| Definition | Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012563 |
| Length | 4,155,278 |
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The map label for this gene is feoB [C]
Identifier: 226948306
GI number: 226948306
Start: 1227441
End: 1229597
Strand: Direct
Name: feoB [C]
Synonym: CLM_1186
Alternate gene names: 226948306
Gene position: 1227441-1229597 (Clockwise)
Preceding gene: 226948305
Following gene: 226948307
Centisome position: 29.54
GC content: 31.43
Gene sequence:
>2157_bases ATGGAAAATATAAGAATTGCTCTTGTAGGAAATCCTAATTGTGGTAAAACTACAATGTTTAATTATTTAACTGGTAGTTC ACAGTATGTAGGTAACTGGCCTGGAGTAACTGTAGAAAAAAAAGAAGGTAAATTAAAACAACATAAAGATGTAAAAGTCA TAGATTTACCTGGAATATATTCACTTTCACCATATACTTTAGAAGAAGTTATAACAAGAAACTATCTTATTACAGAAAAA CCAGAGGTTATTATAAATATAGTAGATGGTACAAACCTTGAAAGAAACTTATATTTATCAACTCAGGTAATGGAGCTTGG AATTCCTGTTATAATAGCCTTAAATATGATGGATATTGTTAGAAAAAATGGAGATATCATAGATAAGGACAAGTTAAGTA AATCTATGGGTTGTACTGTAGTTGAAACATCTGCTTTAAAAGGTGATGGGTGTAAAGAATTAATTGATAAAGCAATAGAA TTAGCTAAATCACATAAAAATAATATAATTGAACATACTTTTTCAAATGATGTGGAGAAAGTATTATCTGATATTGAGAA TGAAATTTATAATCAGGTTAAAAAAGAACATTTACGTTGGTTTGCTATAAAATTGTTTGAAAATGATGAAAAAGCAATTG AACAAGGAAATATTTCAAAGGCTTCGAAAGATAAAGTTAAAATCATTGTGTCTAGTTGTGAAGATGAATTAGATGATGAT GGTGAAAGTATCATAACTAATGAACGTTATAATTACATAAGCAAAATAATTAGTAAATGTGTAGTTAAGAAAAATAAATC CAAGTTAACTACTTCAGATAAAATAGATAAAATAGTTACTAATAGAGTTTTAGGATTGCCTATATTTGCAGCTGTTATGT TCCTTGTTTATTATTTATCTATTTCGACAATAGGAACTGGAGCTACGGATTGGGTAAATGACGTGTTGTTTGGTGATATT ATACCTCCAGCAGTAGAGGGATTTCTTACATCTATAGGAACTGCTGCTTGGTTAAATTCTTTAATACTTGATGGTATTAT TGCTGGTGTAGGAGCTGTACTCGGATTCTTACCTCAAATGATGGTATTATTTTTATGTCTTTCAATTTTAGAAGATTGTG GTTATATGTCACGTATAGCTTTCATAATGGATAGAATATTCCGTAAGTTCGGTCTTTCAGGTAAGTCATTTATTCCTATG CTTATAGGAACAGGTTGCGGGGTGCCGGGAATAATGGCATCAAGAACTATTGAAAATGAGTCAGATAGAAAAATGACTAT TATTACTACTACATTTATGCCTTGTTCTGCAAAACTTCCAATAATAGCTTTGATTGCAGGGGCATTATTCCCAGGTTCAG TTTGGGTAGCACCTTCAGCATATTTTGTTGGAATTGCAGCTATTATATGTTCTGGAATAATTTTAAAGAAAACAAAAGCA TTTGCAGGTGAGCCTGCTCCATTTGTTATGGAATTGCCAAAATATCATGTGCCTGGTGTAAAAGGTGTACTTATTCATAT GTGGGATAGAGCAAAATCTTTCGTTAAAAAAGCAGGTACTGTAATATTCCTTGCTTCTGGATTAATATGGTTCTTAAGTA CTTTCAACTGGTCATTAGCAATGGTAGAAACTCCTGAATCAATGTTGGCTTCAATTGGTAAAGTAATATCTCCTATATTT AATCCACTAGGATGGGGAGATTGGAAAGCAGCAGTAGCTACTATTACAGGATTAATTGCAAAAGAAAATGTAGTTGGTAC ATTTGGTATTTTATATGGTGCTGGAGAAGTAGCAGAAGATGGTGTGGAAATTTGGAAAACTCTACAAGGATCATTTACAC AATTATCTGCATATTCATTCTTACTATTTAACTTATTATGTGCTCCATGTTTTGCAGCAATTGGTGCAATTAAACGTGAA ATGGGTAATAAGAAATGGACTTGGTTAGCTGTTGGATATCAAACTGGATTAGCTTATGGAGTTGCATTTACAGTTTATCA ATTAGGATCACTTTTCACAGGAAAAGGATTTGGAATTGGAACCCTAGTTGCTTTAGTATTATTAGTAGGATTCTTATATT TATTATTTAGACCATATAAGGATTTAACTAATTCAACTAATCATAGAAGCAATAAAGTAGAAAATATTAGCGCATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GAAGTAAATATTAGAAATTATGAATTAACACTTCGTAAAGCCGATGCAGAAATGATAGAAGTAAAATAAAAAAATTATAT ACCTTTTAGGAGGGAATTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CGCATAAGGAGATAATAATTATGGCTACATTTATAATTGGTACATTAGTAATAGGATCCTTTGTTGTTGTTGGACACAAA GTTTATAAAGACAAGAAAAA
Product: ferrous iron transport protein B
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 718; Mature: 718
Protein sequence:
>718_residues MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIYSLSPYTLEEVITRNYLITEK PEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIVRKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGDGCKELIDKAIE LAKSHKNNIIEHTFSNDVEKVLSDIENEIYNQVKKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKASKDKVKIIVSSCEDELDDD GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLSISTIGTGATDWVNDVLFGDI IPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQMMVLFLCLSILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPM LIGTGCGVPGIMASRTIENESDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGSVWVAPSAYFVGIAAIICSGIILKKTKA FAGEPAPFVMELPKYHVPGVKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTVIFLASGLIWFLSTFNWSLAMVETPESMLASIGKVISPIF NPLGWGDWKAAVATITGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAEDGVEIWKTLQGSFTQLSAYSFLLFNLLCAPCFAAIGAIKRE MGNKKWTWLAVGYQTGLAYGVAFTVYQLGSLFTGKGFGIGTLVALVLLVGFLYLLFRPYKDLTNSTNHRSNKVENISA
Sequences:
>Translated_718_residues MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIYSLSPYTLEEVITRNYLITEK PEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIVRKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGDGCKELIDKAIE LAKSHKNNIIEHTFSNDVEKVLSDIENEIYNQVKKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKASKDKVKIIVSSCEDELDDD GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLSISTIGTGATDWVNDVLFGDI IPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQMMVLFLCLSILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPM LIGTGCGVPGIMASRTIENESDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGSVWVAPSAYFVGIAAIICSGIILKKTKA FAGEPAPFVMELPKYHVPGVKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTVIFLASGLIWFLSTFNWSLAMVETPESMLASIGKVISPIF NPLGWGDWKAAVATITGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAEDGVEIWKTLQGSFTQLSAYSFLLFNLLCAPCFAAIGAIKRE MGNKKWTWLAVGYQTGLAYGVAFTVYQLGSLFTGKGFGIGTLVALVLLVGFLYLLFRPYKDLTNSTNHRSNKVENISA >Mature_718_residues MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIYSLSPYTLEEVITRNYLITEK PEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIVRKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGDGCKELIDKAIE LAKSHKNNIIEHTFSNDVEKVLSDIENEIYNQVKKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKASKDKVKIIVSSCEDELDDD GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLSISTIGTGATDWVNDVLFGDI IPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQMMVLFLCLSILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPM LIGTGCGVPGIMASRTIENESDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGSVWVAPSAYFVGIAAIICSGIILKKTKA FAGEPAPFVMELPKYHVPGVKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTVIFLASGLIWFLSTFNWSLAMVETPESMLASIGKVISPIF NPLGWGDWKAAVATITGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAEDGVEIWKTLQGSFTQLSAYSFLLFNLLCAPCFAAIGAIKRE MGNKKWTWLAVGYQTGLAYGVAFTVYQLGSLFTGKGFGIGTLVALVLLVGFLYLLFRPYKDLTNSTNHRSNKVENISA
Specific function: Probable GTP-driven transporter of Fe(2+) ion [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=749, Percent_Identity=35.781041388518, Blast_Score=409, Evalue=1e-115,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003373 - InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011619 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR006073 - InterPro: IPR002917 - InterPro: IPR005225 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78682; Mature: 78682
Theoretical pI: Translated: 8.13; Mature: 8.13
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIY CCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHCCCCEEEECCCCC SLSPYTLEEVITRNYLITEKPEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIV CCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH RKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGDGCKELIDKAIELAKSHKNNIIEHTFSNDVEK HCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH VLSDIENEIYNQVKKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKASKDKVKIIVSSCEDELDDD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLS CCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISTIGTGATDWVNDVLFGDIIPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQM HHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MVLFLCLSILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPMLIGTGCGVPGIMASRTIENE HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCC SDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGSVWVAPSAYFVGIAAIICSGIILKKTKA CCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH FAGEPAPFVMELPKYHVPGVKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTVIFLASGLIWFLSTFNWSLA HCCCCCCHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCEEE MVETPESMLASIGKVISPIFNPLGWGDWKAAVATITGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAED EEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHH GVEIWKTLQGSFTQLSAYSFLLFNLLCAPCFAAIGAIKREMGNKKWTWLAVGYQTGLAYG HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHH VAFTVYQLGSLFTGKGFGIGTLVALVLLVGFLYLLFRPYKDLTNSTNHRSNKVENISA HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MENIRIALVGNPNCGKTTMFNYLTGSSQYVGNWPGVTVEKKEGKLKQHKDVKVIDLPGIY CCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHCCCCEEEECCCCC SLSPYTLEEVITRNYLITEKPEVIINIVDGTNLERNLYLSTQVMELGIPVIIALNMMDIV CCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH RKNGDIIDKDKLSKSMGCTVVETSALKGDGCKELIDKAIELAKSHKNNIIEHTFSNDVEK HCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH VLSDIENEIYNQVKKEHLRWFAIKLFENDEKAIEQGNISKASKDKVKIIVSSCEDELDDD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC GESIITNERYNYISKIISKCVVKKNKSKLTTSDKIDKIVTNRVLGLPIFAAVMFLVYYLS CCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISTIGTGATDWVNDVLFGDIIPPAVEGFLTSIGTAAWLNSLILDGIIAGVGAVLGFLPQM HHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MVLFLCLSILEDCGYMSRIAFIMDRIFRKFGLSGKSFIPMLIGTGCGVPGIMASRTIENE HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCC SDRKMTIITTTFMPCSAKLPIIALIAGALFPGSVWVAPSAYFVGIAAIICSGIILKKTKA CCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH FAGEPAPFVMELPKYHVPGVKGVLIHMWDRAKSFVKKAGTVIFLASGLIWFLSTFNWSLA HCCCCCCHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCEEE MVETPESMLASIGKVISPIFNPLGWGDWKAAVATITGLIAKENVVGTFGILYGAGEVAED EEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHH GVEIWKTLQGSFTQLSAYSFLLFNLLCAPCFAAIGAIKREMGNKKWTWLAVGYQTGLAYG HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHH VAFTVYQLGSLFTGKGFGIGTLVALVLLVGFLYLLFRPYKDLTNSTNHRSNKVENISA HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]