Definition Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 1, complete genome.
Accession NC_011312
Length 3,325,165

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The map label for this gene is 209695902

Identifier: 209695902

GI number: 209695902

Start: 2656578

End: 2659508

Strand: Reverse

Name: 209695902

Synonym: VSAL_I2482

Alternate gene names: NA

Gene position: 2659508-2656578 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209695906

Following gene: 209695901

Centisome position: 79.98

GC content: 31.08

Gene sequence:

>2931_bases
ATGAGAAGTTTTAAAGAAATACAAGAAATTTTAGGTACGCAGCCTGATGTGAAAAAAATATACCTTATAGGCTGTACAGG
TGCAGGTAAAACATCACTGGTTCAACATATCATAGGCTCTAAAAAACACGGTTTTCCGGTGACTAGTCATAGACGAACTA
CGATTGCACCTACTGAATATGTAATTCAAAAAAACATTCCTTTTAAAACAACAATTATTTTAAAAAATAAGAATGATGTA
GTTTTTGCAATAGAGGAATTAATTCAAGGAGCTATATTAAAAGCTAAGCAAGATAAAGCGACCACTGAAGATGTGGTTTT
TGAATTAGAACAATCCCCCGATGACCGATTTAAGCTGAATCAAATGGTTAAAGGTGAAACGTTTGTAAAAGTTGCAAATG
ACATTATTACGAATGTATTACCGCCTATAAGTGGTAAAGATATTAACGATGAAACGTTGCTATCAGACTCATTTATTAAA
GATGAAATAAAGAAAATTGTTACTGAAATTTTAGCTGAAATTGAAGCTAACTTTAATAGAGCGTGCGGAAATGGTCATAC
GCTATTTACAAATAAAACGTTAACGATAGATGGTATTAGTGACAAAGATGAATTTATACTGAAAACTAAGAAACTCTTAA
GCCATGATTTTGGTTCTATTTCTATATTAGCTGAATATATACGCATTGAAGGCGACTTGTTAGCTGATTGGCTTGATCCT
AACCTAGAGTTTTTATTAATTGATGGAGAGGGGATTGGGCACTCTTTAGGTGAAAAAAGAGATACGCTATCTTCACGTCA
TTACAATTTTTTTAATTATTGTAATAATATTGTATTAATTGATGATGCGAATGATCCGTTTGCGGCTGGTGGTCATGGTG
CAATTGAGGGGATATTCTTAAACGGGTATCAAGAGAAATTTAAATTAGTATTCTCTAAAACAGATAAACTTGAGCAGACA
GATCTGAATGCATACTTTAGACGTAGTTTAAATAATCTTAGAAATGCGCTAAAAAAAGATGAAATAGAATTTAATGAAGA
AAACAAAGATACTTACAAACTAAATGCGCTTGATGATAAAAACATTAATGATGAATCTAGAAAAACAATACAACGGCTAT
TAACTAACATTAGTAATAGTAAAAAAAAGCACTTAACCCCTTTAGAATATGATTTTGACTTACTGCTTTCTAAATACAAT
AGTGAGACATTGGTATCAACTATTGTTAATAGAATTGAAGAGGAACATTGGGCTGTAGTTAAAGCTCTTTCAAAACGACT
TCAGAGTGCAGATATTGAATATAGGCATTTAAAACCAATTAGCTGGATTCTGATTTTTTTGATGCATGAACTTAACTCTT
TTCTTAAAAGAGATGAACTAACTTCTGAAGTATTTGATAGTCAAAATATAATCAAACAGAATGTATCTCACCGATTGGTA
CAGTATATATATACTAATTTTGTAAAAGAGAAAGAGCACTTGTGGCAACAAGCATATGAAAAAAGTGGTTTTGGCTCTCA
CAGAGAACGGAAAGATTTTATCTTTAATCAAATAGTTAGGGTTTTTTTACCTAGTAAAGATAAAGAGGATGCATTTAAAT
CATTTAAGAAAGACATTAAAAGCTTACTATTAAAGTCAGGAGCACTTGAGCTAAAGACTGCGGTAAAAACTGAAATTACT
CATGTATCTATAAAAAAAATATTTGGATCTAAAAACGTTGAATGGTCGTTAGGTGATGATGTTAATGTCTTAATTGGTAA
GAATGGTTGTGGCAAATCAACTTTGTTAAAACTCATTTTTGCTTGTATTAATAATGATGAGGAAACATTAGAGTCATTTA
GGTCTCCATATGTAGAATTAACAATTTTAAAAACCTTTGATAATGGTGAAACTCAAATATCTAAAATATCACAAAGTAAA
TCACCATCAAAAATTAATGCTGTCATGGTGAATACATTCGATATTAAGTTAGATCGGCAGAACAATGATGTAGTTGACTT
AGATAGTCAGTTACTGAAACTAACAGGAGAGCTAGAAGGATTTCAGCGTGGTCTATTACAATCAATTAATAAAACTGTTG
GAGAACAAATTAAGCAACGAGATGAGGCAATAAGTAAACTTACAACTGCTACTCCTGATGATTTTGCTCGTTTACAAGAA
CTAAGCATTCAAATAAATGATGCAACGACAAAAATATATAAACCGTTGATTGAGTTTAAGTCAATTATTGATGAGTATTT
TTCAGGTACAAATAAATCGATAATTATTGATGATGAAGAGTTCCCATTAGTTGTCGAAGTTGAAAATAATTCTCACCATA
TTAAAGTGACGGATTTGTCGTCAGGTGAAAAGCAACTTTTAATTATCTTCTTAACGGTGATTCTACAAAAGAATAAATCA
TTTATATTATTAATGGATGAGCCAGAAACATCCTTACATGTAGAGTGGCAAGCAACGTTTATTGATTTTATTAAGAAATT
AAATCCTAACGTACAAATTATTATTGCGACTCATAACCCTCTTATTTTGTTGAATAGAGAAAGTGATGAAATAGGAATTA
TTGAAGCAAATAATGATGAAGTGCAAAAAAGAACAAGTGGAACTAAGTACCTAGATATATCATCAATCTTGTTAGACCAT
TTTAAATTACCATCTTTGGTTGGCACTCAAATGCAAAATGATATCCAGCGTTTTAGTGCGCTTAAGATGCGAGAGCCTGA
ATTAAATTTGGAAGAGAAAAATCAGTTATCTGACCTTGGTGAATTATTAGAAAATAGTTTGGCTGGTGATATGATTTATA
ATAAAAAATATTTCGATTTTTTAACCTTTCTTAAAAATAACAAGCACATCAGTTATGAACAATATGAAGCTTCTTCAGAG
CAGGATATGGCAGACTTCTTAAGTGAGTTTGGAGGCTCATTCAATGATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAACATTATGTAGACGCCGACACCAAACTTGGTGGGTAGTGTCTAGTTCCGATGCTATAAAATCATTATTGGCGTATTA
TAAAATAAAGTTGAGTAATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGCGTACTTTATATCAACATGCCGACTACTCAGTAGCTCTTCAAAACTTTAATAGCAGTAGTCCAAAGAAATGGTCTA
AGTTCCAAGGAGTTCACCTT

Product: ABC transporter ATP-binding protein

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter; With ATPase Activity; AAA ATPase; ATPase; Conserved Protein

Number of amino acids: Translated: 976; Mature: 976

Protein sequence:

>976_residues
MRSFKEIQEILGTQPDVKKIYLIGCTGAGKTSLVQHIIGSKKHGFPVTSHRRTTIAPTEYVIQKNIPFKTTIILKNKNDV
VFAIEELIQGAILKAKQDKATTEDVVFELEQSPDDRFKLNQMVKGETFVKVANDIITNVLPPISGKDINDETLLSDSFIK
DEIKKIVTEILAEIEANFNRACGNGHTLFTNKTLTIDGISDKDEFILKTKKLLSHDFGSISILAEYIRIEGDLLADWLDP
NLEFLLIDGEGIGHSLGEKRDTLSSRHYNFFNYCNNIVLIDDANDPFAAGGHGAIEGIFLNGYQEKFKLVFSKTDKLEQT
DLNAYFRRSLNNLRNALKKDEIEFNEENKDTYKLNALDDKNINDESRKTIQRLLTNISNSKKKHLTPLEYDFDLLLSKYN
SETLVSTIVNRIEEEHWAVVKALSKRLQSADIEYRHLKPISWILIFLMHELNSFLKRDELTSEVFDSQNIIKQNVSHRLV
QYIYTNFVKEKEHLWQQAYEKSGFGSHRERKDFIFNQIVRVFLPSKDKEDAFKSFKKDIKSLLLKSGALELKTAVKTEIT
HVSIKKIFGSKNVEWSLGDDVNVLIGKNGCGKSTLLKLIFACINNDEETLESFRSPYVELTILKTFDNGETQISKISQSK
SPSKINAVMVNTFDIKLDRQNNDVVDLDSQLLKLTGELEGFQRGLLQSINKTVGEQIKQRDEAISKLTTATPDDFARLQE
LSIQINDATTKIYKPLIEFKSIIDEYFSGTNKSIIIDDEEFPLVVEVENNSHHIKVTDLSSGEKQLLIIFLTVILQKNKS
FILLMDEPETSLHVEWQATFIDFIKKLNPNVQIIIATHNPLILLNRESDEIGIIEANNDEVQKRTSGTKYLDISSILLDH
FKLPSLVGTQMQNDIQRFSALKMREPELNLEEKNQLSDLGELLENSLAGDMIYNKKYFDFLTFLKNNKHISYEQYEASSE
QDMADFLSEFGGSFND

Sequences:

>Translated_976_residues
MRSFKEIQEILGTQPDVKKIYLIGCTGAGKTSLVQHIIGSKKHGFPVTSHRRTTIAPTEYVIQKNIPFKTTIILKNKNDV
VFAIEELIQGAILKAKQDKATTEDVVFELEQSPDDRFKLNQMVKGETFVKVANDIITNVLPPISGKDINDETLLSDSFIK
DEIKKIVTEILAEIEANFNRACGNGHTLFTNKTLTIDGISDKDEFILKTKKLLSHDFGSISILAEYIRIEGDLLADWLDP
NLEFLLIDGEGIGHSLGEKRDTLSSRHYNFFNYCNNIVLIDDANDPFAAGGHGAIEGIFLNGYQEKFKLVFSKTDKLEQT
DLNAYFRRSLNNLRNALKKDEIEFNEENKDTYKLNALDDKNINDESRKTIQRLLTNISNSKKKHLTPLEYDFDLLLSKYN
SETLVSTIVNRIEEEHWAVVKALSKRLQSADIEYRHLKPISWILIFLMHELNSFLKRDELTSEVFDSQNIIKQNVSHRLV
QYIYTNFVKEKEHLWQQAYEKSGFGSHRERKDFIFNQIVRVFLPSKDKEDAFKSFKKDIKSLLLKSGALELKTAVKTEIT
HVSIKKIFGSKNVEWSLGDDVNVLIGKNGCGKSTLLKLIFACINNDEETLESFRSPYVELTILKTFDNGETQISKISQSK
SPSKINAVMVNTFDIKLDRQNNDVVDLDSQLLKLTGELEGFQRGLLQSINKTVGEQIKQRDEAISKLTTATPDDFARLQE
LSIQINDATTKIYKPLIEFKSIIDEYFSGTNKSIIIDDEEFPLVVEVENNSHHIKVTDLSSGEKQLLIIFLTVILQKNKS
FILLMDEPETSLHVEWQATFIDFIKKLNPNVQIIIATHNPLILLNRESDEIGIIEANNDEVQKRTSGTKYLDISSILLDH
FKLPSLVGTQMQNDIQRFSALKMREPELNLEEKNQLSDLGELLENSLAGDMIYNKKYFDFLTFLKNNKHISYEQYEASSE
QDMADFLSEFGGSFND
>Mature_976_residues
MRSFKEIQEILGTQPDVKKIYLIGCTGAGKTSLVQHIIGSKKHGFPVTSHRRTTIAPTEYVIQKNIPFKTTIILKNKNDV
VFAIEELIQGAILKAKQDKATTEDVVFELEQSPDDRFKLNQMVKGETFVKVANDIITNVLPPISGKDINDETLLSDSFIK
DEIKKIVTEILAEIEANFNRACGNGHTLFTNKTLTIDGISDKDEFILKTKKLLSHDFGSISILAEYIRIEGDLLADWLDP
NLEFLLIDGEGIGHSLGEKRDTLSSRHYNFFNYCNNIVLIDDANDPFAAGGHGAIEGIFLNGYQEKFKLVFSKTDKLEQT
DLNAYFRRSLNNLRNALKKDEIEFNEENKDTYKLNALDDKNINDESRKTIQRLLTNISNSKKKHLTPLEYDFDLLLSKYN
SETLVSTIVNRIEEEHWAVVKALSKRLQSADIEYRHLKPISWILIFLMHELNSFLKRDELTSEVFDSQNIIKQNVSHRLV
QYIYTNFVKEKEHLWQQAYEKSGFGSHRERKDFIFNQIVRVFLPSKDKEDAFKSFKKDIKSLLLKSGALELKTAVKTEIT
HVSIKKIFGSKNVEWSLGDDVNVLIGKNGCGKSTLLKLIFACINNDEETLESFRSPYVELTILKTFDNGETQISKISQSK
SPSKINAVMVNTFDIKLDRQNNDVVDLDSQLLKLTGELEGFQRGLLQSINKTVGEQIKQRDEAISKLTTATPDDFARLQE
LSIQINDATTKIYKPLIEFKSIIDEYFSGTNKSIIIDDEEFPLVVEVENNSHHIKVTDLSSGEKQLLIIFLTVILQKNKS
FILLMDEPETSLHVEWQATFIDFIKKLNPNVQIIIATHNPLILLNRESDEIGIIEANNDEVQKRTSGTKYLDISSILLDH
FKLPSLVGTQMQNDIQRFSALKMREPELNLEEKNQLSDLGELLENSLAGDMIYNKKYFDFLTFLKNNKHISYEQYEASSE
QDMADFLSEFGGSFND

Specific function: Unknown

COG id: COG3950

COG function: function code R; Predicted ATP-binding protein involved in virulence

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 111475; Mature: 111475

Theoretical pI: Translated: 5.42; Mature: 5.42

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
1.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRSFKEIQEILGTQPDVKKIYLIGCTGAGKTSLVQHIIGSKKHGFPVTSHRRTTIAPTEY
CCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCHHH
VIQKNIPFKTTIILKNKNDVVFAIEELIQGAILKAKQDKATTEDVVFELEQSPDDRFKLN
HEECCCCEEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHEEECCCCCCHHHHH
QMVKGETFVKVANDIITNVLPPISGKDINDETLLSDSFIKDEIKKIVTEILAEIEANFNR
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ACGNGHTLFTNKTLTIDGISDKDEFILKTKKLLSHDFGSISILAEYIRIEGDLLADWLDP
CCCCCCEEEECCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCC
NLEFLLIDGEGIGHSLGEKRDTLSSRHYNFFNYCNNIVLIDDANDPFAAGGHGAIEGIFL
CCEEEEECCCCCCCHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEE
NGYQEKFKLVFSKTDKLEQTDLNAYFRRSLNNLRNALKKDEIEFNEENKDTYKLNALDDK
CCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCC
NINDESRKTIQRLLTNISNSKKKHLTPLEYDFDLLLSKYNSETLVSTIVNRIEEEHWAVV
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KALSKRLQSADIEYRHLKPISWILIFLMHELNSFLKRDELTSEVFDSQNIIKQNVSHRLV
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QYIYTNFVKEKEHLWQQAYEKSGFGSHRERKDFIFNQIVRVFLPSKDKEDAFKSFKKDIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
SLLLKSGALELKTAVKTEITHVSIKKIFGSKNVEWSLGDDVNVLIGKNGCGKSTLLKLIF
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ACINNDEETLESFRSPYVELTILKTFDNGETQISKISQSKSPSKINAVMVNTFDIKLDRQ
HHHCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECC
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CCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LSIQINDATTKIYKPLIEFKSIIDEYFSGTNKSIIIDDEEFPLVVEVENNSHHIKVTDLS
HEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEECC
SGEKQLLIIFLTVILQKNKSFILLMDEPETSLHVEWQATFIDFIKKLNPNVQIIIATHNP
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QDMADFLSEFGGSFND
HHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRSFKEIQEILGTQPDVKKIYLIGCTGAGKTSLVQHIIGSKKHGFPVTSHRRTTIAPTEY
CCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCHHH
VIQKNIPFKTTIILKNKNDVVFAIEELIQGAILKAKQDKATTEDVVFELEQSPDDRFKLN
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HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ACGNGHTLFTNKTLTIDGISDKDEFILKTKKLLSHDFGSISILAEYIRIEGDLLADWLDP
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NGYQEKFKLVFSKTDKLEQTDLNAYFRRSLNNLRNALKKDEIEFNEENKDTYKLNALDDK
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ACINNDEETLESFRSPYVELTILKTFDNGETQISKISQSKSPSKINAVMVNTFDIKLDRQ
HHHCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECC
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EEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKMREPELNLEEKNQLSDLGELLENSLAGDMIYNKKYFDFLTFLKNNKHISYEQYEASSE
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCH
QDMADFLSEFGGSFND
HHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA