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The map label for this gene is 226950398

Identifier: 226950398

GI number: 226950398

Start: 3402039

End: 3403553

Strand: Reverse

Name: 226950398

Synonym: CLM_3367

Alternate gene names: NA

Gene position: 3403553-3402039 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226950399

Following gene: 226950397

Centisome position: 81.91

GC content: 31.75

Gene sequence:

>1515_bases
TTGAAGGAATTAGTTTCTAAATTGAAAGAAGTATCATATGCTGTTCTTCCAATTATAGTTATAGTATTGATACTAAATTT
TACTTTGACGCCTCTTAGCATGACATTAATTTCAAGGTTTCTTATTGGAGCAGGTCTGATTATTATAGGATTATCTATTT
TTTTACTTGGAGTAGATATTGGAATTACTCCTATTGGTAATTTTATGGGATCAATCATAGCAAAGACAAATAAAATATGG
AAGATAGTTATTTCAGGTTTAATACTTGGATTTATTATCTCAATTGCTGAACCGGATTTACACATCCTGGCAGGGCAAGT
TGATTTTGTTACGACTGGTTTAATATCGAAGTTGAGTATTGTTGTTGTTGTATCTATTGGAATTGGAATAATGCTTTCTT
TAGGTCTTGCGAGAATTGTTCGTGGCACACCATTAAAAAAAATGTTAACAATCTTGTACTCTTTTATTTGTATACTTGCA
ATATTTACGTCAAAAGAGTTTTTAGCAATATCTTTTGATGCTTCTGGCGCCACTACTGGTGCGATGACAGTTCCATTTAT
TCTAGCTCTTGCAATGGGAGTTGTTATGTTAAAAAAAGGTGATAAAAATTCAGAGGAAGATAGTTTTGGACTAGTTGCCA
TAGCATCTACTGGTGCAATAATATCGGTTATGATTATGAATATTATTTCAAAAACTGATAAAATAACAGGGAGTCTTGAG
TACCATGAATCAATGTCATCATCAATTATTAGTCCTTTCATTGAAAAAATCCCAACAATAGCTGGAGAATCTTTTTTAGC
GCTGATACCTATATTACTCATTTTTCTTGTGTTTCAAAAAGTTTCAATTAATCTATCTAAAAAGGATTTCAACAAAATTC
TAATTGGGCTTTTATTTACATTTATGGGATTAATTTTATTCTTAGTTGGTGTTAATGCTGGTTTTATGGACGTAGGAAGT
GCTATTGGATATGAAATAGCATCTTTAGATAGTAAAGCTTACGTTATTATTATAGGATTTATTTTGGGAGTTGTTACAAT
ATTTGCTGAGCCAGCTGTTTATGTATTAATGCATCAGATAGAAGAAGTTACAAATGGACATGTAAATAGAAAAGCAGTAA
TGTTTACACTTTCTATAGGAGTTGGACTTGCAGTTGCTTTATCTATGTTAAGAATACTGATTCCTCAAATTCAATTGTGG
CATTATCTATTGCCTGGTTACCTAATTTCCATAGTAATGACTTATTTTGTACCAAATTTATTTGTGGGAATTGCATTTGA
TTCAGGGGGAGTTGCATCTGGACCAATGACAGCAACCTTTATATTAGCATTTGCACAAGGTGTTGCCGAATCAATAGAAG
GAGCAAATGTATTAGTAGATGGGTTTGGAGTAATTGCAATGGTAGCCTTAACCCCTTTAATTGCTTTACAAGTTCTAGGT
CTTATTTTTAAAATAAAGTCTGAAAGGGAAGATGTTAAAAATATTGAATCATCTCAAGAATGTATCTCATCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTAAAAAGCACAGGTCATTATTCAAATCTTTATTTAAAAATTATATTCGCAATATTAATATTAGTGCAAAAATAGTTG
ATAGAAAGGATGTATTATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTATTTTTCAGCTTAAGTTTAAGGCACATATAAGTTTTAAGTAATGATATTTAAAAGTAATTTAGCATAGGTATAATA
ATAGTTACAGGTGCTTATAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 504; Mature: 504

Protein sequence:

>504_residues
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLLGVDIGITPIGNFMGSIIAKTNKIW
KIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSIVVVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILA
IFTSKEFLAISFDASGATTGAMTVPFILALAMGVVMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGESFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFTFMGLILFLVGVNAGFMDVGS
AIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQIEEVTNGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLW
HYLLPGYLISIVMTYFVPNLFVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
LIFKIKSEREDVKNIESSQECISS

Sequences:

>Translated_504_residues
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLLGVDIGITPIGNFMGSIIAKTNKIW
KIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSIVVVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILA
IFTSKEFLAISFDASGATTGAMTVPFILALAMGVVMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGESFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFTFMGLILFLVGVNAGFMDVGS
AIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQIEEVTNGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLW
HYLLPGYLISIVMTYFVPNLFVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
LIFKIKSEREDVKNIESSQECISS
>Mature_504_residues
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLLGVDIGITPIGNFMGSIIAKTNKIW
KIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSIVVVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILA
IFTSKEFLAISFDASGATTGAMTVPFILALAMGVVMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGESFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFTFMGLILFLVGVNAGFMDVGS
AIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQIEEVTNGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLW
HYLLPGYLISIVMTYFVPNLFVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
LIFKIKSEREDVKNIESSQECISS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53908; Mature: 53908

Theoretical pI: Translated: 6.69; Mature: 6.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLLGVDI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GITPIGNFMGSIIAKTNKIWKIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
VVVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILAIFTSKEFLAISFDASGATTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC
AMTVPFILALAMGVVMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGESFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FMGLILFLVGVNAGFMDVGSAIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
EEVTNGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLWHYLLPGYLISIVMTYFVPNL
HHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
HEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIFKIKSEREDVKNIESSQECISS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLLGVDI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GITPIGNFMGSIIAKTNKIWKIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
VVVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILAIFTSKEFLAISFDASGATTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC
AMTVPFILALAMGVVMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGESFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FMGLILFLVGVNAGFMDVGSAIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
EEVTNGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLWHYLLPGYLISIVMTYFVPNL
HHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
HEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIFKIKSEREDVKNIESSQECISS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA