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The map label for this gene is 226950533

Identifier: 226950533

GI number: 226950533

Start: 3531006

End: 3532424

Strand: Reverse

Name: 226950533

Synonym: CLM_3509

Alternate gene names: NA

Gene position: 3532424-3531006 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226950534

Following gene: 226950532

Centisome position: 85.01

GC content: 22.48

Gene sequence:

>1419_bases
TTGATATATAATTTATTTATGGTATTTTTTACATTCGCTATATCTTGTATTTTATTTAAAAAAGCTAGTGGAACTCTAAA
ACCCAACAAACTAAATCTTATTTCTTATATATTTTATCTATTTATATTACAAAGCTTTATAGGAAGCAGTTTAATTTATT
TAGGTTTTAGGGAACATTATTTAATACAAAAGGTAACTAATTTTTCCACTATAGGTAAAACATATGATATGATATGTTTT
ACTGCCATAGCCCTACCCTTAACTATTCTTTTAATATATAAAATATTTAATATAAATATGAGTGAAGATTATAATAATTA
CTTAAATAAAGAAGTAATTTTAGAATATGAGGACAATATTTTTGTAATAACAGTATTAATAAGTATAGTATGCTTAATAT
TCACATTAATTTTGTTTATCAAAATGAGATCAATTCCATTGATTGATTTGATAATTCATAGAAGTTCAGGGAATATAGGA
AATAAAAGAATCAATATATCACATGGTAATTATATGAATCAATATATACAAAATCTATTAGTTTTAGGACTAACGCCCAT
ACTATCTTATCTTTCATATATTTATTACAAATGTACCAAGACAAATAGATGGAAGATTTTATTTTTTGTTTTGTTTATAG
CATCTATATTTTTAAAAACTTATAATTATGCAAAGACACCTGTAGTATTTTACATATTTGTTTTCATACTAATAAATATA
GTAATAGAAGGTAGTATACCTATAAGGAAATTATTAACAGTATTAGTTTTATGTGTTTTTATAATATTATTAATGTATAT
AAAGATAGGATATGACTTTAATAAAGGATTAGATATATATAATGGTCCAATAGGTAGGACTATATTCACTCAAGTAGGAA
CTTTGTTTTTACATGTAGATTTATTTCCTTACTATATTCCATATTTAGGTGGAAGAAGTTTTTCTCCAACTATTTTAAAA
TTATTTTTAGGAGGAGTATCACAGTTTAGATCAGGAAGAGTAGTTATGAATTTTTATAGTCCTGAAAAAGTTGTAGGTGG
AACTGCTGGTGTTATGAATTCATTATTTATAGGAGAGGCTTATGCTAATTTTGGTACTATAGGAGTGTTATCATCAGTAT
TGTACATTGGAGTTTTATTAAGTATAATATTAATTATTTTTGTGAAAATTAAGAAAACTCCTATAAATATTGTGATATAT
GTTACAATAACATCTATATTAGCATCTGCATCTCAAGGTGGATTTATAGATTTTGTATATAATTTTAATATAATATTTAT
TACAGTTACATTAATATTAATTAGTTTATTTGCTAAATATATGGATAAAATTAAAGTTTTAAGATATATAAAAGTTTATG
TACTAAAATTTACTTCCTTAAATATTAAAATTAAGAAAGAGGATAAAAATGAGTGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACCTATAGAAAATATGAAAAATCAGTTAAAAAATGCTGATTCATATACTAAAGCTAAACTTTTGAATAAAGAAATTTTT
AAATGATGGGATGATGAGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAATTGTATTTTTCATATACCTTACTATTTAGATTTACAATGGCCTTCAGGTTCTAATATTAGGCCAATAAAAATGATAA
AAGCATTTGAAAGTATAGGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 472; Mature: 472

Protein sequence:

>472_residues
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHYLIQKVTNFSTIGKTYDMICF
TAIALPLTILLIYKIFNINMSEDYNNYLNKEVILEYEDNIFVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIG
NKRINISHGNYMNQYIQNLLVLGLTPILSYLSYIYYKCTKTNRWKILFFVLFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVDLFPYYIPYLGGRSFSPTILK
LFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEAYANFGTIGVLSSVLYIGVLLSIILIIFVKIKKTPINIVIY
VTITSILASASQGGFIDFVYNFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKVLRYIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC

Sequences:

>Translated_472_residues
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHYLIQKVTNFSTIGKTYDMICF
TAIALPLTILLIYKIFNINMSEDYNNYLNKEVILEYEDNIFVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIG
NKRINISHGNYMNQYIQNLLVLGLTPILSYLSYIYYKCTKTNRWKILFFVLFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVDLFPYYIPYLGGRSFSPTILK
LFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEAYANFGTIGVLSSVLYIGVLLSIILIIFVKIKKTPINIVIY
VTITSILASASQGGFIDFVYNFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKVLRYIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC
>Mature_472_residues
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHYLIQKVTNFSTIGKTYDMICF
TAIALPLTILLIYKIFNINMSEDYNNYLNKEVILEYEDNIFVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIG
NKRINISHGNYMNQYIQNLLVLGLTPILSYLSYIYYKCTKTNRWKILFFVLFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVDLFPYYIPYLGGRSFSPTILK
LFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEAYANFGTIGVLSSVLYIGVLLSIILIIFVKIKKTPINIVIY
VTITSILASASQGGFIDFVYNFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKVLRYIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54116; Mature: 54116

Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH
LIQKVTNFSTIGKTYDMICFTAIALPLTILLIYKIFNINMSEDYNNYLNKEVILEYEDNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCEEEEEECCCE
FVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIGNKRINISHGNYMNQYIQNLL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHH
VLGLTPILSYLSYIYYKCTKTNRWKILFFVLFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVD
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LFPYYIPYLGGRSFSPTILKLFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEA
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
YANFGTIGVLSSVLYIGVLLSIILIIFVKIKKTPINIVIYVTITSILASASQGGFIDFVY
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEE
NFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKVLRYIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC
ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH
LIQKVTNFSTIGKTYDMICFTAIALPLTILLIYKIFNINMSEDYNNYLNKEVILEYEDNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCEEEEEECCCE
FVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIGNKRINISHGNYMNQYIQNLL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHH
VLGLTPILSYLSYIYYKCTKTNRWKILFFVLFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVD
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LFPYYIPYLGGRSFSPTILKLFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEA
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
YANFGTIGVLSSVLYIGVLLSIILIIFVKIKKTPINIVIYVTITSILASASQGGFIDFVY
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEE
NFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKVLRYIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC
ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA