Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_012778 |
Length | 2,144,190 |
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The map label for this gene is 238917536
Identifier: 238917536
GI number: 238917536
Start: 1668762
End: 1671479
Strand: Reverse
Name: 238917536
Synonym: EUBELI_01615
Alternate gene names: NA
Gene position: 1671479-1668762 (Counterclockwise)
Preceding gene: 238917537
Following gene: 238917535
Centisome position: 77.95
GC content: 34.92
Gene sequence:
>2718_bases ATGAAGAAGTCAAAATTTAAAACAATTTTAGGGAAAATCAAACCATATGCCATGCCAGGGATTATTACATGTCTTGTTAT GGTTGTTATTCTTATTCTTAAAGGTATATGGCCGTTTGGAAATGAACGTATAGATTATTTTGACAATATGCAGCAGGTTG CACCTTTATATGCGCATTTATGGGACTGGATGCATGGAAAAGCATCGTTGTGGTTTGACTGGTATACAGGACTTGGAACA AATGTGTCAATGAGTATATCTGCATTCAGTATGCTGACACCATTTAATCTGTTATTATATGTTATTCCAAGAAATTACAT ATTAGAGAGTATATCCATACTTACAATAGTAAAAATGGTGTTTATGTCAATTGCCATGTATTCTCTGATTAATAAGAAAT ATAATAATCTTATATACGGTTTAAAGGTTGCATATTCGTGTATGTATGCATTCTGCGGATATGTAATATTATATGGCTCA TGTTTTACACCGTGGATGGATATAGTTGCAATATTTCCAATTGTTATAATGGCATATGACCACATGGTTGAAACAGGTAA AAAAATGTTTTATATATGTATGATTGCGTTAAGTTTTATAATTAATTATTACTTAAGTGCGATGGCAGTTATATATATTT TCCTTATATGTGGCATCAGAATGATTCTTATGCAGGAAAAGAACAGGTGGAAGGAAACTGCATGGAATGCCGGGATAGGA ACATTTGGCGGAATAGGTCTGTCGGCTTTTGTGTTAGTGCCTGTATTTGCACAGCTGTCATCATCACAAAGAGGTGGTGC CGGGAAAGGCATTCTGTCACAGTATATTGGGTGGGTGACAAGCTCAGTAGTGACAGATGGAGCAATGGCGGCACTTCAGA GATGGATGATGTTATATGGACTGGCATTTGTAATTGCTGTTATAGTAACAGGAATCAGGAAATACAGAAAAGACAGGAAA GAATTAATATATGTTGTGGCAATGCTGGTTGTAGCGTTGGGACCTGTTATTATGGAAGCTGCTAATCTTATGTGGCATTT TGGTTCATATAACGGATATACATTAAGGAATGGCTTTATAATAGCATTTACACTCATATGCATTGCAGCAGGATATTCTG AAAGAATGTTTATTAATGAGCCGTTGAAAACAGTTGCTTATATCAGACAGGGGATATTTGCAGTTATTGCAAGTGCCGTA TATGTGATGATATATAATATTCTTCCGGTTAATAATGAGATGAAAGCGCTTGCATTTTTTACAATAGTATTTGTGGCTAT GTTCATTATTTATATGTTAATGATTACAGGGAAGAAACATAAATTTAATCCTAAGTCTTTAATATCAATAATGATTGTGG AACTTTTTATTGGCGCTTATGCTCTTATAGGACCTCCGAAATTTTATACATATGAAGATTACCAGATTGGAGATTATGTG CAGTATGCCAATAATGTATCAGACAGTCTTGATATAGATGAGTCTGCAACTGACAGAATCGTAAATCCTGATATAAGTCT TAATGCTAATTATCCGCTTATATTAAGAAGGGGTGCATTATCAAGTTTTACAGCTGCTCTCCAGAATGACACACAAAGCT ATGCTAAAAAATGGGGATATTCAAAGTATTTCCTCTGGCTGTTAGATTCGGGTGGAACCGTGTTTACTAATTCTATCCTC CATGTGACAGAGGCAGTCAATATCAATGAGCTTGACAGTAATCTTTTTACACTGAAAAAAAAGGAAGGCGATTACAGCCT GTATAGTAATAACTATACTCTGCCATTTGGATTCTGCATTGATGACAGTTTCAGCAAGCTGGATATGACTAATGTTGACT GGATAACTTATCATAACAGATTTTATAAAGCAATGACAGGCGATAGTGAATCACTTGTTACAAGGATATATCCAGAGAGT GCCAATACAGGTAATATTAATACAATGACAATTTCTGTTGGTGACAGAAGTGCATTGTATATGAGTATAGCTGATATTAA AAAGCCAAATGCAGATGCTAATGCATCAGCTTTAGACAGCAGCATGCATGTTTATGTTAATGGAGAAGCTGTACTTGTAC CAACGCTTGGAGATGTTAAAAACACTGCATATTTTACAGATTATAATAACAATCTTTTATATCTTGGCATATTTGAAAAT GAAGAAGTTGAGATAAAGGTAGAGTATGACAAGACGAAATATATGAAGCAGAGCAGGATAACAGTAGGATGTCTTAATAT GAATAAAATGGAAAGCCTTTGTGCAAAATTTTCAGAGCCGGATAAACAGACAGAGGTTTCATATACTGATAATACACTGA CTGTTAATATAAATGGAGATGGAACTAATAATTATGCCCTTATTCCTGTAATTCACAGTGATAACTGGAAAGTTACTGTG AACGGTAGGATAGTAAAGACAAAAGAGGTTGCCGGATTATTTACGGGAGTGCAGCTTCAGACAGGAGAGAATACGGTTGC CTTTACATTTGTTCCAAAGGGAAAGAATACAGGAATGATGATTACAATGTTCACCCTTATAACAATAATTGCCTGCCTTG TAATTAATCGTTTCAGAAAAATAAATGTTCCGGTATGGGCTAAAAAGTGTGCGGAATATATATATATTGGTTTATTTGCA GTAATAGTAGTTGCAATGTTTGCTGTTCCGGCAGTAACAACTATTCCATCTGCTATTTACCACATAATAGTGAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTCCGATAACATGACATATATACTTTATAGCATAAGTCTGGATGAAGAGTAATCTGGAAATGACAGATTTTATTAAATAG TAAGGAAAGGCAGATTTTGT
Downstream 100 bases:
>100_bases GGCATTAAATGAGCAGACTAAAGGATAATGATAATTTTAAGCTGTTGCTTAAAATATTAATAATATTTGCGATATCACGA CTGATTATGTTAGTAATGGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein; Transmembrane Protein; Bacterial Membrane Protein YfhO; Copper ABC Transporter Permease
Number of amino acids: Translated: 905; Mature: 905
Protein sequence:
>905_residues MKKSKFKTILGKIKPYAMPGIITCLVMVVILILKGIWPFGNERIDYFDNMQQVAPLYAHLWDWMHGKASLWFDWYTGLGT NVSMSISAFSMLTPFNLLLYVIPRNYILESISILTIVKMVFMSIAMYSLINKKYNNLIYGLKVAYSCMYAFCGYVILYGS CFTPWMDIVAIFPIVIMAYDHMVETGKKMFYICMIALSFIINYYLSAMAVIYIFLICGIRMILMQEKNRWKETAWNAGIG TFGGIGLSAFVLVPVFAQLSSSQRGGAGKGILSQYIGWVTSSVVTDGAMAALQRWMMLYGLAFVIAVIVTGIRKYRKDRK ELIYVVAMLVVALGPVIMEAANLMWHFGSYNGYTLRNGFIIAFTLICIAAGYSERMFINEPLKTVAYIRQGIFAVIASAV YVMIYNILPVNNEMKALAFFTIVFVAMFIIYMLMITGKKHKFNPKSLISIMIVELFIGAYALIGPPKFYTYEDYQIGDYV QYANNVSDSLDIDESATDRIVNPDISLNANYPLILRRGALSSFTAALQNDTQSYAKKWGYSKYFLWLLDSGGTVFTNSIL HVTEAVNINELDSNLFTLKKKEGDYSLYSNNYTLPFGFCIDDSFSKLDMTNVDWITYHNRFYKAMTGDSESLVTRIYPES ANTGNINTMTISVGDRSALYMSIADIKKPNADANASALDSSMHVYVNGEAVLVPTLGDVKNTAYFTDYNNNLLYLGIFEN EEVEIKVEYDKTKYMKQSRITVGCLNMNKMESLCAKFSEPDKQTEVSYTDNTLTVNINGDGTNNYALIPVIHSDNWKVTV NGRIVKTKEVAGLFTGVQLQTGENTVAFTFVPKGKNTGMMITMFTLITIIACLVINRFRKINVPVWAKKCAEYIYIGLFA VIVVAMFAVPAVTTIPSAIYHIIVK
Sequences:
>Translated_905_residues MKKSKFKTILGKIKPYAMPGIITCLVMVVILILKGIWPFGNERIDYFDNMQQVAPLYAHLWDWMHGKASLWFDWYTGLGT NVSMSISAFSMLTPFNLLLYVIPRNYILESISILTIVKMVFMSIAMYSLINKKYNNLIYGLKVAYSCMYAFCGYVILYGS CFTPWMDIVAIFPIVIMAYDHMVETGKKMFYICMIALSFIINYYLSAMAVIYIFLICGIRMILMQEKNRWKETAWNAGIG TFGGIGLSAFVLVPVFAQLSSSQRGGAGKGILSQYIGWVTSSVVTDGAMAALQRWMMLYGLAFVIAVIVTGIRKYRKDRK ELIYVVAMLVVALGPVIMEAANLMWHFGSYNGYTLRNGFIIAFTLICIAAGYSERMFINEPLKTVAYIRQGIFAVIASAV YVMIYNILPVNNEMKALAFFTIVFVAMFIIYMLMITGKKHKFNPKSLISIMIVELFIGAYALIGPPKFYTYEDYQIGDYV QYANNVSDSLDIDESATDRIVNPDISLNANYPLILRRGALSSFTAALQNDTQSYAKKWGYSKYFLWLLDSGGTVFTNSIL HVTEAVNINELDSNLFTLKKKEGDYSLYSNNYTLPFGFCIDDSFSKLDMTNVDWITYHNRFYKAMTGDSESLVTRIYPES ANTGNINTMTISVGDRSALYMSIADIKKPNADANASALDSSMHVYVNGEAVLVPTLGDVKNTAYFTDYNNNLLYLGIFEN EEVEIKVEYDKTKYMKQSRITVGCLNMNKMESLCAKFSEPDKQTEVSYTDNTLTVNINGDGTNNYALIPVIHSDNWKVTV NGRIVKTKEVAGLFTGVQLQTGENTVAFTFVPKGKNTGMMITMFTLITIIACLVINRFRKINVPVWAKKCAEYIYIGLFA VIVVAMFAVPAVTTIPSAIYHIIVK >Mature_905_residues MKKSKFKTILGKIKPYAMPGIITCLVMVVILILKGIWPFGNERIDYFDNMQQVAPLYAHLWDWMHGKASLWFDWYTGLGT NVSMSISAFSMLTPFNLLLYVIPRNYILESISILTIVKMVFMSIAMYSLINKKYNNLIYGLKVAYSCMYAFCGYVILYGS CFTPWMDIVAIFPIVIMAYDHMVETGKKMFYICMIALSFIINYYLSAMAVIYIFLICGIRMILMQEKNRWKETAWNAGIG TFGGIGLSAFVLVPVFAQLSSSQRGGAGKGILSQYIGWVTSSVVTDGAMAALQRWMMLYGLAFVIAVIVTGIRKYRKDRK ELIYVVAMLVVALGPVIMEAANLMWHFGSYNGYTLRNGFIIAFTLICIAAGYSERMFINEPLKTVAYIRQGIFAVIASAV YVMIYNILPVNNEMKALAFFTIVFVAMFIIYMLMITGKKHKFNPKSLISIMIVELFIGAYALIGPPKFYTYEDYQIGDYV QYANNVSDSLDIDESATDRIVNPDISLNANYPLILRRGALSSFTAALQNDTQSYAKKWGYSKYFLWLLDSGGTVFTNSIL HVTEAVNINELDSNLFTLKKKEGDYSLYSNNYTLPFGFCIDDSFSKLDMTNVDWITYHNRFYKAMTGDSESLVTRIYPES ANTGNINTMTISVGDRSALYMSIADIKKPNADANASALDSSMHVYVNGEAVLVPTLGDVKNTAYFTDYNNNLLYLGIFEN EEVEIKVEYDKTKYMKQSRITVGCLNMNKMESLCAKFSEPDKQTEVSYTDNTLTVNINGDGTNNYALIPVIHSDNWKVTV NGRIVKTKEVAGLFTGVQLQTGENTVAFTFVPKGKNTGMMITMFTLITIIACLVINRFRKINVPVWAKKCAEYIYIGLFA VIVVAMFAVPAVTTIPSAIYHIIVK
Specific function: Unknown
COG id: COG4485
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 101877; Mature: 101877
Theoretical pI: Translated: 8.74; Mature: 8.74
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 4.9 %Met (Translated Protein) 6.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 4.9 %Met (Mature Protein) 6.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKSKFKTILGKIKPYAMPGIITCLVMVVILILKGIWPFGNERIDYFDNMQQVAPLYAHL CCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH WDWMHGKASLWFDWYTGLGTNVSMSISAFSMLTPFNLLLYVIPRNYILESISILTIVKMV HHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEHHHHHHHCHHHHHEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH FMSIAMYSLINKKYNNLIYGLKVAYSCMYAFCGYVILYGSCFTPWMDIVAIFPIVIMAYD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HMVETGKKMFYICMIALSFIINYYLSAMAVIYIFLICGIRMILMQEKNRWKETAWNAGIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TFGGIGLSAFVLVPVFAQLSSSQRGGAGKGILSQYIGWVTSSVVTDGAMAALQRWMMLYG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAFVIAVIVTGIRKYRKDRKELIYVVAMLVVALGPVIMEAANLMWHFGSYNGYTLRNGFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEECCHH IAFTLICIAAGYSERMFINEPLKTVAYIRQGIFAVIASAVYVMIYNILPVNNEMKALAFF HHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH TIVFVAMFIIYMLMITGKKHKFNPKSLISIMIVELFIGAYALIGPPKFYTYEDYQIGDYV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCHHH QYANNVSDSLDIDESATDRIVNPDISLNANYPLILRRGALSSFTAALQNDTQSYAKKWGY HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC SKYFLWLLDSGGTVFTNSILHVTEAVNINELDSNLFTLKKKEGDYSLYSNNYTLPFGFCI CEEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEECCCEEEEEEEEE DDSFSKLDMTNVDWITYHNRFYKAMTGDSESLVTRIYPESANTGNINTMTISVGDRSALY CCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHCCCCHHHEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEE MSIADIKKPNADANASALDSSMHVYVNGEAVLVPTLGDVKNTAYFTDYNNNLLYLGIFEN EEEHHCCCCCCCCCHHHCCCCEEEEECCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEECC EEVEIKVEYDKTKYMKQSRITVGCLNMNKMESLCAKFSEPDKQTEVSYTDNTLTVNINGD CEEEEEEEECHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEECC GTNNYALIPVIHSDNWKVTVNGRIVKTKEVAGLFTGVQLQTGENTVAFTFVPKGKNTGMM CCCCEEEEEEEECCCEEEEECCEEEEEHHHHHHHCCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCHH ITMFTLITIIACLVINRFRKINVPVWAKKCAEYIYIGLFAVIVVAMFAVPAVTTIPSAIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HIIVK HHCCC >Mature Secondary Structure MKKSKFKTILGKIKPYAMPGIITCLVMVVILILKGIWPFGNERIDYFDNMQQVAPLYAHL CCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH WDWMHGKASLWFDWYTGLGTNVSMSISAFSMLTPFNLLLYVIPRNYILESISILTIVKMV HHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEHHHHHHHCHHHHHEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH FMSIAMYSLINKKYNNLIYGLKVAYSCMYAFCGYVILYGSCFTPWMDIVAIFPIVIMAYD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HMVETGKKMFYICMIALSFIINYYLSAMAVIYIFLICGIRMILMQEKNRWKETAWNAGIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TFGGIGLSAFVLVPVFAQLSSSQRGGAGKGILSQYIGWVTSSVVTDGAMAALQRWMMLYG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAFVIAVIVTGIRKYRKDRKELIYVVAMLVVALGPVIMEAANLMWHFGSYNGYTLRNGFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEECCHH IAFTLICIAAGYSERMFINEPLKTVAYIRQGIFAVIASAVYVMIYNILPVNNEMKALAFF HHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH TIVFVAMFIIYMLMITGKKHKFNPKSLISIMIVELFIGAYALIGPPKFYTYEDYQIGDYV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCHHH QYANNVSDSLDIDESATDRIVNPDISLNANYPLILRRGALSSFTAALQNDTQSYAKKWGY HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC SKYFLWLLDSGGTVFTNSILHVTEAVNINELDSNLFTLKKKEGDYSLYSNNYTLPFGFCI CEEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEECCCEEEEEEEEE DDSFSKLDMTNVDWITYHNRFYKAMTGDSESLVTRIYPESANTGNINTMTISVGDRSALY CCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHCCCCHHHEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEE MSIADIKKPNADANASALDSSMHVYVNGEAVLVPTLGDVKNTAYFTDYNNNLLYLGIFEN EEEHHCCCCCCCCCHHHCCCCEEEEECCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEECC EEVEIKVEYDKTKYMKQSRITVGCLNMNKMESLCAKFSEPDKQTEVSYTDNTLTVNINGD CEEEEEEEECHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEECC GTNNYALIPVIHSDNWKVTVNGRIVKTKEVAGLFTGVQLQTGENTVAFTFVPKGKNTGMM CCCCEEEEEEEECCCEEEEECCEEEEEHHHHHHHCCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCHH ITMFTLITIIACLVINRFRKINVPVWAKKCAEYIYIGLFAVIVVAMFAVPAVTTIPSAIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HIIVK HHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA