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The map label for this gene is yccS [H]

Identifier: 218928584

GI number: 218928584

Start: 1630083

End: 1632221

Strand: Reverse

Name: yccS [H]

Synonym: YPO1438

Alternate gene names: 218928584

Gene position: 1632221-1630083 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218928585

Following gene: 218928582

Centisome position: 35.07

GC content: 46.14

Gene sequence:

>2139_bases
GTGTTCACTTTCGTCACTGATTTACGCCGTTATGCATACAACAGTAGCCTGCTTTATCATGCCCGTATTTTTATCGCTTT
GGTGGGCGTAACAGCCGTCCCATGGTGGATTGAACAACCCAAACTGACTATCCCATTAACATTAGGGGTCGTTGCCGCAG
CACTGACAGATCTTGATGACCGCCTAACCGGGCGGTTACGTAACTTATTCATTACGCTAATTTGCTTTTTTGTAGCCTCA
TCTTCAATTGAGTTGCTATTTCCTTACCCATGGTTTTTTGCTCTCGGTCTGACCTTATCAACCTGTGGCTTCACACTGCT
AGGTGCATTAGGGCAGCGCTATGCCACTATTGCTTTCGGCGCGTTGCTCATTGCTATTTACACTATGCTAGGTGCCTCGA
TGTACCCTACTTGGTACCAGCAACCACTCTTACTGATATCAGGTGCTGTTTGGTATAACGTACTCACCTTATTCGGCCAT
CTTATTTTCCCTATCCGTCCCTTACAGGATAATTTAGCCCGTTGTTACCAACAGTTGGCTCATTATTTGGAAGCAAAGGC
CAATTTGTTTGATCCAGATATTGAATCTGATATTAATCAACCCTTAATCGACGTGGCGATGGTCAACAGTACATTAGTAG
CCACCTTGAATCAGGCCAAAGCCTCACTCGTGACCCGACTAAAAGGTGACCGTGGTCAACGAGGCACTCGCCGGACACTT
CACTATTATTTTGTTGCGCAAGATATCCATGAGCGGGCCAGTTCATCTCATTTTCAATACCAGGTTCTGCGAGAAAAATT
TCGTTACAGTGATGTTCTGTTCAGATTTCAGCGTTTACTGAGTATGCAAGCTAAGGCCTGTAACCACCTCTCCCAATCCA
TTCTGATGCATCAGAAATACCAGCATGACCCACGTTTCGAACGGGCATTTACGTTCTTAGATGCCGCACTGGCCAGAGAA
GAGCTGGCTCATCACGAAAATACTCAGCAAGTTAAGGCACTTTCCTACTTGCTAAAAAATTTGCGCGCTATTGATGCACA
ACTGGCAGGGATAGAGTCAGAGCAAGTCTTAGCGCAAGACCCAACACCTGATAACCATTTGTCAGATGACCGCATCACTG
GCTGGAGTGATATCAAACTACGAATCAGCCGCCATTTAACACCGCAATCAGCACTATTTCGCCATGCAATACGCATGTCT
ATTGTCTTGTGTGTGGGCTACGCATTCATTCAATTCACTGGGTTACGCCACGGTTATTGGATCTTGCTGACCAGCCTTTT
TGTCTGCCAGCCAAACTATAGTGCGACCCGTCGCCGCCTTGCGCTACGCATTATCGGCACCTTAGCCGGTATCCTTGTCG
GTTTGCCTATCCTTTATTTCGTTCCTTCTATTGAGGGGCAACTCACCCTGATTGTGATCAGTGGTGTTCTGTTTTTTGCG
TTCCGTAATGTCCAGTATGCTCACGCGACGATGTTTATCACCCTGCTAGTCTTATTGTGCTTTAACCTTTTGGGTGAAGG
GTTTGAGGTGGCCGCACCACGGGTGTTTGATACCTTGTTGGGTTGTGCCATTGCTTGGGTAGCCGTCAGTTTTATCTGGC
CGGATTGGAAATTTCGTCAACTGCCTACGGTGGTTCATAAAACATTTAATGCTAATTGCCGCTATCTGGATGCCATTTTG
GCGCAATATCATCAAGGTAAAGACAATAGTTTGCTTTATCGGGTTGCCCGCCGTGATGCACATAATTGCGATGCTGAATT
AGCGTCAGTTATTTCAAATATGTCAGCGGAACCCAAAAACGATAAAGAAACTCAGGAAGCGGCATTCCGCTTACTTTGCC
TGAACCACACCATGTTGAGCTATATTTCTGCTCTGGGTGCCCATCGTGAAAAATTGACCAATAGCACCACGCTAAATTTG
CTCAATGATGCTATTTGCTATATTGAGGGCACCCTGGCGAAAGAACAACCAGACAACGCTAGAATGGCAAGTGCGTTAGC
TGAGTTATCCAACCGGCTACAGCACTGTCATCCAGAACCAGAGAGCAGAGACCTATTGGTCTTACAACAAATTGGTTTGC
TGCTTGAACTGCTACCGGAACTCAGCGAATTAAATAAACGTATTAGCCAGCCAGCCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCCGTCGAGTCGTTTCGGTGGAAGTGGCGCAGCAAGCCAGAGTGGCTAATGCTCAACGCCAGCATCGGTAACACTGAGTT
TTTCTGTTTTAGAGGTTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGTACCCAAGGGCCACCCATCGTGGCCCATTATACGGTTTCATACGGTTATACTGTTTCACACAGTTATGCTGACTCACC
CCATTACACTGGCTCACACC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 712; Mature: 712

Protein sequence:

>712_residues
MFTFVTDLRRYAYNSSLLYHARIFIALVGVTAVPWWIEQPKLTIPLTLGVVAAALTDLDDRLTGRLRNLFITLICFFVAS
SSIELLFPYPWFFALGLTLSTCGFTLLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGASMYPTWYQQPLLLISGAVWYNVLTLFGH
LIFPIRPLQDNLARCYQQLAHYLEAKANLFDPDIESDINQPLIDVAMVNSTLVATLNQAKASLVTRLKGDRGQRGTRRTL
HYYFVAQDIHERASSSHFQYQVLREKFRYSDVLFRFQRLLSMQAKACNHLSQSILMHQKYQHDPRFERAFTFLDAALARE
ELAHHENTQQVKALSYLLKNLRAIDAQLAGIESEQVLAQDPTPDNHLSDDRITGWSDIKLRISRHLTPQSALFRHAIRMS
IVLCVGYAFIQFTGLRHGYWILLTSLFVCQPNYSATRRRLALRIIGTLAGILVGLPILYFVPSIEGQLTLIVISGVLFFA
FRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVAAPRVFDTLLGCAIAWVAVSFIWPDWKFRQLPTVVHKTFNANCRYLDAIL
AQYHQGKDNSLLYRVARRDAHNCDAELASVISNMSAEPKNDKETQEAAFRLLCLNHTMLSYISALGAHREKLTNSTTLNL
LNDAICYIEGTLAKEQPDNARMASALAELSNRLQHCHPEPESRDLLVLQQIGLLLELLPELSELNKRISQPA

Sequences:

>Translated_712_residues
MFTFVTDLRRYAYNSSLLYHARIFIALVGVTAVPWWIEQPKLTIPLTLGVVAAALTDLDDRLTGRLRNLFITLICFFVAS
SSIELLFPYPWFFALGLTLSTCGFTLLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGASMYPTWYQQPLLLISGAVWYNVLTLFGH
LIFPIRPLQDNLARCYQQLAHYLEAKANLFDPDIESDINQPLIDVAMVNSTLVATLNQAKASLVTRLKGDRGQRGTRRTL
HYYFVAQDIHERASSSHFQYQVLREKFRYSDVLFRFQRLLSMQAKACNHLSQSILMHQKYQHDPRFERAFTFLDAALARE
ELAHHENTQQVKALSYLLKNLRAIDAQLAGIESEQVLAQDPTPDNHLSDDRITGWSDIKLRISRHLTPQSALFRHAIRMS
IVLCVGYAFIQFTGLRHGYWILLTSLFVCQPNYSATRRRLALRIIGTLAGILVGLPILYFVPSIEGQLTLIVISGVLFFA
FRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVAAPRVFDTLLGCAIAWVAVSFIWPDWKFRQLPTVVHKTFNANCRYLDAIL
AQYHQGKDNSLLYRVARRDAHNCDAELASVISNMSAEPKNDKETQEAAFRLLCLNHTMLSYISALGAHREKLTNSTTLNL
LNDAICYIEGTLAKEQPDNARMASALAELSNRLQHCHPEPESRDLLVLQQIGLLLELLPELSELNKRISQPA
>Mature_712_residues
MFTFVTDLRRYAYNSSLLYHARIFIALVGVTAVPWWIEQPKLTIPLTLGVVAAALTDLDDRLTGRLRNLFITLICFFVAS
SSIELLFPYPWFFALGLTLSTCGFTLLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGASMYPTWYQQPLLLISGAVWYNVLTLFGH
LIFPIRPLQDNLARCYQQLAHYLEAKANLFDPDIESDINQPLIDVAMVNSTLVATLNQAKASLVTRLKGDRGQRGTRRTL
HYYFVAQDIHERASSSHFQYQVLREKFRYSDVLFRFQRLLSMQAKACNHLSQSILMHQKYQHDPRFERAFTFLDAALARE
ELAHHENTQQVKALSYLLKNLRAIDAQLAGIESEQVLAQDPTPDNHLSDDRITGWSDIKLRISRHLTPQSALFRHAIRMS
IVLCVGYAFIQFTGLRHGYWILLTSLFVCQPNYSATRRRLALRIIGTLAGILVGLPILYFVPSIEGQLTLIVISGVLFFA
FRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVAAPRVFDTLLGCAIAWVAVSFIWPDWKFRQLPTVVHKTFNANCRYLDAIL
AQYHQGKDNSLLYRVARRDAHNCDAELASVISNMSAEPKNDKETQEAAFRLLCLNHTMLSYISALGAHREKLTNSTTLNL
LNDAICYIEGTLAKEQPDNARMASALAELSNRLQHCHPEPESRDLLVLQQIGLLLELLPELSELNKRISQPA

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=704, Percent_Identity=70.1704545454545, Blast_Score=1003, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=462, Percent_Identity=25.3246753246753, Blast_Score=108, Evalue=8e-25,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80662; Mature: 80662

Theoretical pI: Translated: 8.35; Mature: 8.35

Prosite motif: PS00217 SUGAR_TRANSPORT_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFTFVTDLRRYAYNSSLLYHARIFIALVGVTAVPWWIEQPKLTIPLTLGVVAAALTDLDD
CCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
RLTGRLRNLFITLICFFVASSSIELLFPYPWFFALGLTLSTCGFTLLGALGQRYATIAFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALLIAIYTMLGASMYPTWYQQPLLLISGAVWYNVLTLFGHLIFPIRPLQDNLARCYQQLA
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
HYLEAKANLFDPDIESDINQPLIDVAMVNSTLVATLNQAKASLVTRLKGDRGQRGTRRTL
HHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH
HYYFVAQDIHERASSSHFQYQVLREKFRYSDVLFRFQRLLSMQAKACNHLSQSILMHQKY
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QHDPRFERAFTFLDAALAREELAHHENTQQVKALSYLLKNLRAIDAQLAGIESEQVLAQD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCC
PTPDNHLSDDRITGWSDIKLRISRHLTPQSALFRHAIRMSIVLCVGYAFIQFTGLRHGYW
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
ILLTSLFVCQPNYSATRRRLALRIIGTLAGILVGLPILYFVPSIEGQLTLIVISGVLFFA
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHH
FRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVAAPRVFDTLLGCAIAWVAVSFIWPDWKFRQ
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LPTVVHKTFNANCRYLDAILAQYHQGKDNSLLYRVARRDAHNCDAELASVISNMSAEPKN
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC
DKETQEAAFRLLCLNHTMLSYISALGAHREKLTNSTTLNLLNDAICYIEGTLAKEQPDNA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHH
RMASALAELSNRLQHCHPEPESRDLLVLQQIGLLLELLPELSELNKRISQPA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MFTFVTDLRRYAYNSSLLYHARIFIALVGVTAVPWWIEQPKLTIPLTLGVVAAALTDLDD
CCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
RLTGRLRNLFITLICFFVASSSIELLFPYPWFFALGLTLSTCGFTLLGALGQRYATIAFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALLIAIYTMLGASMYPTWYQQPLLLISGAVWYNVLTLFGHLIFPIRPLQDNLARCYQQLA
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
HYLEAKANLFDPDIESDINQPLIDVAMVNSTLVATLNQAKASLVTRLKGDRGQRGTRRTL
HHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH
HYYFVAQDIHERASSSHFQYQVLREKFRYSDVLFRFQRLLSMQAKACNHLSQSILMHQKY
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QHDPRFERAFTFLDAALAREELAHHENTQQVKALSYLLKNLRAIDAQLAGIESEQVLAQD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCC
PTPDNHLSDDRITGWSDIKLRISRHLTPQSALFRHAIRMSIVLCVGYAFIQFTGLRHGYW
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
ILLTSLFVCQPNYSATRRRLALRIIGTLAGILVGLPILYFVPSIEGQLTLIVISGVLFFA
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHH
FRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVAAPRVFDTLLGCAIAWVAVSFIWPDWKFRQ
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LPTVVHKTFNANCRYLDAILAQYHQGKDNSLLYRVARRDAHNCDAELASVISNMSAEPKN
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC
DKETQEAAFRLLCLNHTMLSYISALGAHREKLTNSTTLNLLNDAICYIEGTLAKEQPDNA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHH
RMASALAELSNRLQHCHPEPESRDLLVLQQIGLLLELLPELSELNKRISQPA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503 [H]