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The map label for this gene is yndJ [H]

Identifier: 23098185

GI number: 23098185

Start: 776596

End: 778269

Strand: Direct

Name: yndJ [H]

Synonym: OB0730

Alternate gene names: 23098185

Gene position: 776596-778269 (Clockwise)

Preceding gene: 23098184

Following gene: 23098190

Centisome position: 21.39

GC content: 33.99

Gene sequence:

>1674_bases
ATGAGAAACAGAATAATTTTTCAAACATGCATAGGTTTCCTATTTTGGCTAAGTTCTTTTCTTTTTATGGAAGTTACCAC
CATAGAGCGCTTGCTGATCTTTGGGATTGCAGTAACAGTCCCACTGACATTTTTATTAACAGAAACTACGGATAGATACG
GAAAACATTTTAAGGTTTATTCATTAGCAGTTAAGTTTTATCCAATTGCTGCTATATTTGCAATTATTTCTTTTTTCTTT
CCGTTAGGATTCATTTCAGGTTTATGGACGGTACCATGGCTGATTTGGGTGACGATGGTCTTTTTATATGGGGTTCAAAG
ATTGATGGCGAGAGGGCTTCACTATATTGAGGAAGTAAGCATCGATATAGGTTTAATCTATTTACTTCTTGGGGGAGTAT
GGTTAAGTATATTCCGATTTGGGATCAATGTGTTGGATTTTGGTACAGTCATTATTAGCTTAACAGCAATACATTTTCAT
TTTTCCTCCTTTGTTACTCCCATATTTGCAGGATTACTTGGTAGATTCTATAGACGCTACATAGGAATATCAAAACAATT
TAAACTAATGTTGGTTGGAATTATGGTTAGTTCGCTTGGGATAGCAATCGGAATTACGATTTCAAGAGTCGTAGAATTTT
TCTTTGTAGGAGTGTATGCGATTAGCTTATGGGGATATACATATTATTTAGTGTTTCGTTTATATAACGTAGTAAAAAAC
AAGCTGGCTTATATATTACTTTCTATCTCTTCATTGACCTTAATAATGACAATGTTATTTGCGTCGATTTATGGGTTTGG
GCGAATGATAAGTATAGACTTTGTTACAATTCCACAAATGGTTGATTATCATGGTATAGCCAATGCCTTTATCTTTGTAT
TTCTTGGAGTGGTTGGTTGGCTCATCGCTCAACCAAAAATGTATTTCATATCTTACGGAATACCTTTCAGTAATTTAAAT
GGAGAGAGAAAAATAGGGTCAGATTTTTTTCAACGCCATGATTATACTTCGACACAGGTTTATTCTGGTTTAGTTAATCG
TTTAGAAGACTTCGATCAAACAGATTTCAATTCTAACAAGGTAAGTCCACGTATTAAACATTTTTATGAGCAGACGATCG
ATTATGATTTATTATCATTAACTTATTGGCAAAAAGGATTCCATAAGCTATCAAATGTGTATAAAGCAATTAGTTCAAAA
GTACAACAAATTAATCTTCCTTCTCATGAAGATAAAGACGAGCTAACAGTAAAAAGTGAAATCATTGGTATTGATGATGT
TAAAGATGGAAGAAAAGATGCTCGTGCATGGGTTCGAACTTCAAAAGTGACAGAAAAAGCGGTTTTTGTTGCTGCATATT
CACACCATTCATTTGCTGAAAACAAATATGTAAACATAGCTTTGCCATTACCGTTTGGGCATATGACAGGGATTCTTCGT
TTCGCAAACGGAATTGACGATGGATTAGAATTAACAAGTAAAGCCCGTTCGAAGAATAAAGGAGATGAAGGTATATATTA
CGTAACTAAATGGTTTTCTGTTAAGCTTCCAATTAGTGAGCATTTTACAGTTTGGGAAGAGGAAGATTATTTGAAGGCGA
GCCATGAAATGTGGATACTTGGAAAGAAATTTTTGGCTATAGATTATATGATTCATCTTAAAATTCACCGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATATATTAATTATAAAATTGATTCCAATTAATGAAATTCAAAATTATATGGTGCAAAGGAGGATCGCTCAATAAAAACA
ATACATAAAAGGTGAGATGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATGACTAACAGTTTAAGTAGTTCTGTTAATAGAAGACAAAAATAGAGCTTGTAGGATTCTCGAAATCCTACAAACTCT
ATTTCATATATTAGGAAATG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 557; Mature: 557

Protein sequence:

>557_residues
MRNRIIFQTCIGFLFWLSSFLFMEVTTIERLLIFGIAVTVPLTFLLTETTDRYGKHFKVYSLAVKFYPIAAIFAIISFFF
PLGFISGLWTVPWLIWVTMVFLYGVQRLMARGLHYIEEVSIDIGLIYLLLGGVWLSIFRFGINVLDFGTVIISLTAIHFH
FSSFVTPIFAGLLGRFYRRYIGISKQFKLMLVGIMVSSLGIAIGITISRVVEFFFVGVYAISLWGYTYYLVFRLYNVVKN
KLAYILLSISSLTLIMTMLFASIYGFGRMISIDFVTIPQMVDYHGIANAFIFVFLGVVGWLIAQPKMYFISYGIPFSNLN
GERKIGSDFFQRHDYTSTQVYSGLVNRLEDFDQTDFNSNKVSPRIKHFYEQTIDYDLLSLTYWQKGFHKLSNVYKAISSK
VQQINLPSHEDKDELTVKSEIIGIDDVKDGRKDARAWVRTSKVTEKAVFVAAYSHHSFAENKYVNIALPLPFGHMTGILR
FANGIDDGLELTSKARSKNKGDEGIYYVTKWFSVKLPISEHFTVWEEEDYLKASHEMWILGKKFLAIDYMIHLKIHR

Sequences:

>Translated_557_residues
MRNRIIFQTCIGFLFWLSSFLFMEVTTIERLLIFGIAVTVPLTFLLTETTDRYGKHFKVYSLAVKFYPIAAIFAIISFFF
PLGFISGLWTVPWLIWVTMVFLYGVQRLMARGLHYIEEVSIDIGLIYLLLGGVWLSIFRFGINVLDFGTVIISLTAIHFH
FSSFVTPIFAGLLGRFYRRYIGISKQFKLMLVGIMVSSLGIAIGITISRVVEFFFVGVYAISLWGYTYYLVFRLYNVVKN
KLAYILLSISSLTLIMTMLFASIYGFGRMISIDFVTIPQMVDYHGIANAFIFVFLGVVGWLIAQPKMYFISYGIPFSNLN
GERKIGSDFFQRHDYTSTQVYSGLVNRLEDFDQTDFNSNKVSPRIKHFYEQTIDYDLLSLTYWQKGFHKLSNVYKAISSK
VQQINLPSHEDKDELTVKSEIIGIDDVKDGRKDARAWVRTSKVTEKAVFVAAYSHHSFAENKYVNIALPLPFGHMTGILR
FANGIDDGLELTSKARSKNKGDEGIYYVTKWFSVKLPISEHFTVWEEEDYLKASHEMWILGKKFLAIDYMIHLKIHR
>Mature_557_residues
MRNRIIFQTCIGFLFWLSSFLFMEVTTIERLLIFGIAVTVPLTFLLTETTDRYGKHFKVYSLAVKFYPIAAIFAIISFFF
PLGFISGLWTVPWLIWVTMVFLYGVQRLMARGLHYIEEVSIDIGLIYLLLGGVWLSIFRFGINVLDFGTVIISLTAIHFH
FSSFVTPIFAGLLGRFYRRYIGISKQFKLMLVGIMVSSLGIAIGITISRVVEFFFVGVYAISLWGYTYYLVFRLYNVVKN
KLAYILLSISSLTLIMTMLFASIYGFGRMISIDFVTIPQMVDYHGIANAFIFVFLGVVGWLIAQPKMYFISYGIPFSNLN
GERKIGSDFFQRHDYTSTQVYSGLVNRLEDFDQTDFNSNKVSPRIKHFYEQTIDYDLLSLTYWQKGFHKLSNVYKAISSK
VQQINLPSHEDKDELTVKSEIIGIDDVKDGRKDARAWVRTSKVTEKAVFVAAYSHHSFAENKYVNIALPLPFGHMTGILR
FANGIDDGLELTSKARSKNKGDEGIYYVTKWFSVKLPISEHFTVWEEEDYLKASHEMWILGKKFLAIDYMIHLKIHR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64181; Mature: 64181

Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CHHHHHEEEEEEEEEEC
>Mature Secondary Structure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CHHHHHEEEEEEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]