| Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012778 |
| Length | 2,144,190 |
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The map label for this gene is pip [H]
Identifier: 238917393
GI number: 238917393
Start: 1524882
End: 1527029
Strand: Direct
Name: pip [H]
Synonym: EUBELI_01470
Alternate gene names: 238917393
Gene position: 1524882-1527029 (Clockwise)
Preceding gene: 238917382
Following gene: 238917394
Centisome position: 71.12
GC content: 37.34
Gene sequence:
>2148_bases ATGATATTTAAGATTTTCAAAAGAGATTTGAAAGGTCTTAGCAGGAATATTCTGGCTTTAGCCATTGCACTTGGTCTGTG CCTTATTCCATCGCTTTACGCATGGTTTAACATATATTCCAACTGGGATCCTTACGCAAACACTGCGTCCGTCCAGATTG CTATTGTTTCTGAAGATGAAGGCTACTCTGAATCTGATGATTCCACTATCAATATGGGAGCACAGATTGTTGAACAGCTT CATTCTAATGATAAATTAGGCTGGCGTTTTCCGGAAACTAAAGATGAAGCCATGAATAAACTGAATGCCGGGAAGTACTA TGCCGTTATCGTTGTTGGTGAGGACTTTTCACGAAGCCTGTATGACTTCCTTGACAATGGTCTTAATCCACCAACAGTTA CATACTATGAGAATTCCAAGAAAAATGCTGTTGCTTCCAAGATTACAGATACAGGAAAAAGCACTCTTCAGAACACTATC AACTCCGAATTCATTGATGTGTGTGTTAAGACTATTATGCAGGGGCTTAACGAAATAGCTGAAAATGATCCTTCAATCAT AGAAAAGACAGTTAAGGACTTACAAAGCATTTCAGCTAATATAAGTTCTTACGACACCATGATTGACATGTTTATTAAGA GTAATTCAAACCTTGCTGATAATCTTGCAGCTCTTGAGGAAGTTCTGCCTGAAATAAAAGATGTTATCACAGGAACTACT GATGTTGCAGACATTGCCAACAAGACACTCGACAACATTACCAATGACATTTATGACCAGATTGACTCTGTACTTAAAGC CATGAATGAATTGGCAGATGACTCACTTAAATCTGTTGATAATGCTGTAAATGCAGCTATAACTGATGTCGGACAGGCTG GTGTTGAACTTAATAATGCCAATAATAAGCTCAACGAACTTATTAATCAGAATAAAGCACTTGAAGATGCCATTGATTCT TTAAGCAAGATAGATGGTATTGATCCGTCTGTTATTACAGCTTTAAAATCTGCACTTTCATCAGTAAATGCTATGGAAAA TGTAGCTTATAACCTTGTAAAACAATGTGCTGACATTTTAACTGACTCTCCTGAAACCCTTCAGGTCAAATATCAGTTGA TAAAATCAGTTGTTGAACAGTGTCGTTCAGAGATACAAAAAAGTCAGGTTATTATACAGACTGTTATCAGAACTAATGTA AATCTCCTGGAATCATCTGTTAAAAATGCTGTAAGCAGTCTTGCTTCCAATATAAGCAGTACCGGAGACAGCATTAACGG AATAACACAGATGCTTCTTGGTGTAAGTGATATTTCTATAAACATTAATACAACACTCGAAAGTACAAAAACTTTGCTCG ACTCACTTAACAGCAAGTTGTCTGTTATCTCTGGTTCTGTCGGAGATATCAGTTCATCTTCTACATATAAGTTAATAATG GATTTCATCAACTCAGATGCTGAGTCAATTGCATCGTTCCTTTCAGAACCTGTACAGGTAGAAGAAATATATGTCTATAT GCAGACTAACTATGGAACAAGTGTTACACCTTTCTATACAACACTTGCTCTCTGGGTTGGGGGAATTGTTTTAGTTGCCC TTATGAAAGTAAAGGTTGACTATGAAGATGATGAATTCAAGGATGCCACAGAACATCAAAAATATATAGGTCGTGCATTA CTCTTCCTTGCAATGGGACAGCTTCAGGCTCTTGTAGTTGTTCTTGGTGATTTGTACATTTTAAAAATTGACTGCACCCA CCCATTCATGCTGTGGCTTGCAGCCGCTATAACAAGCTTTGTATTTACATTATTTATATATACACTTGTTCTTACATTTG GTGATTTGGGAAAAGCTATTGCTGTAGTTATGATTGTGTTACAGATTGCCGGTTCAGGCGGAACTTATCCAATAGAACTT CTTCCTGAATTCTTCCAGAATGTGTACCTTTACTTCCCATTCCCTTATGCAATCAATGCCATGAGGGAGGCAATAAGCGG ATTATATCAGTGTGATTACGCTGTATTTCTTGTGAAATTATGCGCTTATGCTGTTATTTCCCTTATTCTGGGACTTGGAA TCAGAAAGTCACTTCTTGAAGTACGCGAGTTCTTCGAACGCCGTATGAAAGAAACACATTTTATGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAAATATGTCTGATTTATCCTCTCTGTATTGATTTTCCCCAGTTTCTTAAGTAAAATACATATAAGTTTTAAACGATAA TTAAAGAATTGAGGAATGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGGAGAAATGAATTTATGCAAAATGATGATTTTAATATAGATGTTGTTATTGCGGAAATCACAGCATTTGCAGAAAATAT GCATGCTAAGAACCAGCATA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 715; Mature: 715
Protein sequence:
>715_residues MIFKIFKRDLKGLSRNILALAIALGLCLIPSLYAWFNIYSNWDPYANTASVQIAIVSEDEGYSESDDSTINMGAQIVEQL HSNDKLGWRFPETKDEAMNKLNAGKYYAVIVVGEDFSRSLYDFLDNGLNPPTVTYYENSKKNAVASKITDTGKSTLQNTI NSEFIDVCVKTIMQGLNEIAENDPSIIEKTVKDLQSISANISSYDTMIDMFIKSNSNLADNLAALEEVLPEIKDVITGTT DVADIANKTLDNITNDIYDQIDSVLKAMNELADDSLKSVDNAVNAAITDVGQAGVELNNANNKLNELINQNKALEDAIDS LSKIDGIDPSVITALKSALSSVNAMENVAYNLVKQCADILTDSPETLQVKYQLIKSVVEQCRSEIQKSQVIIQTVIRTNV NLLESSVKNAVSSLASNISSTGDSINGITQMLLGVSDISININTTLESTKTLLDSLNSKLSVISGSVGDISSSSTYKLIM DFINSDAESIASFLSEPVQVEEIYVYMQTNYGTSVTPFYTTLALWVGGIVLVALMKVKVDYEDDEFKDATEHQKYIGRAL LFLAMGQLQALVVVLGDLYILKIDCTHPFMLWLAAAITSFVFTLFIYTLVLTFGDLGKAIAVVMIVLQIAGSGGTYPIEL LPEFFQNVYLYFPFPYAINAMREAISGLYQCDYAVFLVKLCAYAVISLILGLGIRKSLLEVREFFERRMKETHFM
Sequences:
>Translated_715_residues MIFKIFKRDLKGLSRNILALAIALGLCLIPSLYAWFNIYSNWDPYANTASVQIAIVSEDEGYSESDDSTINMGAQIVEQL HSNDKLGWRFPETKDEAMNKLNAGKYYAVIVVGEDFSRSLYDFLDNGLNPPTVTYYENSKKNAVASKITDTGKSTLQNTI NSEFIDVCVKTIMQGLNEIAENDPSIIEKTVKDLQSISANISSYDTMIDMFIKSNSNLADNLAALEEVLPEIKDVITGTT DVADIANKTLDNITNDIYDQIDSVLKAMNELADDSLKSVDNAVNAAITDVGQAGVELNNANNKLNELINQNKALEDAIDS LSKIDGIDPSVITALKSALSSVNAMENVAYNLVKQCADILTDSPETLQVKYQLIKSVVEQCRSEIQKSQVIIQTVIRTNV NLLESSVKNAVSSLASNISSTGDSINGITQMLLGVSDISININTTLESTKTLLDSLNSKLSVISGSVGDISSSSTYKLIM DFINSDAESIASFLSEPVQVEEIYVYMQTNYGTSVTPFYTTLALWVGGIVLVALMKVKVDYEDDEFKDATEHQKYIGRAL LFLAMGQLQALVVVLGDLYILKIDCTHPFMLWLAAAITSFVFTLFIYTLVLTFGDLGKAIAVVMIVLQIAGSGGTYPIEL LPEFFQNVYLYFPFPYAINAMREAISGLYQCDYAVFLVKLCAYAVISLILGLGIRKSLLEVREFFERRMKETHFM >Mature_715_residues MIFKIFKRDLKGLSRNILALAIALGLCLIPSLYAWFNIYSNWDPYANTASVQIAIVSEDEGYSESDDSTINMGAQIVEQL HSNDKLGWRFPETKDEAMNKLNAGKYYAVIVVGEDFSRSLYDFLDNGLNPPTVTYYENSKKNAVASKITDTGKSTLQNTI NSEFIDVCVKTIMQGLNEIAENDPSIIEKTVKDLQSISANISSYDTMIDMFIKSNSNLADNLAALEEVLPEIKDVITGTT DVADIANKTLDNITNDIYDQIDSVLKAMNELADDSLKSVDNAVNAAITDVGQAGVELNNANNKLNELINQNKALEDAIDS LSKIDGIDPSVITALKSALSSVNAMENVAYNLVKQCADILTDSPETLQVKYQLIKSVVEQCRSEIQKSQVIIQTVIRTNV NLLESSVKNAVSSLASNISSTGDSINGITQMLLGVSDISININTTLESTKTLLDSLNSKLSVISGSVGDISSSSTYKLIM DFINSDAESIASFLSEPVQVEEIYVYMQTNYGTSVTPFYTTLALWVGGIVLVALMKVKVDYEDDEFKDATEHQKYIGRAL LFLAMGQLQALVVVLGDLYILKIDCTHPFMLWLAAAITSFVFTLFIYTLVLTFGDLGKAIAVVMIVLQIAGSGGTYPIEL LPEFFQNVYLYFPFPYAINAMREAISGLYQCDYAVFLVKLCAYAVISLILGLGIRKSLLEVREFFERRMKETHFM
Specific function: Required for phage infection [H]
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78766; Mature: 78766
Theoretical pI: Translated: 4.25; Mature: 4.25
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIFKIFKRDLKGLSRNILALAIALGLCLIPSLYAWFNIYSNWDPYANTASVQIAIVSEDE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEECCC GYSESDDSTINMGAQIVEQLHSNDKLGWRFPETKDEAMNKLNAGKYYAVIVVGEDFSRSL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHH YDFLDNGLNPPTVTYYENSKKNAVASKITDTGKSTLQNTINSEFIDVCVKTIMQGLNEIA HHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENDPSIIEKTVKDLQSISANISSYDTMIDMFIKSNSNLADNLAALEEVLPEIKDVITGTT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC DVADIANKTLDNITNDIYDQIDSVLKAMNELADDSLKSVDNAVNAAITDVGQAGVELNNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCC NNKLNELINQNKALEDAIDSLSKIDGIDPSVITALKSALSSVNAMENVAYNLVKQCADIL HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TDSPETLQVKYQLIKSVVEQCRSEIQKSQVIIQTVIRTNVNLLESSVKNAVSSLASNISS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGDSINGITQMLLGVSDISININTTLESTKTLLDSLNSKLSVISGSVGDISSSSTYKLIM CCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHH DFINSDAESIASFLSEPVQVEEIYVYMQTNYGTSVTPFYTTLALWVGGIVLVALMKVKVD HHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YEDDEFKDATEHQKYIGRALLFLAMGQLQALVVVLGDLYILKIDCTHPFMLWLAAAITSF CCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH VFTLFIYTLVLTFGDLGKAIAVVMIVLQIAGSGGTYPIELLPEFFQNVYLYFPFPYAINA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHH MREAISGLYQCDYAVFLVKLCAYAVISLILGLGIRKSLLEVREFFERRMKETHFM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MIFKIFKRDLKGLSRNILALAIALGLCLIPSLYAWFNIYSNWDPYANTASVQIAIVSEDE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEECCC GYSESDDSTINMGAQIVEQLHSNDKLGWRFPETKDEAMNKLNAGKYYAVIVVGEDFSRSL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHH YDFLDNGLNPPTVTYYENSKKNAVASKITDTGKSTLQNTINSEFIDVCVKTIMQGLNEIA HHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENDPSIIEKTVKDLQSISANISSYDTMIDMFIKSNSNLADNLAALEEVLPEIKDVITGTT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC DVADIANKTLDNITNDIYDQIDSVLKAMNELADDSLKSVDNAVNAAITDVGQAGVELNNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCC NNKLNELINQNKALEDAIDSLSKIDGIDPSVITALKSALSSVNAMENVAYNLVKQCADIL HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TDSPETLQVKYQLIKSVVEQCRSEIQKSQVIIQTVIRTNVNLLESSVKNAVSSLASNISS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGDSINGITQMLLGVSDISININTTLESTKTLLDSLNSKLSVISGSVGDISSSSTYKLIM CCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHH DFINSDAESIASFLSEPVQVEEIYVYMQTNYGTSVTPFYTTLALWVGGIVLVALMKVKVD HHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YEDDEFKDATEHQKYIGRALLFLAMGQLQALVVVLGDLYILKIDCTHPFMLWLAAAITSF CCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH VFTLFIYTLVLTFGDLGKAIAVVMIVLQIAGSGGTYPIELLPEFFQNVYLYFPFPYAINA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHH MREAISGLYQCDYAVFLVKLCAYAVISLILGLGIRKSLLEVREFFERRMKETHFM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8366036 [H]