Definition | Bacillus anthracis str. CDC 684, complete genome. |
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Accession | NC_012581 |
Length | 5,230,115 |
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The map label for this gene is 227815564
Identifier: 227815564
GI number: 227815564
Start: 2720939
End: 2722375
Strand: Reverse
Name: 227815564
Synonym: BAMEG_2978
Alternate gene names: NA
Gene position: 2722375-2720939 (Counterclockwise)
Preceding gene: 227815565
Following gene: 227815563
Centisome position: 52.05
GC content: 32.85
Gene sequence:
>1437_bases ATGGGTAAATCTATTTTAAATAATATTATCCATCTATTTTATAGCACGATTTTAGCTAATCTTCTTCAGGCTGTAAGTTT AATTGCTTTAGCAAATTTTTTTAATGCACAACATTATGGAATGTTTAGTGTTGCCATAGCAGTGACGTTTATTATGTTAT TTTTCACAGATTTAGGACTTACTAACACGTTTCTTCGAGAAGGGGCAAAAGATGGAGTAGACTTAGGGAAGATTTTATCG TCGTATATAAAAATAAGGATGATCCTACTTATTTTTATTTCTATAATCGGTTATATTGCTATTCATTATATGTATGCGGA TAGAAATGTAATTTACATGATGATAAACGTAATGTTTTTCATGTTAATAGGATTAATTTTCCAAAATATAGGGATTACCT ACTTTCAGTTGATGGAACGAATGAAGTATATAGCACTTATTAAAGTTGTATCAGCGTCAGTTGTTATCATCATTACATGT TTTTGTATTTTCGGAGAGTTACCGGTGTATGTAACAGCTCGTTTATATGCTTTTGGGTATATGATCGGTGGTTTGTTCAG CATATATATCATGAGAAAAAAGACGAAAATGAATATGAAAGTCGTAATTCATAAAGCATTATTTTGGCAATTAACTCCTT TTATTATTAGCGGTTTTTTAATAATGAGCACCCCGCAATTAGCGCCTATCTTACTTAACTATACATTGCCACTAAGTATG GTCGGTGTTTTTGCAGTGGCGTACCGGATGCCAGCAGCTTTATATCAAGTGCCAGGGGTAATTGCAGGTGCGTTTTACCC AGTGCTTTTTAAGCATTATAATCAAAAAAATTTAGAAGAGCATACGAAATTAAACTTACTTCAAATAAAATCAATGGCGA TTGTGGGAATCTGTATGACAATCGGTTTATATTATTTAGCACCATACTTTATTTCTATATTTTTTCATGAGGAATGGAGC AATGCAGTAGAGCCACTCCAAATATTATCCTTTCTCATTGTGCTGCAAAGTTTAAATATTGCTATAGCTGACGGCTTAAC AACGAGTGGACGTCAAAATAAAAGAACGGTTGTGCAATGTATAGCATTAGTGATAGGTGGGATTATGCTTTATAGCTTTA GTAGTATTGGTGGAGTGATAGGAGCGGCTTATGCTATGGTTTTATTTGAAATTGTAGCTTTAGTTGGGTATATAGCAGTA AGTGTAGTGAGGAAGAAAATTGTATTCCAAATTGTCATACCTTATACAAGTTATTTTGGCGTAACTTTTATTGGGGTGCA ATATATGTTGCATACATATCATTTCATTGCGCTCGTTCTGAATACGTTAATCGTAGTAGTTGGTATATTCCTATATGATT ATGAGCTGAAAAAACTTCTTCTTTCGTTTATAACAAAAACACGCAAAAAGGATTATATTACGAAACAGGGGATATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TATTCGTATTTTATGTAAAACTGTTTTAATTGTATTGAACGGTAATGGTGCAAGATAAATATATGTAAGTAGGCTAGGTT GCTTGCAAAGGAGAGCAGGT
Downstream 100 bases:
>100_bases CATATGGAAAATAATATGAAAATATCGATGAAATGGATCATGCTTCTAATATTATTTGTCATGTTAAGTAAATACAATAT ATATATTGGATTTTCGTTGA
Product: polysaccharide synthase family protein
Products: NA
Alternate protein names: Oligosaccharide Translocase; Polysaccharide Biosynthesis Family Protein
Number of amino acids: Translated: 478; Mature: 477
Protein sequence:
>478_residues MGKSILNNIIHLFYSTILANLLQAVSLIALANFFNAQHYGMFSVAIAVTFIMLFFTDLGLTNTFLREGAKDGVDLGKILS SYIKIRMILLIFISIIGYIAIHYMYADRNVIYMMINVMFFMLIGLIFQNIGITYFQLMERMKYIALIKVVSASVVIIITC FCIFGELPVYVTARLYAFGYMIGGLFSIYIMRKKTKMNMKVVIHKALFWQLTPFIISGFLIMSTPQLAPILLNYTLPLSM VGVFAVAYRMPAALYQVPGVIAGAFYPVLFKHYNQKNLEEHTKLNLLQIKSMAIVGICMTIGLYYLAPYFISIFFHEEWS NAVEPLQILSFLIVLQSLNIAIADGLTTSGRQNKRTVVQCIALVIGGIMLYSFSSIGGVIGAAYAMVLFEIVALVGYIAV SVVRKKIVFQIVIPYTSYFGVTFIGVQYMLHTYHFIALVLNTLIVVVGIFLYDYELKKLLLSFITKTRKKDYITKQGI
Sequences:
>Translated_478_residues MGKSILNNIIHLFYSTILANLLQAVSLIALANFFNAQHYGMFSVAIAVTFIMLFFTDLGLTNTFLREGAKDGVDLGKILS SYIKIRMILLIFISIIGYIAIHYMYADRNVIYMMINVMFFMLIGLIFQNIGITYFQLMERMKYIALIKVVSASVVIIITC FCIFGELPVYVTARLYAFGYMIGGLFSIYIMRKKTKMNMKVVIHKALFWQLTPFIISGFLIMSTPQLAPILLNYTLPLSM VGVFAVAYRMPAALYQVPGVIAGAFYPVLFKHYNQKNLEEHTKLNLLQIKSMAIVGICMTIGLYYLAPYFISIFFHEEWS NAVEPLQILSFLIVLQSLNIAIADGLTTSGRQNKRTVVQCIALVIGGIMLYSFSSIGGVIGAAYAMVLFEIVALVGYIAV SVVRKKIVFQIVIPYTSYFGVTFIGVQYMLHTYHFIALVLNTLIVVVGIFLYDYELKKLLLSFITKTRKKDYITKQGI >Mature_477_residues GKSILNNIIHLFYSTILANLLQAVSLIALANFFNAQHYGMFSVAIAVTFIMLFFTDLGLTNTFLREGAKDGVDLGKILSS YIKIRMILLIFISIIGYIAIHYMYADRNVIYMMINVMFFMLIGLIFQNIGITYFQLMERMKYIALIKVVSASVVIIITCF CIFGELPVYVTARLYAFGYMIGGLFSIYIMRKKTKMNMKVVIHKALFWQLTPFIISGFLIMSTPQLAPILLNYTLPLSMV GVFAVAYRMPAALYQVPGVIAGAFYPVLFKHYNQKNLEEHTKLNLLQIKSMAIVGICMTIGLYYLAPYFISIFFHEEWSN AVEPLQILSFLIVLQSLNIAIADGLTTSGRQNKRTVVQCIALVIGGIMLYSFSSIGGVIGAAYAMVLFEIVALVGYIAVS VVRKKIVFQIVIPYTSYFGVTFIGVQYMLHTYHFIALVLNTLIVVVGIFLYDYELKKLLLSFITKTRKKDYITKQGI
Specific function: Unknown
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 53987; Mature: 53856
Theoretical pI: Translated: 9.83; Mature: 9.83
Prosite motif: PS00012 PHOSPHOPANTETHEINE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 4.8 %Met (Translated Protein) 5.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 4.6 %Met (Mature Protein) 5.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGKSILNNIIHLFYSTILANLLQAVSLIALANFFNAQHYGMFSVAIAVTFIMLFFTDLGL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC TNTFLREGAKDGVDLGKILSSYIKIRMILLIFISIIGYIAIHYMYADRNVIYMMINVMFF HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH MLIGLIFQNIGITYFQLMERMKYIALIKVVSASVVIIITCFCIFGELPVYVTARLYAFGY HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH MIGGLFSIYIMRKKTKMNMKVVIHKALFWQLTPFIISGFLIMSTPQLAPILLNYTLPLSM HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH VGVFAVAYRMPAALYQVPGVIAGAFYPVLFKHYNQKNLEEHTKLNLLQIKSMAIVGICMT HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGLYYLAPYFISIFFHEEWSNAVEPLQILSFLIVLQSLNIAIADGLTTSGRQNKRTVVQC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCCCCCCHHHHHHH IALVIGGIMLYSFSSIGGVIGAAYAMVLFEIVALVGYIAVSVVRKKIVFQIVIPYTSYFG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VTFIGVQYMLHTYHFIALVLNTLIVVVGIFLYDYELKKLLLSFITKTRKKDYITKQGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCC >Mature Secondary Structure GKSILNNIIHLFYSTILANLLQAVSLIALANFFNAQHYGMFSVAIAVTFIMLFFTDLGL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC TNTFLREGAKDGVDLGKILSSYIKIRMILLIFISIIGYIAIHYMYADRNVIYMMINVMFF HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH MLIGLIFQNIGITYFQLMERMKYIALIKVVSASVVIIITCFCIFGELPVYVTARLYAFGY HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH MIGGLFSIYIMRKKTKMNMKVVIHKALFWQLTPFIISGFLIMSTPQLAPILLNYTLPLSM HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH VGVFAVAYRMPAALYQVPGVIAGAFYPVLFKHYNQKNLEEHTKLNLLQIKSMAIVGICMT HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGLYYLAPYFISIFFHEEWSNAVEPLQILSFLIVLQSLNIAIADGLTTSGRQNKRTVVQC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCCCCCCHHHHHHH IALVIGGIMLYSFSSIGGVIGAAYAMVLFEIVALVGYIAVSVVRKKIVFQIVIPYTSYFG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VTFIGVQYMLHTYHFIALVLNTLIVVVGIFLYDYELKKLLLSFITKTRKKDYITKQGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA