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The map label for this gene is atoS [C]

Identifier: 22127735

GI number: 22127735

Start: 4303960

End: 4306515

Strand: Reverse

Name: atoS [C]

Synonym: y3864

Alternate gene names: 22127735

Gene position: 4306515-4303960 (Counterclockwise)

Preceding gene: 22127742

Following gene: 22127733

Centisome position: 93.6

GC content: 54.58

Gene sequence:

>2556_bases
ATGGAGCAACCCCGCCTCTCCTTCTTTGCCAGTGTTCGTGGGCGATTGTTGTTCTTCAACTTGCTCGTGGTGGCGGTCAC
CCTGATGGTGAGTGGTGTCGCGGTGCTGGGCTTCGAGCAGGCAAGCCGCTTACAAAAGCAGGTCCAGGAGCGGACACTGC
GCGATATGTCAAGCAGCATGGCGCTGGCGCGCGATACCGCAAATGTGGCGACGGCGGCGGTGCGGCTTTCCCAAGTGGTT
GGGGCGCTTGAATTCCAGAGTGAAGCGGCCAGTCTTCAAGAGACGCAACTGGCGTTACGAAGTTCACTCGCTCATCTTGC
TAATGCCCCGCTTGCCAGCCATGAACCGCTATTGGTGAAACGTATCATTGAGCGTAGCAATGAACTGGAAACCAGCGTTG
CACGTATGCTGAATTTGGGTCACCGTCGCCATCTTGAGCGTAACCTGCTGCTGAGCGCCCTCTATCAGACCCAAAGTTAT
CTTCACCATCTGCAGGAGATTAACCAGCGCGATGGGCTGAACAAACCCGATGCCGCACTGCTAAAAGAGATGGATCGCCT
GCTACTGGTGGCTATCCAGACCTCCTCGCCCAAAGCTGCCGTACAGCAACTTACTGAGGTGATGCAGGCATTGCCTGCCC
ATGCTGACTCGCCGCTGGTGGAGGAAATCTTGCAAGAGTTCAGCGCCAGCCTGTATCAGCTGCTGCCGTTGTCCATCACG
CTTGAAAATAGCGATCTGAGCATTACCTGGTACATGTACCACGTCAAAGCGTTGGTGGCGTTTCTCAATCAGGGCATCAA
TATCTATGTACAAAAGGTGGGGGAGGAATCGCTGCAGCGTAGCCAACAAAACCACAAAGCCTTGCAATCGATCATCACGT
CTATTGGTCTGTTTGCCCTGTTGGCACTGGTTATCACCGGGTTTGCCGGCTGGTATATCTACCATAACCTTGGCTCTAAC
TTAACGGCGATATCTCATGCCATGACCCGATTGGCAAGAGGAGAAAAAGAGGTCAGCGTACCAGCCCAACAACGGCGTGA
TGAACTGGGCGAACTGGCTCGCGCGTTTAACGTTTTTGCCCGCAATACCGCTTCGCTGGAGCAGACATCACGTCTTCTGA
AAGAGAAAAGTACGCTATTGGAAACCACCTTTCACGCTATGCGCGATGGTTTTGCCCTGTTCGACAACGAGGGCTTTCTG
GTGGTGTGGAACCCGCAATACCCACTGTTGCTGGGGCTGGCACCGGAGCAGCTACAGCATGGTCAGCACTACCTTCAATT
ATTGAAGCAGATGACGCCACTGCAAGAGCATATACTTGAGAACCTCGCCCTCCCGCTGCCAAAAACCCAAGAGCTAAGAC
TTGAGGACCATCGCACTATCGAACTGCGTTTCAGTCCGGTTCCTGGACGAGGGATGGTTAATGTGGTGTTGGATCGTAGC
GAGCGCAAAGCACTGGAAGAAGCGCTGGTCCATAGCCAAAAAATGAAGGCGGTAGGGCAGCTCACGGGCGGCCTGGCTCA
TGATTTTAATAACCTGCTGGCGGTGATTATTGGCAGTCTTGAGCTAACCGCTACGGACTCGTCGGATGCCACGCGTATTC
ATCGTGCTCTGAAGGCCGCTGAGCGGGGGGCGCAACTCACCCAACGGTTGCTGGCGTTCTCACGCAAGCAGTCGCTTCAC
CCTCGAGCTGTTGCGATGAAAGAACTACTTGATAACCTGGACCCGCTGATACGCCACTCGCTTCCGGCTCATCTTACGCT
CACAATTGAAGCTCAGCAGCCTGCCTGGCACGCCTGGATAGACGTAAACCAACTGGAAAACGCAATTATCAATCTGGTGA
TGAATGCTCGCGACGCGATGGAAGGGCGCAGCGGCGAGATTAAAATCCGCACCTGGAATCAACGCGTAGAGCGTGGTGAA
GGGCGCAAACAAGATATGGTGGTGCTGGAAGTGGCTGATAGCGGCCATGGCATGACCACCGCAGTGAAAGAGCAGGTTTT
TGAACCCTTCTTCACCACCAAGCAAACCGGTAGCGGGAGTGGGCTTGGGCTGTCAATGGTATACGGCTTTGTGCGCCAGT
CCGGAGGGCGGGTACAGATAGAAAGTGAACCGGGGAAAGGGACCCGGGTCTGCTTGCAGTTACCCCGTGCACTCACACAA
AGTCTGATAGAAGTCCTGCCAGCGCTTGGTGCCGTTGCGAATATGGCTGATCAGCTAGTCTTAGTGCTGGAAGATGAGCC
GGATGTACGCCAGACCCTGTGCGAGCAACTCCATCAACTGGGCTACCTGACGCTTGAAACCGGCGACAGTCGGCAGGCGC
TGGCATTGATGGCCGACGTGCCGGATATCAGCATTGTGATAAGCGACTTAATGCTACCCGGCGACATGACCGGTGCGGAA
GTGCTTCAGCAAGCGCGCAGTGTTTATCCTCATCTTAAGCTGTTGTTAATTAGTGGCCAGGATCTGCGGCGCAGCAAGAA
TTTCATGCCGGAGGTGGAACTGCTGCGTAAGCCTTTTAACCAACAACAGCTAGTACAGGCGCTGCAAAGAGTCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAGTTGAATAGTTAACCGAGATCACATTCCCGATAGGGAAATCATCGCTAGAGGCAGAGGAGTGATTAACTAACAGAA
AATGCCAGCCGGAGCCTTCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGGGATAATCCCCGAGAGCGTCAAGCTTTCGCCCTCCTCCCATCAGGCTGACAAATATTTCACAAATTTAGTCTATGAA
AACCAGACGGGTAAACGGTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Blue-light-activated histidine kinase; Response regulator [H]

