Definition | Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum), complete genome. |
---|---|
Accession | NC_004061 |
Length | 641,454 |
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The map label for this gene is nuoL
Identifier: 21672447
GI number: 21672447
Start: 175198
End: 177045
Strand: Direct
Name: nuoL
Synonym: BUsg157
Alternate gene names: 21672447
Gene position: 175198-177045 (Clockwise)
Preceding gene: 21672446
Following gene: 21672448
Centisome position: 27.31
GC content: 23.38
Gene sequence:
>1848_bases ATGAATATTATTTTCTTGATAATTTTATTTCCATTAATAGGTTTTTTATTTTTGTCCCTTATACAAGGAACTATTTCTGA AAGAAACACAAATATTATAGGTATATCTTCAATATTTGTTTCCTTAATTATTACTTTTTTTTATATTACAGGTTTTATAA ACTATTCATCTCAAATTTTTACTCAAAAATTATTCAGTTGGATTTCTATTAACGAATTAGATATAGATTGTAGTCTAATT TTAGACGGATTATCTTTAAGTATGTTAGCTATGATTCTAGGAATAGGATTATTAATACATATTTTTTCTACTTGGTATAT GAAAGATAAGGAAGGTTATTCGCGTTTTTTTGCGTATACTAATTTATTTATAGCAAGTATGTCATTGCTAGTTTTAGCAG ATAACTTTTTGTTTATGTATTTAGGATGGGAAATTGTAAGTATATGTTCTTATTTATTAATTGGTTTTTATTATAAAACT ACTAATAATACTTCTTGTGCTCTTAAAGCATTTGTTTTCACTAGAATTTCAGATGTATTTTTAATCATTTCAATGTTTTT AATATATAATAAATACGGTACTTTTAATTTTCAAGAAATTAAATTTTTATCAAATTTTTTAAATGTAGAAGATTGTTTTG ATTTAAATGTTCTTACACTATGTTTATTATTAGGAGTAATGGGAAAATCAGCCCAATTACCATTGCATACTTGGTTATCT GACGCTATGGTTGGTCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAATACATGCAGCTACTATGGTAACAGCAGGTGTATACTTAATAGC AAGAACACATTTTTTATTCTTATTAACTCCAAAAATATTATATCTTATAAGTTTGATTGGTATAATAACAATATTTATTT CTAGTTTTTCAGCTTTAGTTCAACAAGATATAAAACGTATTCTTGCATATTCTACTATGAGTCAAATAGGATATATGTTT TTAGCTTTAGGTGTCAAAGCATGGACGGCAGCTATTGTTCATTTAATTGTACATGCTATTTTTAAAGCATTGTTATTTTT ATCTTCAGGTTCTTTAATTCTCTCTTGTAATAATGAAAAAAATATATTTAATTTAAGTAAGGTCAGTTCAAAATGTCCTC TTTTATATGTTTCTTTTTTGGTGGGAGGTGCATCTTTAGTTTCTTTTCCTTTAATCACATCAGGTTTTTACAGCAAGGGG AATATTTTATTTAGTGTTTTAAAAGATGGTTATTTTAATTTGTTTTTAATCGGTTTATTTTGTTCTTTCTTGACATCTAT TTATACATTTAGAATGATTTTTGTTATTTTTCATAGAAGTAGTGTTTCTTTTGTTTTTTCTAATAAAAGATTAGCACATA ATTTACCGTTGTTAATTTTATTGTTTTTTTCTACTATGTTTGGTTATTTTATAATAAGATTACCCCTATTTTATGTTTTT CCGATGGTAAAAAGTTTAGAAAATGGTAAGTTTTTATATGAAATAATATCTAGTTTTATATCTTTTTTAGGTATATTTAT TGCTTATCACATTTGGATTAAACAACCATTTTGGTTTTTTCGATTTTTAAAATTCAAAATAATTAAATTAATTCACAAAT TTTTATTAAATGGATGGTATTTTGATTTTTTTTATAAAATTTTATTTATTCATCCTTATTTATTTATATCTAAAATTTTA TCCTATGAACCATTTGATTTTTTTCCTACTTTTTTTGTTGCATTTATTAAAAAAACTAACTCAATTGTATTAAAAAGCGT TAATGGTAATGTAAAATGCTACATATCAACGATGTTTGTTGGTATTAATTTGTTTTTTATTTTAGTTTTATGTTCTTTTT TATCATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CATTAGCTGCGTCTGAAGCTAGTATAGCATTAGCTTTATTACTACAACTTTATAGACGTCAAAGAACGTTAAACATTAAT GCTTTAAGTGAGATGAGTGG
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATGTTTTTTATTAGTTGTTTTTAAATTTTTACATCCTTTTTTTGATTATATTAATATAATAAATAATAGGAATATACG TCTAATGTTGCTTTCTCTAT
Product: NADH dehydrogenase I chain L
Products: NA
Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit L; NDH-1 subunit L
Number of amino acids: Translated: 615; Mature: 615
Protein sequence:
>615_residues MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIFTQKLFSWISINELDIDCSLI LDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYTNLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKT TNNTSCALKAFVFTRISDVFLIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALVQQDIKRILAYSTMSQIGYMF LALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEKNIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKG NILFSVLKDGYFNLFLIGLFCSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWYFDFFYKILFIHPYLFISKIL SYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFVGINLFFILVLCSFLS
Sequences:
>Translated_615_residues MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIFTQKLFSWISINELDIDCSLI LDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYTNLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKT TNNTSCALKAFVFTRISDVFLIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALVQQDIKRILAYSTMSQIGYMF LALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEKNIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKG NILFSVLKDGYFNLFLIGLFCSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWYFDFFYKILFIHPYLFISKIL SYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFVGINLFFILVLCSFLS >Mature_615_residues MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIFTQKLFSWISINELDIDCSLI LDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYTNLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKT TNNTSCALKAFVFTRISDVFLIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALVQQDIKRILAYSTMSQIGYMF LALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEKNIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKG NILFSVLKDGYFNLFLIGLFCSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWYFDFFYKILFIHPYLFISKIL SYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFVGINLFFILVLCSFLS
Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cyto
COG id: COG1009
COG function: function code CP; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the complex I subunit 5 family
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI251831117, Length=413, Percent_Identity=34.8668280871671, Blast_Score=214, Evalue=2e-55, Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=602, Percent_Identity=48.5049833887043, Blast_Score=595, Evalue=1e-171, Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=413, Percent_Identity=31.4769975786925, Blast_Score=162, Evalue=4e-41, Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=346, Percent_Identity=27.7456647398844, Blast_Score=102, Evalue=9e-23, Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=296, Percent_Identity=28.7162162162162, Blast_Score=101, Evalue=2e-22, Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=309, Percent_Identity=29.126213592233, Blast_Score=90, Evalue=5e-19, Organism=Escherichia coli, GI2367154, Length=296, Percent_Identity=26.0135135135135, Blast_Score=83, Evalue=4e-17, Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=266, Percent_Identity=24.4360902255639, Blast_Score=70, Evalue=5e-13,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NUOL_BUCAP (Q8K9X7)
Other databases:
- EMBL: AE013218 - RefSeq: NP_660514.1 - EnsemblBacteria: EBBUCT00000000366 - GeneID: 1005355 - GenomeReviews: AE013218_GR - KEGG: bas:BUsg157 - GeneTree: EBGT00050000007699 - HOGENOM: HBG643593 - OMA: IARTHVL - ProtClustDB: CLSK315611 - BioCyc: BAPH198804:BUSG157-MONOMER - InterPro: IPR001750 - InterPro: IPR001516 - InterPro: IPR003945 - InterPro: IPR018393 - PRINTS: PR01435 - TIGRFAMs: TIGR01974
Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1; PF00662 Oxidored_q1_N
EC number: =1.6.99.5
Molecular weight: Translated: 70512; Mature: 70512
Theoretical pI: Translated: 9.56; Mature: 9.56
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
HASH(0xbb7c4e4)-; HASH(0xc4d8368)-; HASH(0x4045a4d0)-; HASH(0xb3eeb7c)-; HASH(0x40454e84)-; HASH(0x40482d0c)-; HASH(0xbb7e860)-; HASH(0xb7c5ba0)-; HASH(0xbce0270)-; HASH(0xc32276c)-; HASH(0x40478014)-; HASH(0xb7c58f4)-; HASH(0xc085fec)-; HASH(0x40454ddc)-; HASH(0xb952024)-;
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TQKLFSWISINELDIDCSLILDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYT HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH NLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKTTNNTSCALKAFVFTRISDVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALV HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQDIKRILAYSTMSQIGYMFLALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCC NIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKGNILFSVLKDGYFNLFLIGLF CCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH CSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWY HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH FDFFYKILFIHPYLFISKILSYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEHHHHHH GINLFFILVLCSFLS HHHHHHHHHHHHHCH >Mature Secondary Structure MNIIFLIILFPLIGFLFLSLIQGTISERNTNIIGISSIFVSLIITFFYITGFINYSSQIF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TQKLFSWISINELDIDCSLILDGLSLSMLAMILGIGLLIHIFSTWYMKDKEGYSRFFAYT HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH NLFIASMSLLVLADNFLFMYLGWEIVSICSYLLIGFYYKTTNNTSCALKAFVFTRISDVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LIISMFLIYNKYGTFNFQEIKFLSNFLNVEDCFDLNVLTLCLLLGVMGKSAQLPLHTWLS HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH DAMVGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHFLFLLTPKILYLISLIGIITIFISSFSALV HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQDIKRILAYSTMSQIGYMFLALGVKAWTAAIVHLIVHAIFKALLFLSSGSLILSCNNEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCC NIFNLSKVSSKCPLLYVSFLVGGASLVSFPLITSGFYSKGNILFSVLKDGYFNLFLIGLF CCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH CSFLTSIYTFRMIFVIFHRSSVSFVFSNKRLAHNLPLLILLFFSTMFGYFIIRLPLFYVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PMVKSLENGKFLYEIISSFISFLGIFIAYHIWIKQPFWFFRFLKFKIIKLIHKFLLNGWY HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH FDFFYKILFIHPYLFISKILSYEPFDFFPTFFVAFIKKTNSIVLKSVNGNVKCYISTMFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEHHHHHH GINLFFILVLCSFLS HHHHHHHHHHHHHCH
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12089438