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The map label for this gene is glnT [H]

Identifier: 226948514

GI number: 226948514

Start: 1459792

End: 1461228

Strand: Reverse

Name: glnT [H]

Synonym: CLM_1404

Alternate gene names: 226948514

Gene position: 1461228-1459792 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226948521

Following gene: 226948506

Centisome position: 35.17

GC content: 32.15

Gene sequence:

>1437_bases
ATGAGTTTTATAGAAAATTTTATATCAGTATTAAACAATTATCTATGGTCTTATATACTGATAGCATTATTAATAGCTTT
AGGTTTATTCTTCTCTTTTAAATCTAAATTTGTTCAAATTAGATATTTTAAAGAAATGTTTAGATTACTAGGGGAAGGTG
CAAGTAAATCCGCTAGAGAGGAACATAAAAAGAAAAAAGGAGTTTCTTCTTTTCAAGCCTTCTGTATAAGTACAGCTTCA
AGAGTTGGTACTGGTAACTTAGCTGGTGTGGCTATAGCTATCGCTTCTGGAGGTCCCGGTGCTGTATTTTGGATGTGGCT
TATAGCTCTAATCGGTGGTGCTTCAAGTTTTGTTGAAAGCACTTTAGCACAAATATATAAAGTAGAAGATGAACATGGCT
TTAGGGGCGGTCCTGCTTATTATATGGAAAAAGCTTTAAATAAAAAATGGATGGGAATAATATTTTCTATATTAATAACT
ATAAGTTACGGTCTTGTATTTAACTCCGTACAAGCTAACACTATCTCTTTAGCTTTTGAACAAGCCTTTGGTGTAAACAC
TTTAATTATAGGATTAATACTAGCGTTCCTTACCTCTCTTATTATATTTGGTGGTGTTCAAAGAATTGCTAGAGCAACTG
AAATTATTGTTCCAATAATGGCAATAGCTTATGTAGTAGTAGCTTTATTCGTTATTTTAAAAAATATAGGCAGTATTCCT
ACTATATTTTCTCTTATTATAGAAAATGCTTTTGGTATAAAACAGGTTGTTGGTGGTAGCTTAGGAGCTGCTATACTTAT
GGGTATTAAAAGAGGATTGTTTTCTAATGAAGCTGGAATGGGAAGTGCACCAAATGCTGCTGCAACAGCTAATGTTACTC
ACCCTGCTAAACAAGGACTTATTCAAACTTTAGGTGTATTTACAGATACTATATTAATATGTAGCGCAACTTCTTTCATA
GTTTTAATCTCTGGTAGCTATTTAAAAAGTGACTTAACAGGAATTCAGCTTACACAAACTGCATTAAGTTCACAGGTAGG
TTCTTGGGGAAATACTTTTATAGCCATTTGTATATTCCTTTTTGCTTTTAGTTCTGTAATAGGAAATTACTACTATGGAG
AAACAAACATAGAATTTTTAAAAGGAAGTAAAACTAGTCTATTTTTATATAGACTGTGTGTAATAGGTATGGTTCTCTTT
GGATGTGTTGCTAAAATTCAAATAGTTTGGGACATGGCTGATCTATTCATGGGATTTATGGCTATAATAAACTTAATTGC
TATATCTATGTTATCTAAAATAGCTTTCGCAGCTTTAAAAGATTATGATAGACAAAAGAAACAAGGTATAGAACCTGTTT
TTTATGCAGACAGCATTGAAGGTTTAAGTAATATAGAATGTTGGCCAACTCGCGAAGAAGCAGAAAAATCAGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTGATATTCATATTATTTTCTGATACAATTTTAAATGTATTTATATAAAGCAAATAATTTAATAACATAAAAATATA
TTTGGAAAGGTGGAAATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTAGTACTATTTATCAAACTGATTATAATAGTGAGTTGTTTTAAAATAGAGTTAATTTTAAAACAGCAAAAATAAAAA
AATACATGTAATAAACATAT

Product: sodium:alanine symporter family protein

Products: Na (I) [Cytoplasm]; L-alanine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 478; Mature: 477

Protein sequence:

>478_residues
MSFIENFISVLNNYLWSYILIALLIALGLFFSFKSKFVQIRYFKEMFRLLGEGASKSAREEHKKKKGVSSFQAFCISTAS
RVGTGNLAGVAIAIASGGPGAVFWMWLIALIGGASSFVESTLAQIYKVEDEHGFRGGPAYYMEKALNKKWMGIIFSILIT
ISYGLVFNSVQANTISLAFEQAFGVNTLIIGLILAFLTSLIIFGGVQRIARATEIIVPIMAIAYVVVALFVILKNIGSIP
TIFSLIIENAFGIKQVVGGSLGAAILMGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATANVTHPAKQGLIQTLGVFTDTILICSATSFI
VLISGSYLKSDLTGIQLTQTALSSQVGSWGNTFIAICIFLFAFSSVIGNYYYGETNIEFLKGSKTSLFLYRLCVIGMVLF
GCVAKIQIVWDMADLFMGFMAIINLIAISMLSKIAFAALKDYDRQKKQGIEPVFYADSIEGLSNIECWPTREEAEKSA

Sequences:

>Translated_478_residues
MSFIENFISVLNNYLWSYILIALLIALGLFFSFKSKFVQIRYFKEMFRLLGEGASKSAREEHKKKKGVSSFQAFCISTAS
RVGTGNLAGVAIAIASGGPGAVFWMWLIALIGGASSFVESTLAQIYKVEDEHGFRGGPAYYMEKALNKKWMGIIFSILIT
ISYGLVFNSVQANTISLAFEQAFGVNTLIIGLILAFLTSLIIFGGVQRIARATEIIVPIMAIAYVVVALFVILKNIGSIP
TIFSLIIENAFGIKQVVGGSLGAAILMGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATANVTHPAKQGLIQTLGVFTDTILICSATSFI
VLISGSYLKSDLTGIQLTQTALSSQVGSWGNTFIAICIFLFAFSSVIGNYYYGETNIEFLKGSKTSLFLYRLCVIGMVLF
GCVAKIQIVWDMADLFMGFMAIINLIAISMLSKIAFAALKDYDRQKKQGIEPVFYADSIEGLSNIECWPTREEAEKSA
>Mature_477_residues
SFIENFISVLNNYLWSYILIALLIALGLFFSFKSKFVQIRYFKEMFRLLGEGASKSAREEHKKKKGVSSFQAFCISTASR
VGTGNLAGVAIAIASGGPGAVFWMWLIALIGGASSFVESTLAQIYKVEDEHGFRGGPAYYMEKALNKKWMGIIFSILITI
SYGLVFNSVQANTISLAFEQAFGVNTLIIGLILAFLTSLIIFGGVQRIARATEIIVPIMAIAYVVVALFVILKNIGSIPT
IFSLIIENAFGIKQVVGGSLGAAILMGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATANVTHPAKQGLIQTLGVFTDTILICSATSFIV
LISGSYLKSDLTGIQLTQTALSSQVGSWGNTFIAICIFLFAFSSVIGNYYYGETNIEFLKGSKTSLFLYRLCVIGMVLFG
CVAKIQIVWDMADLFMGFMAIINLIAISMLSKIAFAALKDYDRQKKQGIEPVFYADSIEGLSNIECWPTREEAEKSA

Specific function: Probably functions as a sodium/glutamine symporter for glutamine uptake [H]

COG id: COG1115

COG function: function code E; Na+/alanine symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:alanine (SAF) symporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786188, Length=463, Percent_Identity=42.7645788336933, Blast_Score=371, Evalue=1e-104,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001463 [H]

Pfam domain/function: PF01235 Na_Ala_symp [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51856; Mature: 51724

Theoretical pI: Translated: 9.04; Mature: 9.04

Prosite motif: PS00873 NA_ALANINE_SYMP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSFIENFISVLNNYLWSYILIALLIALGLFFSFKSKFVQIRYFKEMFRLLGEGASKSARE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
EHKKKKGVSSFQAFCISTASRVGTGNLAGVAIAIASGGPGAVFWMWLIALIGGASSFVES
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
TLAQIYKVEDEHGFRGGPAYYMEKALNKKWMGIIFSILITISYGLVFNSVQANTISLAFE
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
QAFGVNTLIIGLILAFLTSLIIFGGVQRIARATEIIVPIMAIAYVVVALFVILKNIGSIP
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
TIFSLIIENAFGIKQVVGGSLGAAILMGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATANVTHPAKQGL
HHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
IQTLGVFTDTILICSATSFIVLISGSYLKSDLTGIQLTQTALSSQVGSWGNTFIAICIFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
FAFSSVIGNYYYGETNIEFLKGSKTSLFLYRLCVIGMVLFGCVAKIQIVWDMADLFMGFM
HHHHHHHCCCEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIINLIAISMLSKIAFAALKDYDRQKKQGIEPVFYADSIEGLSNIECWPTREEAEKSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
SFIENFISVLNNYLWSYILIALLIALGLFFSFKSKFVQIRYFKEMFRLLGEGASKSARE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
EHKKKKGVSSFQAFCISTASRVGTGNLAGVAIAIASGGPGAVFWMWLIALIGGASSFVES
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
TLAQIYKVEDEHGFRGGPAYYMEKALNKKWMGIIFSILITISYGLVFNSVQANTISLAFE
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
QAFGVNTLIIGLILAFLTSLIIFGGVQRIARATEIIVPIMAIAYVVVALFVILKNIGSIP
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
TIFSLIIENAFGIKQVVGGSLGAAILMGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATANVTHPAKQGL
HHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
IQTLGVFTDTILICSATSFIVLISGSYLKSDLTGIQLTQTALSSQVGSWGNTFIAICIFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
FAFSSVIGNYYYGETNIEFLKGSKTSLFLYRLCVIGMVLFGCVAKIQIVWDMADLFMGFM
HHHHHHHCCCEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIINLIAISMLSKIAFAALKDYDRQKKQGIEPVFYADSIEGLSNIECWPTREEAEKSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; L-alanine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + L-alanine [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + L-alanine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]