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The map label for this gene is 229918298

Identifier: 229918298

GI number: 229918298

Start: 2542852

End: 2544870

Strand: Reverse

Name: 229918298

Synonym: EAT1b_2581

Alternate gene names: NA

Gene position: 2544870-2542852 (Counterclockwise)

Preceding gene: 229918299

Following gene: 229918297

Centisome position: 84.83

GC content: 34.82

Gene sequence:

>2019_bases
ATGATTCTCAAGCAAGTAATCATTGAAAACTTCCGTCAATATTATGGGCAGAATACGATTGAATTTGCACACGGATCAAG
CAAAAATGTTACTGTCATCCACGGTGAAAATGGAAGCGGTAAAACAGCATTACTTACAGCTTTGATTTGGGGATTTTATG
GACGAGAACTTAAATTACCGAATCCTGAGTCTATTTTTAATAATAAAGCTGTTCAAGAAAACACAAACAATAAAAATGAC
TTAATCACAGCGGTACAAATTAAATTTGAACATAACGATTATGAATACGAACTACGTCGTATGTTATACGCGAAGTTTGA
TTCTGAGCACAATATGCTTAATTTGCCAAAGAATAAAACAATCAATCAAAAAGTTGAATTGACTAAACGGAATGTAGCTA
CAAATCAATCTACTAAAATTAGAGATATCTCATACGAAATTAATCGCATTTTGCCGTATAAATTGCATACGTTCTTCTTC
TTTGACGGTGAACGAATGGACCATTTAGGAAAGAAAGAAGCTTATTCGGAAATTCGTGATTCCATTAAGAGAATGATGGG
ATTGGAGTTATTCGATAACTCTATTGAACATTTAAGTAAAACTATAATTAAACTTCGCGACGAAGTATCTAAAAATGTAA
AGAGTGAATTGAGCGACAAGTACTTGCGCATAAATCAACTTGAAGATGAAAAAATAAAGAAGAAACAGCAACTTACTGAA
ACAAGACAAGAACTTTCGGCTGCCCAAAGCGAATTGAAAAGTATTGAAAATGCTTTACGTAACGGTGAAGAAACGAGAAC
CTTTCAAGTCACACGTGATCACTTAGTTGAGTCAATTAAAGAAACGAAAAATGCATTTGATGAGAAATTAAATGAGTTGA
GAATCCTACTTTCCCGCTCAAGTCACTTGGCTTTTTCAACCTTACCAATGAAAAGATTCCAGCGCATTGCATCTACAAAT
GACCAGGATTCAATTGAAAAATTGATTCATCCTGATTTGATTCCTTTTTTAATGTCGAAAGGGAAATGTTTGTGTGGACA
AGAACTTGAGACAACATCAATTGCATCATTAGAAAAAGTTCAGCAAGAGGTCTTAAATTTATCGAGTTCAAAAAATGAAA
TGGATCAACTTTATTTCCGCTTAAGTGGTTGGGAAGTTGCTAGAAGCCATTTTTACACAGAAATCAGACGACTCGTTAGT
GAACGTGAAGAATTGAGAGAAAACCTTAGAGGATTGGAAGACGAGTTACGAGAAATTGAGGAACGTATGAAAGCAAGTTC
ACGCAATATCGAAAATTCATCCAATTTAATCGAGAGAGAATCCTCGATTCGAACTGCAATCGTTAAAGCAGAGGCTGCTA
TAGAAAGTTTACTTCGATCAATTGAGGAAATTTCAAAAGAAGAAGAGTTATTAAATAAAGAGGTCAGTAAACTGACTAAA
GCAGAAGAAAGACAATTAAAACTTCAACTTGCTCTAGAGTCTGCTACGAAAGTGAAAAACACTTTGATTGGGCTTTTAAA
GCTCAGAGAATCCCAAGTAAAAACCGAATTAGAAGAAAAAATCAAACTAACCTATTCTCAGTTATTACGAAAAGACTATC
CAATCTCACTTACTGATAATTACGAACTTCTCGTTTCAGATGTAAACGGAGGAAGTATTGGTTTATCTCAGGGAGAATCA
CAGATTACAAGTCTTGCTTTCATCGGTGCTATTGTAGATTTAACTAGGGAGTACAAAGACAAAGAAAAAGGTCACGCGTT
AGATGAAGATTTAAAACTCGGAAATATTTTTCCACTTGTAATGGATTCTCCGTTTGGAGCACTCGATGCAGACCATCGTT
CTCGCGTTGCAATAAATTTACCAAAATTATCAGATCAAATTGTTGTGATTGTATCTACTTCACAATGGCGTGGAGAAGTG
GATGAAGCCATTAATCATCGGATTGGAAAATCATATAAATTACTCAACCATACAAATGAAGGCACTGGGGAATATACGGA
AATTATGGAGGTAATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTCGCTTAGAAAAAGACTATTTAGATAAAGAAGGTTCATTTACTGCTGCGCAATTACCTGATGAATTTTCTAAATTAAT
CAAAAAGGAGTTTATCTGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGCAAAGCGTTCCGTGCGTCGAGATAGTACACAAGATCATATGTATACAGCGTTAAAAGAAGACGCTCAACTTTTTGAA
ACCTATAAAGATGCTTTCAT

Product: SMC domain protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 672; Mature: 672

Protein sequence:

>672_residues
MILKQVIIENFRQYYGQNTIEFAHGSSKNVTVIHGENGSGKTALLTALIWGFYGRELKLPNPESIFNNKAVQENTNNKND
LITAVQIKFEHNDYEYELRRMLYAKFDSEHNMLNLPKNKTINQKVELTKRNVATNQSTKIRDISYEINRILPYKLHTFFF
FDGERMDHLGKKEAYSEIRDSIKRMMGLELFDNSIEHLSKTIIKLRDEVSKNVKSELSDKYLRINQLEDEKIKKKQQLTE
TRQELSAAQSELKSIENALRNGEETRTFQVTRDHLVESIKETKNAFDEKLNELRILLSRSSHLAFSTLPMKRFQRIASTN
DQDSIEKLIHPDLIPFLMSKGKCLCGQELETTSIASLEKVQQEVLNLSSSKNEMDQLYFRLSGWEVARSHFYTEIRRLVS
EREELRENLRGLEDELREIEERMKASSRNIENSSNLIERESSIRTAIVKAEAAIESLLRSIEEISKEEELLNKEVSKLTK
AEERQLKLQLALESATKVKNTLIGLLKLRESQVKTELEEKIKLTYSQLLRKDYPISLTDNYELLVSDVNGGSIGLSQGES
QITSLAFIGAIVDLTREYKDKEKGHALDEDLKLGNIFPLVMDSPFGALDADHRSRVAINLPKLSDQIVVIVSTSQWRGEV
DEAINHRIGKSYKLLNHTNEGTGEYTEIMEVM

Sequences:

>Translated_672_residues
MILKQVIIENFRQYYGQNTIEFAHGSSKNVTVIHGENGSGKTALLTALIWGFYGRELKLPNPESIFNNKAVQENTNNKND
LITAVQIKFEHNDYEYELRRMLYAKFDSEHNMLNLPKNKTINQKVELTKRNVATNQSTKIRDISYEINRILPYKLHTFFF
FDGERMDHLGKKEAYSEIRDSIKRMMGLELFDNSIEHLSKTIIKLRDEVSKNVKSELSDKYLRINQLEDEKIKKKQQLTE
TRQELSAAQSELKSIENALRNGEETRTFQVTRDHLVESIKETKNAFDEKLNELRILLSRSSHLAFSTLPMKRFQRIASTN
DQDSIEKLIHPDLIPFLMSKGKCLCGQELETTSIASLEKVQQEVLNLSSSKNEMDQLYFRLSGWEVARSHFYTEIRRLVS
EREELRENLRGLEDELREIEERMKASSRNIENSSNLIERESSIRTAIVKAEAAIESLLRSIEEISKEEELLNKEVSKLTK
AEERQLKLQLALESATKVKNTLIGLLKLRESQVKTELEEKIKLTYSQLLRKDYPISLTDNYELLVSDVNGGSIGLSQGES
QITSLAFIGAIVDLTREYKDKEKGHALDEDLKLGNIFPLVMDSPFGALDADHRSRVAINLPKLSDQIVVIVSTSQWRGEV
DEAINHRIGKSYKLLNHTNEGTGEYTEIMEVM
>Mature_672_residues
MILKQVIIENFRQYYGQNTIEFAHGSSKNVTVIHGENGSGKTALLTALIWGFYGRELKLPNPESIFNNKAVQENTNNKND
LITAVQIKFEHNDYEYELRRMLYAKFDSEHNMLNLPKNKTINQKVELTKRNVATNQSTKIRDISYEINRILPYKLHTFFF
FDGERMDHLGKKEAYSEIRDSIKRMMGLELFDNSIEHLSKTIIKLRDEVSKNVKSELSDKYLRINQLEDEKIKKKQQLTE
TRQELSAAQSELKSIENALRNGEETRTFQVTRDHLVESIKETKNAFDEKLNELRILLSRSSHLAFSTLPMKRFQRIASTN
DQDSIEKLIHPDLIPFLMSKGKCLCGQELETTSIASLEKVQQEVLNLSSSKNEMDQLYFRLSGWEVARSHFYTEIRRLVS
EREELRENLRGLEDELREIEERMKASSRNIENSSNLIERESSIRTAIVKAEAAIESLLRSIEEISKEEELLNKEVSKLTK
AEERQLKLQLALESATKVKNTLIGLLKLRESQVKTELEEKIKLTYSQLLRKDYPISLTDNYELLVSDVNGGSIGLSQGES
QITSLAFIGAIVDLTREYKDKEKGHALDEDLKLGNIFPLVMDSPFGALDADHRSRVAINLPKLSDQIVVIVSTSQWRGEV
DEAINHRIGKSYKLLNHTNEGTGEYTEIMEVM

Specific function: Unknown

COG id: COG0419

COG function: function code L; ATPase involved in DNA repair

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77415; Mature: 77415

Theoretical pI: Translated: 6.38; Mature: 6.38

Prosite motif: PS00214 FABP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MILKQVIIENFRQYYGQNTIEFAHGSSKNVTVIHGENGSGKTALLTALIWGFYGRELKLP
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NPESIFNNKAVQENTNNKNDLITAVQIKFEHNDYEYELRRMLYAKFDSEHNMLNLPKNKT
CCHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCC
INQKVELTKRNVATNQSTKIRDISYEINRILPYKLHTFFFFDGERMDHLGKKEAYSEIRD
CCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCHHHHCCHHHHHHHHHH
SIKRMMGLELFDNSIEHLSKTIIKLRDEVSKNVKSELSDKYLRINQLEDEKIKKKQQLTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHH
TRQELSAAQSELKSIENALRNGEETRTFQVTRDHLVESIKETKNAFDEKLNELRILLSRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SHLAFSTLPMKRFQRIASTNDQDSIEKLIHPDLIPFLMSKGKCLCGQELETTSIASLEKV
CCCEEHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
QQEVLNLSSSKNEMDQLYFRLSGWEVARSHFYTEIRRLVSEREELRENLRGLEDELREIE
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERMKASSRNIENSSNLIERESSIRTAIVKAEAAIESLLRSIEEISKEEELLNKEVSKLTK
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEERQLKLQLALESATKVKNTLIGLLKLRESQVKTELEEKIKLTYSQLLRKDYPISLTDN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC
YELLVSDVNGGSIGLSQGESQITSLAFIGAIVDLTREYKDKEKGHALDEDLKLGNIFPLV
CEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEE
MDSPFGALDADHRSRVAINLPKLSDQIVVIVSTSQWRGEVDEAINHRIGKSYKLLNHTNE
ECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCC
GTGEYTEIMEVM
CCCHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MILKQVIIENFRQYYGQNTIEFAHGSSKNVTVIHGENGSGKTALLTALIWGFYGRELKLP
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NPESIFNNKAVQENTNNKNDLITAVQIKFEHNDYEYELRRMLYAKFDSEHNMLNLPKNKT
CCHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCC
INQKVELTKRNVATNQSTKIRDISYEINRILPYKLHTFFFFDGERMDHLGKKEAYSEIRD
CCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCHHHHCCHHHHHHHHHH
SIKRMMGLELFDNSIEHLSKTIIKLRDEVSKNVKSELSDKYLRINQLEDEKIKKKQQLTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHH
TRQELSAAQSELKSIENALRNGEETRTFQVTRDHLVESIKETKNAFDEKLNELRILLSRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SHLAFSTLPMKRFQRIASTNDQDSIEKLIHPDLIPFLMSKGKCLCGQELETTSIASLEKV
CCCEEHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
QQEVLNLSSSKNEMDQLYFRLSGWEVARSHFYTEIRRLVSEREELRENLRGLEDELREIE
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERMKASSRNIENSSNLIERESSIRTAIVKAEAAIESLLRSIEEISKEEELLNKEVSKLTK
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEERQLKLQLALESATKVKNTLIGLLKLRESQVKTELEEKIKLTYSQLLRKDYPISLTDN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC
YELLVSDVNGGSIGLSQGESQITSLAFIGAIVDLTREYKDKEKGHALDEDLKLGNIFPLV
CEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEE
MDSPFGALDADHRSRVAINLPKLSDQIVVIVSTSQWRGEVDEAINHRIGKSYKLLNHTNE
ECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCC
GTGEYTEIMEVM
CCCHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA