Definition Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum), complete genome.
Accession NC_004061
Length 641,454

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The map label for this gene is nuoL

Identifier: 21672447

GI number: 21672447

Start: 175198

End: 177045

Strand: Direct

Name: nuoL

Synonym: BUsg157

Alternate gene names: 21672447

Gene position: 175198-177045 (Clockwise)

Preceding gene: 21672446

Following gene: 21672448

Centisome position: 27.31

GC content: 23.38

Gene sequence:

>1848_bases
ATGAATATTATTTTCTTGATAATTTTATTTCCATTAATAGGTTTTTTATTTTTGTCCCTTATACAAGGAACTATTTCTGA
AAGAAACACAAATATTATAGGTATATCTTCAATATTTGTTTCCTTAATTATTACTTTTTTTTATATTACAGGTTTTATAA
ACTATTCATCTCAAATTTTTACTCAAAAATTATTCAGTTGGATTTCTATTAACGAATTAGATATAGATTGTAGTCTAATT
TTAGACGGATTATCTTTAAGTATGTTAGCTATGATTCTAGGAATAGGATTATTAATACATATTTTTTCTACTTGGTATAT
GAAAGATAAGGAAGGTTATTCGCGTTTTTTTGCGTATACTAATTTATTTATAGCAAGTATGTCATTGCTAGTTTTAGCAG
ATAACTTTTTGTTTATGTATTTAGGATGGGAAATTGTAAGTATATGTTCTTATTTATTAATTGGTTTTTATTATAAAACT
ACTAATAATACTTCTTGTGCTCTTAAAGCATTTGTTTTCACTAGAATTTCAGATGTATTTTTAATCATTTCAATGTTTTT
AATATATAATAAATACGGTACTTTTAATTTTCAAGAAATTAAATTTTTATCAAATTTTTTAAATGTAGAAGATTGTTTTG
ATTTAAATGTTCTTACACTATGTTTATTATTAGGAGTAATGGGAAAATCAGCCCAATTACCATTGCATACTTGGTTATCT
GACGCTATGGTTGGTCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAATACATGCAGCTACTATGGTAACAGCAGGTGTATACTTAATAGC
AAGAACACATTTTTTATTCTTATTAACTCCAAAAATATTATATCTTATAAGTTTGATTGGTATAATAACAATATTTATTT
CTAGTTTTTCAGCTTTAGTTCAACAAGATATAAAACGTATTCTTGCATATTCTACTATGAGTCAAATAGGATATATGTTT
TTAGCTTTAGGTGTCAAAGCATGGACGGCAGCTATTGTTCATTTAATTGTACATGCTATTTTTAAAGCATTGTTATTTTT
ATCTTCAGGTTCTTTAATTCTCTCTTGTAATAATGAAAAAAATATATTTAATTTAAGTAAGGTCAGTTCAAAATGTCCTC
TTTTATATGTTTCTTTTTTGGTGGGAGGTGCATCTTTAGTTTCTTTTCCTTTAATCACATCAGGTTTTTACAGCAAGGGG
AATATTTTATTTAGTGTTTTAAAAGATGGTTATTTTAATTTGTTTTTAATCGGTTTATTTTGTTCTTTCTTGACATCTAT
TTATACATTTAGAATGATTTTTGTTATTTTTCATAGAAGTAGTGTTTCTTTTGTTTTTTCTAATAAAAGATTAGCACATA
ATTTACCGTTGTTAATTTTATTGTTTTTTTCTACTATGTTTGGTTATTTTATAATAAGATTACCCCTATTTTATGTTTTT
CCGATGGTAAAAAGTTTAGAAAATGGTAAGTTTTTATATGAAATAATATCTAGTTTTATATCTTTTTTAGGTATATTTAT
TGCTTATCACATTTGGATTAAACAACCATTTTGGTTTTTTCGATTTTTAAAATTCAAAATAATTAAATTAATTCACAAAT
TTTTATTAAATGGATGGTATTTTGATTTTTTTTATAAAATTTTATTTATTCATCCTTATTTATTTATATCTAAAATTTTA
TCCTATGAACCATTTGATTTTTTTCCTACTTTTTTTGTTGCATTTATTAAAAAAACTAACTCAATTGTATTAAAAAGCGT
TAATGGTAATGTAAAATGCTACATATCAACGATGTTTGTTGGTATTAATTTGTTTTTTATTTTAGTTTTATGTTCTTTTT
TATCATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATTAGCTGCGTCTGAAGCTAGTATAGCATTAGCTTTATTACTACAACTTTATAGACGTCAAAGAACGTTAAACATTAAT
GCTTTAAGTGAGATGAGTGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATGTTTTTTATTAGTTGTTTTTAAATTTTTACATCCTTTTTTTGATTATATTAATATAATAAATAATAGGAATATACG
TCTAATGTTGCTTTCTCTAT

Product: NADH dehydrogenase I chain L

Products: NA

Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit L; NDH-1 subunit L

Number of amino acids: Translated: 615; Mature: 615

Protein sequence:

>615_residues
MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIFTQKLFSWISINELDIDCSLI
LDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYTNLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKT
TNNTSCALKAFVFTRISDVFLIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS
DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALVQQDIKRILAYSTMSQIGYMF
LALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEKNIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKG
NILFSVLKDGYFNLFLIGLFCSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF
PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWYFDFFYKILFIHPYLFISKIL
SYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFVGINLFFILVLCSFLS

Sequences:

>Translated_615_residues
MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIFTQKLFSWISINELDIDCSLI
LDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYTNLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKT
TNNTSCALKAFVFTRISDVFLIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS
DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALVQQDIKRILAYSTMSQIGYMF
LALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEKNIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKG
NILFSVLKDGYFNLFLIGLFCSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF
PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWYFDFFYKILFIHPYLFISKIL
SYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFVGINLFFILVLCSFLS
>Mature_615_residues
MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIFTQKLFSWISINELDIDCSLI
LDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYTNLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKT
TNNTSCALKAFVFTRISDVFLIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS
DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALVQQDIKRILAYSTMSQIGYMF
LALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEKNIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKG
NILFSVLKDGYFNLFLIGLFCSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF
PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWYFDFFYKILFIHPYLFISKIL
SYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFVGINLFFILVLCSFLS

Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cyto

COG id: COG1009

COG function: function code CP; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the complex I subunit 5 family

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI251831117, Length=413, Percent_Identity=34.8668280871671, Blast_Score=214, Evalue=2e-55,
Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=602, Percent_Identity=48.5049833887043, Blast_Score=595, Evalue=1e-171,
Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=413, Percent_Identity=31.4769975786925, Blast_Score=162, Evalue=4e-41,
Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=346, Percent_Identity=27.7456647398844, Blast_Score=102, Evalue=9e-23,
Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=296, Percent_Identity=28.7162162162162, Blast_Score=101, Evalue=2e-22,
Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=309, Percent_Identity=29.126213592233, Blast_Score=90, Evalue=5e-19,
Organism=Escherichia coli, GI2367154, Length=296, Percent_Identity=26.0135135135135, Blast_Score=83, Evalue=4e-17,
Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=266, Percent_Identity=24.4360902255639, Blast_Score=70, Evalue=5e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NUOL_BUCAP (Q8K9X7)

Other databases:

- EMBL:   AE013218
- RefSeq:   NP_660514.1
- EnsemblBacteria:   EBBUCT00000000366
- GeneID:   1005355
- GenomeReviews:   AE013218_GR
- KEGG:   bas:BUsg157
- GeneTree:   EBGT00050000007699
- HOGENOM:   HBG643593
- OMA:   IARTHVL
- ProtClustDB:   CLSK315611
- BioCyc:   BAPH198804:BUSG157-MONOMER
- InterPro:   IPR001750
- InterPro:   IPR001516
- InterPro:   IPR003945
- InterPro:   IPR018393
- PRINTS:   PR01435
- TIGRFAMs:   TIGR01974

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1; PF00662 Oxidored_q1_N

EC number: =1.6.99.5

Molecular weight: Translated: 70512; Mature: 70512

Theoretical pI: Translated: 9.56; Mature: 9.56

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xbb7c4e4)-; HASH(0xc4d8368)-; HASH(0x4045a4d0)-; HASH(0xb3eeb7c)-; HASH(0x40454e84)-; HASH(0x40482d0c)-; HASH(0xbb7e860)-; HASH(0xb7c5ba0)-; HASH(0xbce0270)-; HASH(0xc32276c)-; HASH(0x40478014)-; HASH(0xb7c58f4)-; HASH(0xc085fec)-; HASH(0x40454ddc)-; HASH(0xb952024)-;

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TQKLFSWISINELDIDCSLILDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYT
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
NLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKTTNNTSCALKAFVFTRISDVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALV
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QQDIKRILAYSTMSQIGYMFLALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCC
NIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKGNILFSVLKDGYFNLFLIGLF
CCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
CSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWY
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
FDFFYKILFIHPYLFISKILSYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEHHHHHH
GINLFFILVLCSFLS
HHHHHHHHHHHHHCH
>Mature Secondary Structure
MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TQKLFSWISINELDIDCSLILDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYT
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
NLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKTTNNTSCALKAFVFTRISDVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALV
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QQDIKRILAYSTMSQIGYMFLALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCC
NIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKGNILFSVLKDGYFNLFLIGLF
CCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
CSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWY
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
FDFFYKILFIHPYLFISKILSYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEHHHHHH
GINLFFILVLCSFLS
HHHHHHHHHHHHHCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12089438