| Definition | Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004461 |
| Length | 2,499,279 |
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Identifier: 27469313
GI number:
Start: 2470982
End: 2475883
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: SE2395
Alternate gene names: NA
Gene position: NA
Preceding gene: 27469315
Following gene: 27469312
Centisome position: NA
GC content: NA
Gene sequence:
>4902_bases ATGAAAAAGAGAAGACAAGGACCAATTAACAAGAGAGTGGATTTTCTATCCAACAAGGTAAACAAGTACTCGATTAGGAA GTTCACAGTAGGTACAGCTTCAATACTCGTGGGTGCTACGTTAATGTTTGGTGCCGCAGACAATGAGGCTAAAGCGGCTG AAGACAATCAATTAGAATCAGCTTCAAAAGAAGAACAGAAAGGTAGTCGTGATAATGAAAGCTCAAAACTTAATCAAGTC GATTTAGACAACGGATCACATAGTTCTGAGAAAACAACAAATGTAAACAATGCAACTGAAGTAAAAAAAGTTGAAGCACC AACGACAAGTGACGTATCTAAGCCTAAAGCTAATGAAGCAGTAGTGACGAACGAGTCAACTAAACCAAAAACAACAGAAG CACCAACTGTTAATGAGGAATCAATAGCTGAAACACCCAAAACCTCAACTACACAACAAGATTCGACTGAGAAGAATAAT CCATCTTTAAAAGATAATTTAAATTCATCCTCAACGACATCTAAAGAAAGTAAAACAGACGAACATTCTACTAAGCAAGC TCAAATGTCTACTAATAAATCAAATTTAGACACAAATGACTCTCCAACTCAAAGTGAGAAAACTTCATCACAAGCAAATA ACGACAGTACAGACAATCAGTCAGCACCTTCTAAACAATTAGATTCAAAACCATCAGAACAAAAAGTATATAAAACAAAA TTTAATGATGAACCTACTCAAGATGTTGAACACACGACAACTAAATTAAAAACACCTTCTATTTCAACAGATAGTTCAGT CAATGATAAGCAAGATTACACACGAAGTGCTGTAGCTAGTTTAGGTGTTGATTCTAATGAAACAGAAGCAATTACAAATG CAGTTAGAGATAATTTAGATTTAAAAGCTGCATCTAGAGAACAAATCAATGAAGCAATCATTGCTGAAGCACTAAAAAAA GACTTTTCTAACCCTGATTATGGTGTCGATACGCCATTAGCTCTGAACACATCTCAATCAAAAAATTCACCACATAAGAG TGCAAGTCCACGCATGAATTTAATGAGTTTAGCTGCTGAGCCTAATAGTGGTAAAAATGTGAATGATAAAGTTAAAATCA CAAACCCTACGCTTTCACTTAATAAGAGTAATAATCACGCTAATAACGTAATATGGCCAACAAGTAACGAACAATTTAAT TTAAAAGCAAATTATGAATTAGATGACAGCATAAAAGAGGGAGATACTTTTACTATTAAGTATGGTCAGTATATTAGACC GGGTGGTTTAGAACTTCCTGCAATAAAAACTCAACTACGTAGTAAGGATGGCTCTATTGTAGCTAATGGTGTATATGATA AAACTACAAATACGACGACTTATACATTTACTAACTATGTTGATCAATATCAAAATATTACAGGTAGTTTTGATTTAATT GCGACGCCTAAGAGGGAAACAGCAATTAAGGATAATCAGAATTATCCTATGGAAGTGACGATTGCTAACGAAGTAGTCAA AAAAGACTTCATTGTGGATTATGGTAATAAAAAGGACAATACAACTACAGCAGCGGTAGCAAATGTGGATAATGTAAATA ATAAACATAACGAAGTTGTTTATCTAAACCAAAATAACCAAAATCCTAAATATGCTAAATATTTCTCAACAGTAAAAAAT GGTAAATTTATACCAGGTGAAGTGAAAGTTTACGAAGTGACGGATACCAATGCGATGGTAGATAGCTTCAATCCTGATTT AAATAGTTCTAATGTAAAAGATGTGACAAGTCAATTTACACCTAAAGTAAGTGCAGATGGTACTAGAGTTGATATCAATT TTGCTAGAAGTATGGCAAATGGTAAAAAGTATATTGTAACTCAAGCAGTGAGACCAACGGGAACTGGAAATGTTTATACC GAATATTGGTTAACAAGAGATGGTACTACCAATACAAATGATTTTTATCGTGGAACGAAGTCTACAACGGTGACTTATCT CAATGGTTCTTCAACAGCACAGGGGGATAATCCTACATATAGTCTAGGTGACTATGTATGGTTAGATAAAAATAAAAACG GTGTTCAAGATGATGATGAGAAAGGTTTAGCAGGTGTTTATGTTACTCTTAAAGACAGTAACAATAGAGAATTACAACGT GTAACTACTGATCAATCTGGACATTATCAATTTGATAATTTACAAAATGGAACGTACACAGTCGAGTTTGCGATTCCTGA TAATTATACGCCATCTCCCGCAAATAATTCTACAAATGATGCAATAGATTCAGATGGTGAACGTGATGGTACACGTAAAG TAGTTGTTGCCAAAGGAACAATTAATAATGCTGATAATATGACTGTAGATACTGGCTTTTATTTAACTCCTAAATACAAT GTCGGAGATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTATCCAAGATGACAATGAAAAGGGAATTTCAAATGTCAAAGT GACGTTAAAAAATAAAAATGGAGATACCATTGGGACAACGACAACAGATTCAAATGGTAAATATGAATTCACAGGTTTAG AGAACGGGGATTACACAATAGAATTTGAGACGCCGGAAGGCTACACACCGACTAAACAAAACTCGGGAAGTGACGAAGGT AAAGATTCAAATGGTACGAAAACAACAGTCACAGTCAAAGATGCAGATAATAAAACAATAGACTCAGGTTTCTACAAGCC AATATATAACTTAGGTGACTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTATTCAAGACGACAGTGAAAAAGGGATTTCTG GTGTTAAAGTGACGTTAAAAGATAAAAATGGAAATGCCATTGGGACAACGACAACAGACGCAAGTGGTCATTATCAATTT AAAGGATTAGAAAATGGAAGCTACACAGTTGAGTTTGAGACACCATCAGGTTATACACCGACAAAAGCGAATTCAGGTCA AGATATAACTGTAGATTCCAACGGTATAACAACAACAGGTATCATTAACGGAGCTGATAATCTCACAATTGATAGTGGTT TCTACAAAACACCAAAATATAGTGTCGGAGATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTATCCAAGATGACAATGAA AAAGGAATTTCTGGTGTTAAAGTAACGTTAAAGGATGAAAAAGGAAATATAATTAGCACTACAACAACTGATGAAAATGG GAAGTATCAATTTGATAATTTAGATAGTGGTAATTACATTATTCATTTTGAGAAACCGGAAGGCATGACTCAAACTACAG CAAATTCTGGAAATGATGATGAAAAAGATGCTGATGGGGAAGATGTTCGTGTAACGATTACTGATCATGATGACTTTAGT ATAGATAATGGTTATTTTGACGATGATTCAGACAGTGACTCAGACGCAGATAGTGATTCAGACTCCGACAGTGACTCGGA CGCAGACAGCGATTCTGACGCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGTGATTCTGACTCAGACAGCGACTCGGATTCTGATA GTGATTCGGATTCCGATTCAGACAGTGACTCAGACGCAGATAGTGATTCTGACGCAGACAGTGACTCAGATTCAGATAGT GATTCTGACTCAGACAGCGACTCGGATTCTGATAGTGATTCGGATTCCGATTCAGACAGTGACTCAGACGCAGATAGTGA TTCGGACGCAGACAGTGACTCAGACGCAGATAGTGATTCGGATGCAGACAGCGACTCGGATTCAGATAGTGATTCGGATG CAGACAGCGACTCGGATTCAGATAGTGATTCGGATGCAGACAGCGACTCGGATTCTGACAGTGATTCGGACGCAGACAGT GACTCAGATTCAGACAGTGATTCGGACGCAGACAGCGACTCGGATTCTGATAGTGATTCGGACGCAGACAGTGACTCAGA TTCAGACAGTGACTCGGATTCAGACAGCGATTCGGATTCCGATTCAGACAGTGACTCGGATTCAGACAGTGACTCAGACT CCGACAGTGATTCCGATTCAGATAGCGACTCAGACGCAGATAGTGATTCCGATTCAGATAGCGACTCCGACGCAGATAGT GATTCGGACGCAGACAGTGACTCAGATTCAGACAGTGACTCAGATTCAGACAGTGATTCGGACGCAGACAGTGACTCCGA CTCCGACAGCGATTCAGACTCAGATAGTGACTCAGACGCAGACAGTGACTCGGACTCAGATAGTGATTCAGATGCAGAAA GCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCCGATTCAGACAGCGACTCCGACTCAGACAGTGATTCCGATTCAGACAGCGATTCG GACTCAGATAGTGACTCAGACGCAGATAGTGATTCCGATTCAGATAGCGACTCCGATTCTGATAGTGACTCCGATTCAGA TAGCGACTCCGATTCAGATAGTGATTCGGACGCAGACAGTGACTCGTACTCAGATAGTGACTCCGATTCAGACAGTGATT CGGATTCCGATAGCGATTCGGATTCCGATAGTGACTCGGATTCAGACAGTGATTCGGACTCAGACAGCGACTCCGATTCA GATAGTGATTCCGACTCAGACAGCGATTCGGATTCCGATAGTGACTCGGATTCAGACAGTGATTCGGACTCAGACAGCGA TTCCGATTCCGATAGTGACTCGGATTCAGACAGTGATTCGGACTCAGACAGCGATTCCGATTCAGACAGTGACTCGGACT CAGATAGTGACTCCGATTCAGACAGCGACTCGGATTCTGATAAAAATGCAAAAGATAAATTACCTGATACAGGAGCAAAT GAAGATCATGATTCTAAAGGCACATTACTTGGAACTTTATTTGCAGGTTTAGGAGCATTATTATTAGGAAGACGTCGTAA AAAAGATAATAAAGAAAAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATGCTTATAAAGTATTTACATAAAAATGTAAATGCAATTTACAAGTAAATATTCAAATTATTTCCTTGTAAAATATTT ATTTTAACTGGAGGTATAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases CGCTATTGATTCATTCATAAGTTATTTCAAGCCAGGTCTATATGGCCTGGTTTGAAATCATATTAAATTGAAAGGAGAAA AAGATGAGTATGGAAAATCA
Product: Ser-Asp rich fibrinogen-binding,bone sialoprotein-binding protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: NA
Protein sequence:
>1633_residues MKKRRQGPINKRVDFLSNKVNKYSIRKFTVGTASILVGATLMFGAADNEAKAAEDNQLESASKEEQKGSRDNESSKLNQV DLDNGSHSSEKTTNVNNATEVKKVEAPTTSDVSKPKANEAVVTNESTKPKTTEAPTVNEESIAETPKTSTTQQDSTEKNN PSLKDNLNSSSTTSKESKTDEHSTKQAQMSTNKSNLDTNDSPTQSEKTSSQANNDSTDNQSAPSKQLDSKPSEQKVYKTK FNDEPTQDVEHTTTKLKTPSISTDSSVNDKQDYTRSAVASLGVDSNETEAITNAVRDNLDLKAASREQINEAIIAEALKK DFSNPDYGVDTPLALNTSQSKNSPHKSASPRMNLMSLAAEPNSGKNVNDKVKITNPTLSLNKSNNHANNVIWPTSNEQFN LKANYELDDSIKEGDTFTIKYGQYIRPGGLELPAIKTQLRSKDGSIVANGVYDKTTNTTTYTFTNYVDQYQNITGSFDLI ATPKRETAIKDNQNYPMEVTIANEVVKKDFIVDYGNKKDNTTTAAVANVDNVNNKHNEVVYLNQNNQNPKYAKYFSTVKN GKFIPGEVKVYEVTDTNAMVDSFNPDLNSSNVKDVTSQFTPKVSADGTRVDINFARSMANGKKYIVTQAVRPTGTGNVYT EYWLTRDGTTNTNDFYRGTKSTTVTYLNGSSTAQGDNPTYSLGDYVWLDKNKNGVQDDDEKGLAGVYVTLKDSNNRELQR VTTDQSGHYQFDNLQNGTYTVEFAIPDNYTPSPANNSTNDAIDSDGERDGTRKVVVAKGTINNADNMTVDTGFYLTPKYN VGDYVWEDTNKDGIQDDNEKGISNVKVTLKNKNGDTIGTTTTDSNGKYEFTGLENGDYTIEFETPEGYTPTKQNSGSDEG KDSNGTKTTVTVKDADNKTIDSGFYKPIYNLGDYVWEDTNKDGIQDDSEKGISGVKVTLKDKNGNAIGTTTTDASGHYQF KGLENGSYTVEFETPSGYTPTKANSGQDITVDSNGITTTGIINGADNLTIDSGFYKTPKYSVGDYVWEDTNKDGIQDDNE KGISGVKVTLKDEKGNIISTTTTDENGKYQFDNLDSGNYIIHFEKPEGMTQTTANSGNDDEKDADGEDVRVTITDHDDFS IDNGYFDDDSDSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDADSDSDSDS DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDADSDSDADSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADS DSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADS DSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDAESDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS DSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSYSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDKNAKDKLPDTGAN EDHDSKGTLLGTLFAGLGALLLGRRRKKDNKEK
Sequences:
NA
Specific function: NA
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: NA
Metaboloic importance: NA
Operon status: NA
Operon components: NA
Similarity: NA
Homologues:
NA
Paralogues:
NA
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: NA
Theoretical pI: NA
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
NA
Transmembrane regions:
NA
Cys/Met content:
NA
Secondary structure: NA
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: NA
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: NA
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA