNYTSIAVNYFTPENEKPFPLTVQRGNNLYNSTTADGSYLFYTTGQKGNY DIWFRDLKSSITVPVTTHPAPEYKPAISPDGKKLVFVSEQYDSSGDLILLKMNPGLWADKILQGKRFINSDFIILTNSNF SDTGKKDSYVDTDPFFAPDGRHLVFSTDRLTPGIQNLVVLDTEGKEPMKLLTQKGGASPFWSKDGKSIVYISYQDGVFGD VYLLDLSSGKNERLTKDSYLNFSPSLSEDKRYLYYTSIQNDTNRNGRLDERDNSLIVRKDLKTGVVRRLTSGNDSLFDSR FSAFNGGSILFTAAYYDTLNIYFIPASGSVSKEKDIISQYELALKYKEKQSFEDFLLAIDAIEFYFSQDPIYPLIFSKAL LLKYEEAKNSGRTIIAENAKKEILSSRLNPVYGLAYGLFLSNEKKLTVSIQELRKYYEQIRVISDTGKNLLASLLEEEGD LARKSGDSQHSLKVYDEIIIHYPDYYRIRDVYRKSGDLQYKNAHLNHYKIPEPFFRVANDLSAGKEDLKLLYERIDGEVV VGKSFSEKINASEISIESNSLENKSPRLFQYFLYIKSLGLNGKGSFEESNSLLNTFLSKVAKSDPLFLKIHLLKSNNFKG LGEVQKSFDELRIYLEEYDPLLGVDLEEKEIERSFIYFENKARDHDRRGNLQDAAFHYFYNTENMFLVKSRNLFLESLYK EFAVYYQRMMVDAVFKLSGSLSEERKKALLNQLDVIDIAKVDPLAEEGLVYINQYYKEAVPRARPVLDLATLYGYSYYLI NRSVIRETYYNSTKSMTSSKKEEILRDFKQAEYELRWIIFADPRYYEAYQLLGWMYQYVDILKNRKSGEDQPSDEEKYIS VYEKYFPEKNFEENIELYSQVLELLGDNFENKKALSDLRLNLGNNYFLLKNYPKANEQYSKVDSLSDYIISKTQFEDYRQ KAIFLFNSARSSIYVADYKSAIQKLKAASDIYFRNESKKTIVGKDSAEKLEQYKLKLALLFTLTGLSYMEAGEYSNAIPY YKDALSLNGENGWIDPVNLHNGLALCYQKLGKYKLSELHLTKADKIVDDRVGTGWIPRGVKLAFWDYFWDWVWEVALPDG VRISGEGRFPEAISPKFQPLMTSGIRVNNLIASMEIDGAIKEINSRLAYVKSKSLGTTLAGSLIGANSLNDLGYLHFKRD EFKNAIDVYEQAEKFETEKGFAAKARTSFKRKLYSYFGHLENTNEDPELELRTLGSAAERILSSKSDFIKGCLGDVQYQE ELIYSETKKCILKFYNSFSDHDPTLALIYYYQGEQFFRMGNFVAAFEFFGKSAGLLENPSLVPKEVVGLADDPYSRKERL SYSISRANLYVRLEDSQKAISLLELASETANEFYYIQEWIEALVTQAEIFRKEKNDFKAKEKIDKASALLLSHPHLISEL KYFRIYKLFKIQSELNFQSGKFSDGFKSLDRLHKLKLYRQFIKIPHESEDPNFTEDITKLQNLIKKQKFYYSAIQNALEK KEKSESLLKKYVQLSKDLEKELGVISRKNQDLDGYLGIFIEEPSVTSLLDVNEGYLRIESAEDKIRIYRATSYTEEYLVN TGKLEEVLNQISNSGKIPFVSKKIWFVQLGDRIDFEKIRNFLPEKFSLVFRPSHLKPVREKDRRTTRNVAIVDGSPNFKS SLSVKKITPNQIFSIHLDTDMLVSPFPNINEDNSFGESLSEKNLAVRDLFHNQNEISSALFYEQTKPHLGKISELYEVLN ASGIRNVAICNASDSCATAFPEKIFSGEISGSLFLGSSVLRKKDVFISLENLSLLVRENERKDNVREAYTHAFSYRSFLK KEDMFLAAELDVLRLKWKLSPQVTMEEIYGDLLQNTKLETVKDSILFSALLNCYLDKNLSDCNSYSFEDITDFQKRNLLK NLYLLKNGISVEPLSLKVSDKTVFSFYDPYLYYKNILKIARANYEPELGEFAGRLALEFTHDPDEIIAVEEILQGLYAQK YFLQGSALSKNQIRRKEELYLILSGNWKEALRILKEKEAEEDTGKFRERLFRNWRREITGAWFSPYSLYSEVYGNSSKLF ESLDAEERSLLYHLILYSIPFQENEELDLLTESLVEYEWNTGAKSRALRMVLGYSQALFSRGELSKSKDWMDKIDSRYKT ESKSIFRDKNILNNKLLFHLGKISSVAEGDEKTEWLLLYEKAASKPPNEFVEFLNSTIRSKRGNRFSSKERTELLDWIVY LQKLCFKKNNSEVFFDLVLAKDLLSLTRPVVLNSIPDYKDIPTFVAVADKLKEKLPADQEFLAVTDLGLETFYIRFLKGK SKGDLAFKDNRKLRASLFQYLEEAAKGGYEVLLREELENEYRRNVKLAKNKLTYLYLSSYHFRIPLVPRTEDKFYLVNDP QSLVSNPIVSTKEEFSPEYRIQFLENSKLPESWKKSLKELEVFEAGSGKLGSDSKSRLYILQDPLEIVDQVHLSLGGKAL ADSYGSPKKGNWIFTSSFLDDEYYDIINYRDSFYWISQNFQSPGVIFIGEQTDTAHVDFLKRFTKRSLSKVPLYIRFQET LDAIKEAYPLDRIWNGYRLYTNSIILEE
Sequences:
>Translated_2588_residues MVRFGICFFSFFFFYHCSIFRAASRIKPLEFNYTSIAVNYFTPENEKPFPLTVQRGNNLYNSTTADGSYLFYTTGQKGNY DIWFRDLKSSITVPVTTHPAPEYKPAISPDGKKLVFVSEQYDSSGDLILLKMNPGLWADKILQGKRFINSDFIILTNSNF SDTGKKDSYVDTDPFFAPDGRHLVFSTDRLTPGIQNLVVLDTEGKEPMKLLTQKGGASPFWSKDGKSIVYISYQDGVFGD VYLLDLSSGKNERLTKDSYLNFSPSLSEDKRYLYYTSIQNDTNRNGRLDERDNSLIVRKDLKTGVVRRLTSGNDSLFDSR FSAFNGGSILFTAAYYDTLNIYFIPASGSVSKEKDIISQYELALKYKEKQSFEDFLLAIDAIEFYFSQDPIYPLIFSKAL LLKYEEAKNSGRTIIAENAKKEILSSRLNPVYGLAYGLFLSNEKKLTVSIQELRKYYEQIRVISDTGKNLLASLLEEEGD LARKSGDSQHSLKVYDEIIIHYPDYYRIRDVYRKSGDLQYKNAHLNHYKIPEPFFRVANDLSAGKEDLKLLYERIDGEVV VGKSFSEKINASEISIESNSLENKSPRLFQYFLYIKSLGLNGKGSFEESNSLLNTFLSKVAKSDPLFLKIHLLKSNNFKG LGEVQKSFDELRIYLEEYDPLLGVDLEEKEIERSFIYFENKARDHDRRGNLQDAAFHYFYNTENMFLVKSRNLFLESLYK EFAVYYQRMMVDAVFKLSGSLSEERKKALLNQLDVIDIAKVDPLAEEGLVYINQYYKEAVPRARPVLDLATLYGYSYYLI NRSVIRETYYNSTKSMTSSKKEEILRDFKQAEYELRWIIFADPRYYEAYQLLGWMYQYVDILKNRKSGEDQPSDEEKYIS VYEKYFPEKNFEENIELYSQVLELLGDNFENKKALSDLRLNLGNNYFLLKNYPKANEQYSKVDSLSDYIISKTQFEDYRQ KAIFLFNSARSSIYVADYKSAIQKLKAASDIYFRNESKKTIVGKDSAEKLEQYKLKLALLFTLTGLSYMEAGEYSNAIPY YKDALSLNGENGWIDPVNLHNGLALCYQKLGKYKLSELHLTKADKIVDDRVGTGWIPRGVKLAFWDYFWDWVWEVALPDG VRISGEGRFPEAISPKFQPLMTSGIRVNNLIASMEIDGAIKEINSRLAYVKSKSLGTTLAGSLIGANSLNDLGYLHFKRD EFKNAIDVYEQAEKFETEKGFAAKARTSFKRKLYSYFGHLENTNEDPELELRTLGSAAERILSSKSDFIKGCLGDVQYQE ELIYSETKKCILKFYNSFSDHDPTLALIYYYQGEQFFRMGNFVAAFEFFGKSAGLLENPSLVPKEVVGLADDPYSRKERL SYSISRANLYVRLEDSQKAISLLELASETANEFYYIQEWIEALVTQAEIFRKEKNDFKAKEKIDKASALLLSHPHLISEL KYFRIYKLFKIQSELNFQSGKFSDGFKSLDRLHKLKLYRQFIKIPHESEDPNFTEDITKLQNLIKKQKFYYSAIQNALEK KEKSESLLKKYVQLSKDLEKELGVISRKNQDLDGYLGIFIEEPSVTSLLDVNEGYLRIESAEDKIRIYRATSYTEEYLVN TGKLEEVLNQISNSGKIPFVSKKIWFVQLGDRIDFEKIRNFLPEKFSLVFRPSHLKPVREKDRRTTRNVAIVDGSPNFKS SLSVKKITPNQIFSIHLDTDMLVSPFPNINEDNSFGESLSEKNLAVRDLFHNQNEISSALFYEQTKPHLGKISELYEVLN ASGIRNVAICNASDSCATAFPEKIFSGEISGSLFLGSSVLRKKDVFISLENLSLLVRENERKDNVREAYTHAFSYRSFLK KEDMFLAAELDVLRLKWKLSPQVTMEEIYGDLLQNTKLETVKDSILFSALLNCYLDKNLSDCNSYSFEDITDFQKRNLLK 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ESKSIFRDKNILNNKLLFHLGKISSVAEGDEKTEWLLLYEKAASKPPNEFVEFLNSTIRSKRGNRFSSKERTELLDWIVY LQKLCFKKNNSEVFFDLVLAKDLLSLTRPVVLNSIPDYKDIPTFVAVADKLKEKLPADQEFLAVTDLGLETFYIRFLKGK SKGDLAFKDNRKLRASLFQYLEEAAKGGYEVLLREELENEYRRNVKLAKNKLTYLYLSSYHFRIPLVPRTEDKFYLVNDP QSLVSNPIVSTKEEFSPEYRIQFLENSKLPESWKKSLKELEVFEAGSGKLGSDSKSRLYILQDPLEIVDQVHLSLGGKAL ADSYGSPKKGNWIFTSSFLDDEYYDIINYRDSFYWISQNFQSPGVIFIGEQTDTAHVDFLKRFTKRSLSKVPLYIRFQET LDAIKEAYPLDRIWNGYRLYTNSIILEE
Specific function: Involved in the tonB-independent uptake of proteins [H]
COG id: COG0823
COG function: function code U; Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system
Gene ontology:
Cell location: Periplasm (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the tolB family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011659 - InterPro: IPR014167 - InterPro: IPR007195 [H]
Pfam domain/function: PF07676 PD40; PF04052 TolB_N [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 299373; Mature: 299373
Theoretical pI: Translated: 6.55; Mature: 6.55
Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 1.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 1.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
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