Definition Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome.
Accession NC_012778
Length 2,144,190

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The map label for this gene is pip [H]

Identifier: 238917395

GI number: 238917395

Start: 1527392

End: 1529137

Strand: Direct

Name: pip [H]

Synonym: EUBELI_01472

Alternate gene names: 238917395

Gene position: 1527392-1529137 (Clockwise)

Preceding gene: 238917394

Following gene: 238917396

Centisome position: 71.23

GC content: 39.18

Gene sequence:

>1746_bases
ATGAAAAATATATTTAAGATTATACGGGCTGACCTTCGCCACATAAAAACAAATGTAATTGCACTATGCGTAATTATCGG
TCTTACCGTTATTCCTGCATTGTATTCGTGGTTTAATATCCTGTCAAACTGGGATCCATATGGACAGGCTTCCACAAGCA
GGATTAAAGTTGCCGTTGTATCTGTTGACAAAGGTACTTCTCTTGAAGGAACGGAGCTTAATGTCGGTGACACCATAATT
GATGCACTTAAAACTAATAACACTATCGGTTGGCAGTTTGTTGCTTCATCAGATGAAGCAATCGAAGGCGTATACAGCGG
TGAGTATTATGCAGCCCTCGTTGTTCCAGAGAATTTTTCCAAGAATCTTATAAGCTTCTTAAGTGATTCCATGGAACATC
CTCAGTTAAAATATTACTGTAACCAGAAAGCAAACGCTATTGCACCTAAGATAACAGACAAGGCTAAAACAGCAGTTCAG
CAGCAGGTTAACCAGACATTTATAGATACAATCGTATCTACGATTGCCGGAACTGGCGACTCAGTTATCAAAGATTCAGA
TAAAGAAACCGGTTCTCTTATGGATGCAGTTATTAACAGACTTACATCCGCAAGGACTACACTTTCAACATACGATGTAA
TTCTTAACTCAATGCTTGCAATTACTGACCTTACATCATCAATAAGCAGCAGTTCAAACAGTGCTGCACCGCAAGTTTAT
ACACAATTACAGTTACAGCAGCAGCAGTTAATAACCTTACAGGCACTTGTAAATGGTAATTCCGCTGAATCTTTAAATGA
ATTATCATCTGCTCTTTCAAACCAGATGTCCCAGATTCAAAGCATTATGAGTTCATTAACAGAGCTTTATTCTGACATGA
ACATGGATGTTGCAGACCTGTCTGCTGCAATTAAGCTTACATCGGGCTCACTCACTCAGACTAAAGAGCTTCTCAGTGAC
CTTGAGACAAAGCTTGATAACGCAATTAATACATTAAACACAATCACTGAACAGGATACATATGGTTTATTATCAGAGAT
GTTAAATGCAAATGCCAATACTTTGGGAGATTTTCTCTCTGCACCTGTAAATATAACAACAGAGCAGGTATATGCTGTTA
AAAGCTATGGAACAAGCGCTTCACCATTCTACACAATACTTGCACTGTGGTTTGGTGGACTTATACTTGTTGCTATTATG
CACACACCTGTGCATCCTGCTCCGGACATTCCAGCAGATGCAAAGAGATATGAAAAATTCTTCGGAAGGTATTTTATCTT
CTTTGCAGTAGGACAGCTTCAGGCACTGCTTATAACACTTGGAAATCTTCTCTACATAGGAATCCAGTGTTACCACCCAT
TCCTTTACTGGGTTGCATGTGCATTCTCAAGCTTCGTATTCACCTTCTTTATGTACAGCCTTACTGTTGCATTTGGAAAT
ATCGGTGAAGCACTTGGAATTGTCCTGCTCGTTATACAGGTTGCCGGCTCAGGCGGTACATTCCCTATAGAAGTACTTCC
TAACGCCTACCAGATAATATACCGATTCCTGCTCTTCCCATATTCAATGGATGCATTAAGAGAATGTATAGCAGGAATGT
ACAGATATGATTACATTAAGAATCTCGCTTTTCTTTCTATATATATAGTTGTTTCGCTGATTATCGGATTGTTCTTACAG
AAACCATTTGAGAAGCTGAATCATATGATTGAGAGAAGTAAGGAGAAGTCGGGGGTAATGTTGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGCAAGAAAGCTTAATGAGCTCAATATTGAGATTAAGGAAAAACAGGCTGATACTTCTCTTACAGACAGTATCAAAGCA
TTTTTAAGTGAGGTACAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAGTTGCTCCCCTAAAGCACGCCCAGCCGTGTATATTAGTAAAATCAAAACACGCTTCCGCTCGGATTCCGACGCAGCG
GTACTAGGTTCGCTGGGATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 581; Mature: 581

Protein sequence:

>581_residues
MKNIFKIIRADLRHIKTNVIALCVIIGLTVIPALYSWFNILSNWDPYGQASTSRIKVAVVSVDKGTSLEGTELNVGDTII
DALKTNNTIGWQFVASSDEAIEGVYSGEYYAALVVPENFSKNLISFLSDSMEHPQLKYYCNQKANAIAPKITDKAKTAVQ
QQVNQTFIDTIVSTIAGTGDSVIKDSDKETGSLMDAVINRLTSARTTLSTYDVILNSMLAITDLTSSISSSSNSAAPQVY
TQLQLQQQQLITLQALVNGNSAESLNELSSALSNQMSQIQSIMSSLTELYSDMNMDVADLSAAIKLTSGSLTQTKELLSD
LETKLDNAINTLNTITEQDTYGLLSEMLNANANTLGDFLSAPVNITTEQVYAVKSYGTSASPFYTILALWFGGLILVAIM
HTPVHPAPDIPADAKRYEKFFGRYFIFFAVGQLQALLITLGNLLYIGIQCYHPFLYWVACAFSSFVFTFFMYSLTVAFGN
IGEALGIVLLVIQVAGSGGTFPIEVLPNAYQIIYRFLLFPYSMDALRECIAGMYRYDYIKNLAFLSIYIVVSLIIGLFLQ
KPFEKLNHMIERSKEKSGVML

Sequences:

>Translated_581_residues
MKNIFKIIRADLRHIKTNVIALCVIIGLTVIPALYSWFNILSNWDPYGQASTSRIKVAVVSVDKGTSLEGTELNVGDTII
DALKTNNTIGWQFVASSDEAIEGVYSGEYYAALVVPENFSKNLISFLSDSMEHPQLKYYCNQKANAIAPKITDKAKTAVQ
QQVNQTFIDTIVSTIAGTGDSVIKDSDKETGSLMDAVINRLTSARTTLSTYDVILNSMLAITDLTSSISSSSNSAAPQVY
TQLQLQQQQLITLQALVNGNSAESLNELSSALSNQMSQIQSIMSSLTELYSDMNMDVADLSAAIKLTSGSLTQTKELLSD
LETKLDNAINTLNTITEQDTYGLLSEMLNANANTLGDFLSAPVNITTEQVYAVKSYGTSASPFYTILALWFGGLILVAIM
HTPVHPAPDIPADAKRYEKFFGRYFIFFAVGQLQALLITLGNLLYIGIQCYHPFLYWVACAFSSFVFTFFMYSLTVAFGN
IGEALGIVLLVIQVAGSGGTFPIEVLPNAYQIIYRFLLFPYSMDALRECIAGMYRYDYIKNLAFLSIYIVVSLIIGLFLQ
KPFEKLNHMIERSKEKSGVML
>Mature_581_residues
MKNIFKIIRADLRHIKTNVIALCVIIGLTVIPALYSWFNILSNWDPYGQASTSRIKVAVVSVDKGTSLEGTELNVGDTII
DALKTNNTIGWQFVASSDEAIEGVYSGEYYAALVVPENFSKNLISFLSDSMEHPQLKYYCNQKANAIAPKITDKAKTAVQ
QQVNQTFIDTIVSTIAGTGDSVIKDSDKETGSLMDAVINRLTSARTTLSTYDVILNSMLAITDLTSSISSSSNSAAPQVY
TQLQLQQQQLITLQALVNGNSAESLNELSSALSNQMSQIQSIMSSLTELYSDMNMDVADLSAAIKLTSGSLTQTKELLSD
LETKLDNAINTLNTITEQDTYGLLSEMLNANANTLGDFLSAPVNITTEQVYAVKSYGTSASPFYTILALWFGGLILVAIM
HTPVHPAPDIPADAKRYEKFFGRYFIFFAVGQLQALLITLGNLLYIGIQCYHPFLYWVACAFSSFVFTFFMYSLTVAFGN
IGEALGIVLLVIQVAGSGGTFPIEVLPNAYQIIYRFLLFPYSMDALRECIAGMYRYDYIKNLAFLSIYIVVSLIIGLFLQ
KPFEKLNHMIERSKEKSGVML

Specific function: Required for phage infection [H]

COG id: COG1511

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013525
- InterPro:   IPR017501
- InterPro:   IPR017500 [H]

Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63944; Mature: 63944

Theoretical pI: Translated: 4.78; Mature: 4.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNIFKIIRADLRHIKTNVIALCVIIGLTVIPALYSWFNILSNWDPYGQASTSRIKVAVV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEE
SVDKGTSLEGTELNVGDTIIDALKTNNTIGWQFVASSDEAIEGVYSGEYYAALVVPENFS
EECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHH
KNLISFLSDSMEHPQLKYYCNQKANAIAPKITDKAKTAVQQQVNQTFIDTIVSTIAGTGD
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SVIKDSDKETGSLMDAVINRLTSARTTLSTYDVILNSMLAITDLTSSISSSSNSAAPQVY
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
TQLQLQQQQLITLQALVNGNSAESLNELSSALSNQMSQIQSIMSSLTELYSDMNMDVADL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
SAAIKLTSGSLTQTKELLSDLETKLDNAINTLNTITEQDTYGLLSEMLNANANTLGDFLS
HHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC
APVNITTEQVYAVKSYGTSASPFYTILALWFGGLILVAIMHTPVHPAPDIPADAKRYEKF
CCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
FGRYFIFFAVGQLQALLITLGNLLYIGIQCYHPFLYWVACAFSSFVFTFFMYSLTVAFGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGEALGIVLLVIQVAGSGGTFPIEVLPNAYQIIYRFLLFPYSMDALRECIAGMYRYDYIK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLAFLSIYIVVSLIIGLFLQKPFEKLNHMIERSKEKSGVML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKNIFKIIRADLRHIKTNVIALCVIIGLTVIPALYSWFNILSNWDPYGQASTSRIKVAVV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEE
SVDKGTSLEGTELNVGDTIIDALKTNNTIGWQFVASSDEAIEGVYSGEYYAALVVPENFS
EECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHH
KNLISFLSDSMEHPQLKYYCNQKANAIAPKITDKAKTAVQQQVNQTFIDTIVSTIAGTGD
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SVIKDSDKETGSLMDAVINRLTSARTTLSTYDVILNSMLAITDLTSSISSSSNSAAPQVY
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
TQLQLQQQQLITLQALVNGNSAESLNELSSALSNQMSQIQSIMSSLTELYSDMNMDVADL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
SAAIKLTSGSLTQTKELLSDLETKLDNAINTLNTITEQDTYGLLSEMLNANANTLGDFLS
HHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC
APVNITTEQVYAVKSYGTSASPFYTILALWFGGLILVAIMHTPVHPAPDIPADAKRYEKF
CCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
FGRYFIFFAVGQLQALLITLGNLLYIGIQCYHPFLYWVACAFSSFVFTFFMYSLTVAFGN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGEALGIVLLVIQVAGSGGTFPIEVLPNAYQIIYRFLLFPYSMDALRECIAGMYRYDYIK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLAFLSIYIVVSLIIGLFLQKPFEKLNHMIERSKEKSGVML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8366036 [H]