Number of amino acids: Translated: 851; Mature: 851

Protein sequence:

>851_residues
MEQPRLSFFASVRGRLLFFNLLVVAVTLMVSGVAVLGFEQASRLQKQVQERTLRDMSSSMALARDTANVATAAVRLSQVV
GALEFQSEAASLQETQLALRSSLAHLANAPLASHEPLLVKRIIERSNELETSVARMLNLGHRRHLERNLLLSALYQTQSY
LHHLQEINQRDGLNKPDAALLKEMDRLLLVAIQTSSPKAAVQQLTEVMQALPAHADSPLVEEILQEFSASLYQLLPLSIT
LENSDLSITWYMYHVKALVAFLNQGINIYVQKVGEESLQRSQQNHKALQSIITSIGLFALLALVITGFAGWYIYHNLGSN
LTAISHAMTRLARGEKEVSVPAQQRRDELGELARAFNVFARNTASLEQTSRLLKEKSTLLETTFHAMRDGFALFDNEGFL
VVWNPQYPLLLGLAPEQLQHGQHYLQLLKQMTPLQEHILENLALPLPKTQELRLEDHRTIELRFSPVPGRGMVNVVLDRS
ERKALEEALVHSQKMKAVGQLTGGLAHDFNNLLAVIIGSLELTATDSSDATRIHRALKAAERGAQLTQRLLAFSRKQSLH
PRAVAMKELLDNLDPLIRHSLPAHLTLTIEAQQPAWHAWIDVNQLENAIINLVMNARDAMEGRSGEIKIRTWNQRVERGE
GRKQDMVVLEVADSGHGMTTAVKEQVFEPFFTTKQTGSGSGLGLSMVYGFVRQSGGRVQIESEPGKGTRVCLQLPRALTQ
SLIEVLPALGAVANMADQLVLVLEDEPDVRQTLCEQLHQLGYLTLETGDSRQALALMADVPDISIVISDLMLPGDMTGAE
VLQQARSVYPHLKLLLISGQDLRRSKNFMPEVELLRKPFNQQQLVQALQRV

Sequences:

