| Definition | Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012032 |
| Length | 5,268,950 |
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The map label for this gene is 222527239
Identifier: 222527239
GI number: 222527239
Start: 4969640
End: 4973356
Strand: Direct
Name: 222527239
Synonym: Chy400_4023
Alternate gene names: NA
Gene position: 4969640-4973356 (Clockwise)
Preceding gene: 222527233
Following gene: 222527241
Centisome position: 94.32
GC content: 57.52
Gene sequence:
>3717_bases ATGATTAGCCAAAATACCATTGTTCGGGATAGCGTCGGAGTAGCCTTGTCTATGGAAGCTCTTGTCATCTTGGTTTGTCT GATTCCGATTATCTTCTTTGTCGGGGTGATTGGTTTTGTGATCGGACGGGCAACAGCTCGTCGTGGCGATCCGCGTCGTC AGTTCGCCGACCTGGTTCGCTTCTGGGAGCAATCGCACCAGATTGATCGCGCAACTGCTGAACACCTGCTTGCCTTGTTA CGCTCGCAACCTGGTGACACCGCAGTAGCCATACCAGAAGTCCGGCCAGCACCATCGCCAGGTGTGCCTGCGCTGGCCCC GGTACCGACAGCGCCCCAGGCTGTTGCCTCGCAACCGGGCAGCGCAGCACCACCGGTTACGCCGACGCAACCGCCTCTCG CTTATGAGTATGGGGTGGTAAGCCCCGCCGCAGTAACGCCACTCACTCCCGGCACACAAGCCCAACCATTGCATGAAGGG CAGGCTGCTTCGTCAAGTCTTCCCGCAACCTCGTCGGCGGCGCCGGTTGCCTCAGAACGCCAACCGGACGATGCCCAAGC CGTGCCGCCACTTCTGGCTGCCTTGCTCTCGATGGGTGCCCGCCGCACGCTGTTGATCATCGGTACCTTCCTGGTGATGA TCTCCAGCCTGGTGCTGGTGATCTTCAACTGGAACCGCTTCCCTGCCATCGTTCAGGTCGCATTTTTGAGCGCGTTCACC GGTGGTTTGTGGGGGGCAGGCCATTGGATGCAGCAAAAGACAACCCTGACCACGGCAGGTCGCAATTTGCAATCGGTAGC GATGCTGATGGTGCCGGTAGTGGTGTTTTCGTTTACGCGACCCGGTTTATTCAATCTTGAGGGTTCTCTCGCGCTCCTGG TCACAAGTACGCTGAGTTTCCTTGTGTATACGATTGGCGCATGGCGCAGCCAGCGACTCTTCTACAGTCTGGCGGCCAGT ACTGCTGCCTGTGCAGTGTTGATCAGTAGCTTCTGGTGGTGGTCGGTACCGGCAAGCTGGCAACCGGTCTGGTCTTTTGT GTTGTCAGGAATTGCGCTCGTTACCACCAGACTTCTCGATGATCATCACCGCTCAAGGCTGGCGCTGGGACCGCGGATCA TCAAAATCGCTGTACCACCATTGGCCCTTGCGACTAGCATGGGTATCTTCCTGGTCAATCCAATCCCGGCTGAGGCGACT ACAACCATCATCGTGACGCTGCTCAGTGCTGCTTTCGCGGTAGCGTTGGCGTGGCTCGACAGGCAGCCGCTCTGGCTGTG GGCAACGGCAATCCTGATCCCCATGGCGGCAATGGTGGGTGTGGTTCACGCCGACGATGCACTGATGTGGATCAATCTGA GCTTCGCCGGTTTAACGCTGATCTATCCGCTGCTGGCAGTAATTGCTGAGCGGCGCGATCCGGCATACTCCAGACCATTT CTGGCCCTGATCCTTTTTCTGGCCATTGTCGCCGCTGTGAGTGCGACCGACTGGATTGCGATTCGGCGCAGCTATCCAAT CCTGATTGCCGCTACGCTTCTGATCATCGGTCTACTAGAGGTTCGCCGCCTGACGCTCCTTCAACCCTGGCGCAACGAGG TGGGTGGTAGTTTACTGGCGGTACAGCTCGGTTTGCTGGCAATCTGGCCTGGTGCGTTTGTCGAAACCTGGGAGCTGCGG GCGCTGATTGTCATGGTTGTCGGTGCAGTGGCTTTTATCGTCAGTGCCATTCCCATCAGAGGTTTCCTCTCGTATGCACC GCCGATCTGGTGCTATGGCGGCGCATTCCTGGTGGCAGTCGGTGCCGGATGGAGTAGCTGGTTTAATGCCGATCTGCGTC TGCCCACGCTCGCAGTCGCGACCGCCCTCTACGGCTGGCGGGCTATCATCAACCGTGAACATGTCTGGGCGTTTATGACG GTTACCACCGGGCTGGTATTGAGTGGCGTGATCCTGGATCGCGTTGGATGGCTGGCGAATACCGATCACTATCTGTTGGC GAGTGTATTGTTCGCAGGTGGTCTGAGTATCGGTGGAAGTATTCTCAACAAATACGCTGTTCGCTACAATTATTGGGCGC CATCAGCGCTGATCTGGGCAGGAGTGCTGGGGAGTATTGGTTCAATCCTCTTTCTGAGTGCATTTCTCAGCCCAACCCAC GCCGCAGTGTATGCCGCCCTGATCGGGAGCGCAACTATTGCCGTCCTGAGTGTGATATATCGTAACTGGCGCTTCGGCTA TCCCATCGCGTTGCTTCTAGCCGGCGCGTGGGCAATGGCGATAGCCAGCAATCTGATCACCTGGAACGGGAGCTGGCACA CGCTGTCGGTGCTATTACTCGCCCTTGCCGTCGGTTATGGCCTGATCACACTCGTACTGCGTGGCTGGTCGCCGTTTGAT CGACCGTATGCCCAATCTGCGCTTGGCGTCGCATTACTGGCACCACTACCGGCAATCTTCGAGCTGAACGCCTTTATCTT CCTGCCCCTACCTGCCTCACTGTTGCCGAATCTGGCCCTGACGGCTGCCGGTTCAGCCGTGATGATTGCAATCGGCGCAT TTATATATCGGCGCTGGCGATTAACGAGTCTGACGCAGATTCAGCTTTTGATTGCCCTGGGCAGCACTATTCACTGGTTG AGCGCCGAAAACAGCACGGTAACCGGTTGGAGTCTGCTAGTTACGGCGAGCATTATCATGCTGAGTAGCGCGGCTGTTCG CCGCCAATTCTCAGATGCCCCGGTCAACCACATCACTGCCGATAGTTATGTCATCAGTAGCACGGTCATGCTAGTGGCAC TGGCATTTCTGTTCGATGGTGTCATTGGTCAGCTTAGTCTGCCGCTGCTGCTGGTCGCGATAACTATCGGCATCGTCGCC TGGCTTGAGCAGAGCCGCCTTGTTGCTGGTCTCAATCTGATAGCACTGGTGGGGAGTCTCCTCACTGCACTATCGCTAAC ACCGCTCACCCTCGCGTGGCAGGCAGCCTGGTTTGTGCTTCTGCTTGTTCCATTACTGCTGGTGGGCTGGTTAGCACCAC GGTTAGCCAGTACGGCCATCTGGCAACAACCATCGCTCTGGATTCCGCTGGCTGCGGCTGGATTGGTTGGGTTGCTGGCC CTGGTCGATCTGCGGGCCAGTGTTGTGGCACTGGTGAACGGTGGTGTTTTGCTTGTGACGGCTACGCTGCGGGAACGGAA CAGTTTGTACGCTTACCTGGCCGGCGCCCTGTTTGTTGCGGCCAGCCTCGGTCAGTTTCTGGTGTGGGAATTGCGTGAGC TGCAACTGTACGTTGTGCCGGTGGGGGTCTACCTCTTCGGGCTGGCAGCCGGTATTCGGCGATTTCAACGCCAGATTCAG GTGGCACGACTGGTAGACAGTGCAGCCGTCTGTTTGCTGCTCGGCGCAACCTTTATCCAGGCTGCCGGATCGGTGAGCAA TATTGGCTACATTATGTTGTTTGGTCTGGAGTCGCTGCTGGTCGCAACCTACGGCACCCTTGCCCGTTTGCGGGCGCCAT TTATTGGCGGTGTAGCCGGTTTTGTGATTGGTGTGCTCTGGATGGCCGCCAATGCAGCGAGGATGCTCAACCAGTGGCTC TTGTTAGGTGCGCTAGGGGTGTTGATGCTGCTGGCCTACGTGATTCTTGAGCGGCAGCAAGATCAACTGCGTCGTTTTGG CCGCGATCTGGTTGTGCGCCTGCAACAGTGGCAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GGGAATCGGCTGACTCCCGCTGGCACGGCCATCATTCGTCGCTGCCGGAAATGAAAAAAATGGCGCATATTTTTTACCGA ATTGTTAATCAGAAGCTGCT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATCAAATCTTGAGTGCCACGGTGCCTGACAGCCCGTTACCGGATATGCGGTGAATCGTGACGATCCATCTCCTCCGCAC TGTGGTTGTCACCTGCATGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1238; Mature: 1238
Protein sequence:
>1238_residues MISQNTIVRDSVGVALSMEALVILVCLIPIIFFVGVIGFVIGRATARRGDPRRQFADLVRFWEQSHQIDRATAEHLLALL RSQPGDTAVAIPEVRPAPSPGVPALAPVPTAPQAVASQPGSAAPPVTPTQPPLAYEYGVVSPAAVTPLTPGTQAQPLHEG QAASSSLPATSSAAPVASERQPDDAQAVPPLLAALLSMGARRTLLIIGTFLVMISSLVLVIFNWNRFPAIVQVAFLSAFT GGLWGAGHWMQQKTTLTTAGRNLQSVAMLMVPVVVFSFTRPGLFNLEGSLALLVTSTLSFLVYTIGAWRSQRLFYSLAAS TAACAVLISSFWWWSVPASWQPVWSFVLSGIALVTTRLLDDHHRSRLALGPRIIKIAVPPLALATSMGIFLVNPIPAEAT TTIIVTLLSAAFAVALAWLDRQPLWLWATAILIPMAAMVGVVHADDALMWINLSFAGLTLIYPLLAVIAERRDPAYSRPF LALILFLAIVAAVSATDWIAIRRSYPILIAATLLIIGLLEVRRLTLLQPWRNEVGGSLLAVQLGLLAIWPGAFVETWELR ALIVMVVGAVAFIVSAIPIRGFLSYAPPIWCYGGAFLVAVGAGWSSWFNADLRLPTLAVATALYGWRAIINREHVWAFMT VTTGLVLSGVILDRVGWLANTDHYLLASVLFAGGLSIGGSILNKYAVRYNYWAPSALIWAGVLGSIGSILFLSAFLSPTH AAVYAALIGSATIAVLSVIYRNWRFGYPIALLLAGAWAMAIASNLITWNGSWHTLSVLLLALAVGYGLITLVLRGWSPFD RPYAQSALGVALLAPLPAIFELNAFIFLPLPASLLPNLALTAAGSAVMIAIGAFIYRRWRLTSLTQIQLLIALGSTIHWL SAENSTVTGWSLLVTASIIMLSSAAVRRQFSDAPVNHITADSYVISSTVMLVALAFLFDGVIGQLSLPLLLVAITIGIVA WLEQSRLVAGLNLIALVGSLLTALSLTPLTLAWQAAWFVLLLVPLLLVGWLAPRLASTAIWQQPSLWIPLAAAGLVGLLA LVDLRASVVALVNGGVLLVTATLRERNSLYAYLAGALFVAASLGQFLVWELRELQLYVVPVGVYLFGLAAGIRRFQRQIQ VARLVDSAAVCLLLGATFIQAAGSVSNIGYIMLFGLESLLVATYGTLARLRAPFIGGVAGFVIGVLWMAANAARMLNQWL LLGALGVLMLLAYVILERQQDQLRRFGRDLVVRLQQWQ
Sequences:
>Translated_1238_residues MISQNTIVRDSVGVALSMEALVILVCLIPIIFFVGVIGFVIGRATARRGDPRRQFADLVRFWEQSHQIDRATAEHLLALL RSQPGDTAVAIPEVRPAPSPGVPALAPVPTAPQAVASQPGSAAPPVTPTQPPLAYEYGVVSPAAVTPLTPGTQAQPLHEG QAASSSLPATSSAAPVASERQPDDAQAVPPLLAALLSMGARRTLLIIGTFLVMISSLVLVIFNWNRFPAIVQVAFLSAFT GGLWGAGHWMQQKTTLTTAGRNLQSVAMLMVPVVVFSFTRPGLFNLEGSLALLVTSTLSFLVYTIGAWRSQRLFYSLAAS TAACAVLISSFWWWSVPASWQPVWSFVLSGIALVTTRLLDDHHRSRLALGPRIIKIAVPPLALATSMGIFLVNPIPAEAT TTIIVTLLSAAFAVALAWLDRQPLWLWATAILIPMAAMVGVVHADDALMWINLSFAGLTLIYPLLAVIAERRDPAYSRPF LALILFLAIVAAVSATDWIAIRRSYPILIAATLLIIGLLEVRRLTLLQPWRNEVGGSLLAVQLGLLAIWPGAFVETWELR ALIVMVVGAVAFIVSAIPIRGFLSYAPPIWCYGGAFLVAVGAGWSSWFNADLRLPTLAVATALYGWRAIINREHVWAFMT VTTGLVLSGVILDRVGWLANTDHYLLASVLFAGGLSIGGSILNKYAVRYNYWAPSALIWAGVLGSIGSILFLSAFLSPTH AAVYAALIGSATIAVLSVIYRNWRFGYPIALLLAGAWAMAIASNLITWNGSWHTLSVLLLALAVGYGLITLVLRGWSPFD RPYAQSALGVALLAPLPAIFELNAFIFLPLPASLLPNLALTAAGSAVMIAIGAFIYRRWRLTSLTQIQLLIALGSTIHWL SAENSTVTGWSLLVTASIIMLSSAAVRRQFSDAPVNHITADSYVISSTVMLVALAFLFDGVIGQLSLPLLLVAITIGIVA WLEQSRLVAGLNLIALVGSLLTALSLTPLTLAWQAAWFVLLLVPLLLVGWLAPRLASTAIWQQPSLWIPLAAAGLVGLLA LVDLRASVVALVNGGVLLVTATLRERNSLYAYLAGALFVAASLGQFLVWELRELQLYVVPVGVYLFGLAAGIRRFQRQIQ VARLVDSAAVCLLLGATFIQAAGSVSNIGYIMLFGLESLLVATYGTLARLRAPFIGGVAGFVIGVLWMAANAARMLNQWL LLGALGVLMLLAYVILERQQDQLRRFGRDLVVRLQQWQ >Mature_1238_residues MISQNTIVRDSVGVALSMEALVILVCLIPIIFFVGVIGFVIGRATARRGDPRRQFADLVRFWEQSHQIDRATAEHLLALL RSQPGDTAVAIPEVRPAPSPGVPALAPVPTAPQAVASQPGSAAPPVTPTQPPLAYEYGVVSPAAVTPLTPGTQAQPLHEG QAASSSLPATSSAAPVASERQPDDAQAVPPLLAALLSMGARRTLLIIGTFLVMISSLVLVIFNWNRFPAIVQVAFLSAFT GGLWGAGHWMQQKTTLTTAGRNLQSVAMLMVPVVVFSFTRPGLFNLEGSLALLVTSTLSFLVYTIGAWRSQRLFYSLAAS TAACAVLISSFWWWSVPASWQPVWSFVLSGIALVTTRLLDDHHRSRLALGPRIIKIAVPPLALATSMGIFLVNPIPAEAT TTIIVTLLSAAFAVALAWLDRQPLWLWATAILIPMAAMVGVVHADDALMWINLSFAGLTLIYPLLAVIAERRDPAYSRPF LALILFLAIVAAVSATDWIAIRRSYPILIAATLLIIGLLEVRRLTLLQPWRNEVGGSLLAVQLGLLAIWPGAFVETWELR ALIVMVVGAVAFIVSAIPIRGFLSYAPPIWCYGGAFLVAVGAGWSSWFNADLRLPTLAVATALYGWRAIINREHVWAFMT VTTGLVLSGVILDRVGWLANTDHYLLASVLFAGGLSIGGSILNKYAVRYNYWAPSALIWAGVLGSIGSILFLSAFLSPTH AAVYAALIGSATIAVLSVIYRNWRFGYPIALLLAGAWAMAIASNLITWNGSWHTLSVLLLALAVGYGLITLVLRGWSPFD RPYAQSALGVALLAPLPAIFELNAFIFLPLPASLLPNLALTAAGSAVMIAIGAFIYRRWRLTSLTQIQLLIALGSTIHWL SAENSTVTGWSLLVTASIIMLSSAAVRRQFSDAPVNHITADSYVISSTVMLVALAFLFDGVIGQLSLPLLLVAITIGIVA WLEQSRLVAGLNLIALVGSLLTALSLTPLTLAWQAAWFVLLLVPLLLVGWLAPRLASTAIWQQPSLWIPLAAAGLVGLLA LVDLRASVVALVNGGVLLVTATLRERNSLYAYLAGALFVAASLGQFLVWELRELQLYVVPVGVYLFGLAAGIRRFQRQIQ VARLVDSAAVCLLLGATFIQAAGSVSNIGYIMLFGLESLLVATYGTLARLRAPFIGGVAGFVIGVLWMAANAARMLNQWL LLGALGVLMLLAYVILERQQDQLRRFGRDLVVRLQQWQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 132825; Mature: 132825
Theoretical pI: Translated: 10.12; Mature: 10.12
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MISQNTIVRDSVGVALSMEALVILVCLIPIIFFVGVIGFVIGRATARRGDPRRQFADLVR CCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH FWEQSHQIDRATAEHLLALLRSQPGDTAVAIPEVRPAPSPGVPALAPVPTAPQAVASQPG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCC SAAPPVTPTQPPLAYEYGVVSPAAVTPLTPGTQAQPLHEGQAASSSLPATSSAAPVASER CCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC QPDDAQAVPPLLAALLSMGARRTLLIIGTFLVMISSLVLVIFNWNRFPAIVQVAFLSAFT CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH GGLWGAGHWMQQKTTLTTAGRNLQSVAMLMVPVVVFSFTRPGLFNLEGSLALLVTSTLSF CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH LVYTIGAWRSQRLFYSLAASTAACAVLISSFWWWSVPASWQPVWSFVLSGIALVTTRLLD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DHHRSRLALGPRIIKIAVPPLALATSMGIFLVNPIPAEATTTIIVTLLSAAFAVALAWLD HHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RQPLWLWATAILIPMAAMVGVVHADDALMWINLSFAGLTLIYPLLAVIAERRDPAYSRPF 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CCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC TDHYLLASVLFAGGLSIGGSILNKYAVRYNYWAPSALIWAGVLGSIGSILFLSAFLSPTH CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH AAVYAALIGSATIAVLSVIYRNWRFGYPIALLLAGAWAMAIASNLITWNGSWHTLSVLLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHH ALAVGYGLITLVLRGWSPFDRPYAQSALGVALLAPLPAIFELNAFIFLPLPASLLPNLAL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCEEEECCCHHHCCCHHH TAAGSAVMIAIGAFIYRRWRLTSLTQIQLLIALGSTIHWLSAENSTVTGWSLLVTASIIM HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHH LSSAAVRRQFSDAPVNHITADSYVISSTVMLVALAFLFDGVIGQLSLPLLLVAITIGIVA HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLEQSRLVAGLNLIALVGSLLTALSLTPLTLAWQAAWFVLLLVPLLLVGWLAPRLASTAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WQQPSLWIPLAAAGLVGLLALVDLRASVVALVNGGVLLVTATLRERNSLYAYLAGALFVA HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHH ASLGQFLVWELRELQLYVVPVGVYLFGLAAGIRRFQRQIQVARLVDSAAVCLLLGATFIQ 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA