| Definition | Yersinia pestis CO92 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003143 |
| Length | 4,653,728 |
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The map label for this gene is yapH [H]
Identifier: 218928174
GI number: 218928174
Start: 1119829
End: 1130946
Strand: Direct
Name: yapH [H]
Synonym: YPO1004
Alternate gene names: 218928174
Gene position: 1119829-1130946 (Clockwise)
Preceding gene: 218928173
Following gene: 218928178
Centisome position: 24.06
GC content: 52.92
Gene sequence:
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Product: putative autotransporter protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
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Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell outer membrane; Peripheral membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 autotransporter (TC 1.B.12) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788565, Length=474, Percent_Identity=29.3248945147679, Blast_Score=193, Evalue=2e-49,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR005546 - InterPro: IPR013425 - InterPro: IPR006315 - InterPro: IPR012332 - InterPro: IPR011050 - InterPro: IPR004899 [H]
Pfam domain/function: PF03797 Autotransporter; PF03212 Pertactin [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 370485; Mature: 370485
Theoretical pI: Translated: 3.90; Mature: 3.90
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 0.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 0.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNTIFKVIWNASLNVWVVVSELAKGRIKTKSSRNLISEGVLPKFEQSMVSKLFRKNLLAL CCCEEEEEECCCCEEEEEEEHHHCCCEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCEEEE SLGSIVFLSTGPVFAADITVSTQAELSAALSNGTYDKIILGADITLIGSLTVNMTSNQVV EECCEEEEECCCEEEEEEEEECHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEEEEEEEEEEECCCEEE IDGQGKFGLTVNNTTNYGLVVSSGSGTLTLQNMSKIDSANYYSMVVLNGANTAVNVIYNN EECCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEECCHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEEEC IDFLGSSQLIYMGAYGAATNSIMTFGDILNDVVVNDRAQEIGEVNKLAFTGRFHVTHTGS EEECCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEECCC SVTSFVSTGGANNTSTMDFASGADVKIDRTGSTGDLTSTGVNAFAYTFADGASFELIANQ HHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECC NVFSGTTTNRGLEIGSYNSIDGFGSGVKIVLQSRSDGSIISGNGIDNATTNAAGINNNAS CEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCC GDANVIYNLGTGSILKATNTGILATKNANNASDIYIRSAGDITAATGISATHNGTGTVKI CCCEEEEECCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCEEEECCCCEECCCEEEEEE KNDGTITSTTAGIAISSASIKEISVDNTDGTITATAGTGVNVLASAILNLFGGTINTSAT 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CCCCHHHHHHEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCEE IFDGAVPQSQTSGVVTVTDLALNSGTVNITGSGSWDNTDPLATNVSILEQDRAGSTLELI EEECCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEE NATNVTGDIDALDLLVNGTAITSGTQGVQSAIQQGGSTVANAIHNYGLASSNSNGDSGLY EECCCCCCCCEEEEEEECEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE VNYTLSALELLADGADALLLATESGLTANRVLNAELFGVGGLVVDAQNGALTLANGSNRY EEEEHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECEEEEECCCCEEEEECCCCCC EGTTTVTAGELILGANGAFGQTSLLDIASGASANINGYSQTVGAVTNVGTVTLGSGGVLT CCEEEEEECEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCEE SGLLTNGGILDLTGGALNLTAGGASTVAGGLTGAGTLNINGGNLSVSAANSGLSGQTHIA CCEECCCCEEEECCCEEEEECCCCHHHCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCEEEE DVASVTLTDTGTLGTSAVEVLGTLNLNGANAAMTNVLSGDGTINTNAAVTLSGNNSFSGA EEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHEEECCCCEECCCEEEEECCCCCCCCC HQIGTDGELTVGQASNLGASSATVNLGTLTSHLILNGVSESIANVLSGVAGSTVDIIGGA EECCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCC DTALTANNSGFLGQYALAGNSKLTVASTNNLGASSSVALAGAGDTLSLSGFNGTFGNSVT 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