>Translated_851_residues
MEQPRLSFFASVRGRLLFFNLLVVAVTLMVSGVAVLGFEQASRLQKQVQERTLRDMSSSMALARDTANVATAAVRLSQVV
GALEFQSEAASLQETQLALRSSLAHLANAPLASHEPLLVKRIIERSNELETSVARMLNLGHRRHLERNLLLSALYQTQSY
LHHLQEINQRDGLNKPDAALLKEMDRLLLVAIQTSSPKAAVQQLTEVMQALPAHADSPLVEEILQEFSASLYQLLPLSIT
LENSDLSITWYMYHVKALVAFLNQGINIYVQKVGEESLQRSQQNHKALQSIITSIGLFALLALVITGFAGWYIYHNLGSN
LTAISHAMTRLARGEKEVSVPAQQRRDELGELARAFNVFARNTASLEQTSRLLKEKSTLLETTFHAMRDGFALFDNEGFL
VVWNPQYPLLLGLAPEQLQHGQHYLQLLKQMTPLQEHILENLALPLPKTQELRLEDHRTIELRFSPVPGRGMVNVVLDRS
ERKALEEALVHSQKMKAVGQLTGGLAHDFNNLLAVIIGSLELTATDSSDATRIHRALKAAERGAQLTQRLLAFSRKQSLH
PRAVAMKELLDNLDPLIRHSLPAHLTLTIEAQQPAWHAWIDVNQLENAIINLVMNARDAMEGRSGEIKIRTWNQRVERGE
GRKQDMVVLEVADSGHGMTTAVKEQVFEPFFTTKQTGSGSGLGLSMVYGFVRQSGGRVQIESEPGKGTRVCLQLPRALTQ
SLIEVLPALGAVANMADQLVLVLEDEPDVRQTLCEQLHQLGYLTLETGDSRQALALMADVPDISIVISDLMLPGDMTGAE
VLQQARSVYPHLKLLLISGQDLRRSKNFMPEVELLRKPFNQQQLVQALQRV
>Mature_851_residues
MEQPRLSFFASVRGRLLFFNLLVVAVTLMVSGVAVLGFEQASRLQKQVQERTLRDMSSSMALARDTANVATAAVRLSQVV
GALEFQSEAASLQETQLALRSSLAHLANAPLASHEPLLVKRIIERSNELETSVARMLNLGHRRHLERNLLLSALYQTQSY
LHHLQEINQRDGLNKPDAALLKEMDRLLLVAIQTSSPKAAVQQLTEVMQALPAHADSPLVEEILQEFSASLYQLLPLSIT
LENSDLSITWYMYHVKALVAFLNQGINIYVQKVGEESLQRSQQNHKALQSIITSIGLFALLALVITGFAGWYIYHNLGSN
LTAISHAMTRLARGEKEVSVPAQQRRDELGELARAFNVFARNTASLEQTSRLLKEKSTLLETTFHAMRDGFALFDNEGFL
VVWNPQYPLLLGLAPEQLQHGQHYLQLLKQMTPLQEHILENLALPLPKTQELRLEDHRTIELRFSPVPGRGMVNVVLDRS
ERKALEEALVHSQKMKAVGQLTGGLAHDFNNLLAVIIGSLELTATDSSDATRIHRALKAAERGAQLTQRLLAFSRKQSLH
PRAVAMKELLDNLDPLIRHSLPAHLTLTIEAQQPAWHAWIDVNQLENAIINLVMNARDAMEGRSGEIKIRTWNQRVERGE
GRKQDMVVLEVADSGHGMTTAVKEQVFEPFFTTKQTGSGSGLGLSMVYGFVRQSGGRVQIESEPGKGTRVCLQLPRALTQ
SLIEVLPALGAVANMADQLVLVLEDEPDVRQTLCEQLHQLGYLTLETGDSRQALALMADVPDISIVISDLMLPGDMTGAE
VLQQARSVYPHLKLLLISGQDLRRSKNFMPEVELLRKPFNQQQLVQALQRV

Specific function: Photosensitive kinase and response regulator that is involved in increased bacterial virulence upon exposure to light [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 response regulatory domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788549, Length=420, Percent_Identity=25.2380952380952, Blast_Score=106, Evalue=5e-24,
Organism=Escherichia coli, GI1790436, Length=246, Percent_Identity=30.0813008130081, Blast_Score=91, Evalue=3e-19,
Organism=Escherichia coli, GI87081816, Length=219, Percent_Identity=26.9406392694064, Blast_Score=70, Evalue=5e-13,
Organism=Escherichia coli, GI1790300, Length=242, Percent_Identity=26.8595041322314, Blast_Score=70, Evalue=8e-13,
Organism=Escherichia coli, GI1790346, Length=240, Percent_Identity=25.4166666666667, Blast_Score=67, Evalue=7e-12,
Organism=Escherichia coli, GI1788713, Length=352, Percent_Identity=25, Blast_Score=65, Evalue=2e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003594
- InterPro:   IPR011006
- InterPro:   IPR001610
- InterPro:   IPR000014
- InterPro:   IPR000700
- InterPro:   IPR013767
- InterPro:   IPR004358
- InterPro:   IPR003661
- InterPro:   IPR005467
- InterPro:   IPR009082
- InterPro:   IPR001789 [H]

Pfam domain/function: PF02518 HATPase_c; PF00512 HisKA; PF00989 PAS; PF00072 Response_reg [H]

EC number: =2.7.13.3 [H]

Molecular weight: Translated: 94763; Mature: 94763

Theoretical pI: Translated: 7.02; Mature: 7.02

Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50112 PAS ; PS50110 RESPONSE_REGULATORY ; PS50109 HIS_KIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEQPRLSFFASVRGRLLFFNLLVVAVTLMVSGVAVLGFEQASRLQKQVQERTLRDMSSSM
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALARDTANVATAAVRLSQVVGALEFQSEAASLQETQLALRSSLAHLANAPLASHEPLLVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
RIIERSNELETSVARMLNLGHRRHLERNLLLSALYQTQSYLHHLQEINQRDGLNKPDAAL
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
LKEMDRLLLVAIQTSSPKAAVQQLTEVMQALPAHADSPLVEEILQEFSASLYQLLPLSIT
HHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE
LENSDLSITWYMYHVKALVAFLNQGINIYVQKVGEESLQRSQQNHKALQSIITSIGLFAL
EECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LALVITGFAGWYIYHNLGSNLTAISHAMTRLARGEKEVSVPAQQRRDELGELARAFNVFA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RNTASLEQTSRLLKEKSTLLETTFHAMRDGFALFDNEGFLVVWNPQYPLLLGLAPEQLQH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEECCCCCEEECCCHHHHHH
GQHYLQLLKQMTPLQEHILENLALPLPKTQELRLEDHRTIELRFSPVPGRGMVNVVLDRS
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCH
ERKALEEALVHSQKMKAVGQLTGGLAHDFNNLLAVIIGSLELTATDSSDATRIHRALKAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
ERGAQLTQRLLAFSRKQSLHPRAVAMKELLDNLDPLIRHSLPAHLTLTIEAQQPAWHAWI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEE
DVNQLENAIINLVMNARDAMEGRSGEIKIRTWNQRVERGEGRKQDMVVLEVADSGHGMTT
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHH
AVKEQVFEPFFTTKQTGSGSGLGLSMVYGFVRQSGGRVQIESEPGKGTRVCLQLPRALTQ
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
SLIEVLPALGAVANMADQLVLVLEDEPDVRQTLCEQLHQLGYLTLETGDSRQALALMADV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCHHHHHHHCC
PDISIVISDLMLPGDMTGAEVLQQARSVYPHLKLLLISGQDLRRSKNFMPEVELLRKPFN
CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCC
QQQLVQALQRV
HHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MEQPRLSFFASVRGRLLFFNLLVVAVTLMVSGVAVLGFEQASRLQKQVQERTLRDMSSSM
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALARDTANVATAAVRLSQVVGALEFQSEAASLQETQLALRSSLAHLANAPLASHEPLLVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
RIIERSNELETSVARMLNLGHRRHLERNLLLSALYQTQSYLHHLQEINQRDGLNKPDAAL
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
LKEMDRLLLVAIQTSSPKAAVQQLTEVMQALPAHADSPLVEEILQEFSASLYQLLPLSIT
HHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE
LENSDLSITWYMYHVKALVAFLNQGINIYVQKVGEESLQRSQQNHKALQSIITSIGLFAL
EECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LALVITGFAGWYIYHNLGSNLTAISHAMTRLARGEKEVSVPAQQRRDELGELARAFNVFA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RNTASLEQTSRLLKEKSTLLETTFHAMRDGFALFDNEGFLVVWNPQYPLLLGLAPEQLQH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEECCCCCEEECCCHHHHHH
GQHYLQLLKQMTPLQEHILENLALPLPKTQELRLEDHRTIELRFSPVPGRGMVNVVLDRS
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCH
ERKALEEALVHSQKMKAVGQLTGGLAHDFNNLLAVIIGSLELTATDSSDATRIHRALKAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
ERGAQLTQRLLAFSRKQSLHPRAVAMKELLDNLDPLIRHSLPAHLTLTIEAQQPAWHAWI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEE
DVNQLENAIINLVMNARDAMEGRSGEIKIRTWNQRVERGEGRKQDMVVLEVADSGHGMTT
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHH
AVKEQVFEPFFTTKQTGSGSGLGLSMVYGFVRQSGGRVQIESEPGKGTRVCLQLPRALTQ
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
SLIEVLPALGAVANMADQLVLVLEDEPDVRQTLCEQLHQLGYLTLETGDSRQALALMADV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCHHHHHHHCC
PDISIVISDLMLPGDMTGAEVLQQARSVYPHLKLLLISGQDLRRSKNFMPEVELLRKPFN
CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCC
QQQLVQALQRV
HHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA