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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 226947553

GI number: 226947553

Start: 410734

End: 412596

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: CLM_0390

Alternate gene names: 226947553

Gene position: 410734-412596 (Clockwise)

Preceding gene: 226947552

Following gene: 226947554

Centisome position: 9.88

GC content: 25.12

Gene sequence:

>1863_bases
ATGAATTTTAGAGAATTTTGCACCAAAAATGTAGTAAGAAATATTAGAGCATATTTTGCATATTTATTAAGTAGTACCAT
ATCAGCAGCTTTATTATTTTCATTTACTATGCTTGTATTACATCCTAATTTAGATGTAACTACATTTCCAATATATTTAC
AGAAGGCATTTAATATAACAACAATAATTGCATATCTATTTTTATGTTTATTTATATTTTATTCTGTAAGTGTATTTATA
AAGAGTAGGTTTAAAGAGTTCGGTATATTATATATTTTAGGATCTTCGGATAAACAAATTAAAAAGATGATTGCAATTGA
AAATGTATTAATTAGTTCACTATCTGGAATATTTGGGATTATATTAGGATTAGTTTTTTCTAAAATATTTTTAATACTTA
GTGGAAGACTTTTAGGGTATAATGCTTTACGATTCTATTTGCCAGTTAAAGCAATTATAATAACTTTTTTAGCCTTTGTT
TTAATGGGAATTTTAATTTCTATCTTTACTACATATATGATAAAGGAAGATGAAGTTTTAAATTTACTCAAGGGCACACA
AAAACCAAAGAATGAGCCAAAGACTTCAAATATTATTGCAATATTGTGTGTAGTATTATTGCTTGGAGGATATTATTTTT
CTATTACATCAACTATGAATAATATAGCCTATAGAATTATACCTGTAACAGTAGTAGTTATAATTGGAACATATTTGTTG
TTTTCACAATTAAGCGTTTTTGTAATAAAGATTTTAAAAAAGGATAGAGAATTCTATATGAATAAAACAAAGGTATTATG
GATTTCAACCCTTTTATATAGGATAAAGGATAATACTAGAATGTTCTTTTTAATCACCATAACTTCTGCCATGGCATTTA
CATCTATTGGAGCTGTATCAGCTTTTTGGATCAATAAGGAGGCTGAAGTTGATAAAAATTTTCCTCAAGCATTTTTTTAC
GCATCTTACAAAAAAAATTATAACGAATTAGACTTTATAGAAGGTTCTTTAAAAAAAGAAGGTTATAATTATACAAAAAT
TCAAGGGCATATTAAGTCTTTAGTATCTAAGAAAAATACTATACCTATAAATATAATTAATGAAAGTACCTATAATAGTA
TAGCTGAATCACTTGGACAAGAAAAAATACATATTAAAAGTAATGAAGCAATAGCAGGGACACCATTAATGGGTAATAAG
AGAGATAATATTTTAGTAGATAATATGGATATAAAAGTTATCACAACGTTAGAAGAAAGAATAATTCCTGCATTATATGA
TTATGTATATATTGTAAAAGATGATGTATATGATAAAATTAGTGGTTCAACATCTTCATTCTGCGCATTTAATGTAGAAA
GTTATAAAGATACTCTGAATATTTGTAAAAACTATGAGGGAAAATTTGGAGAAAGCAATAATAAGAAAGAGCATATTATT
TTAATGAAAGCGAATATACTAGAATCACATAAAATAGGATATGGAGTGATTATGTTCTTAACTATATTCATAGGAATAAT
TTTCTTTGTAACTACGGGGAGCTTTTTATATAACAAATATTATATGGATGTTCAACAAGATAGAATGAAGTATGAACAGC
TAAATAAAATTGGGATAACCTTTAAAGAAATAAAGAAAGTATCAACTATTGAAATTGGAGTATTATTTTTGTTTCCTTAT
ATTATTTCAGTAATACATTCATTATTTGCATTGTTAGCATTAAAAAATGCCTTTGAAATGGATGTTAGCTTAGTAGCATT
CTTTGTAATGGGTAGTTTCTTAATTATTCAAATAATATATTTCTTTATTATAAGGGGAAACTACTTATTAGATATAAAAA
GAAGCCTAGTAAATAGAATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGACGGAGTTATATACAATGAAATTTATAAGGGGGAGAGTAGGCAGCAATTCTATCAAGAAATAATAGATTTACTTGCA
TTATTAGGAGGTGGTAACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTAGAAAAAGTTATACTTATAAAAAAATATATATAGCTTTTATATAAAACTTAATATGTTTAAATAAACTAACCGTTAG
TATATAATAATATATAATAA

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 620; Mature: 620

Protein sequence:

>620_residues
MNFREFCTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNITTIIAYLFLCLFIFYSVSVFI
KSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGIILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFV
LMGILISIFTTYMIKEDEVLNLLKGTQKPKNEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
FSQLSVFVIKILKKDREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVSAFWINKEAEVDKNFPQAFFY
ASYKKNYNELDFIEGSLKKEGYNYTKIQGHIKSLVSKKNTIPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNK
RDNILVDNMDIKVITTLEERIIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKEHII
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGITFKEIKKVSTIEIGVLFLFPY
IISVIHSLFALLALKNAFEMDVSLVAFFVMGSFLIIQIIYFFIIRGNYLLDIKRSLVNRI

Sequences:

>Translated_620_residues
MNFREFCTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNITTIIAYLFLCLFIFYSVSVFI
KSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGIILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFV
LMGILISIFTTYMIKEDEVLNLLKGTQKPKNEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
FSQLSVFVIKILKKDREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVSAFWINKEAEVDKNFPQAFFY
ASYKKNYNELDFIEGSLKKEGYNYTKIQGHIKSLVSKKNTIPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNK
RDNILVDNMDIKVITTLEERIIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKEHII
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGITFKEIKKVSTIEIGVLFLFPY
IISVIHSLFALLALKNAFEMDVSLVAFFVMGSFLIIQIIYFFIIRGNYLLDIKRSLVNRI
>Mature_620_residues
MNFREFCTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNITTIIAYLFLCLFIFYSVSVFI
KSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGIILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFV
LMGILISIFTTYMIKEDEVLNLLKGTQKPKNEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
FSQLSVFVIKILKKDREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVSAFWINKEAEVDKNFPQAFFY
ASYKKNYNELDFIEGSLKKEGYNYTKIQGHIKSLVSKKNTIPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNK
RDNILVDNMDIKVITTLEERIIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKEHII
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGITFKEIKKVSTIEIGVLFLFPY
IISVIHSLFALLALKNAFEMDVSLVAFFVMGSFLIIQIIYFFIIRGNYLLDIKRSLVNRI

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71049; Mature: 71049

Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNFREFCTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNIT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
TIIAYLFLCLFIFYSVSVFIKSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFVLMGILISIFTTYMIKEDEVL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
NLLKGTQKPKNEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
HHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSQLSVFVIKILKKDREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
AFWINKEAEVDKNFPQAFFYASYKKNYNELDFIEGSLKKEGYNYTKIQGHIKSLVSKKNT
EEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
IPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNKRDNILVDNMDIKVITTLEER
CEEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEECCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEHHHHH
IIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKEHII
HHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEE
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGIT
EEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCC
FKEIKKVSTIEIGVLFLFPYIISVIHSLFALLALKNAFEMDVSLVAFFVMGSFLIIQIIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIIRGNYLLDIKRSLVNRI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNFREFCTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNIT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
TIIAYLFLCLFIFYSVSVFIKSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFVLMGILISIFTTYMIKEDEVL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
NLLKGTQKPKNEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
HHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSQLSVFVIKILKKDREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
AFWINKEAEVDKNFPQAFFYASYKKNYNELDFIEGSLKKEGYNYTKIQGHIKSLVSKKNT
EEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
IPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNKRDNILVDNMDIKVITTLEER
CEEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEECCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEHHHHH
IIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKEHII
HHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEE
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGIT
EEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCC
FKEIKKVSTIEIGVLFLFPYIISVIHSLFALLALKNAFEMDVSLVAFFVMGSFLIIQIIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIIRGNYLLDIKRSLVNRI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]