Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 226950344

Identifier: 226950344

GI number: 226950344

Start: 3343510

End: 3344199

Strand: Reverse

Name: 226950344

Synonym: CLM_3311

Alternate gene names: NA

Gene position: 3344199-3343510 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226950345

Following gene: 226950343

Centisome position: 80.48

GC content: 22.46

Gene sequence:

>690_bases
ATGAAGAGTATTATTAACTTAATAATTAATGATTTAATATTATGTAGAAAAATTTTTTTAGTTTCTATACCTATGATAAT
ATTTTTGGCCTTTACAGGATTAGGATACAGTACTAATGGAGAACAGCATTGTATATATGTTTATGTTATAGCTATGTCTT
CTTATATATTAATAAACTATGTAGAACAAGCTATAACTAAAAATAAGAGTAATATGTTTATATATAGCTTACCCATTGAA
AAAAACAATATAGTCTTAGAAAAATATTTATTTGTAATTGGTATAAATATAATAAATTGGGGTATATGTATTTTAACAAC
AGTAACATTTTCAATTATTCTAAAAGGTAGTTTTAAAGGCAATATATGTTCTATAGGTGATTTAGTTTTTGCAGCCACTT
TAGCTTCTATATATTATAGTGTATACTATCCTTTCTATTTCAAATTAGGACCTAATAAAATAAATCTTTTTAGCAAATGT
ATATATATGCTTATAATTGTTTTACCTGTAATCATCCAAAGGATAATAGGCATTTTAAATATATCTATATCTAAAAAAGA
TTTTTATGGACAAATTAATGTTGTACAGAGCAAGTTCTTATGGATCATATTATTTGAGATTATAATGGTTACTATTTCAG
CATATATATCTATGGTAATTCATAAACATAAAACTATTATGTATGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAAAATTTATTTTGATATCCACAATAATAATCATAATTTTATTTATTATATCTGCTATTTTATCCATGAGAATATATGA
AAAGAAAGAGAGCATGTAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATATTAAAATTTTAAAATAATAATAGGATATAATTAATTTTAGGAGAGATATATATGATTATAGGTACAGCTAAAATAC
ATTTATATGCTAATTGGGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 229; Mature: 229

Protein sequence:

>229_residues
MKSIINLIINDLILCRKIFLVSIPMIIFLAFTGLGYSTNGEQHCIYVYVIAMSSYILINYVEQAITKNKSNMFIYSLPIE
KNNIVLEKYLFVIGINIINWGICILTTVTFSIILKGSFKGNICSIGDLVFAATLASIYYSVYYPFYFKLGPNKINLFSKC
IYMLIIVLPVIIQRIIGILNISISKKDFYGQINVVQSKFLWIILFEIIMVTISAYISMVIHKHKTIMYE

Sequences:

>Translated_229_residues
MKSIINLIINDLILCRKIFLVSIPMIIFLAFTGLGYSTNGEQHCIYVYVIAMSSYILINYVEQAITKNKSNMFIYSLPIE
KNNIVLEKYLFVIGINIINWGICILTTVTFSIILKGSFKGNICSIGDLVFAATLASIYYSVYYPFYFKLGPNKINLFSKC
IYMLIIVLPVIIQRIIGILNISISKKDFYGQINVVQSKFLWIILFEIIMVTISAYISMVIHKHKTIMYE
>Mature_229_residues
MKSIINLIINDLILCRKIFLVSIPMIIFLAFTGLGYSTNGEQHCIYVYVIAMSSYILINYVEQAITKNKSNMFIYSLPIE
KNNIVLEKYLFVIGINIINWGICILTTVTFSIILKGSFKGNICSIGDLVFAATLASIYYSVYYPFYFKLGPNKINLFSKC
IYMLIIVLPVIIQRIIGILNISISKKDFYGQINVVQSKFLWIILFEIIMVTISAYISMVIHKHKTIMYE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 26257; Mature: 26257

Theoretical pI: Translated: 9.45; Mature: 9.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.2 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
5.7 %Cys+Met (Translated Protein)
2.2 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
5.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSIINLIINDLILCRKIFLVSIPMIIFLAFTGLGYSTNGEQHCIYVYVIAMSSYILINY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHH
VEQAITKNKSNMFIYSLPIEKNNIVLEKYLFVIGINIINWGICILTTVTFSIILKGSFKG
HHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCC
NICSIGDLVFAATLASIYYSVYYPFYFKLGPNKINLFSKCIYMLIIVLPVIIQRIIGILN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISISKKDFYGQINVVQSKFLWIILFEIIMVTISAYISMVIHKHKTIMYE
CEEECHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECC
>Mature Secondary Structure
MKSIINLIINDLILCRKIFLVSIPMIIFLAFTGLGYSTNGEQHCIYVYVIAMSSYILINY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHH
VEQAITKNKSNMFIYSLPIEKNNIVLEKYLFVIGINIINWGICILTTVTFSIILKGSFKG
HHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCC
NICSIGDLVFAATLASIYYSVYYPFYFKLGPNKINLFSKCIYMLIIVLPVIIQRIIGILN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISISKKDFYGQINVVQSKFLWIILFEIIMVTISAYISMVIHKHKTIMYE
CEEECHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA