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The map label for this gene is ylbJ [H]

Identifier: 226949844

GI number: 226949844

Start: 2802362

End: 2803528

Strand: Direct

Name: ylbJ [H]

Synonym: CLM_2791

Alternate gene names: 226949844

Gene position: 2802362-2803528 (Clockwise)

Preceding gene: 226949843

Following gene: 226949851

Centisome position: 67.44

GC content: 24.08

Gene sequence:

>1167_bases
GTGCCTTTGTTTTTTTATATAATGTTATTTTTAATATTTATTTTACTTTTTAAACTCTTTAAAAATGAAAATATAATAAT
AACCTTTTTATGTTCAATTTTAATCATATATATTATTATAGCACCTAGGTTTTGTATAGAAGCTACTTTATCTGGTGCTA
AGTTATTTTTTTATAAGGTTTTTCCTTCTTTATTTCCTTTTCTAATACTTACGAATATAATAATAAATTATGGTGGAGTA
CATGTATATTCTAAAATATTTGGGAAAATTCTATGTCCCCCCCTAAAGCTAAAAAAAGAATGTAGTTTTCCCCTAATAAT
AAGCGCCCTTTGTGGTTATCCCTTAGGAGCAAAATACTCCTGTGATCTTTACCAAAATGGTGATATTAATTTTCCTACTT
TGGAAAGACTTATAAATATAGCTTCTAATGCTGGTCCATTATTTATAATTGGATCTGTAGGTACTTCCATGTTAGGCAAT
CCTTATGCAGGATATGTATTACTCTTATCAAATTATATTTCCTGTATTATAGTAGGTCTTATTTTACCTAGCAGAAACAC
TAAAATGTATAGAAATTTTAAAGAAAATTTGAAAACATCAAATAAAAACATAGGTGAATCTTTAAAGAATAGCATTGAAG
GTGCCATAAAAACCTGTATAGGTGTAGCAGGATTTGTAATACTGTTTTCTTTATTGCTTAGTATACTAAAGAATAATTTC
CTTTTTAAATTTATATTAAATAAGTTATGCATTTTTTTTAATGCAGATAAAAACCTAATAGAAGGATTTCTATTAGGCTT
AGTAGAAATGACCAATGGATGTTATTTAATTTCCACAAGTTCTATTGATATATCTAAAAAATTAATATTAATAAGCTTCC
TATTAGCTTTTAGTGGATTTTCTATAATATCTCAAGTTTACTCTTTTACTTATAAACATGGTATAAATATTAAAAGATAT
ATAAAAATAAAATTTATGCAAGGACTTATAGCTTCTATAACCTGCATTGTTTTATACAGAATCCCCATATTTTCCATGTA
TCTAGATGCTTTTACAGATAAAAATACTTATCTAATTTTAAGTAACAATTTATTATTTATATTTATTTTATTTCTTTTAA
TTATACCCTTAATAATATACTATATAAAATCTTTAAATAAAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTAGAAGTCCTACTATAATAAAAAATACTATTTATTAATGTAATAATATTTAATTTTAAAAATATAATTATAATAAA
TCAATTCTAGGAGTCTTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTTATATTTCTTAATTCCTTTATATTTTCTCTTATAGTATCTGTTTTTATCTCTACACTTTCTTCTAAAGAAGCCG
CAAAGGCTTCTAAATTTTTT

Product: nucleoside recognition domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 388; Mature: 387

Protein sequence:

>388_residues
MPLFFYIMLFLIFILLFKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKVFPSLFPFLILTNIIINYGGV
HVYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYSCDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGN
PYAGYVLLLSNYISCIIVGLILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSILKNNF
LFKFILNKLCIFFNADKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLILISFLLAFSGFSIISQVYSFTYKHGINIKRY
IKIKFMQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLILSNNLLFIFILFLLIIPLIIYYIKSLNKI

Sequences:

>Translated_388_residues
MPLFFYIMLFLIFILLFKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKVFPSLFPFLILTNIIINYGGV
HVYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYSCDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGN
PYAGYVLLLSNYISCIIVGLILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSILKNNF
LFKFILNKLCIFFNADKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLILISFLLAFSGFSIISQVYSFTYKHGINIKRY
IKIKFMQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLILSNNLLFIFILFLLIIPLIIYYIKSLNKI
>Mature_387_residues
PLFFYIMLFLIFILLFKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKVFPSLFPFLILTNIIINYGGVH
VYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYSCDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGNP
YAGYVLLLSNYISCIIVGLILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSILKNNFL
FKFILNKLCIFFNADKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLILISFLLAFSGFSIISQVYSFTYKHGINIKRYI
KIKFMQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLILSNNLLFIFILFLLIIPLIIYYIKSLNKI

Specific function: Required for spore cortex formation [H]

COG id: COG3314

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011642
- InterPro:   IPR014226 [H]

Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43947; Mature: 43816

Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.8 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
2.8 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPLFFYIMLFLIFILLFKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHHHHHHH
FPSLFPFLILTNIIINYGGVHVYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEE
CDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGNPYAGYVLLLSNYISCIIVGL
ECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSILKNNF
HCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
LFKFILNKLCIFFNADKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLILISFLLAFSGF
HHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCH
SIISQVYSFTYKHGINIKRYIKIKFMQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLIL
HHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
SNNLLFIFILFLLIIPLIIYYIKSLNKI
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
PLFFYIMLFLIFILLFKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHHHHHHH
FPSLFPFLILTNIIINYGGVHVYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEE
CDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGNPYAGYVLLLSNYISCIIVGL
ECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSILKNNF
HCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
LFKFILNKLCIFFNADKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLILISFLLAFSGF
HHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCH
SIISQVYSFTYKHGINIKRYIKIKFMQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLIL
HHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
SNNLLFIFILFLLIIPLIIYYIKSLNKI
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377; 12662922 [H]