| Definition | Streptococcus pneumoniae ATCC 700669, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011900 |
| Length | 2,221,315 |
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The map label for this gene is 221232282
Identifier: 221232282
GI number: 221232282
Start: 1498538
End: 1501819
Strand: Reverse
Name: 221232282
Synonym: SPN23F_15360
Alternate gene names: NA
Gene position: 1501819-1498538 (Counterclockwise)
Preceding gene: 221232283
Following gene: 221232281
Centisome position: 67.61
GC content: 41.35
Gene sequence:
>3282_bases ATGGCTGATGGAAAAGTGACCATCGTTGTCGATGTGGATGGTAATAAAGTCAAGGTTCTAAACGATGAGTTAGATAAAGC GGCACAGAAAGGTGACAGAGGGAGCGATTCTCTAAAGAAGTTTGCGATTGGTGGTGCTGCTTTTAAACTGGCATCTAAAG CGGTAGATCTTCTAACAGATTCCTTGGGCGGAGCGATTCAACGTTTTGATACTCTTGAAAGTTATCCAAGAGTGATGCAA GCTATGGGGCATAGTACAGAAGATGTCACGCGCTCAACTAAGAAACTAGCGGCAGGTATTGAGGGTTTGCCTACGACTTT AAATGAAGTGGTAGGCACAGCTCAACGCCTTACCTCGATTACTGGCGATATAAACAAATCAACAGATTTAACACTTGCTC TTAATAATGCCTTTCTTGCCTCTGGATCTTCTAGTGCTGATGCAAGCCGTGGTTTACAACAGTTCAGTCAGATGTTATCA GCTGGTAAGGTTGACATGCAAAGTTGGAAAACGTTACAGGAAACCATGCCTTATGCTTTGCAAAAGACTGCTGATTCATT CGGTTTTGCTGGCCAATCTGCTCAGAATGATTTCTATTCTGCATTAAAAGAGGGGCGTATCACTTTCAACCAATTTTCAA AGAAATTAGTTGAGCTAAACGGTGGCGTGGGTGGTTTCGCTGAGCTTGCAAAATCAAACAGTAAAGGGATCCAGACATCT TTTGGGAACTTAAAGAATGCGGTTGTTAAAGGTGTAGCTAATACTATCAAGGCTCTTGACGATTTAACAAAGGCAGCAAC AGGTAAGACGATTGCTGAGAACTTCGATGCATTGAAAGTAATCATCAATGCGGCTTTTGGTGTTATTGTCAACGTAATTA AAGCTAGCACACCTGTTTTTCAGACTTTGTTTAGTATTTTGGGTACTGGAGCTTCTGTAATCTCATCTTTGACACCAGTT ATTATTAGTTTGGTTTCTGCTTTGGTGGCTATGCGTGCCGCTAATGAAGCTATAACAGCAACAAAAAACTTAATTAATTC CTGGCAGACATTCAAAACAACAGCCACAGGAGCGATTCAGATCATCAATCTAATGACAGCTGCCCAAGCTACTTGTGGCT CAGTAACAAAGGCTCAACTGGTTGCTAACTTGGCCAATAACGGAGCTTTGACAGCATCCAATTTGCTTTATGGGGTTCTA ACTGGCTCTATCAGCTTACAGACTGCTGCTACTATTGCTGCGACTGCTGCAACTACTGCATTTAAAGCAGCACTGACCGC TTTAACTGGCCCGATTGGTTTGGTTGTTGCTGGTGTAGGTCTTGCTGTTGGGGCATTGGTAGGGTTGTGGCAATGGCTAA CTGCCGAGAGTGAGGAGACCAAACGCCTCAAATCAGAACAAGAGGAGTTAGTCAAGAGTACGGATCAATTAACGGATTCT GTTAAACAAAGCGCAAAAGAACGTCAAAAAAATCTTGAGTCTGTAAAAGGTAATACAGAATCTTACCAAAAATTGGCTGA CGAAATTGTCCAGTTATCACAAAAGACAAATAAGACAGCAGCAGACAAGAAAAATCTCAAGAAAAAGATTGATGCTTTAA ATGCCTCTGTTAGTGGATTGAATCTAGTCTATGACAAAAACACTGATTCTTTGTCTCATAACAATGACCAAATCAAAGCT CGTATCTCAGCGATGGAGGCGGAATCAACATGGGAGACATCCCAGAAGAACCTGCTTGATATCGAACAAAAGCGTGCTGA AATTGGCGAACAGCTAAAGCAGATAGCTGAACAACGCAAAAAATGGAATGAAGAATCCAATGTTAGCGATAGTGTCCGTA AAGAAAGACTGCAAGAACTCAACGACAAGGAAACTGAGCTAAAAAATACTCAGACAGAATTGCAAACTGAGTACGAAAAA ACGTCTCAAGTTCAACAGGCGGCATCTGAAGCGATGGCTGCTGCTGCCGAAAATGGATCTAATCGACAAGTTATATCATA CGAAGGTATGTCTAAAGCTCAACAAAAAGCGGTTGATGATATGCGCTCTAAATACAATGAGTTGCTTGAAACCACAACGA ACATGTTTGATCAGATACAAATGAAGTCAGCTATTAGTGTCGATGAAATGATTGCCAACCTCCAAAAAAACCAAGAGGCG GTTAATAATTGGGCAACAAACCTCAATACATTGGCCGAACGTGGGGTAAACGAGGGGATTTTAGCTAAATTGCAAGCGAT GGGGCCTCAAGGTGGGTTGTACGTTCAAGAACTCGTTAATGCATCAGACGAAAAATTGGCAACATTGAACGAAGTCTTTA CTCAAGGTGGTGAGTCAGCTATGAATGGCTTAACTGCTGGTATGGATACGGGTGCTTTGGGTATCACAGACAAAATCAAG GGTATTGTACAAAGTCAAGTTTCAAGCTTACAAGAGGAAATTGCAGCTGCTGACTTCCCTGAAAAAGGGAAAAATATTCC TGAAGGTGTTGGTGATGGTATAAAAGCTGGAGCTGAAATTGCAAGTGAAGCTTCTAAAAACATGGCAAATGACATAAAAG AATCCTTTACAAGTGAAATGGATATCAATTCCCCATCTCGTGTTTTCAATGAGTATGGTGGTTTTATCACTACTGGTTTA GCTGAGGGGGTAGATAAAGGTACCAATCAACCTGTATCATCTGTTACTAATTTAGCCAATCAAATTAAGAAACCATTTGA TAGTCTGCAGAGTGATTTCACGTACATTGGTGAAATGGCGATGTCTGGTCTTAATGCAGGGCTTTGGAGTGGCTCTGGTT CTGTTATGGCAACAGCTAATTCAATTGCTGAAAGGGTAAAAGCGACCATCAAGAGCGCACTAGATATTCACTCGCCATCT AGAGCAATGCGTGATGAAGTCGGACGTTTCATTCCTCAAGGTATCGCTGTTGGTATTGAAGCAGATGCAGGGGTTGTTGA AAAATCAATGTTGCGATTAAAAGAAAGCATGATGATTGATACTAGACCAGAAATTGCACTTGGCTTAAACAAGAAACTAG GTGCTCAAGTGACTGTTAAACAAAGTAGTAAGCAGACAATAGCTGAAAAAATCAAAGTTACTATGGACAAGTCTAGCGAA CTACTCGAAAAAGCCCTGGATGTAGCTGAGACGGCCGTTAGACGACCAAATGAAATGTACTTAAACGATGGTACTTTAGT CGCCAGAACAGGCGATAAATTTGCTAAATATCAATCGGAACAACTAAGACGAGATAATAGGATGAAAGGGGTATTGTCAT GA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CAAAGATAATGACTTTCAACGGAGTTGATATGTCTAAATTCTTTCGTATAACAGATATTATCCGCCCTATCGGGAACAAG AGGAGCGTATCAACTGATAA
Product: phage minor tail protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1093; Mature: 1092
Protein sequence:
>1093_residues MADGKVTIVVDVDGNKVKVLNDELDKAAQKGDRGSDSLKKFAIGGAAFKLASKAVDLLTDSLGGAIQRFDTLESYPRVMQ AMGHSTEDVTRSTKKLAAGIEGLPTTLNEVVGTAQRLTSITGDINKSTDLTLALNNAFLASGSSSADASRGLQQFSQMLS AGKVDMQSWKTLQETMPYALQKTADSFGFAGQSAQNDFYSALKEGRITFNQFSKKLVELNGGVGGFAELAKSNSKGIQTS FGNLKNAVVKGVANTIKALDDLTKAATGKTIAENFDALKVIINAAFGVIVNVIKASTPVFQTLFSILGTGASVISSLTPV IISLVSALVAMRAANEAITATKNLINSWQTFKTTATGAIQIINLMTAAQATCGSVTKAQLVANLANNGALTASNLLYGVL TGSISLQTAATIAATAATTAFKAALTALTGPIGLVVAGVGLAVGALVGLWQWLTAESEETKRLKSEQEELVKSTDQLTDS VKQSAKERQKNLESVKGNTESYQKLADEIVQLSQKTNKTAADKKNLKKKIDALNASVSGLNLVYDKNTDSLSHNNDQIKA RISAMEAESTWETSQKNLLDIEQKRAEIGEQLKQIAEQRKKWNEESNVSDSVRKERLQELNDKETELKNTQTELQTEYEK TSQVQQAASEAMAAAAENGSNRQVISYEGMSKAQQKAVDDMRSKYNELLETTTNMFDQIQMKSAISVDEMIANLQKNQEA VNNWATNLNTLAERGVNEGILAKLQAMGPQGGLYVQELVNASDEKLATLNEVFTQGGESAMNGLTAGMDTGALGITDKIK GIVQSQVSSLQEEIAAADFPEKGKNIPEGVGDGIKAGAEIASEASKNMANDIKESFTSEMDINSPSRVFNEYGGFITTGL AEGVDKGTNQPVSSVTNLANQIKKPFDSLQSDFTYIGEMAMSGLNAGLWSGSGSVMATANSIAERVKATIKSALDIHSPS RAMRDEVGRFIPQGIAVGIEADAGVVEKSMLRLKESMMIDTRPEIALGLNKKLGAQVTVKQSSKQTIAEKIKVTMDKSSE LLEKALDVAETAVRRPNEMYLNDGTLVARTGDKFAKYQSEQLRRDNRMKGVLS
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 116809; Mature: 116678
Theoretical pI: Translated: 5.49; Mature: 5.49
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MADGKVTIVVDVDGNKVKVLNDELDKAAQKGDRGSDSLKKFAIGGAAFKLASKAVDLLTD CCCCEEEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLGGAIQRFDTLESYPRVMQAMGHSTEDVTRSTKKLAAGIEGLPTTLNEVVGTAQRLTSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TGDINKSTDLTLALNNAFLASGSSSADASRGLQQFSQMLSAGKVDMQSWKTLQETMPYAL HCCCCCCCCEEEEECCHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH QKTADSFGFAGQSAQNDFYSALKEGRITFNQFSKKLVELNGGVGGFAELAKSNSKGIQTS HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHH FGNLKNAVVKGVANTIKALDDLTKAATGKTIAENFDALKVIINAAFGVIVNVIKASTPVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH QTLFSILGTGASVISSLTPVIISLVSALVAMRAANEAITATKNLINSWQTFKTTATGAIQ HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IINLMTAAQATCGSVTKAQLVANLANNGALTASNLLYGVLTGSISLQTAATIAATAATTA HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH FKAALTALTGPIGLVVAGVGLAVGALVGLWQWLTAESEETKRLKSEQEELVKSTDQLTDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKQSAKERQKNLESVKGNTESYQKLADEIVQLSQKTNKTAADKKNLKKKIDALNASVSGL HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC NLVYDKNTDSLSHNNDQIKARISAMEAESTWETSQKNLLDIEQKRAEIGEQLKQIAEQRK EEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KWNEESNVSDSVRKERLQELNDKETELKNTQTELQTEYEKTSQVQQAASEAMAAAAENGS HCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NRQVISYEGMSKAQQKAVDDMRSKYNELLETTTNMFDQIQMKSAISVDEMIANLQKNQEA CCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH VNNWATNLNTLAERGVNEGILAKLQAMGPQGGLYVQELVNASDEKLATLNEVFTQGGESA HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH MNGLTAGMDTGALGITDKIKGIVQSQVSSLQEEIAAADFPEKGKNIPEGVGDGIKAGAEI HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH ASEASKNMANDIKESFTSEMDINSPSRVFNEYGGFITTGLAEGVDKGTNQPVSSVTNLAN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH QIKKPFDSLQSDFTYIGEMAMSGLNAGLWSGSGSVMATANSIAERVKATIKSALDIHSPS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH RAMRDEVGRFIPQGIAVGIEADAGVVEKSMLRLKESMMIDTRPEIALGLNKKLGAQVTVK HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCCEEEEC QSSKQTIAEKIKVTMDKSSELLEKALDVAETAVRRPNEMYLNDGTLVARTGDKFAKYQSE CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEEEEECCHHHHHHHHH QLRRDNRMKGVLS HHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure ADGKVTIVVDVDGNKVKVLNDELDKAAQKGDRGSDSLKKFAIGGAAFKLASKAVDLLTD CCCEEEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLGGAIQRFDTLESYPRVMQAMGHSTEDVTRSTKKLAAGIEGLPTTLNEVVGTAQRLTSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TGDINKSTDLTLALNNAFLASGSSSADASRGLQQFSQMLSAGKVDMQSWKTLQETMPYAL HCCCCCCCCEEEEECCHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH QKTADSFGFAGQSAQNDFYSALKEGRITFNQFSKKLVELNGGVGGFAELAKSNSKGIQTS HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHH FGNLKNAVVKGVANTIKALDDLTKAATGKTIAENFDALKVIINAAFGVIVNVIKASTPVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH QTLFSILGTGASVISSLTPVIISLVSALVAMRAANEAITATKNLINSWQTFKTTATGAIQ HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IINLMTAAQATCGSVTKAQLVANLANNGALTASNLLYGVLTGSISLQTAATIAATAATTA HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH FKAALTALTGPIGLVVAGVGLAVGALVGLWQWLTAESEETKRLKSEQEELVKSTDQLTDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKQSAKERQKNLESVKGNTESYQKLADEIVQLSQKTNKTAADKKNLKKKIDALNASVSGL HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC NLVYDKNTDSLSHNNDQIKARISAMEAESTWETSQKNLLDIEQKRAEIGEQLKQIAEQRK EEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KWNEESNVSDSVRKERLQELNDKETELKNTQTELQTEYEKTSQVQQAASEAMAAAAENGS HCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NRQVISYEGMSKAQQKAVDDMRSKYNELLETTTNMFDQIQMKSAISVDEMIANLQKNQEA CCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH VNNWATNLNTLAERGVNEGILAKLQAMGPQGGLYVQELVNASDEKLATLNEVFTQGGESA HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH MNGLTAGMDTGALGITDKIKGIVQSQVSSLQEEIAAADFPEKGKNIPEGVGDGIKAGAEI HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH ASEASKNMANDIKESFTSEMDINSPSRVFNEYGGFITTGLAEGVDKGTNQPVSSVTNLAN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH QIKKPFDSLQSDFTYIGEMAMSGLNAGLWSGSGSVMATANSIAERVKATIKSALDIHSPS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH RAMRDEVGRFIPQGIAVGIEADAGVVEKSMLRLKESMMIDTRPEIALGLNKKLGAQVTVK HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCCEEEEC QSSKQTIAEKIKVTMDKSSELLEKALDVAETAVRRPNEMYLNDGTLVARTGDKFAKYQSE CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEEEEECCHHHHHHHHH QLRRDNRMKGVLS HHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA