Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 218708777

Identifier: 218708777

GI number: 218708777

Start: 798490

End: 800862

Strand: Reverse

Name: 218708777

Synonym: VS_0775

Alternate gene names: NA

Gene position: 800862-798490 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218708778

Following gene: 218708776

Centisome position: 24.27

GC content: 45.64

Gene sequence:

>2373_bases
ATGCTGAAGCGCAACAATTCCAATTCTAGCCTAGCCCTTGCTTGGCTTGTTGTCGTAATACTGTTTAGCGGATTGTTGAT
CAAACAATTCGCTTTTTCTTCGTCGGTACCCATTGAAAGCAACATCATGAAATTGCTGCCAGAAAACCAGCAAGATCCCA
TGGTAGAGCAAGCCTTTCAGCAAATATCCAGCTCGATGAGCGAGCAAGTGGTGTTTATCATAAGTGCCTCCGACGTCGAA
CAAGCCATGACAGCGACTGACGCTTTTGAAAAAGCCCTCAACCAAAGATCTTTCTCAAATCAGCCAACTCTGTTTAAGCA
AGTTCAAGGCAAGATCAACGCCAGCACGCAAAGCCAATGGAGCGATTTCTATTTTCGTCACCGAGCTCAACTTCTAACTC
AACAACAAAAAGAGACGCTGACACACTCGCCGGATTCGCGAGCTCAATATGTCATTCAGTCTTTGTACAATCCGTTCTCA
GGCGTCACCGCAGCAGAGCTATCTCTCGACCCATTCTTGTTATTTCGCGACTACATCAGTGCTGTTGGCGTTCAATCAAG
TAACTTTGTTCTGAAAGAGGGATACCTCACAGCTCAATCTAATGAGCAAACTCATATTTTGGTGACGGCGACTCTGGCAG
GCTCACCTTATAGCTTGGCGATTCAAGAACAACTTCCTGATCTTGATTCAATTGAGCGCGAGATCGAAAAGCAGTTTGGT
GTCAAAGTGCAGCATACCGGTGTGGTGTTCTACGCCAATTACGGTACCGAAAGCGCGAAATCAGAAATCAGTACCATTGG
TTTGGGCTCATTGGCCGGTGTAATTTTATTGGTGTGGCTGACATTTCGTAGCGCCCTCCCACTTGCCTTGTCTTTGCTTT
CAATCAGTACCGGATTATTGGTTGCGCTGGCAAGCACCGTCGCTATCTTCGGCAAGATTCACCTGTTTAGTTTGGTATTC
GGTGCCAGCTTAATTGGCGTATCCATCGACTACTCTTTCCATTACCTAACCGATCGTTTGGCGGCTGGTAATCAATGGCA
AAGCGACAAAGGGTTGAAACATATTATCGTTGCGATCACCTTGGGTCTGATCACCAGCTTGATTGGCTACCTAGGTCTGT
TGGTGGCACCTTTCCCGGGATTGCAGCAACTTGCTCTGTTTTCGTCGATTGGACTGATCGCAGCTTACGCCAGTGTGGTG
TGTTGGTATCCGGTTTTAGCGGCAAAACCAAGCCAAGAACGCCCTCTTCCCTTGTCGAAGCTTTGGCATACTTGGTTAAG
CCTCTGGAGCAACCAAAAATTTAGAATTGGCTTACCATTAATAGTGACTGTCGTTAGTTTGATATCACTCAGCCAAATTC
GCTACGACGACGATATTCGTCAACTTCAGGCGATGCCAGAGCAACTCAAACAGCAAGAACAAGCCATTACTGAGATATCA
GGATTAGGCAGTGGTCAAAATATGCTGCTGGTGACCGCCAAGAGCGACCAAAAACTGCTAAATAAACTGGCAGAGATCAC
CACGAGCTTAGATTCTTTGGTCGATAACCAAGGTATCTCCGGATATCGCAGCATCAATCAACAATTGTTAAGCAAGCAAC
AACAGCATGATAACTATCAATTGGTTGAACAACTTTATAGCCAGCAAAGCCATATCTTACAGAACACTCTTGGTTGGCCT
AGCTTTCCAGAGCCACCTAAGTTCGAGGCAATCACGGTATCTGGATTTTTAGAATCACCGGTGTCAGAACCTGTTCGGCC
ACTTTGGTTAAAGCCGATAGACGGACAAGCAGCGTCAGTCATTTTGATAAAAGACGTCACGAATTCAGAACTGTTCTCTC
AATGGCTCGATTCAAGCTTTGCTCAGCAACAAGGCGTTAAATACCTTAATAAAGCCGATGAAATCTCCGCTCTCTTTGCG
GAATATAGAGTCAAGATCACCGAGTTGTTATTGATAGCATTAGCGGCTATTGGCATGGTGTTGGGTTGGCGTTATGGTGT
GAAGCAAAGCCTATTAATGCTGTTGCCTTCATTAATTGCCGGAGTCGCTGGTTTAGCGGTCACGGGTATTTTAGGCTCGA
CACTGAATCTGTTTAACCTGCTTGGACTGATTCTAATTTTAGGGATTGGTATCGACTACACCCTCTTCTTTGCTGAGCAG
AAGAAATCACTAAGCACCTTATTGGCGATTACTTTGTCAGGCCTCACAACGCTACTCTCATTTGGCTTATTGTCATTGAG
TCAGACTCATGCCATTCATAGCTTCGGTGTTACCGTCCTAACTGGTATTTTCGTCGCGTGGTTGCTTTCTCCACTTGCAA
TCAACCACGAACAAGCAGCGGAAAAATCAAACTCTCGAGAGGCTTTTAGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGAAAAGGTGACATTGAACGTATCGAACTTAGAGAAGTTCGTGGGGACAGCACTGTGATCGAATTTAGCCAGTTAAGCCA
TCTACCGGAAGTATTATCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAAAACAATCAAGATAGCGCTCGCCGTTGGATTGGGCTTACTACTCAGCGCTTGTTCGATGGTGTCTCAACAGCCTACA
GGCGCAAGTGTCGCAATCGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 790; Mature: 790

Protein sequence:

>790_residues
MLKRNNSNSSLALAWLVVVILFSGLLIKQFAFSSSVPIESNIMKLLPENQQDPMVEQAFQQISSSMSEQVVFIISASDVE
QAMTATDAFEKALNQRSFSNQPTLFKQVQGKINASTQSQWSDFYFRHRAQLLTQQQKETLTHSPDSRAQYVIQSLYNPFS
GVTAAELSLDPFLLFRDYISAVGVQSSNFVLKEGYLTAQSNEQTHILVTATLAGSPYSLAIQEQLPDLDSIEREIEKQFG
VKVQHTGVVFYANYGTESAKSEISTIGLGSLAGVILLVWLTFRSALPLALSLLSISTGLLVALASTVAIFGKIHLFSLVF
GASLIGVSIDYSFHYLTDRLAAGNQWQSDKGLKHIIVAITLGLITSLIGYLGLLVAPFPGLQQLALFSSIGLIAAYASVV
CWYPVLAAKPSQERPLPLSKLWHTWLSLWSNQKFRIGLPLIVTVVSLISLSQIRYDDDIRQLQAMPEQLKQQEQAITEIS
GLGSGQNMLLVTAKSDQKLLNKLAEITTSLDSLVDNQGISGYRSINQQLLSKQQQHDNYQLVEQLYSQQSHILQNTLGWP
SFPEPPKFEAITVSGFLESPVSEPVRPLWLKPIDGQAASVILIKDVTNSELFSQWLDSSFAQQQGVKYLNKADEISALFA
EYRVKITELLLIALAAIGMVLGWRYGVKQSLLMLLPSLIAGVAGLAVTGILGSTLNLFNLLGLILILGIGIDYTLFFAEQ
KKSLSTLLAITLSGLTTLLSFGLLSLSQTHAIHSFGVTVLTGIFVAWLLSPLAINHEQAAEKSNSREAFR

Sequences:

>Translated_790_residues
MLKRNNSNSSLALAWLVVVILFSGLLIKQFAFSSSVPIESNIMKLLPENQQDPMVEQAFQQISSSMSEQVVFIISASDVE
QAMTATDAFEKALNQRSFSNQPTLFKQVQGKINASTQSQWSDFYFRHRAQLLTQQQKETLTHSPDSRAQYVIQSLYNPFS
GVTAAELSLDPFLLFRDYISAVGVQSSNFVLKEGYLTAQSNEQTHILVTATLAGSPYSLAIQEQLPDLDSIEREIEKQFG
VKVQHTGVVFYANYGTESAKSEISTIGLGSLAGVILLVWLTFRSALPLALSLLSISTGLLVALASTVAIFGKIHLFSLVF
GASLIGVSIDYSFHYLTDRLAAGNQWQSDKGLKHIIVAITLGLITSLIGYLGLLVAPFPGLQQLALFSSIGLIAAYASVV
CWYPVLAAKPSQERPLPLSKLWHTWLSLWSNQKFRIGLPLIVTVVSLISLSQIRYDDDIRQLQAMPEQLKQQEQAITEIS
GLGSGQNMLLVTAKSDQKLLNKLAEITTSLDSLVDNQGISGYRSINQQLLSKQQQHDNYQLVEQLYSQQSHILQNTLGWP
SFPEPPKFEAITVSGFLESPVSEPVRPLWLKPIDGQAASVILIKDVTNSELFSQWLDSSFAQQQGVKYLNKADEISALFA
EYRVKITELLLIALAAIGMVLGWRYGVKQSLLMLLPSLIAGVAGLAVTGILGSTLNLFNLLGLILILGIGIDYTLFFAEQ
KKSLSTLLAITLSGLTTLLSFGLLSLSQTHAIHSFGVTVLTGIFVAWLLSPLAINHEQAAEKSNSREAFR
>Mature_790_residues
MLKRNNSNSSLALAWLVVVILFSGLLIKQFAFSSSVPIESNIMKLLPENQQDPMVEQAFQQISSSMSEQVVFIISASDVE
QAMTATDAFEKALNQRSFSNQPTLFKQVQGKINASTQSQWSDFYFRHRAQLLTQQQKETLTHSPDSRAQYVIQSLYNPFS
GVTAAELSLDPFLLFRDYISAVGVQSSNFVLKEGYLTAQSNEQTHILVTATLAGSPYSLAIQEQLPDLDSIEREIEKQFG
VKVQHTGVVFYANYGTESAKSEISTIGLGSLAGVILLVWLTFRSALPLALSLLSISTGLLVALASTVAIFGKIHLFSLVF
GASLIGVSIDYSFHYLTDRLAAGNQWQSDKGLKHIIVAITLGLITSLIGYLGLLVAPFPGLQQLALFSSIGLIAAYASVV
CWYPVLAAKPSQERPLPLSKLWHTWLSLWSNQKFRIGLPLIVTVVSLISLSQIRYDDDIRQLQAMPEQLKQQEQAITEIS
GLGSGQNMLLVTAKSDQKLLNKLAEITTSLDSLVDNQGISGYRSINQQLLSKQQQHDNYQLVEQLYSQQSHILQNTLGWP
SFPEPPKFEAITVSGFLESPVSEPVRPLWLKPIDGQAASVILIKDVTNSELFSQWLDSSFAQQQGVKYLNKADEISALFA
EYRVKITELLLIALAAIGMVLGWRYGVKQSLLMLLPSLIAGVAGLAVTGILGSTLNLFNLLGLILILGIGIDYTLFFAEQ
KKSLSTLLAITLSGLTTLLSFGLLSLSQTHAIHSFGVTVLTGIFVAWLLSPLAINHEQAAEKSNSREAFR

Specific function: Unknown

COG id: COG4258

COG function: function code R; Predicted exporter

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 86723; Mature: 86723

Theoretical pI: Translated: 6.46; Mature: 6.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKRNNSNSSLALAWLVVVILFSGLLIKQFAFSSSVPIESNIMKLLPENQQDPMVEQAFQ
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
QISSSMSEQVVFIISASDVEQAMTATDAFEKALNQRSFSNQPTLFKQVQGKINASTQSQW
HHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHH
SDFYFRHRAQLLTQQQKETLTHSPDSRAQYVIQSLYNPFSGVTAAELSLDPFLLFRDYIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHCCCHHHHHHHHHH
AVGVQSSNFVLKEGYLTAQSNEQTHILVTATLAGSPYSLAIQEQLPDLDSIEREIEKQFG
HHCCCCCCEEEECCEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
VKVQHTGVVFYANYGTESAKSEISTIGLGSLAGVILLVWLTFRSALPLALSLLSISTGLL
CEEEECCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VALASTVAIFGKIHLFSLVFGASLIGVSIDYSFHYLTDRLAAGNQWQSDKGLKHIIVAIT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LGLITSLIGYLGLLVAPFPGLQQLALFSSIGLIAAYASVVCWYPVLAAKPSQERPLPLSK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
LWHTWLSLWSNQKFRIGLPLIVTVVSLISLSQIRYDDDIRQLQAMPEQLKQQEQAITEIS
HHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLGSGQNMLLVTAKSDQKLLNKLAEITTSLDSLVDNQGISGYRSINQQLLSKQQQHDNYQ
CCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
LVEQLYSQQSHILQNTLGWPSFPEPPKFEAITVSGFLESPVSEPVRPLWLKPIDGQAASV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHCHHCCCCCCCEECCCCCCCEEE
ILIKDVTNSELFSQWLDSSFAQQQGVKYLNKADEISALFAEYRVKITELLLIALAAIGMV
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGWRYGVKQSLLMLLPSLIAGVAGLAVTGILGSTLNLFNLLGLILILGIGIDYTLFFAEQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHH
KKSLSTLLAITLSGLTTLLSFGLLSLSQTHAIHSFGVTVLTGIFVAWLLSPLAINHEQAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
EKSNSREAFR
HCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLKRNNSNSSLALAWLVVVILFSGLLIKQFAFSSSVPIESNIMKLLPENQQDPMVEQAFQ
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
QISSSMSEQVVFIISASDVEQAMTATDAFEKALNQRSFSNQPTLFKQVQGKINASTQSQW
HHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHH
SDFYFRHRAQLLTQQQKETLTHSPDSRAQYVIQSLYNPFSGVTAAELSLDPFLLFRDYIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHCCCHHHHHHHHHH
AVGVQSSNFVLKEGYLTAQSNEQTHILVTATLAGSPYSLAIQEQLPDLDSIEREIEKQFG
HHCCCCCCEEEECCEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
VKVQHTGVVFYANYGTESAKSEISTIGLGSLAGVILLVWLTFRSALPLALSLLSISTGLL
CEEEECCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VALASTVAIFGKIHLFSLVFGASLIGVSIDYSFHYLTDRLAAGNQWQSDKGLKHIIVAIT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LGLITSLIGYLGLLVAPFPGLQQLALFSSIGLIAAYASVVCWYPVLAAKPSQERPLPLSK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
LWHTWLSLWSNQKFRIGLPLIVTVVSLISLSQIRYDDDIRQLQAMPEQLKQQEQAITEIS
HHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLGSGQNMLLVTAKSDQKLLNKLAEITTSLDSLVDNQGISGYRSINQQLLSKQQQHDNYQ
CCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
LVEQLYSQQSHILQNTLGWPSFPEPPKFEAITVSGFLESPVSEPVRPLWLKPIDGQAASV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHCHHCCCCCCCEECCCCCCCEEE
ILIKDVTNSELFSQWLDSSFAQQQGVKYLNKADEISALFAEYRVKITELLLIALAAIGMV
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGWRYGVKQSLLMLLPSLIAGVAGLAVTGILGSTLNLFNLLGLILILGIGIDYTLFFAEQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHH
KKSLSTLLAITLSGLTTLLSFGLLSLSQTHAIHSFGVTVLTGIFVAWLLSPLAINHEQAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
EKSNSREAFR
HCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA