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The map label for this gene is mdtH [H]

Identifier: 226224649

GI number: 226224649

Start: 2125333

End: 2126580

Strand: Reverse

Name: mdtH [H]

Synonym: Lm4b_02064

Alternate gene names: 226224649

Gene position: 2126580-2125333 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226224651

Following gene: 226224648

Centisome position: 73.01

GC content: 37.5

Gene sequence:

>1248_bases
ATGTTTAGAGAGTTGCACCCAAATATTCGTGCGCGGATATTAATTCAGTTTTTGAGTAAAGTAATTGGTTCGATGATTTT
TCCTTTTATGGCAATTTATTTTTCAAGGGAAATTAATAGTAGTGTCGCCGGCTTTCTCTTGATGATTAATGTATTAGTAC
AATTTCTTGCTGGCATGTACGGTGGACATCTAGCGGATATTATTGGACGTAAAAAATTAATGGTCACCGGAGAACTGCTT
AAAGTGTTTGCCTTTCTCGGGATGGTACTATGCAATTCCCCCATGTTTCATTCTCCGTGGATAACTTTTGTCATGTTACT
TATTATTGGGGTAGCTCAGGGATTGATTAATCCAGCTGGAGAAGCAATGTTAATTGATGTAAGTACCCCAGAGAACCGTT
CATTTATGTATTCGGTCAGTTATTGGGCGAATAATTTATCGATCATGATTGGAATTATGGTGGGGGGGTGGTTTTTTGTA
GATTATCTGTTTCCTCTATTAGTTGTTCTTTTTATCATGTCATTTGTTACGGCATGGCTTACTATAAGCTTAATTTCCGA
GACGTTGCAGCAAAAAGAAATGCCGCACAAAGGGTCATATGGACTAATGGGAATGCTTAAAAATTATGGACAAGTATTAC
ATGATTATCGTTTTCTTCTATATACTATTGGTGGAATTGCTATCATGTCGATCGAGTTTCAACGGAGCAACTACATTTCG
GTTCGTTTAGCAGAAGATGTGAAAGCGCTACTTGTACATTTGGGGCCACTTGGAAATATTTCTCTCAATGGAGTACAAAT
AGTGAGTGTGTTAACCGCTGTGAATACTTTATTTATTGTACTTTTTACCGTACCAATTGCGAGATTTGTGACTAAAAGGG
CGCAGCAACCTATTATGTATGTAGGGTTTACTTTGTTTGCGCTTGGATTTGCAGTTTGTGCTTTCGCAAATAATCTAACA
GTTTTACTTTTGGCGACGATGGTGCTCTCAATTGGTGAATTACTCTATGTACCAACACGTCAAACGATCTTAGCGGCAAT
TGTAGATGATGAAAGACGTGGGGCCTACATGGCATTTAATGGTATTATTTTCCAAATTGGTAAAATGATTGGTTCTGTAA
GTTTAGTATTTGCACCATTTATTGGTAAATATGGCATGGGAGCTTTTACGATTACGCTTGGTGTTTTAAGTATAGTGTTC
TCAGCAGTGGCACTAAAATCTGGTTGGGAAAAAGTGTTGGTAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAGGGGACAATATATGAAAATGAATACCCTTTTTAAATTTATGTATCCCTTTTATACTAGCAGAGAAGTCAGAAAAA
TTGCAAATGGAGGGGATGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGTTGGTTCAAAGTGGGGAATCCCTCCACCAAGCCCCACATTGTTTTTTAAGAATTGAATTAGATGGAAATGGCTTTAA
ATAAGGGATTGATCATTCTA

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 415; Mature: 415

Protein sequence:

>415_residues
MFRELHPNIRARILIQFLSKVIGSMIFPFMAIYFSREINSSVAGFLLMINVLVQFLAGMYGGHLADIIGRKKLMVTGELL
KVFAFLGMVLCNSPMFHSPWITFVMLLIIGVAQGLINPAGEAMLIDVSTPENRSFMYSVSYWANNLSIMIGIMVGGWFFV
DYLFPLLVVLFIMSFVTAWLTISLISETLQQKEMPHKGSYGLMGMLKNYGQVLHDYRFLLYTIGGIAIMSIEFQRSNYIS
VRLAEDVKALLVHLGPLGNISLNGVQIVSVLTAVNTLFIVLFTVPIARFVTKRAQQPIMYVGFTLFALGFAVCAFANNLT
VLLLATMVLSIGELLYVPTRQTILAAIVDDERRGAYMAFNGIIFQIGKMIGSVSLVFAPFIGKYGMGAFTITLGVLSIVF
SAVALKSGWEKVLVK

Sequences:

>Translated_415_residues
MFRELHPNIRARILIQFLSKVIGSMIFPFMAIYFSREINSSVAGFLLMINVLVQFLAGMYGGHLADIIGRKKLMVTGELL
KVFAFLGMVLCNSPMFHSPWITFVMLLIIGVAQGLINPAGEAMLIDVSTPENRSFMYSVSYWANNLSIMIGIMVGGWFFV
DYLFPLLVVLFIMSFVTAWLTISLISETLQQKEMPHKGSYGLMGMLKNYGQVLHDYRFLLYTIGGIAIMSIEFQRSNYIS
VRLAEDVKALLVHLGPLGNISLNGVQIVSVLTAVNTLFIVLFTVPIARFVTKRAQQPIMYVGFTLFALGFAVCAFANNLT
VLLLATMVLSIGELLYVPTRQTILAAIVDDERRGAYMAFNGIIFQIGKMIGSVSLVFAPFIGKYGMGAFTITLGVLSIVF
SAVALKSGWEKVLVK
>Mature_415_residues
MFRELHPNIRARILIQFLSKVIGSMIFPFMAIYFSREINSSVAGFLLMINVLVQFLAGMYGGHLADIIGRKKLMVTGELL
KVFAFLGMVLCNSPMFHSPWITFVMLLIIGVAQGLINPAGEAMLIDVSTPENRSFMYSVSYWANNLSIMIGIMVGGWFFV
DYLFPLLVVLFIMSFVTAWLTISLISETLQQKEMPHKGSYGLMGMLKNYGQVLHDYRFLLYTIGGIAIMSIEFQRSNYIS
VRLAEDVKALLVHLGPLGNISLNGVQIVSVLTAVNTLFIVLFTVPIARFVTKRAQQPIMYVGFTLFALGFAVCAFANNLT
VLLLATMVLSIGELLYVPTRQTILAAIVDDERRGAYMAFNGIIFQIGKMIGSVSLVFAPFIGKYGMGAFTITLGVLSIVF
SAVALKSGWEKVLVK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. DHA1 family. MdtH (TC 2.A.1.2.21) subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081828, Length=346, Percent_Identity=23.4104046242775, Blast_Score=86, Evalue=4e-18,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR022855
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45968; Mature: 45968

Theoretical pI: Translated: 9.82; Mature: 9.82

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
5.5 %Met     (Translated Protein)
6.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
5.5 %Met     (Mature Protein)
6.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFRELHPNIRARILIQFLSKVIGSMIFPFMAIYFSREINSSVAGFLLMINVLVQFLAGMY
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGHLADIIGRKKLMVTGELLKVFAFLGMVLCNSPMFHSPWITFVMLLIIGVAQGLINPAG
CCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
EAMLIDVSTPENRSFMYSVSYWANNLSIMIGIMVGGWFFVDYLFPLLVVLFIMSFVTAWL
CEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TISLISETLQQKEMPHKGSYGLMGMLKNYGQVLHDYRFLLYTIGGIAIMSIEFQRSNYIS
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCEEE
VRLAEDVKALLVHLGPLGNISLNGVQIVSVLTAVNTLFIVLFTVPIARFVTKRAQQPIMY
EEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
VGFTLFALGFAVCAFANNLTVLLLATMVLSIGELLYVPTRQTILAAIVDDERRGAYMAFN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHH
GIIFQIGKMIGSVSLVFAPFIGKYGMGAFTITLGVLSIVFSAVALKSGWEKVLVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFRELHPNIRARILIQFLSKVIGSMIFPFMAIYFSREINSSVAGFLLMINVLVQFLAGMY
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGHLADIIGRKKLMVTGELLKVFAFLGMVLCNSPMFHSPWITFVMLLIIGVAQGLINPAG
CCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
EAMLIDVSTPENRSFMYSVSYWANNLSIMIGIMVGGWFFVDYLFPLLVVLFIMSFVTAWL
CEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TISLISETLQQKEMPHKGSYGLMGMLKNYGQVLHDYRFLLYTIGGIAIMSIEFQRSNYIS
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCEEE
VRLAEDVKALLVHLGPLGNISLNGVQIVSVLTAVNTLFIVLFTVPIARFVTKRAQQPIMY
EEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
VGFTLFALGFAVCAFANNLTVLLLATMVLSIGELLYVPTRQTILAAIVDDERRGAYMAFN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHH
GIIFQIGKMIGSVSLVFAPFIGKYGMGAFTITLGVLSIVFSAVALKSGWEKVLVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA