Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yhgE [H]

Identifier: 218550658

GI number: 218550658

Start: 3425088

End: 3426821

Strand: Reverse

Name: yhgE [H]

Synonym: EFER_3368

Alternate gene names: 218550658

Gene position: 3426821-3425088 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218550662

Following gene: 218550653

Centisome position: 74.68

GC content: 45.96

Gene sequence:

>1734_bases
ATGGAACAGAACATGGATAGTACAGAGCTTTCACTTAAAACACGCTGGGGTATGGCGTTAACCGGTTTGATTCAGGGAGG
CATATGCTACCTGTTGATGACTTATCTGGTGCCCATTCATGACAGTTGGTTGTTCTTTGGTTTGCCCGCAACGCTGGCTA
TTTCGCTAACGCTACTGCTTACAGTGGTTTCTTTTAAACAACGTGCATTGTGGGGTTGGCTGGCAGTAATCGCCTTTGTT
GTTCTGGCGCTGTCATGGTGGCAGAAATACAACGCTGAAGGCATGGACAGGTGGCAACAGTATGAGATGCTGTTTTTATT
TGGTTGCCGTTTATTATTTATGGCGTTGCTGGCACTTCCCTGGTTGCAGTACCGTCTGCATGAGGGTAAAGGCATACCTT
CCTATTCTTATTTTTATAACCAGCTTTGGCATAACGCTCTGACTGTTTTTGTCTTTATTGTCCTACAAGGTCTTGTGTGG
CTGGTCTTACTGCTGTGGAGTTCATTGTTCAGGCTGGTTGGTATCTATTTTTTCAAAACACTTTTTTTTGATAGTGAGTG
GTTTCTGTACATTACTACTGGTCTGATTACCGCGCTGGCGGTGATTCTTGCACGTACTCAACCACGTTTAATTACTGCCA
TTCAAAAGCTGCTGACACTTATCGCCACTGGGTTATTGCCGCTGGTTTCTGTTCTGGCATTGTTATTTATTGTTACCTTG
CCCTTTACTGGGCTGGAGATGATCTCAGAACGTATTTCTGCGGCTGCTTTACTTTCCACACTGGCGCTGATCTTACTGTT
ACTAATGGCGATTGTGCGGGAACCGCAAAAAAGTTCGCTGCCTTACCCCATTGCTTTGCGTTGTGTTATCAAAGCGTCTC
TGTTAATTGCCCCCGTGTTTGTTCTTCTTGCAGGGTGGGCATTGTGGCTTCGAATTCATCCCTATGGCTGGACGCCAGAG
CGGCTGTACGGTGCGCTGATAGTACTGGTATTACTCATCTGGTCGGTAGGATATGTAGCGAGCATTGTGCGTCGTGGGTG
CAATCCACTTCTGCTGCAAGGCAAAGTGATCCTCGCACTTTCCTTGTTCATTTTTACCATTTTATTGCTGCTCAGTTCTC
CGGTGCTTGATGTTCAACGTATCAGTGTAAATAGTCATATGGCGCGTTATCAAAGTGGCAAAATCACCGCAGATCAGGTC
AGCTTGTATATGCTGCAACGTAACGGCAGAGCAGGGCGTGAAGCGCTGGAAAAGCTGGCGAAAGATGACACGTTTACCAG
TGACAACAAGCGAGCAGGACAACTCGCACGGATACTGAAAAACAGTGACGATGATACCTTTGTTGTCACAGCTGAATTAT
TAGCCAAAATGGTGACTATTGCTCCAGGTAGTCAGACGCCAGATAAAGAATTCTGGGAAGGCGTTATGGAGTACCGATAT
CGTGTCATATCTTGCAATAAACCAGATAGATGCGTCATTGTTAGTCAGGATCTCAATACTGATGGTAAGCCAGAGCAGGT
GTTGTTTACATTCGGTGATCGTGAGCTGAGTAGTGATGTGCTGGTCTTCGGTTATGAAGAGCACAAGTGGAAGCTGATTG
AAACGTTGATGGCGCCATCAGGTTTGACACGTGATCGACTATTAAAAGCAGTGGCTGAGAATAAAATTGGTGCCATACCG
CAGGTCCGGCAGGATCTCACTGTGGATGGTAAACGACTGAAAAGGTCATATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTAAAGTATCGATTCACCTCGACAGGCGTTTTTCTGAAAAAAAATCTTTGAAATCTCTTAATTGCGCTTGAATGCGAT
AATTAATTTTTCTCCTGGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATGAAGTCCGGCAGAGTTATCTCTGCCGGATTTCATGATTAATGTACTTGCGGGTCTGCCGGAGACGCATTGTTGCGGA
TCTCGGCAATATCCATTGCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 577; Mature: 577

Protein sequence:

>577_residues
MEQNMDSTELSLKTRWGMALTGLIQGGICYLLMTYLVPIHDSWLFFGLPATLAISLTLLLTVVSFKQRALWGWLAVIAFV
VLALSWWQKYNAEGMDRWQQYEMLFLFGCRLLFMALLALPWLQYRLHEGKGIPSYSYFYNQLWHNALTVFVFIVLQGLVW
LVLLLWSSLFRLVGIYFFKTLFFDSEWFLYITTGLITALAVILARTQPRLITAIQKLLTLIATGLLPLVSVLALLFIVTL
PFTGLEMISERISAAALLSTLALILLLLMAIVREPQKSSLPYPIALRCVIKASLLIAPVFVLLAGWALWLRIHPYGWTPE
RLYGALIVLVLLIWSVGYVASIVRRGCNPLLLQGKVILALSLFIFTILLLLSSPVLDVQRISVNSHMARYQSGKITADQV
SLYMLQRNGRAGREALEKLAKDDTFTSDNKRAGQLARILKNSDDDTFVVTAELLAKMVTIAPGSQTPDKEFWEGVMEYRY
RVISCNKPDRCVIVSQDLNTDGKPEQVLFTFGDRELSSDVLVFGYEEHKWKLIETLMAPSGLTRDRLLKAVAENKIGAIP
QVRQDLTVDGKRLKRSY

Sequences:

>Translated_577_residues
MEQNMDSTELSLKTRWGMALTGLIQGGICYLLMTYLVPIHDSWLFFGLPATLAISLTLLLTVVSFKQRALWGWLAVIAFV
VLALSWWQKYNAEGMDRWQQYEMLFLFGCRLLFMALLALPWLQYRLHEGKGIPSYSYFYNQLWHNALTVFVFIVLQGLVW
LVLLLWSSLFRLVGIYFFKTLFFDSEWFLYITTGLITALAVILARTQPRLITAIQKLLTLIATGLLPLVSVLALLFIVTL
PFTGLEMISERISAAALLSTLALILLLLMAIVREPQKSSLPYPIALRCVIKASLLIAPVFVLLAGWALWLRIHPYGWTPE
RLYGALIVLVLLIWSVGYVASIVRRGCNPLLLQGKVILALSLFIFTILLLLSSPVLDVQRISVNSHMARYQSGKITADQV
SLYMLQRNGRAGREALEKLAKDDTFTSDNKRAGQLARILKNSDDDTFVVTAELLAKMVTIAPGSQTPDKEFWEGVMEYRY
RVISCNKPDRCVIVSQDLNTDGKPEQVLFTFGDRELSSDVLVFGYEEHKWKLIETLMAPSGLTRDRLLKAVAENKIGAIP
QVRQDLTVDGKRLKRSY
>Mature_577_residues
MEQNMDSTELSLKTRWGMALTGLIQGGICYLLMTYLVPIHDSWLFFGLPATLAISLTLLLTVVSFKQRALWGWLAVIAFV
VLALSWWQKYNAEGMDRWQQYEMLFLFGCRLLFMALLALPWLQYRLHEGKGIPSYSYFYNQLWHNALTVFVFIVLQGLVW
LVLLLWSSLFRLVGIYFFKTLFFDSEWFLYITTGLITALAVILARTQPRLITAIQKLLTLIATGLLPLVSVLALLFIVTL
PFTGLEMISERISAAALLSTLALILLLLMAIVREPQKSSLPYPIALRCVIKASLLIAPVFVLLAGWALWLRIHPYGWTPE
RLYGALIVLVLLIWSVGYVASIVRRGCNPLLLQGKVILALSLFIFTILLLLSSPVLDVQRISVNSHMARYQSGKITADQV
SLYMLQRNGRAGREALEKLAKDDTFTSDNKRAGQLARILKNSDDDTFVVTAELLAKMVTIAPGSQTPDKEFWEGVMEYRY
RVISCNKPDRCVIVSQDLNTDGKPEQVLFTFGDRELSSDVLVFGYEEHKWKLIETLMAPSGLTRDRLLKAVAENKIGAIP
QVRQDLTVDGKRLKRSY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis yrdB [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789805, Length=573, Percent_Identity=54.4502617801047, Blast_Score=550, Evalue=1e-157,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65344; Mature: 65344

Theoretical pI: Translated: 9.54; Mature: 9.54

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEQNMDSTELSLKTRWGMALTGLIQGGICYLLMTYLVPIHDSWLFFGLPATLAISLTLLL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHH
TVVSFKQRALWGWLAVIAFVVLALSWWQKYNAEGMDRWQQYEMLFLFGCRLLFMALLALP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLQYRLHEGKGIPSYSYFYNQLWHNALTVFVFIVLQGLVWLVLLLWSSLFRLVGIYFFKT
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFFDSEWFLYITTGLITALAVILARTQPRLITAIQKLLTLIATGLLPLVSVLALLFIVTL
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PFTGLEMISERISAAALLSTLALILLLLMAIVREPQKSSLPYPIALRCVIKASLLIAPVF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLLAGWALWLRIHPYGWTPERLYGALIVLVLLIWSVGYVASIVRRGCNPLLLQGKVILAL
HHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHH
SLFIFTILLLLSSPVLDVQRISVNSHMARYQSGKITADQVSLYMLQRNGRAGREALEKLA
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
KDDTFTSDNKRAGQLARILKNSDDDTFVVTAELLAKMVTIAPGSQTPDKEFWEGVMEYRY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCE
RVISCNKPDRCVIVSQDLNTDGKPEQVLFTFGDRELSSDVLVFGYEEHKWKLIETLMAPS
EEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCC
GLTRDRLLKAVAENKIGAIPQVRQDLTVDGKRLKRSY
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEQNMDSTELSLKTRWGMALTGLIQGGICYLLMTYLVPIHDSWLFFGLPATLAISLTLLL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHH
TVVSFKQRALWGWLAVIAFVVLALSWWQKYNAEGMDRWQQYEMLFLFGCRLLFMALLALP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLQYRLHEGKGIPSYSYFYNQLWHNALTVFVFIVLQGLVWLVLLLWSSLFRLVGIYFFKT
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFFDSEWFLYITTGLITALAVILARTQPRLITAIQKLLTLIATGLLPLVSVLALLFIVTL
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PFTGLEMISERISAAALLSTLALILLLLMAIVREPQKSSLPYPIALRCVIKASLLIAPVF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLLAGWALWLRIHPYGWTPERLYGALIVLVLLIWSVGYVASIVRRGCNPLLLQGKVILAL
HHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHH
SLFIFTILLLLSSPVLDVQRISVNSHMARYQSGKITADQVSLYMLQRNGRAGREALEKLA
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
KDDTFTSDNKRAGQLARILKNSDDDTFVVTAELLAKMVTIAPGSQTPDKEFWEGVMEYRY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCE
RVISCNKPDRCVIVSQDLNTDGKPEQVLFTFGDRELSSDVLVFGYEEHKWKLIETLMAPS
EEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCC
GLTRDRLLKAVAENKIGAIPQVRQDLTVDGKRLKRSY
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9278503 [H]