Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is kdpA

Identifier: 226225233

GI number: 226225233

Start: 2726850

End: 2728535

Strand: Reverse

Name: kdpA

Synonym: Lm4b_02655

Alternate gene names: 226225233

Gene position: 2728535-2726850 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226225237

Following gene: 226225232

Centisome position: 93.68

GC content: 44.42

Gene sequence:

>1686_bases
ATGAAGTATATCGTGATGCAAGATGCGTTTTTTGTTGTATTGTTATTAGTTTTGGCGGTGCCTCTTGGAATTTATATGTA
TAAGGTGATGATTGGGGAAAAGGTATTTTTGTCACGAGTGCTTGAGCCGGTTGAGCGGTTTGGTTATCGATTGATGGGTG
TGAGTGAGGTTGGCATGTCGGCGAAGCGTTATGCAGTATCCGTACTTGCTTTTAGTGCAGTTGGCTTTGTATTTGTAATG
GCGGTGTTGATGCTACAAGGCTTTTTACCGCTCAACCCGGAAGGTATGAAAGGACTTAGTTTTAGTCTTGCATTTAATAC
GGCGGCGAGTTTTGTGTCGAATACGAACTGGCAAGCTTATTCTGGTGAGGCGGCGTTATCTTATTTTTCGCAGTCGATTG
GTTTAACGGTGCAGAACTTTGTTTCGGCAGCGACAGGGATTGCAGTATTATTTGCGGTAATTCGTGGCTTTATATGGAAG
AAACAGAAAACGATAGGAAATTTTTGGCAAGATTTATTTCGAGTGACGCTATATATTCTATTACCACTTTCGCTTATTTT
GGCGCTTCTTTTAGTATCGCAAGGAGTGGTGCAGTCATTTGCTGATTATTCGGTTGTGGAGACGCTTGAAAATGGAGCAA
AACAATTGATTCCGCTTGGTCCAGCTGCAAGTCAAATTGCGATTAAACAACTGGGAACGAATGGTGGAGGCTTTTTCGGG
GCAAATTCGGCGTTTCCGTTTGAAAACCCATCTAGTTTTACTAATTTAATAGAAATGTTGGCGATTTTACTTATTCCAGT
GGCGCTTGTTGTGATGTTTGGGCGTGCGGTGAAGGATAGTAAGCAAGGACGCGCGATTATGACAGCGATGATGATTGTTT
TTGTTATTGGTGTTGTTGCGATAACTATCTCCGAACAATTTGCAGGTCCACATTATCAAGGTGTTGCGACTTCTGGCAGT
ATGGAAGGAAAAGAGGTTCGTTTTGGTGTTGGCGGTTCGTCGCTTTTTGCAGCTTCCACGACGGCAGCCTCGAATGGAGC
GGTGAACGCAATGCACGACAGTTTGACTCCGCTTGGGGGACTGGTGCCGATGTTCTTTATGCAACTCGGTGAGGTTGTTT
TTGGCGGTGTTGGTAGCGGGCTTTATGGCATGATTGGTTTTATTATTTTGACGGTGTTTATTGCGGGGCTTTTGGTTGGG
CGGACGCCGGAATATTTAGGGAAGAAAATTGAACCTTATGATATGAAAATGGTTTGTTTGCTTATTTTGGTTCCGCCGCT
GTTGACTTTGTTTGGAACTGCGGTTGCGGTGATGATGCCAAGTGTGCAAGCTTCTGTTTCGGCGAGTGGGGCGCACGGTT
TTTCCGAGGTCCTCTATGCATTTACTTCGATGGGAAATAATAATGGTAGTGCTTTTGCTGGATTTGCGGCGGACACGACG
TTTACAAATATGGTTGGCGCAGTAATGATGTTACTTGCTCGTTTTATTCCACTTGTTGCGGCGCTTTATTTAGCGCAAAA
TATGGCTGGAAAGAGTTCGGTTGCAGCGAGCAGCGGGACGTTATCGACGAAAAATGGCATGTTTATTGGTCTTTTAATTG
GTGTTGTGGTACTTGTTGGCGCACTTAGTTTCTTGCCAGCACTTGCGCTTGGACCGATTGCGGACTTCTTTACAACTTTC
AAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGGGTGAACGGAAAATGGGTGTTGTTCTAGTAATTGCTGGAATAATCGGTTTAGGTTTGTTGGTATATTTATTTTATGTG
TTATTTAGAGGTGAGGACTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGTGAATGGAAATGATGGAAAAAGGTATTTGGAAAGATGCGCTGATTCAGTCGACGAAAAAACTGTCTCCAAAACTGCAA
GTGAAAAATCCGGTGATGTT

Product: potassium-transporting ATPase subunit A

Products: NA

Alternate protein names: ATP phosphohydrolase [potassium-transporting] A chain; Potassium-binding and translocating subunit A; Potassium-translocating ATPase A chain [H]

Number of amino acids: Translated: 561; Mature: 561

Protein sequence:

>561_residues
MKYIVMQDAFFVVLLLVLAVPLGIYMYKVMIGEKVFLSRVLEPVERFGYRLMGVSEVGMSAKRYAVSVLAFSAVGFVFVM
AVLMLQGFLPLNPEGMKGLSFSLAFNTAASFVSNTNWQAYSGEAALSYFSQSIGLTVQNFVSAATGIAVLFAVIRGFIWK
KQKTIGNFWQDLFRVTLYILLPLSLILALLLVSQGVVQSFADYSVVETLENGAKQLIPLGPAASQIAIKQLGTNGGGFFG
ANSAFPFENPSSFTNLIEMLAILLIPVALVVMFGRAVKDSKQGRAIMTAMMIVFVIGVVAITISEQFAGPHYQGVATSGS
MEGKEVRFGVGGSSLFAASTTAASNGAVNAMHDSLTPLGGLVPMFFMQLGEVVFGGVGSGLYGMIGFIILTVFIAGLLVG
RTPEYLGKKIEPYDMKMVCLLILVPPLLTLFGTAVAVMMPSVQASVSASGAHGFSEVLYAFTSMGNNNGSAFAGFAADTT
FTNMVGAVMMLLARFIPLVAALYLAQNMAGKSSVAASSGTLSTKNGMFIGLLIGVVVLVGALSFLPALALGPIADFFTTF
K

Sequences:

>Translated_561_residues
MKYIVMQDAFFVVLLLVLAVPLGIYMYKVMIGEKVFLSRVLEPVERFGYRLMGVSEVGMSAKRYAVSVLAFSAVGFVFVM
AVLMLQGFLPLNPEGMKGLSFSLAFNTAASFVSNTNWQAYSGEAALSYFSQSIGLTVQNFVSAATGIAVLFAVIRGFIWK
KQKTIGNFWQDLFRVTLYILLPLSLILALLLVSQGVVQSFADYSVVETLENGAKQLIPLGPAASQIAIKQLGTNGGGFFG
ANSAFPFENPSSFTNLIEMLAILLIPVALVVMFGRAVKDSKQGRAIMTAMMIVFVIGVVAITISEQFAGPHYQGVATSGS
MEGKEVRFGVGGSSLFAASTTAASNGAVNAMHDSLTPLGGLVPMFFMQLGEVVFGGVGSGLYGMIGFIILTVFIAGLLVG
RTPEYLGKKIEPYDMKMVCLLILVPPLLTLFGTAVAVMMPSVQASVSASGAHGFSEVLYAFTSMGNNNGSAFAGFAADTT
FTNMVGAVMMLLARFIPLVAALYLAQNMAGKSSVAASSGTLSTKNGMFIGLLIGVVVLVGALSFLPALALGPIADFFTTF
K
>Mature_561_residues
MKYIVMQDAFFVVLLLVLAVPLGIYMYKVMIGEKVFLSRVLEPVERFGYRLMGVSEVGMSAKRYAVSVLAFSAVGFVFVM
AVLMLQGFLPLNPEGMKGLSFSLAFNTAASFVSNTNWQAYSGEAALSYFSQSIGLTVQNFVSAATGIAVLFAVIRGFIWK
KQKTIGNFWQDLFRVTLYILLPLSLILALLLVSQGVVQSFADYSVVETLENGAKQLIPLGPAASQIAIKQLGTNGGGFFG
ANSAFPFENPSSFTNLIEMLAILLIPVALVVMFGRAVKDSKQGRAIMTAMMIVFVIGVVAITISEQFAGPHYQGVATSGS
MEGKEVRFGVGGSSLFAASTTAASNGAVNAMHDSLTPLGGLVPMFFMQLGEVVFGGVGSGLYGMIGFIILTVFIAGLLVG
RTPEYLGKKIEPYDMKMVCLLILVPPLLTLFGTAVAVMMPSVQASVSASGAHGFSEVLYAFTSMGNNNGSAFAGFAADTT
FTNMVGAVMMLLARFIPLVAALYLAQNMAGKSSVAASSGTLSTKNGMFIGLLIGVVVLVGALSFLPALALGPIADFFTTF
K

Specific function: One of the components of the high-affinity ATP-driven potassium transport (or KDP) system, which catalyzes the hydrolysis of ATP coupled with the exchange of hydrogen and potassium ions [H]

COG id: COG2060

COG function: function code P; K+-transporting ATPase, A chain

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the kdpA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786915, Length=556, Percent_Identity=53.2374100719424, Blast_Score=564, Evalue=1e-162,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004623 [H]

Pfam domain/function: PF03814 KdpA [H]

EC number: =3.6.3.12 [H]

Molecular weight: Translated: 59308; Mature: 59308

Theoretical pI: Translated: 9.40; Mature: 9.40

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
5.2 %Met     (Translated Protein)
5.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
5.2 %Met     (Mature Protein)
5.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKYIVMQDAFFVVLLLVLAVPLGIYMYKVMIGEKVFLSRVLEPVERFGYRLMGVSEVGMS
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHCCH
AKRYAVSVLAFSAVGFVFVMAVLMLQGFLPLNPEGMKGLSFSLAFNTAASFVSNTNWQAY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCCEE
SGEAALSYFSQSIGLTVQNFVSAATGIAVLFAVIRGFIWKKQKTIGNFWQDLFRVTLYIL
CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPLSLILALLLVSQGVVQSFADYSVVETLENGAKQLIPLGPAASQIAIKQLGTNGGGFFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCC
ANSAFPFENPSSFTNLIEMLAILLIPVALVVMFGRAVKDSKQGRAIMTAMMIVFVIGVVA
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITISEQFAGPHYQGVATSGSMEGKEVRFGVGGSSLFAASTTAASNGAVNAMHDSLTPLGG
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCHHH
LVPMFFMQLGEVVFGGVGSGLYGMIGFIILTVFIAGLLVGRTPEYLGKKIEPYDMKMVCL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHH
LILVPPLLTLFGTAVAVMMPSVQASVSASGAHGFSEVLYAFTSMGNNNGSAFAGFAADTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHH
FTNMVGAVMMLLARFIPLVAALYLAQNMAGKSSVAASSGTLSTKNGMFIGLLIGVVVLVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ALSFLPALALGPIADFFTTFK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11679669 [H]