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The map label for this gene is 226950528

Identifier: 226950528

GI number: 226950528

Start: 3525183

End: 3526415

Strand: Reverse

Name: 226950528

Synonym: CLM_3504

Alternate gene names: NA

Gene position: 3526415-3525183 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226950529

Following gene: 226950527

Centisome position: 84.87

GC content: 24.33

Gene sequence:

>1233_bases
ATGGAAAGATTAAGTAATATTATTACATATTTAATTTGTTCTTATATATTTATTTTGCCTATTTTGCCAAGTAAGTATAA
ATATAAGAATATTCCTTTTAATGGTGATGTTTTGTTGCTATTAATCATAGTTTTGTTTATTATATTTATATTTATAAATG
GTGAATGGAGAAAAAAATTTTTAAATGGTATAAAAGATTTTTTTTGCAAAGCAAATACTATATTTATTTTTATGTGGGTA
GGCATGATGATTATATCGATTTTTTATTCAACTGATAAGAAATTAGCTTTACAAGAAACCATAAGAACTAGTACGTATAT
AGTATTATTTTTTATAATAAAATATGAAGTTTATAAAAAGAAATATTTAGATAAAATTATTTATTCATATATATTTACTT
CAATTATTGTAGGATTTATAGGAATATACGAATATTTAAAAGGGATTGGATTGACTCATAAAGGTGAGTTTAGTACAGTA
GTAAGATGCGTATCTACCTTAGAGAATTCTAATAATTTGGGAGGGTTTTTTATAATGATAGTATTTCCTATGATGGTACT
ATCATTTAAAGAAAAACAAAAATGCAAAAGAAATGTATATATTCTATGCTCAATTATAGCTATTATAAATATAATAATAT
CTTTTTCACGAAATGCTTGGTTAGCATTTGTAATAGGATATATGGTATTAATAATTGTATTTAATTTTAAGCTAATATAT
GGAGCTATATTGGGAGCTGGAGTGTCCTTATTTATACCTAAAATATCTAATAGATTAAGAGAAATTGGAGATGTAAGTCA
GAATTTATCTAGAATTAGTTTATGGAAAATAGCTTGGGAAATGGTAAAAGACAAGCCATTATTAGGTGTAGGAAATGGGA
ATTATAGGACTTTATACCCGCAATACTATAAAAAAGTTAAATATTTAGGATATACAGCTCAAGCAAAATTTCATCCACAT
AATGCTTATCTAAAAGCTCAATGTGAATTAGGGATAGTAGGATTAATATCGTTGCTTGGTATTTTTGTAAGTTCCGTATG
GAAGGTAAGTGAATTATCTAAGAAATCAAATAATACATTTTATAAATATTTTTACAAAGGTTTTATTGCTTCTTTAATAG
CTTTTATGTTCATGAATTTTATAGATAATTTCTTTTCAGCACCTAAAGTTATAGCCTTTTTTTGGATAAGTTTAGCTGTA
GCTGATTCTTTTGAGTATAATTGTAAAATTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTAAAATTAAAGAATAGTTAGTACCTTTATGTAAATAGATTGAATATAATTGTTCACTATTGTTATTTCTATAATCTT
TAGTTTAAGGGGACATACTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTGTAAAAAGGAGTTATAAAAACTCCTTTTTTAATGTAATAGGTGAGTCGGTACAAGCAAAAGATTATTTCGTTATT
AATTAAGATTTTATGGCTGA

Product: exopolysaccharide biosynthesis family protein

Products: NA

Alternate protein names: ExoQ Family Exopolysaccharide Biosynthesis Membrane Protein; Exopolysaccharide Biosynthesis Family Protein

Number of amino acids: Translated: 410; Mature: 410

Protein sequence:

>410_residues
MERLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVLLLLIIVLFIIFIFINGEWRKKFLNGIKDFFCKANTIFIFMWV
GMMIISIFYSTDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV
VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH
NAYLKAQCELGIVGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV
ADSFEYNCKI

Sequences:

>Translated_410_residues
MERLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVLLLLIIVLFIIFIFINGEWRKKFLNGIKDFFCKANTIFIFMWV
GMMIISIFYSTDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV
VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH
NAYLKAQCELGIVGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV
ADSFEYNCKI
>Mature_410_residues
MERLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVLLLLIIVLFIIFIFINGEWRKKFLNGIKDFFCKANTIFIFMWV
GMMIISIFYSTDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV
VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH
NAYLKAQCELGIVGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV
ADSFEYNCKI

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47537; Mature: 47537

Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MERLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVLLLLIIVLFIIFIFINGEWRKKF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
LNGIKDFFCKANTIFIFMWVGMMIISIFYSTDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKK
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTVVRCVSTLENSNNLGGFFIMI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
VFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYP
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCEEECH
QYYKKVKYLGYTAQAKFHPHNAYLKAQCELGIVGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTF
HHHHHHHHCCEEEECEECCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
YKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAVADSFEYNCKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA