Definition Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome chromosome I, complete sequence.
Accession NC_005823
Length 4,277,185

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The map label for this gene is 45656877

Identifier: 45656877

GI number: 45656877

Start: 1198009

End: 1203204

Strand: Direct

Name: 45656877

Synonym: LIC10989

Alternate gene names: NA

Gene position: 1198009-1203204 (Clockwise)

Preceding gene: 45656876

Following gene: 45656878

Centisome position: 28.01

GC content: 31.45

Gene sequence:

>5196_bases
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TTAGAATTTCAAATTTTATAAAAGGATTAAAAACTCAAAATCCTCTTGAATTAATACGATACGGAGACATTCAAGCTCTT
ATATTAGAGGATTTTAATTCAATTCCACTTGCAAAACTCTTTCCTAATGGAGTAGGCTCCGTTCAAAAATTTTTCGAAAT
TGCTTTAGAAGTTTCTTTTGCACTTCAAGAAATCCATGAAAGAAGAATTTTACACAAGTCATTATGTCCAGGGAATATTT
GGATTCAACCAGATACTGGGATAGTAAGGATTGTTGATTTTTCATCCTCTACTTTTTCTGGTAAGGATATTTCTCCTTCT
AACACACCTCATCTGCCTCCTGAAGTTCTTTCTTATATAGCACCTGAGTTGACGGGTAAGTTATCTCGCGTTTTGGATCT
TCGAACTGATTTTTATTCTTTGGGAATTGTTTTTTACGAAATGGCAACTGGAAGTGTTCCGTTTGTTTCTAAAGATAGAA
ACGAAATTTTACACTCTCATCTTACTAAAAAACCTGTTCCTATTCATATGATTAGAAATGATTTTCCTATTTCAATTTCT
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TTGTTTTAAAGATTTTCAAAATGGAAAAATTAATTCTGAATTTGTTCCCGGTTCAAAAGATAATCCTGAGATTATATTAG
ATTCTTCTAATTTATATGGAAGAGAAAAGGAAATTCTCCTTTTACAATCTTCTTTAGATAAGGCGTCTCAAGGAGAAACT
AGAATTGTTTTTATTACTGGTGTTTCAGGTTCGGGAAAATCTGCGCTGATAAAATCCTTTTTAACAAGTATTTCAGATAT
TTTTGTCCAAGGAAAGTTCAATCAATATGAAACTTCAATGCCATTTGGGGGATTGATTCATTCCTTACGGGATTTGGTTT
CGATCTTGCTTTCTAAAAGTGAAAAAGAAATTCAAGAATTTAAAGAACTAGTTTCTAAACATATAGGTAACAATGGAAAA
ATTCTTTTAAATCAGTTTCCGGAATTAGAATTTATTTTGGGTCCTCAGCCAGAGTTATCTAAACTCCCTCCGGATGAAAA
TCAGAATCGTTTCTACCATACGCTCAGTAGCTTTATCAAAGTTCTTACAGAAATAAGTAGACCATTTGTTCTTTGTTTAG
ACGATTTACAATGGGCTGATTCTGCGAGTCTCAGGTTTGTAGAAACTATTTTAGTACATTCAGAAATTAAAAAATTCTTA
TGTATTTTATCTTTTAGATCTGAAGAATTTGAACTTTCAAGTTCTTTTTCTAGTGTATTAAGAAAAATTGAAAGTAGTAG
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GGGAAGAACAGTCTAAATTTGCAACTTCTATCTTTCTCAAAAAAACGTCAGGAAATCCTTTAGCTATTATTCAACTTCTC
GGAATTTGCCAAAAGAAACGTCTCATCAATTATCAATTTAAATCTAAACTTTGGAAATGGGATCTTGAAAAGATAGAAAA
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GTGTATGTTCTTGTTTGGGAAAAAAATTTACTTTAGAATTTTTATCTAAATTAACTTTTTTTAATACTATAAAATTAGAT
CAGCTCCTTTGGTTAGCGGTAAGAGAAGGATTTTTAAATATTTTTTTTAATGAGAATCATTTTCTTTTCGAAGAAAATCT
TTTTTCGGAACGAATTTTTAGTTTTTCACACGATAAAATCCAACAAGTTATTTATGACTTACTAGAAGAATCGAAACGGA
AAAAAATTCACCAACATATAGGGATGACCCTACTTACAATTTACGGATTAGAATCTAAAGACAAGATTCTTTTTCAAATT
GTACAACATCTTAATCATACAATTGATACAATCGAAGAAGAGTCTATAAAAAATGATCTTACAATTTTAAATTATAAAGC
GGGTCTTCAAGCTAAGAATTCAGGATCATACGAAAGTTCTCTTCAATATTTAAATTTTGCTTTGAATTTTCTGAATAAGG
AGGCTTCCGTCGAGAACTTTGAACTGTATACAGATGTGATTTTAGAAACCGCAGAAACAGAATATCTCTTAAGCAATTAC
GAAAGGGTGGAATCTCTTTTGAGATTATTAGAAAATAAAAATATAACAAATTTACAATATATTCGTAAAGAAACAATTTC
GGTTCGTTTGTATTCTAAAATGAATAGAATAGAAGAGGCGGTTTTAGCGGGTTTAAGTGGAATGAGACGTTTTAAAATTT
ATATTCCTTCTTTTTGTTTCAGAGTCATTTTTGCACTTTTTAAGGAATTGTTAATTTCTATAATTTTATCCATAAAAAAA
ACCGATTTGGAACTTGTTTGTGTAAAAGAAAACTTGGAACCTGAATACGAAGCTTTGATCGATCTTTTTGCGGAGTTGGG
TCCATCAGCTTTTACATACGATCAAAATTTATTTGCCCTTATTGTATTAAAAATGTTTAATGTTTCTTTGACAAAGGGAG
TTTCTAGAAGTAGCGCTATTGTGTATAGCGGATACGGTATGATCATTAACCAGGTTCTAAAAGACCTAAATCAGGCGGTG
CGTTATTCTAAGCTCGCGATGGATCTGAACAAAAAGATTCCGTTTGATCTTGTAAAGTGGAAAGTGAAATACGTATATTC
TGCTTATATCTGCCACTGGGTAAGGCATATCACTTTCGACATAGGTTTGTTAGACGAAGTTCATAATGGAGCCTTACAAA
ACGGGGATATTTTTTTTGCCGGATTTAGTCTTCAGGCCAAGATTCAGAAAAAAATTTTTGCTTCCTATTCTATAAATGAA
CTTTTGACGGACATAGATAATGCGGAAAAGTATTTTAAGATAACAAGAGACGATTTCGCTTCCGTAATTTCAAAAAGTTC
TCATCAGTTTATCAAAGCTCTTGCAGGAAAAACTTTTTCCGGCTGTTCTTTGGAAGATTCTGAGTTCCAATACCAAGATT
TTGAAAGTGAAATAATGGAAAATAAAAATTACACTGCACTTTCCTATTATTATCATGATCTTACTAAACTTTATTATTTT
TCAGGGCAATATAAAAAAGCTATAATATTCGCCGCAAAGTGTGAAAAGTTAATTCGGAATGCTTTTGGTTTGATTCCTTT
TGCCGAATATTGGTTTTATTATGGAATTGTCATTTTAGCTAATTTTCATGAATTTAGTTTTTTTCAAAGAATTAGATATT
TAAAAAAATTGAATATTGTATTTTCATACTTTAAAAAATGGAGTAGAGATTGCCCGGAAAATTTTATGGGACTTTTGGAA
CTTCTTAGTGCAGAAAAAAAAAGAATACGCGGAAAAGTTTACGATACAATTGTAGGTTACGAAAGAGCGATCAAACTTTT
TCAAGAATCGGGTTTTATTTCGTTTCAGGCTTTATCGAGCGAAATGGCTGCTGAGTTTCATTATAAAATTGGAAATTTCT
CTCTTGGAAATCACTATTTAGGATACGCGATCAATTTATATTCTAAATGGGGAGCTTTGTCTAAGGTATCTGATCTAAAA
AGTCGTTTTTCGAATCAACCCCAGCTTTGTTTTTTGAATGAAAATGATCTAAACAAAATCTTGGAACAAGATCTTGTTTT
AGATCGGGAAGTTATATTAAAATATTATAATATTATTTCTAAAGAGATTGTCTTGGATAATCTTCTTAAGAAATTGATGC
AAATAACGATGCAAACTGCTGGAGCGACAAAAGCGGTTTATTTTAATTTGTATAATGAAAATCCAATGCCTTATCTTATA
GGACAAAACGAAAAGACAGGAATTAAGATTGAAAAATTTCCAGAATTAGATAAACCTCAATATCCGGTTTCTTATCTGAA
TTACGTGTTTAGAACGGGTAAATTGATTTCTACGTTTGATTCTTTCTCGATTAAAAATTTTAACGATCAATATATCAAAG
AAAAAAATCCACAGTCTATGGTTTGTATTCCATTGATACACATTGGAAAATTAAAGGGGATTCTCTATTTAGAAAATGAA
TTCGCCAAAGGAATGTTTACCGAAAAGAATATTCAAATTTTGGAACTGATCGCGGGGCAAGCGGCGATTTTTATAGAAAA
TGCTAACCTTTATGCGGAATTAGAAGAAAAGGTAAAACAAAGGACTTCCGAACTCGATAATACAATTCATCTGCTTCGAA
AGGATTTACTCTACGCTCAAAAAATTCAGGATAAAATTTTATCAAAACCGGAGTCTACATTATGTGGAATACATGTTTTT
ACGAAGTACATTCCGATGATGTACGTAGGAGGTGATATTTACGACTATGAAGAAATTTCTCCAGGTAAGGTGAGAATCTT
TTTAGCGGATGCTACTGGTCACGGTGTTCAAGCTGCGTTAGTCACTATGTTAATTAAATCCGAATATGAAAGTCTCAAAT
ATTTAAATATATCTCCGGGAGGTTTGATTACCAAATTGAATCGAACCATCATAGCAAAATATAAAACTCTTAAATTCTTT
TTTAGTTGCCTAGTCGCTGACGTTGATGCGCAAAGAGGAACATTTTACTACTCAGCGGCAGGACATCCGGACCAACTCTA
CCTTTCTGGAAATACGATAACAAAATTGATTCGATGTGGACCGATTATAGGTATTCTTGAAAATAAAGAATACGATTCTC
ATTCTTTGAAGATATTTAAAGGAGATAAGTTGTTTTTCTTTTCTGACGGAATGATAGAAGGATCTAATTCGTTTAATGAG
ACGTTCGGTGAAGATAGACTTTTGAAATTAATTTTAAATCATTCTTCCAAATCGGTTTCGGAAATCGTTTCGTTTGTATT
TTCTGATTTTCAAACTTTTCTTTCAGGTAAAGAAGTTGCGGATGACATTACGTTTTTGTCGGCAGAAGTATTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGATATATAGGGAAATAATTCAAATTTATTGAAAACGTATATATACTCCGTTTTATTTTAGATTTTTATTTCGGGCTCG
TATTTTTTTAAAGAGGAAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATCTTTTTCTATAAATTATTTCTTTTAAAAATCTTAACAATTTCTTAACTTCCTTTTTTGCGCCTTAACCCTACATTTA
TTGACTCAGTCTCTATTTTA

Product: serine/threonine kinase protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1731; Mature: 1731

Protein sequence:

>1731_residues
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Sequences:

>Translated_1731_residues
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TFGEDRLLKLILNHSSKSVSEIVSFVFSDFQTFLSGKEVADDITFLSAEVL

Specific function: Unknown

COG id: COG3899

COG function: function code R; Predicted ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 protein kinase domain [H]

Homologues:

Organism=Caenorhabditis elegans, GI115533552, Length=211, Percent_Identity=27.9620853080569, Blast_Score=72, Evalue=2e-12,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI115533550, Length=211, Percent_Identity=27.9620853080569, Blast_Score=72, Evalue=3e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011009
- InterPro:   IPR005543
- InterPro:   IPR000719
- InterPro:   IPR017441
- InterPro:   IPR017442
- InterPro:   IPR008271 [H]

Pfam domain/function: PF03793 PASTA; PF00069 Pkinase [H]

EC number: =2.7.11.1 [H]

Molecular weight: Translated: 199020; Mature: 199020

Theoretical pI: Translated: 7.48; Mature: 7.48

Prosite motif: PS50011 PROTEIN_KINASE_DOM

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIPGFKILDLFSEDYKFIIYKAFDQRFEKKVLIKTISQKNSFMTDVQGIYHDFRISNFI
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KGLKTQNPLELIRYGDIQALILEDFNSIPLAKLFPNGVGSVQKFFEIALEVSFALQEIHE
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEHH
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HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCC
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CCCEEEEEEHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCC
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CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCC
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CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
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HHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
RIKTLSPELQELLGVCSCLGKKFTLEFLSKLTFFNTIKLDQLLWLAVREGFLNIFFNENH
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCE
FLFEENLFSERIFSFSHDKIQQVIYDLLEESKRKKIHQHIGMTLLTIYGLESKDKILFQI
EEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHEECCCCCHHHHHHH
VQHLNHTIDTIEEESIKNDLTILNYKAGLQAKNSGSYESSLQYLNFALNFLNKEASVENF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
ELYTDVILETAETEYLLSNYERVESLLRLLENKNITNLQYIRKETISVRLYSKMNRIEEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLAGLSGMRRFKIYIPSFCFRVIFALFKELLISIILSIKKTDLELVCVKENLEPEYEALI
HHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHH
DLFAELGPSAFTYDQNLFALIVLKMFNVSLTKGVSRSSAIVYSGYGMIINQVLKDLNQAV
HHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHH
RYSKLAMDLNKKIPFDLVKWKVKYVYSAYICHWVRHITFDIGLLDEVHNGALQNGDIFFA
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
GFSLQAKIQKKIFASYSINELLTDIDNAEKYFKITRDDFASVISKSSHQFIKALAGKTFS
ECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
GCSLEDSEFQYQDFESEIMENKNYTALSYYYHDLTKLYYFSGQYKKAIIFAAKCEKLIRN
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHEEHHHHHHHHHH
AFGLIPFAEYWFYYGIVILANFHEFSFFQRIRYLKKLNIVFSYFKKWSRDCPENFMGLLE
HHCCCHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
LLSAEKKRIRGKVYDTIVGYERAIKLFQESGFISFQALSSEMAAEFHYKIGNFSLGNHYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCEE
GYAINLYSKWGALSKVSDLKSRFSNQPQLCFLNENDLNKILEQDLVLDREVILKYYNIIS
EHEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEIVLDNLLKKLMQITMQTAGATKAVYFNLYNENPMPYLIGQNEKTGIKIEKFPELDKPQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCC
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CCHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHCCCCEEEEECH
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HHCCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIQDKILSKPESTLCGIHVFTKYIPMMYVGGDIYDYEEISPGKVRIFLADATGHGVQAAL
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HHHHHHHHHHHCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECC
GHPDQLYLSGNTITKLIRCGPIIGILENKEYDSHSLKIFKGDKLFFFSDGMIEGSNSFNE
CCCCEEEECCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCEEEEEECCEECCCCCHHH
TFGEDRLLKLILNHSSKSVSEIVSFVFSDFQTFLSGKEVADDITFLSAEVL
HCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KGLKTQNPLELIRYGDIQALILEDFNSIPLAKLFPNGVGSVQKFFEIALEVSFALQEIHE
HHCCCCCCHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RRILHKSLCPGNIWIQPDTGIVRIVDFSSSTFSGKDISPSNTPHLPPEVLSYIAPELTGK
HHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEHH
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HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCC
REKEILLLQSSLDKASQGETRIVFITGVSGSGKSALIKSFLTSISDIFVQGKFNQYETSM
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CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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