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The map label for this gene is yccS [H]

Identifier: 218548469

GI number: 218548469

Start: 1141851

End: 1144064

Strand: Reverse

Name: yccS [H]

Synonym: EFER_1097

Alternate gene names: 218548469

Gene position: 1144064-1141851 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218548470

Following gene: 218548467

Centisome position: 24.93

GC content: 49.86

Gene sequence:

>2214_bases
GTGCTGCGCGCGAAGCCAATGCCCGTCGTCGCTTCGAATAATCAGGATTTGCTGGCCGATATGTTAAGCCCCCTGCTCAA
ACGTTATACCTGGAACAGCAACTGGCTGTATTACGTACGGATTTTCATCGCATTGTGCGGCACCACCGCCCTGCCCTGGT
GGCTGGGTGAGGTTAAGCTGACGATCCCGTTGACGCTTGGCATGGTCGCCGCTGCACTGACCGACCTTGATGATCGTCTG
GCCGGTCGCCTGCGTAATTTAATTATTACGCTTATCTGCTTTTTTATCGCTTCAGCATCTGTTGAGTTGCTGTTTCCCTG
GCCGTGGTTGTTTGCTATTGGTTTAACATTCTCCACCAGCGGATTTATTCTGCTGGGTGCATTAGGGCAGCGTTATGCCA
CTATCGCCTTCGGTGCCCTGCTGATTGCAATCTACACGATGCTGGGAACGTCGCTGTATGACCAATGGTATCAGCAACCA
CTGTTATTACTGGCTGGTGCAATTTGGTACAACTTGCTGACACTGATCGGTCATTTGTTATTTCCTATACGCCCTTTACA
GGACAACCTTGCGCGTTGTTATGAGCAACTGGCGCACTATCTTGAACTTAAATCGCGCCTTTTCGATCCTGATATTGAAG
ATGAAAGCCAGGCCCCGCTCTATGATCTCGCACTGGCGAATGGGCAGTTGATGGCGACGCTGAACCAGACAAAACAATCA
TTACTGACGCGCTTACGCGGAGATCGCGGGCAGCGAGGTACACGTCGAACGCTTCACTATTATTTTGTTGCGCAGGATAT
TCACGAGCGGGCCAGCTCCTCACACGTGCAATATCAGGCGTTACGGGACTACTTTCGCCATAGCGATGTGATGTTCCGTT
TCCAGCGTTTGATGTCGATGCAGGGTCAGGCTTGCATGAAATTGTCGCGTTGTATTTTGCTACGAACGCCTTACCAACAT
GATTCCCATTTTGAGCGCGCATTTACTCATATAGATGCAGCTCTGGAGCGTGTTCGTGCCGATGGCGCTTCTGAAGAGCA
ACTAAAAGCGTTGGGCTTTTTGCTGTCAAATTTACGGGCGATTGATGCTCAACTGGCCACGATTGAATCGGAGCAAGCCC
TTGCGCTACCAGACAACAGCACCGAAAGCCAATTGGCAGACGACAGTCCTCATGGGCTGAGTGATATCTGGTTACGGCTG
CGTCGTAATTTTTCACCAGAATCAGCACTTTTTCGCCATGCTATCCGTATGTCGCTGGTCCTTTGTGTTGGCTATGGCAT
CATCCAGATCACCGGTATGAACCATGGATACTGGATCCTGCTGACCAGTTTGTTTGTTTGCCAGCCAAACTATAACGCTA
CACGACATCGGTTAACGTTGAGAATTATCGGTACGCTGGTTGGTGTAGCGATTGGTTTGCCCATTTTATGGTTTGTACCG
TCACTGGAAGGGCAACTTGTATTACTGGTGATCACTGGCGTCCTGTTTTTTGCTTTTCGCAATGTGCAGTATGCCCATGC
GACCATGTTTATTACCTTGCTGGTACTGTTGTGCTTTAACTTGCTGGGTGAAGGGTTTGAAGTGGCCCTGCCACGTGTAA
TCGATACGCTTATTGGCTGTGCAATTGCCTGGGCTGCGGTAAGTTTCATTTGGCCAGACTGGCGGTTTCGCAATCTCCCG
CGTGTTCTTGAGCGCGCTACAGATGCAAACTGCCGTTATCTGGATGCGATCCTCGAGCAATATCATCAGGGGAGAGATAA
CCGACTGGCATATCGTGTAGCCCGTAGAGATGCTCATAATCGCGATGCAGAACTGGCGTCCGTGGTTTCTAATATGTCCA
GCGAGCCTGATGTAACGCCGCAAATTCGTGAGGCAGCATTCCGGTTACTCTGCCTCAACCATACATTTACCAGCTACATT
TCTGCATTAGGCGCACATCGGGAAAAATTAACGAACCCTGATGTGCTGGCGTTTCTGGATGATGCCGTGTGCTACGTTGA
TGATGCGCTTCATCATCAACCTGCTGACGATATCCGTGTGAATCAGGCGCTGGAAGATCTTAAGCAACGCATTTCCCAAC
TTGACCCACACCAGGACAGTAAAGAGCCTCTGGTAGTTCAACAAATTGGTTTACTTATTGCGATGTTGCCGGAAATTGGT
CGTTTGCAGCGCAAGATTAATCAAATGACGCCAGCAACGCCAGATCTGGCGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAACCATTATTGGTATTCCTGTTGGTATCGCGAATTTCAAAATTGCCGCCATTGCACTCTGGCCTGTTGGCCGTCGCGT
GGTGTCGGTAGAGACGGCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGACTCCACCCATACAGCAAGCTCCTGGCGACGGACCACCGGGAGCGCTGCTTCATGAATATCCTGCACCGCGCCTTCC
AGCAAATAGAGTATTTTCAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 737; Mature: 737

Protein sequence:

>737_residues
MLRAKPMPVVASNNQDLLADMLSPLLKRYTWNSNWLYYVRIFIALCGTTALPWWLGEVKLTIPLTLGMVAAALTDLDDRL
AGRLRNLIITLICFFIASASVELLFPWPWLFAIGLTFSTSGFILLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGTSLYDQWYQQP
LLLLAGAIWYNLLTLIGHLLFPIRPLQDNLARCYEQLAHYLELKSRLFDPDIEDESQAPLYDLALANGQLMATLNQTKQS
LLTRLRGDRGQRGTRRTLHYYFVAQDIHERASSSHVQYQALRDYFRHSDVMFRFQRLMSMQGQACMKLSRCILLRTPYQH
DSHFERAFTHIDAALERVRADGASEEQLKALGFLLSNLRAIDAQLATIESEQALALPDNSTESQLADDSPHGLSDIWLRL
RRNFSPESALFRHAIRMSLVLCVGYGIIQITGMNHGYWILLTSLFVCQPNYNATRHRLTLRIIGTLVGVAIGLPILWFVP
SLEGQLVLLVITGVLFFAFRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVALPRVIDTLIGCAIAWAAVSFIWPDWRFRNLP
RVLERATDANCRYLDAILEQYHQGRDNRLAYRVARRDAHNRDAELASVVSNMSSEPDVTPQIREAAFRLLCLNHTFTSYI
SALGAHREKLTNPDVLAFLDDAVCYVDDALHHQPADDIRVNQALEDLKQRISQLDPHQDSKEPLVVQQIGLLIAMLPEIG
RLQRKINQMTPATPDLA

Sequences:

>Translated_737_residues
MLRAKPMPVVASNNQDLLADMLSPLLKRYTWNSNWLYYVRIFIALCGTTALPWWLGEVKLTIPLTLGMVAAALTDLDDRL
AGRLRNLIITLICFFIASASVELLFPWPWLFAIGLTFSTSGFILLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGTSLYDQWYQQP
LLLLAGAIWYNLLTLIGHLLFPIRPLQDNLARCYEQLAHYLELKSRLFDPDIEDESQAPLYDLALANGQLMATLNQTKQS
LLTRLRGDRGQRGTRRTLHYYFVAQDIHERASSSHVQYQALRDYFRHSDVMFRFQRLMSMQGQACMKLSRCILLRTPYQH
DSHFERAFTHIDAALERVRADGASEEQLKALGFLLSNLRAIDAQLATIESEQALALPDNSTESQLADDSPHGLSDIWLRL
RRNFSPESALFRHAIRMSLVLCVGYGIIQITGMNHGYWILLTSLFVCQPNYNATRHRLTLRIIGTLVGVAIGLPILWFVP
SLEGQLVLLVITGVLFFAFRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVALPRVIDTLIGCAIAWAAVSFIWPDWRFRNLP
RVLERATDANCRYLDAILEQYHQGRDNRLAYRVARRDAHNRDAELASVVSNMSSEPDVTPQIREAAFRLLCLNHTFTSYI
SALGAHREKLTNPDVLAFLDDAVCYVDDALHHQPADDIRVNQALEDLKQRISQLDPHQDSKEPLVVQQIGLLIAMLPEIG
RLQRKINQMTPATPDLA
>Mature_737_residues
MLRAKPMPVVASNNQDLLADMLSPLLKRYTWNSNWLYYVRIFIALCGTTALPWWLGEVKLTIPLTLGMVAAALTDLDDRL
AGRLRNLIITLICFFIASASVELLFPWPWLFAIGLTFSTSGFILLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGTSLYDQWYQQP
LLLLAGAIWYNLLTLIGHLLFPIRPLQDNLARCYEQLAHYLELKSRLFDPDIEDESQAPLYDLALANGQLMATLNQTKQS
LLTRLRGDRGQRGTRRTLHYYFVAQDIHERASSSHVQYQALRDYFRHSDVMFRFQRLMSMQGQACMKLSRCILLRTPYQH
DSHFERAFTHIDAALERVRADGASEEQLKALGFLLSNLRAIDAQLATIESEQALALPDNSTESQLADDSPHGLSDIWLRL
RRNFSPESALFRHAIRMSLVLCVGYGIIQITGMNHGYWILLTSLFVCQPNYNATRHRLTLRIIGTLVGVAIGLPILWFVP
SLEGQLVLLVITGVLFFAFRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVALPRVIDTLIGCAIAWAAVSFIWPDWRFRNLP
RVLERATDANCRYLDAILEQYHQGRDNRLAYRVARRDAHNRDAELASVVSNMSSEPDVTPQIREAAFRLLCLNHTFTSYI
SALGAHREKLTNPDVLAFLDDAVCYVDDALHHQPADDIRVNQALEDLKQRISQLDPHQDSKEPLVVQQIGLLIAMLPEIG
RLQRKINQMTPATPDLA

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=714, Percent_Identity=88.6554621848739, Blast_Score=1298, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=204, Percent_Identity=32.3529411764706, Blast_Score=82, Evalue=1e-16,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83548; Mature: 83548

Theoretical pI: Translated: 7.19; Mature: 7.19

Prosite motif: PS00217 SUGAR_TRANSPORT_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLRAKPMPVVASNNQDLLADMLSPLLKRYTWNSNWLYYVRIFIALCGTTALPWWLGEVKL
CCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEE
TIPLTLGMVAAALTDLDDRLAGRLRNLIITLICFFIASASVELLFPWPWLFAIGLTFSTS
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCC
GFILLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGTSLYDQWYQQPLLLLAGAIWYNLLTLIGHLL
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FPIRPLQDNLARCYEQLAHYLELKSRLFDPDIEDESQAPLYDLALANGQLMATLNQTKQS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCHHHHHHHHHHH
LLTRLRGDRGQRGTRRTLHYYFVAQDIHERASSSHVQYQALRDYFRHSDVMFRFQRLMSM
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QGQACMKLSRCILLRTPYQHDSHFERAFTHIDAALERVRADGASEEQLKALGFLLSNLRA
CCHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IDAQLATIESEQALALPDNSTESQLADDSPHGLSDIWLRLRRNFSPESALFRHAIRMSLV
HHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LCVGYGIIQITGMNHGYWILLTSLFVCQPNYNATRHRLTLRIIGTLVGVAIGLPILWFVP
HHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SLEGQLVLLVITGVLFFAFRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVALPRVIDTLIGC
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AIAWAAVSFIWPDWRFRNLPRVLERATDANCRYLDAILEQYHQGRDNRLAYRVARRDAHN
HHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCC
RDAELASVVSNMSSEPDVTPQIREAAFRLLCLNHTFTSYISALGAHREKLTNPDVLAFLD
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
DAVCYVDDALHHQPADDIRVNQALEDLKQRISQLDPHQDSKEPLVVQQIGLLIAMLPEIG
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLQRKINQMTPATPDLA
HHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLRAKPMPVVASNNQDLLADMLSPLLKRYTWNSNWLYYVRIFIALCGTTALPWWLGEVKL
CCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEE
TIPLTLGMVAAALTDLDDRLAGRLRNLIITLICFFIASASVELLFPWPWLFAIGLTFSTS
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCC
GFILLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGTSLYDQWYQQPLLLLAGAIWYNLLTLIGHLL
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FPIRPLQDNLARCYEQLAHYLELKSRLFDPDIEDESQAPLYDLALANGQLMATLNQTKQS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCHHHHHHHHHHH
LLTRLRGDRGQRGTRRTLHYYFVAQDIHERASSSHVQYQALRDYFRHSDVMFRFQRLMSM
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QGQACMKLSRCILLRTPYQHDSHFERAFTHIDAALERVRADGASEEQLKALGFLLSNLRA
CCHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IDAQLATIESEQALALPDNSTESQLADDSPHGLSDIWLRLRRNFSPESALFRHAIRMSLV
HHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LCVGYGIIQITGMNHGYWILLTSLFVCQPNYNATRHRLTLRIIGTLVGVAIGLPILWFVP
HHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SLEGQLVLLVITGVLFFAFRNVQYAHATMFITLLVLLCFNLLGEGFEVALPRVIDTLIGC
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AIAWAAVSFIWPDWRFRNLPRVLERATDANCRYLDAILEQYHQGRDNRLAYRVARRDAHN
HHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCC
RDAELASVVSNMSSEPDVTPQIREAAFRLLCLNHTFTSYISALGAHREKLTNPDVLAFLD
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
DAVCYVDDALHHQPADDIRVNQALEDLKQRISQLDPHQDSKEPLVVQQIGLLIAMLPEIG
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLQRKINQMTPATPDLA
HHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503 [H]