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The map label for this gene is 226950571

Identifier: 226950571

GI number: 226950571

Start: 3584338

End: 3585909

Strand: Reverse

Name: 226950571

Synonym: CLM_3549

Alternate gene names: NA

Gene position: 3585909-3584338 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226950572

Following gene: 226950569

Centisome position: 86.3

GC content: 25.45

Gene sequence:

>1572_bases
ATGGGATCACTTAGTTACATAGTTAGAAAAAGTATAAAAAATTATTTTAAACAACTAAAGAATAAACCGGCTAAAGCTAT
ATTGTATGTTCTTTTTATTGCCCTTTTAGTTTTTATCTTAATTGTATCTCCAGAATCAAGTGGTAATAAGAGGATAAAGG
ATGGTAAAGAATTTTTTAATGCTATAGTTACTATAGTAACTTTATATGCAGTATTTAGTGCTATTAATACAGGTACTAAA
AAGGGTAAAAGTTTTTTTAGATTAAGTGATGTGAATTTTTTGTTTACAGCTCCTATACCACCTCAAAGAGTATTGCTTTA
TGGATTCTTAAAAGAATTATATAAAAGTATGATGATGATAGTATTTCTTTTATTTCAAATACCTAATCTTTATAATTTAT
TTCCTATAAAGCAACACGGTGCCATACCTGTGGTAGTGGGTATATTCATGTTGATGTTTTCTTATTCAACTATAGCTGTA
TTAATATATTCTATAGCTGCTAAGGAAGATAAATATAGAAATTTTATAAAAAATATTCTTAATTTATTATTAGGATTATT
TGGAGCAGGTTTTTTATGGACGTTATTTAAAGTAAAATCTATAAAATTAGCTTTTATAACCTTTTTAGGGTTAGATATGT
TTTCCCAAATACCTTTTATAGGATGGAATATAAATATATTTAATGCCGCTATAGAGGGTATAAATAAGTTATTCTTTATA
AACCTACTAGGGGTACTCTTATCTATAATTTTTATAATATATATAGTGTATATTTTAAAAACAGATTATTATGAAGATGC
TATGTCAGTTACAGAGGTCAATGAAAGAAAGATAGAGAGAGCTAAAAAAGGTAAAGGAAATGTAGATTTAAATAAACCTA
TAAAAAGAAAAAATGTTATGGGGATATTAAAATCAAAGGGAGCAAAAAGTATATTTGAAAGACAAGTTTTAGAGTATAAA
AGAAGTGGATTTTTCTTTGTAGATAAGATGACCTTAGTAATGGGAGCAAGCTCCTTAGTTTTTGGATTTTTTATGAATGA
TAAAAATGGCAGTATAAATACAGTAATGTATTTTGCAATATATATGTTATTGATATTTACATTTCAAGGCAAATGGGCTG
AAGAACTGTCTAAGCCTTATATATATTTAATTCCAGAGAGTTCAGAAATTAAAGTTTTCTATGCTACCCTTACCAACCAT
ATTAAAAATTTTGTGGATGGTTTCGTATTATTTTTAATTTGTGGTATTATATTCAAAACTAATCCTATGATTATATTGTT
AGCTACATTAACCTATGTAAGTTTTGGAGCAATATTTGTATATGTGGATTTAGTTTTAAGAAGATTTTTTGGTGGTAATA
TTAGTAAAGTTGTAGAAGCCACATTAAAATTTATTTTATTAATAATAGCAGTATTACCAGGAATAATAATATCTGTAGTA
ATTTCTTTTAAGTATAAAGGATTATTTGGAACAGTTTCTATGTATCTTGCTATGATTTTATATAATTGTCTTATTAGTTT
TATAGGGATATTATTATCTAAAGGTATATTTGAAAAAATAGAGATGAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGAAAGAAGGGAATATAGTCTTTGCTAGAACCAAGCAAGAATTAATAGATAAAAATGAGTCCTTAGAAGAAATATTCTT
TGAAGTAACGGAGGGATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAAAATAGAGCATTTCAAAATAAAATATATTTAATTTAAACAGGAATAACAAAAAAATACACATTATATGTTTATGATG
TGTATTTTTTATATTTACTA

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 523; Mature: 522

Protein sequence:

>523_residues
MGSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFNAIVTIVTLYAVFSAINTGTK
KGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMIVFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAV
LIYSIAAKEDKYRNFIKNILNLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFI
NLLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVMGILKSKGAKSIFERQVLEYK
RSGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAIYMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNH
IKNFVDGFVLFLICGIIFKTNPMIILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKVVEATLKFILLIIAVLPGIIISVV
ISFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKGIFEKIEMK

Sequences:

>Translated_523_residues
MGSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFNAIVTIVTLYAVFSAINTGTK
KGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMIVFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAV
LIYSIAAKEDKYRNFIKNILNLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFI
NLLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVMGILKSKGAKSIFERQVLEYK
RSGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAIYMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNH
IKNFVDGFVLFLICGIIFKTNPMIILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKVVEATLKFILLIIAVLPGIIISVV
ISFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKGIFEKIEMK
>Mature_522_residues
GSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFNAIVTIVTLYAVFSAINTGTKK
GKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMIVFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAVL
IYSIAAKEDKYRNFIKNILNLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFIN
LLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVMGILKSKGAKSIFERQVLEYKR
SGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAIYMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNHI
KNFVDGFVLFLICGIIFKTNPMIILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKVVEATLKFILLIIAVLPGIIISVVI
SFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKGIFEKIEMK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59552; Mature: 59421

Theoretical pI: Translated: 10.33; Mature: 10.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
AIVTIVTLYAVFSAINTGTKKGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAVLIYSIAAKEDKYRNFIKNIL
HHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHH
GILKSKGAKSIFERQVLEYKRSGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAI
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHH
YMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNHIKNFVDGFVLFLICGIIFKT
HHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NPMIILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKVVEATLKFILLIIAVLPGIIISVV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKGIFEKIEMK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
GSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
AIVTIVTLYAVFSAINTGTKKGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAVLIYSIAAKEDKYRNFIKNIL
HHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHH
GILKSKGAKSIFERQVLEYKRSGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAI
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHH
YMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNHIKNFVDGFVLFLICGIIFKT
HHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NPMIILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKVVEATLKFILLIIAVLPGIIISVV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKGIFEKIEMK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA