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The map label for this gene is yhfA [H]

Identifier: 23098827

GI number: 23098827

Start: 1420391

End: 1421803

Strand: Direct

Name: yhfA [H]

Synonym: OB1372

Alternate gene names: 23098827

Gene position: 1420391-1421803 (Clockwise)

Preceding gene: 23098826

Following gene: 23098828

Centisome position: 39.12

GC content: 39.42

Gene sequence:

>1413_bases
ATGACATTAACCCTAGCGCATTTCATTTATGGGTTGTTTACACTTGTAATTATCATCACTATGATTTTTCGGAAAGGAAT
TGTACTACCGACCTTATTAGGAACTTTCATATTGTCATGGGTTTTTAATGGCAGTATCGTTTCAGGATTTACAGCCATCT
TTCATGCCAATCTAGTCGCCGCGCAAGAATTATTTAGTATATTTTTAATTATTACATTTATGCTTGCTTTATTACATTCA
TTAAAAGACCTTGGTGCCGATGTGCGAATGATCCAGCCAATACAAAGCGTAATGGTAAATGGACACGTATCATTCTTTGT
ATTAATAGGAGTAACCTATGTAATTTCATTATTCTTTTGGCCAACCCCGGCTGTACCATTGATTTGTGCATTATTGGTTC
CTGCTGCAATTAGAGCGGGGTTACCAGCAATGGTAGCTGCAGTTGCAATTGCAATTGCCGGTCAAGGCATGGCACTATCA
TCTGATTATATCGTTCAAGTAGCTCCAAATCTCTCGGCAACTGCTGCAAATATAGATACAAGTGTTGTTGCCGACCGTTC
ACTCATTCTCTCTTTAGTTGCTGGTGGAGTCGCTATCGCAATTGCATATACACTTTATCGAAAACATATACGCTCAAAAC
ATGATCCGGAAAATGAAAGGGAGTTAGAACAACTGCAGCAATCGGAGCATTCTCTACACCACCCCAAAACGAAACAGTTA
GAAACATGGAGCAAACTTTTTGCAGTTATTGTACCAACTGCTTTGTTAGCTGTAGTCGTGTATATGCTTTATGGTAAGTT
TATTGCGAATACAGAATTAGTAGGTGGTGATGGAGCTGCATTTGTTGGTGGAGTTGCAGTAATATTGTTATTGCTCTCGA
CAATAGCGTTTGGAAAACAAAACGCATTAGACTATGTAGGGAGTCATATTACAAATGGTTTTGTATTTGCTTTTAAGGCT
ATGGGGCCAGTTATACCTATCGCTGGATTTTTCTTTCTTGGCAGTCCCGAGTTTTCAGGTAGAATATTAGGTGTGGAAGA
AGGACCTGCATTATTATTTGATCTAGTTGCTTCTATTCAGCAATATCTACCAGAAAGCTCATTCTTAGTTGCTTTCAGTG
TGTTAATCATTGGAATAATAACAGGTTTAGATGGTTCTGGTTTTTCAGGCTTGCCCTTAACGGGAGCATTAGCTGCTTCT
CTTCAGACAGGAGGAGTGGATGCTGCTACACTAGCCAGTATCGGTCAATTAGGAGCTATTTGGACGGGGGGCGGCACCAT
TGTTGCTTGGTCGTCATTAATTGCAATAGCAGGTTTTTGTGGTGTATCTGTAATGGATTTGGTTCGAAAGAATTTTATCC
CTGTAATAGTCGGATTGATTATAGCGACAATCGTAGGAGTTATCTTTCTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGTCCTTAGACTTTTATTATTAAATGAAGATAGTTACAGTAGCGAAAACACTTCTCTTTGCATAGGCTATAGTACATTC
AAGGAGAGGAAGAATGTAGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTCTTATTTTATGATACCTTTATATGTTACGTATTCTTCCATTATAAACAATGGAAGAATAGTAAACGTGTGAAGGTA
TTTTTTATCTAATTTAATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 470; Mature: 469

Protein sequence:

>470_residues
MTLTLAHFIYGLFTLVIIITMIFRKGIVLPTLLGTFILSWVFNGSIVSGFTAIFHANLVAAQELFSIFLIITFMLALLHS
LKDLGADVRMIQPIQSVMVNGHVSFFVLIGVTYVISLFFWPTPAVPLICALLVPAAIRAGLPAMVAAVAIAIAGQGMALS
SDYIVQVAPNLSATAANIDTSVVADRSLILSLVAGGVAIAIAYTLYRKHIRSKHDPENERELEQLQQSEHSLHHPKTKQL
ETWSKLFAVIVPTALLAVVVYMLYGKFIANTELVGGDGAAFVGGVAVILLLLSTIAFGKQNALDYVGSHITNGFVFAFKA
MGPVIPIAGFFFLGSPEFSGRILGVEEGPALLFDLVASIQQYLPESSFLVAFSVLIIGIITGLDGSGFSGLPLTGALAAS
LQTGGVDAATLASIGQLGAIWTGGGTIVAWSSLIAIAGFCGVSVMDLVRKNFIPVIVGLIIATIVGVIFL

Sequences:

>Translated_470_residues
MTLTLAHFIYGLFTLVIIITMIFRKGIVLPTLLGTFILSWVFNGSIVSGFTAIFHANLVAAQELFSIFLIITFMLALLHS
LKDLGADVRMIQPIQSVMVNGHVSFFVLIGVTYVISLFFWPTPAVPLICALLVPAAIRAGLPAMVAAVAIAIAGQGMALS
SDYIVQVAPNLSATAANIDTSVVADRSLILSLVAGGVAIAIAYTLYRKHIRSKHDPENERELEQLQQSEHSLHHPKTKQL
ETWSKLFAVIVPTALLAVVVYMLYGKFIANTELVGGDGAAFVGGVAVILLLLSTIAFGKQNALDYVGSHITNGFVFAFKA
MGPVIPIAGFFFLGSPEFSGRILGVEEGPALLFDLVASIQQYLPESSFLVAFSVLIIGIITGLDGSGFSGLPLTGALAAS
LQTGGVDAATLASIGQLGAIWTGGGTIVAWSSLIAIAGFCGVSVMDLVRKNFIPVIVGLIIATIVGVIFL
>Mature_469_residues
TLTLAHFIYGLFTLVIIITMIFRKGIVLPTLLGTFILSWVFNGSIVSGFTAIFHANLVAAQELFSIFLIITFMLALLHSL
KDLGADVRMIQPIQSVMVNGHVSFFVLIGVTYVISLFFWPTPAVPLICALLVPAAIRAGLPAMVAAVAIAIAGQGMALSS
DYIVQVAPNLSATAANIDTSVVADRSLILSLVAGGVAIAIAYTLYRKHIRSKHDPENERELEQLQQSEHSLHHPKTKQLE
TWSKLFAVIVPTALLAVVVYMLYGKFIANTELVGGDGAAFVGGVAVILLLLSTIAFGKQNALDYVGSHITNGFVFAFKAM
GPVIPIAGFFFLGSPEFSGRILGVEEGPALLFDLVASIQQYLPESSFLVAFSVLIIGIITGLDGSGFSGLPLTGALAASL
QTGGVDAATLASIGQLGAIWTGGGTIVAWSSLIAIAGFCGVSVMDLVRKNFIPVIVGLIIATIVGVIFL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49574; Mature: 49443

Theoretical pI: Translated: 6.68; Mature: 6.68

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTLTLAHFIYGLFTLVIIITMIFRKGIVLPTLLGTFILSWVFNGSIVSGFTAIFHANLVA
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
AQELFSIFLIITFMLALLHSLKDLGADVRMIQPIQSVMVNGHVSFFVLIGVTYVISLFFW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PTPAVPLICALLVPAAIRAGLPAMVAAVAIAIAGQGMALSSDYIVQVAPNLSATAANIDT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCEEEECCCCCCHHCCCCH
SVVADRSLILSLVAGGVAIAIAYTLYRKHIRSKHDPENERELEQLQQSEHSLHHPKTKQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
ETWSKLFAVIVPTALLAVVVYMLYGKFIANTELVGGDGAAFVGGVAVILLLLSTIAFGKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NALDYVGSHITNGFVFAFKAMGPVIPIAGFFFLGSPEFSGRILGVEEGPALLFDLVASIQ
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
QYLPESSFLVAFSVLIIGIITGLDGSGFSGLPLTGALAASLQTGGVDAATLASIGQLGAI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCE
WTGGGTIVAWSSLIAIAGFCGVSVMDLVRKNFIPVIVGLIIATIVGVIFL
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TLTLAHFIYGLFTLVIIITMIFRKGIVLPTLLGTFILSWVFNGSIVSGFTAIFHANLVA
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
AQELFSIFLIITFMLALLHSLKDLGADVRMIQPIQSVMVNGHVSFFVLIGVTYVISLFFW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PTPAVPLICALLVPAAIRAGLPAMVAAVAIAIAGQGMALSSDYIVQVAPNLSATAANIDT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCEEEECCCCCCHHCCCCH
SVVADRSLILSLVAGGVAIAIAYTLYRKHIRSKHDPENERELEQLQQSEHSLHHPKTKQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
ETWSKLFAVIVPTALLAVVVYMLYGKFIANTELVGGDGAAFVGGVAVILLLLSTIAFGKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NALDYVGSHITNGFVFAFKAMGPVIPIAGFFFLGSPEFSGRILGVEEGPALLFDLVASIQ
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
QYLPESSFLVAFSVLIIGIITGLDGSGFSGLPLTGALAASLQTGGVDAATLASIGQLGAI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCE
WTGGGTIVAWSSLIAIAGFCGVSVMDLVRKNFIPVIVGLIIATIVGVIFL
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377 [H]