Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 209554434

Identifier: 209554434

GI number: 209554434

Start: 615870

End: 618347

Strand: Reverse

Name: 209554434

Synonym: UUR10_0533

Alternate gene names: NA

Gene position: 618347-615870 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209554388

Following gene: 209554190

Centisome position: 70.71

GC content: 22.32

Gene sequence:

>2478_bases
ATGAAATTAACCAAATCACAACAAAAAGCTGTTAGTCAATTAGTTAATTGTTATTTAGAAAGCGTGAATAACAATAAAAA
AGAAATTATTGATTTTCAAGCACCAACAGGATCTGGTAAAACCTTTATTATTACCAATACTATTAATAAAATTATTAAGA
CAAACAAAGCTAATGGCAGTCCTCAAAAATTAATTTTTGTAATTGCGACTTTATCATCAGCTGATTTACCATTTCAATTA
GAACAAAATATGAATGAGTATAAATATTATATTAATGGTTTATTTGATGTCGAACTTAAAGAATCACCATCTTCTAAAAA
TGCTAAAAAAGATAGTTCTTACAATATTTTAGCTGAAGAAAATAAAGTAATTATTTTTGGGTCTTCTTCATTTGGTAAAG
GAAGAATTATTACAGAAGAAGGAATTTTAGATGCTTTTTTAGATGAAATTAAATCACAAGGATATACATTAGTTTATATC
CGTGATGAAGCTCATCATGGCGGTAATGTTAATAAAACAAAAATATTTGAAGATTTTGATGAAAAAATACACAAAAATTC
TTTTAAAAAAGAAGAAACACGATTTGAATATAAAATTCAAGAAGCAGCATCTTTTATTATTAAAATGACAGCAACTCCTA
AAGGAATTCATAAATTAGTATTCATTGATGAAAAAGATTTAATGGATGATGATACAAAATTGTTAAAAGATGAACATGTT
TATAATCTAGAAATTAAAGAACTAAAAGAAGAAAACATTGATGATGAACTATTATTAACAACTGCTTGTGAGCAATTTTT
AAAAATCAAAGAGCAATATTCAAAAGCAAAAGAGTTAAAAAATATTCGTCCAGCCATGTTAATTCAAGTTGAAAATGAAC
CTAATAAAAAACCACAAAAAAGCGAATTTTTAGATAAAATTGAAAAAATTATTAAAATTTTAGAAAAACATAATTTATCA
TGAGTTAAATACTTTTCTAATGATAAAGAGGTTCAAACTAATATTTTAATTAATAAAAAAAATAATAAAATTTCTCTAAA
AGAAATTTCTAAAAAGACTTCAAATGTGGATGTAATTTTGTTTAAAATTGGTCCTGCAACTGGTTGAAATATTCCGCGTG
CTTGCATGTTAGTACAATTGCGAAACGTTTCTTCAAAAAATTTATCAGTACAAACAATTGGAAGAATTAAGCGTTTTCCA
AATCCTAGCTTTGACAAAAACGAAATTAGCTATAATTCCATATCAAATCAATATTTTATTTATTCTAATATTATTTCAGA
AGATAAAATTCGTCAAACTTTGATTTTAAAAGACAAATATAAAAATGATAGATTTTTTTATGGCGAAATTAATCAAGATA
AAATTAATAACTATTTAAATGGAGAAACTTATAAAGAAGAAATAGTAGAGAAGTTTGAAGATTCAATTAGTAATTTTGAA
TACTATGTTAATGAGGAATATCGTGAAAATTTTGTAAAAAATCAATACTTAGAAGGCGAAACTTCAAAAATTGAAGGTAA
AACACGTGTTTATACTAAAATTAAAAATTCAATCGAACTTGAACTTTATATTATTGAACAATTAAGAAAATACAAACATC
TATTTCCTCAAAAAATTATTGATTTTCTTGAAACGAAGTTTAATGAGTGAGAAAAAAGATGAAAATTAAACATAAGCATC
AACATGTATTGATATGTTATCATTAAAGAATATCTTGATAAAATTGAAAAAATATATAAAAATTCATTAGAACAAATGAA
AAAAGATAATCATGAATTACTTTTTAAATTGCAAAATAATAAAAATTTACCTAATCAAAATGAAATTTTTATTCCCATTG
AAAAATATAAAAAATGTGAAAACATGTTAGATTTAAATGTTTGTGATAAGTATGCATATAAAGATCTTAAAGAACAAAAT
CACTATTTTGATTCTTTAACTGAATCTAAATTTGCAAATCGTTTCCTTTCATTATCAAATGATAATGATAAAATTAAAAA
TAATGTTGAACTTTGGACTAAAAATCCTGTTTTTCATGGATTAAAATATCAATATTTTAATGAAGATGGTCAAATAAGTA
ATTCATACCCTGATTTTATTTTAAAAATAAAAACACATGATCAAAAAGATCATTATTTATATATTGAAGTAAAAAATTTA
TATAGTGATTATGATTATGAAAAAACAAAATTATTAATTGAATCATATCAACGATATATTGAAAATAAAAACAATAACGA
TAATTTAATATTAGATGAATTAGACAAAGCAGAAATTACGATTTTAGTTTGTTATATTAATATGAAAAATCAAAAAGATT
TTTATTTTTATGGAGCTAGTTCAAATGATGTTTTAAATAAAAAAGTTAATTTTGATCTTTTAAAAAACACAAGTATTAAC
AAAACTCCAGAACAACTAGTTGCGAATAAAGCAAAATTTATTATTGACATTAAACATTTATTAGATTTCTTACTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATAATACAAGTCAATCAAGTTTATTTGAAAATAACCAACGCGAATTATTAATTAATTTAAGTACACTAAAACCAATT
GAAAAAAAGGAATAAAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAATATCTAACTTTAGATCAATCTACTTTAGGATAAAACTAGAGTAGATTTTTATTTTAATAATGTTAAAATATTTAAGC
GTTTAATTCGAATAATACTT

Product: type III restriction enzyme, res subunit family

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 825; Mature: 825

Protein sequence:

>825_residues
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINKIIKTNKANGSPQKLIFVIATLSSADLPFQL
EQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKNAKKDSSYNILAEENKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYI
RDEAHHGGNVNKTKIFEDFDEKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKKPQKSEFLDKIEKIIKILEKHNLS
WVKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILFKIGPATGWNIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFP
NPSFDKNEISYNSISNQYFIYSNIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQDKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFE
YYVNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDFLETKFNEWEKRWKLNISI
NMYWYVIIKEYLDKIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPNQNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQN
HYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKIKNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNL
YSDYDYEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVLNKKVNFDLLKNTSIN
KTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL

Sequences:

>Translated_825_residues
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINKIIKTNKANGSPQKLIFVIATLSSADLPFQL
EQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKNAKKDSSYNILAEENKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYI
RDEAHHGGNVNKTKIFEDFDEKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKKPQKSEFLDKIEKIIKILEKHNLS
*VKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILFKIGPATG*NIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFP
NPSFDKNEISYNSISNQYFIYSNIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQDKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFE
YYVNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDFLETKFNE*EKR*KLNISI
NMY*YVIIKEYLDKIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPNQNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQN
HYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKIKNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNL
YSDYDYEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVLNKKVNFDLLKNTSIN
KTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL
>Mature_825_residues
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINKIIKTNKANGSPQKLIFVIATLSSADLPFQL
EQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKNAKKDSSYNILAEENKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYI
RDEAHHGGNVNKTKIFEDFDEKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKKPQKSEFLDKIEKIIKILEKHNLS
*VKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILFKIGPATG*NIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFP
NPSFDKNEISYNSISNQYFIYSNIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQDKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFE
YYVNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDFLETKFNE*EKR*KLNISI
NMY*YVIIKEYLDKIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPNQNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQN
HYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKIKNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNL
YSDYDYEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVLNKKVNFDLLKNTSIN
KTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96487; Mature: 96487

Theoretical pI: Translated: 8.37; Mature: 8.37

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINKIIKTNKANGS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCC
PQKLIFVIATLSSADLPFQLEQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKNAKKDSSYNILAEE
CCEEEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECC
NKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYIRDEAHHGGNVNKTKIFEDFD
CEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH
EKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCE
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKKPQK
EECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCH
SEFLDKIEKIIKILEKHNLSVKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHCCCCCCEEEEE
KIGPATGNIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFPNPSFDKNEISYNSISNQYFIYS
EECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE
NIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQDKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFEYY
CCCCHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
VNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDF
ECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LETKFNEEKRKLNISINMYYVIIKEYLDKIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPN
HHHHCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC
QNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQNHYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKI
CCCEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
KNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNLYSDYD
CCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHCCCC
YEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCC
NKKVNFDLLKNTSINKTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL
CCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHCCHHHEEEHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINKIIKTNKANGS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCC
PQKLIFVIATLSSADLPFQLEQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKNAKKDSSYNILAEE
CCEEEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECC
NKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYIRDEAHHGGNVNKTKIFEDFD
CEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH
EKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCE
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKKPQK
EECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCH
SEFLDKIEKIIKILEKHNLSVKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHCCCCCCEEEEE
KIGPATGNIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFPNPSFDKNEISYNSISNQYFIYS
EECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE
NIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQDKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFEYY
CCCCHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
VNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDF
ECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LETKFNEEKRKLNISINMYYVIIKEYLDKIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPN
HHHHCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC
QNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQNHYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKI
CCCEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
KNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNLYSDYD
CCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHCCCC
YEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCC
NKKVNFDLLKNTSINKTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL
CCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHCCHHHEEEHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA