Definition Exiguobacterium sp. AT1b, complete genome.
Accession NC_012673
Length 2,999,895

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The map label for this gene is 229918313

Identifier: 229918313

GI number: 229918313

Start: 2566208

End: 2569183

Strand: Reverse

Name: 229918313

Synonym: EAT1b_2598

Alternate gene names: NA

Gene position: 2569183-2566208 (Counterclockwise)

Preceding gene: 229918317

Following gene: 229918310

Centisome position: 85.64

GC content: 26.61

Gene sequence:

>2976_bases
ATGGTCGATAATTTTTTAGACACTAGTATAAAAAAAATCAAAGAAGCGAGCGAAAACAACAAATTGGTGATTTTTGTTGG
AGCTGGGGTTTCGGCTAATTCAGGTATACCTACTTGGAGTGAATTAATCAAATCACTTTCAAAAGATTTAGGAGACTTTG
ATATTGATAAGTCTCCAGAATTATTTTTAAAAATACCTCAATATTATTTCAATGAGAGAGGCGAAAAAGAGTATTTTGAA
AAATTGGATGAAATATTTCTCAAAAATAAGTACAAAACGAATCCAATTCATAAAGAAATTTTCAAATTAAAACCTACACA
CATCATCACAACGAACTATGATACTTTGTTGGAAGAAGCCGCTATAGAAGAGGGACAATTTTTCCATACGGTAAAGTATG
ATTTGCACCTACCCTATAATAATTTCAATAAAACTATCATTAAAATGCATGGAGACTTTGAGCATCGTAATATCGTACTA
AAGGAAGATGACTATTTAAATTATTCTAAAAATTTCACTTTAATCGAAAGTTATATCAAGTCTCTAATAGCTACAAATAC
AGTTTTATTTATAGGGTATTCAGTCAATGATCCGAATTTCAACTTGATTTTTCAATGGGTTAAAAATATTTTAAGTAGCC
ATTTTCAACCAGCATATCTAATAGAGAACAGTAAGGAATTTTCTCGAATCGAACATTCATATTATAAAAATCGAGGCATA
AATATTTTATATAAAAATGAGATTGAAGGCTTACCTTTTACTGACGTTTTTAATAGCAACAATGTAAGAGGAAATGCTTT
ATATAATTTTTTAAACTATTTTAATACATTTGATAAGAGAAAAGAGATTAATGATTTAGAAGGTGTTTATGAGAAATTAA
GTTGTTTTGAGGATTTAAATTTCATTATGCCTGACCAAATTACAAAAAGATTGAATATAAAATCTTTAGCATATGATTTA
TTTGGCGATAGAACTTTAACAACTTTAGAAAATGAAAATCCTCTAATAGATATATTCTCAAATATCGAAAGCTTTTCAGA
TAAAACTATATTTAATAAAATCTCAAAGATATTCTTAAAAGCAAACATTCGGGGGGTTTCTACAGATAAAGAATTAATAA
TTGAATTTGAAGACAATGATGATTTTATAAATAGTTTAATAACTAAGATTATAAAAACTGACAGTACAATCAATCCAACA
ACCCCTAATAATTTGACAAGTATTTTTGAAGGGAAAGATTATGAGTCAATGCTTAGGCTCGGGTATGTTTTCTATAAACA
AAATCAATTTCATGATTCGTATACAGTCTTTAAAACTATTTCAATTAAAGCATTTAAAGATAAAAAGTATCTCATTTACT
ACATTTCAGAGTTTAATAGAAAACATTTAGGAAATTTCCTAATGAACAATTCAAAAAAAATAAGTGAAGATTTGAAGATT
GAAATTCAAGATATAAACCTTGAAGAGATTTATGACACTCTCCCATCAATCGAAAAAAAAAGCATAAGTTTTCTAACAGA
TATTCAGAATTTTAATTTTATATATAAAGTTCAGAATAAAATCAACAAACATGTCAATGCATTAAAAAATACCAAAAGAA
CTGTTGAAAATAATGGATTCTCAATAGATAGTACTTTACAACGAAGCTTCACTGAATTAACAAACATTTGGATGTTTTTA
GAATCTAACTATTTATGTATAGACATTTATAGTGAAATCAAAAGCTTATACCTAAGTTTTGTAGAAGGTATTTTTGTAAG
TTATAGTACCCAAAATAATAGTACTGGCGAAACTTTTTTTAATGACTTACCTATAAATAAAATTGAAGAATTAGATATCT
TTGAAGTATATATTATTATGACTAAATTGAAGACTAAAGACTTGTCTCAAATTTTGACTGATTATAATGTAAATGAAATA
GTTATTAGTGAGCCGGCTCTCGAATTTGTCATGCATACTTTGGAAACCCTAGTTAATGACGTATTAAACAATAAAATTAA
AGATAAAAGTGAAAATTATCTTTATAATCTTCTAACGTTACTTTCCAGGTCCAAATTAAATGTGGATCACGCTAATCGCA
TTGGAAGTAAACTGAAATTACTGATTAATGAAGAAGTGTATTTTAATGAATTTAAATATATTAATAGATTTATCGTTTCT
TCAGCAAATAAAAACCTACTAAATCAAAATTTAATATCGCAACTATTAAATAGTTACCTAAACGCTTATTTAAAAAACAG
AAGGATATTGGAATTTGATACGGTTGGCTTGTATTCAAATTTGGCAAAAATCTATGCGGATTATAATAGCTATCCTCTAG
ATGAAGATACGATTACCAATGTTGTAAACGTAGTGAATATCGACTACAAAGCAGAAAATCGTAATCTGATATATAACACT
TTACAAAGCGTTGTATATCCAATATTCAGTATTTTAAAAAGCGAAGAGAAAGAAATAATAAAAATATTAACAAAATCAAT
ATTAGAAAAAATAATTTCTGCGCAAAGTCCTTTGGATTCAAAAACCATATCTTTTTATGAATCAATGTTACTCAGTAACG
TTCTTGAGGCAAACACGTCTATCAATAAACTTATAATTGAAGGTACATGTAAATTAATCGAAAATCAAAATGAAAGCCTT
AAAACACATCCCGATCCCATTTATATAGGGTTACATGCATTAACAAATATGTATAAGTTTGACCACTTGAATTTAGAAGA
AATTAAAGATTATTTGAAAATGCTTGGTGGCCATGTTGAGTATTTCGATTTAATTTTCAATATTGAAGGTGTAAAGCTAA
CCAACTTAAATTTACTAGTATATATAAATGAAGAAGAAATGGAATCTTTAATGAAACAAGAAAAATTTAAAAATTCTGTG
TACGAATTATTTGAAGAAAAATTAGAAGACCTAACTCTTGAAAAGAGAAAAGATATCCTATCTAAAATATACACAAGAAG
ATATAAAAATTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATTATTTCATAAATAAAATTTTATAGTCACCTTCATAATCAAATTTTATTATTGGTAAATTATAGAAAACTATGATTTT
TAGTGATTGGGGGAGAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTCATTTTTGAAGACAACATTCAATCACCCATATTGACGTATTTTTTCCCACGTAATTTATTCTAAGTAATCAAATAACA
GTCTTGACTGATCAGCGAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 991; Mature: 991

Protein sequence:

>991_residues
MVDNFLDTSIKKIKEASENNKLVIFVGAGVSANSGIPTWSELIKSLSKDLGDFDIDKSPELFLKIPQYYFNERGEKEYFE
KLDEIFLKNKYKTNPIHKEIFKLKPTHIITTNYDTLLEEAAIEEGQFFHTVKYDLHLPYNNFNKTIIKMHGDFEHRNIVL
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TPNNLTSIFEGKDYESMLRLGYVFYKQNQFHDSYTVFKTISIKAFKDKKYLIYYISEFNRKHLGNFLMNNSKKISEDLKI
EIQDINLEEIYDTLPSIEKKSISFLTDIQNFNFIYKVQNKINKHVNALKNTKRTVENNGFSIDSTLQRSFTELTNIWMFL
ESNYLCIDIYSEIKSLYLSFVEGIFVSYSTQNNSTGETFFNDLPINKIEELDIFEVYIIMTKLKTKDLSQILTDYNVNEI
VISEPALEFVMHTLETLVNDVLNNKIKDKSENYLYNLLTLLSRSKLNVDHANRIGSKLKLLINEEVYFNEFKYINRFIVS
SANKNLLNQNLISQLLNSYLNAYLKNRRILEFDTVGLYSNLAKIYADYNSYPLDEDTITNVVNVVNIDYKAENRNLIYNT
LQSVVYPIFSILKSEEKEIIKILTKSILEKIISAQSPLDSKTISFYESMLLSNVLEANTSINKLIIEGTCKLIENQNESL
KTHPDPIYIGLHALTNMYKFDHLNLEEIKDYLKMLGGHVEYFDLIFNIEGVKLTNLNLLVYINEEEMESLMKQEKFKNSV
YELFEEKLEDLTLEKRKDILSKIYTRRYKNL

Sequences:

>Translated_991_residues
MVDNFLDTSIKKIKEASENNKLVIFVGAGVSANSGIPTWSELIKSLSKDLGDFDIDKSPELFLKIPQYYFNERGEKEYFE
KLDEIFLKNKYKTNPIHKEIFKLKPTHIITTNYDTLLEEAAIEEGQFFHTVKYDLHLPYNNFNKTIIKMHGDFEHRNIVL
KEDDYLNYSKNFTLIESYIKSLIATNTVLFIGYSVNDPNFNLIFQWVKNILSSHFQPAYLIENSKEFSRIEHSYYKNRGI
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EIQDINLEEIYDTLPSIEKKSISFLTDIQNFNFIYKVQNKINKHVNALKNTKRTVENNGFSIDSTLQRSFTELTNIWMFL
ESNYLCIDIYSEIKSLYLSFVEGIFVSYSTQNNSTGETFFNDLPINKIEELDIFEVYIIMTKLKTKDLSQILTDYNVNEI
VISEPALEFVMHTLETLVNDVLNNKIKDKSENYLYNLLTLLSRSKLNVDHANRIGSKLKLLINEEVYFNEFKYINRFIVS
SANKNLLNQNLISQLLNSYLNAYLKNRRILEFDTVGLYSNLAKIYADYNSYPLDEDTITNVVNVVNIDYKAENRNLIYNT
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KTHPDPIYIGLHALTNMYKFDHLNLEEIKDYLKMLGGHVEYFDLIFNIEGVKLTNLNLLVYINEEEMESLMKQEKFKNSV
YELFEEKLEDLTLEKRKDILSKIYTRRYKNL
>Mature_991_residues
MVDNFLDTSIKKIKEASENNKLVIFVGAGVSANSGIPTWSELIKSLSKDLGDFDIDKSPELFLKIPQYYFNERGEKEYFE
KLDEIFLKNKYKTNPIHKEIFKLKPTHIITTNYDTLLEEAAIEEGQFFHTVKYDLHLPYNNFNKTIIKMHGDFEHRNIVL
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TPNNLTSIFEGKDYESMLRLGYVFYKQNQFHDSYTVFKTISIKAFKDKKYLIYYISEFNRKHLGNFLMNNSKKISEDLKI
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ESNYLCIDIYSEIKSLYLSFVEGIFVSYSTQNNSTGETFFNDLPINKIEELDIFEVYIIMTKLKTKDLSQILTDYNVNEI
VISEPALEFVMHTLETLVNDVLNNKIKDKSENYLYNLLTLLSRSKLNVDHANRIGSKLKLLINEEVYFNEFKYINRFIVS
SANKNLLNQNLISQLLNSYLNAYLKNRRILEFDTVGLYSNLAKIYADYNSYPLDEDTITNVVNVVNIDYKAENRNLIYNT
LQSVVYPIFSILKSEEKEIIKILTKSILEKIISAQSPLDSKTISFYESMLLSNVLEANTSINKLIIEGTCKLIENQNESL
KTHPDPIYIGLHALTNMYKFDHLNLEEIKDYLKMLGGHVEYFDLIFNIEGVKLTNLNLLVYINEEEMESLMKQEKFKNSV
YELFEEKLEDLTLEKRKDILSKIYTRRYKNL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 116087; Mature: 116087

Theoretical pI: Translated: 5.30; Mature: 5.30

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVDNFLDTSIKKIKEASENNKLVIFVGAGVSANSGIPTWSELIKSLSKDLGDFDIDKSPE
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCH
LFLKIPQYYFNERGEKEYFEKLDEIFLKNKYKTNPIHKEIFKLKPTHIITTNYDTLLEEA
HEEECCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHH
AIEEGQFFHTVKYDLHLPYNNFNKTIIKMHGDFEHRNIVLKEDDYLNYSKNFTLIESYIK
HHCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
SLIATNTVLFIGYSVNDPNFNLIFQWVKNILSSHFQPAYLIENSKEFSRIEHSYYKNRGI
HHHHCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCC
NILYKNEIEGLPFTDVFNSNNVRGNALYNFLNYFNTFDKRKEINDLEGVYEKLSCFEDLN
EEEECCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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CCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
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GYVFYKQNQFHDSYTVFKTISIKAFKDKKYLIYYISEFNRKHLGNFLMNNSKKISEDLKI
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NDLPINKIEELDIFEVYIIMTKLKTKDLSQILTDYNVNEIVISEPALEFVMHTLETLVND
CCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHH
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
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YELFEEKLEDLTLEKRKDILSKIYTRRYKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
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HHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
KTISFYESMLLSNVLEANTSINKLIIEGTCKLIENQNESLKTHPDPIYIGLHALTNMYKF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHC
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CCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEHEEEEECCEEEECEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
YELFEEKLEDLTLEKRKDILSKIYTRRYKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA