| Definition | Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010981 |
| Length | 1,482,455 |
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The map label for this gene is wapA [H]
Identifier: 190571717
GI number: 190571717
Start: 1420834
End: 1432482
Strand: Reverse
Name: wapA [H]
Synonym: WPa_1346
Alternate gene names: 190571717
Gene position: 1432482-1420834 (Counterclockwise)
Preceding gene: 190571718
Following gene: 190571715
Centisome position: 96.63
GC content: 34.92
Gene sequence:
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AAACCATTTCCAGATAATATAGATTTTAAAAAACCACTTGATCCAAAGTTTCCTGACTTAGTACCTTTTGAGCGGTGTAA CTATTGTAAGGTAACAACTGGTAGCGTAAGAAATGTTATAACTGATCCTGCTTGGTTAAAAAAAATTGATGATCTGATTG GTTTAAACGAGAAATTAGACTACTCTAAACAAAGGCTATATTTTCTTATCCCTTACCATGACATAACGAACAGGATAGTT AAAATGAATACTACAAACAATGGAAACAGATCTCTTTCTAATAGGCAAAAAAGGTCATCTGATAAGCGAATTATGGTAGA AGTTGAACATAGTGCTATAGACCATAGCATAAATGAAACAGGAAGATGGAGTGAACCTAATACTGTTAAAAACAAAAAAA TTACAAGTAGTGCTACAAGTTCATCTGCAAGAACTGGATCAAAAATAAACAATTTGTTCAGCTGGATAAAAAGCTCTATA GGTGGGTTGTTAAGTTCTAAATCTGTGGGAACATCAAATACTACAAGTTCAATCTCGCAAGTTGATGCGCAAATAGATGT GAATAGCACAATAATGTTGCTTGACTTATTGATTAGAAAGGTTACGGGTCGAAAGTATATTTCTACAGCAGATCAGTCTA TATCTCCACTAGAAGCACAGGGATATGCACTCAATATTACAAAGGGATTTGAGAAAGTAGTAGAGCAAGCTGGATTAAAA AGTGGTGTATCAATGCACCGGTTAAATATTGATTATATGGGAATGCAAAAAGAGATTACTAGAAAAGTCATGAGTGGTAA ATTTAATGAGATTTCAGGGATTTTAAGCTCATATGTAGAGAAAGCGTTACCTGGTAGAGAAGCAGGATACCCTGGTAAAT TAAGCGAGAAAAGGTTTAATGAGTTTATGATTAAATTTAATAAGGGGCTAGATGTGACATTAAATCAATCAATAGAGCAC 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Downstream 100 bases:
>100_bases TATCATCTAAAGAAAGGCCGGTTATTTCAGCAATAACATCAATAGATACACTGGCCTTAAGTGAGTTTTTTGCCACAGCA ATTTTAGCCTGTTTTTCGCC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Cell wall-associated polypeptide CWBP200; CWBP200 [H]
Number of amino acids: Translated: 3882; Mature: 3882
Protein sequence:
>3882_residues MKDELLAGEYPIWPLDTNLSILGNYSQADFFLSDLQRKGQENVIMRNREGLNIYEFNQRNGLEHLTQVPNGAKLGNSEEK LFFPDLTGQSYKDIVALNSSGLFIYQYGQNNYRSIHYNPLFSKIKGWNTEHINSVQFEDIDLDGRQDMLFTGPRGIDILT FDNHTSQWRSLLDNSQLTISERHSNVIKVISSNPHVIEHPIIFTQYKDQLRWANIVEAEKSLEEEVGIQERNETSSQSVP PIVPQLLQLQSEEEKPILLLREQLDCSSVINAVDKNTGKPKFKLPLIDLSNLSSDIKLDFFYDSNSKASDILGLGWSLPR NFIMMDHQSSIFPEDEKYYVILQDLPQQLIFDSSNSTDTVYCFKLSTDQPDLQIHYHKNEERWEINNSGIKQIYGRTDSV RSDSINWELAWENWRSVGSSSTGQKKLATGWYLAEVRDENDNVVRYTYDIINVSVPNGESFTQEIYLKTVGDNQGNEVIF NYSDKEESEYNLLPLIDKDGNLNTRKVETRYLSGYKVSTPGYQQDVDFVYRVEDGKRLLTEIRQRGDITNQPILQFTYKE FSAYMLEKVTLPIGASVEFSYRSIGTASHITEELGRRYDVQKSHRVDYSNDDVLISYIDEQGQVALRMFNQEMIEELYSS VSSSISSRFPLLGRGLVKAHEIVRAEDFFAVILYYNTDKELCLFRKEEGKWLPTPKYYSFNEDTMIRFGADFTVVASTNS SVEIIDWNKASKEWTKKPFFNKDNTSLLLAASGRMFLIYDDQGLLIGYRNHDNEWQSKVIKEIPGVASSIQKTLEKFNLS NNVHKHLLSYFRNNALQLNNNLLLLSTWEAEGPQLYSIINLFVLDRTYQIVQEQQYRIDQDNINVFSREVEDSSNNKYTL AYRINGDKYKFTVKDFSGPINDELENSKKEALDEIEEKKCKALAQIDAARGDLQIKAEEARIDLQNRAYEVRRDFQDNAT QARASLDARVKTEKDVVSSRIRKVKTDLENKVKGVHDDIQSAVQKAKADMQVKVEKVKSEAFAEITKQGRKFLAEVQSKE ERDEIHRLMQKEKDSVLSKLSEEVSKVNAQLARESNEAYRKLEEKVNETYEQLKKSTNEAYQKFEESKNEVYGQLERRLR EALEQLEQKIHEAYERLEEQISQAYQQLEEGEKEVYKNVKDSRVRVYEQIEDIKAKICKNVASLWEKEFFLLDSVKYSAT LNSQIAVCSHRKFTFTGDKWKEGTISETELRQENFSIPLGNKLVLDKENSRSSLKLYSQGNNREKQGNSLLDLEVKQLNQ TSIRNMYPAYLAYQEKDKQVGVVEFSSDGTIDKTYKLPQEEKLSSWSSYQTLVTHVNNLDSGESNTLVFRQQLGIRRLLP NPVITKTAVTLENGSKRITGYEYDVSSAKALGNSVYYEKTSIIPGNNKTFFGWIEEMKDFDNYSNGEKKVFNAQEVLIKT LKLKEEQASTNDTIINRENLYLNTTLLDKTGKLEVAQFFPYEIADEEVSHYGFENYEINKIGKNVTLPEKRWLFNETDVV KQGFSFTGQSYLSLSRSTLEGTFQPNNQNQEYVASCWMRPQSRVFGLGAVTPYLKAVVYAENGDEIFGLLSEVKFQSGDW FYLEVVIDLLHAKQIYKGLQKSSNSTLTEQPDINLKTSIIVSPGTNTTIDVDHVRFSPLNSHSKVNVYDTKTKQVREVIQ ANGLVEKHVYDEYQNEIASINEYGQLEKLSSYTKASSIGRVVQLKSSIQIQPETGFYEDFSPYSFKERWKIDNADVWKIS LAQLQHFTNHLHSLQLNPYDINSASHGMRVCFSLQSESSIIKFNDDLKLMRTGNRANIIFPGKRLSVPLNGEILVAVEHG RLLVWIDGGLYFDGLSNGSLFNLGVSGKVRISDVMVFSEPSIQVTYFNALDEKLQEVVLKGENTAIVTEYLYDELGRQTI TTQPARIERSSSQSVLAYYPNFVTNSNPYSANSVWKIEQLQGDVGRIVGEHSYSQTKYDNNPLDERCAVGLPGREFSVSG PYAKRFASSSENLFINNLFPTSQNYSYQVEYKPGGVEDISVFDNKNNRVAQYTRVPGSRDLLSTYEYDENDKLVKSLPPL YHEKVRTFHKLNSQLQSLSTEEKALQDFLGAHTSYDGKGNAIIKTTPDSGKVEHLYDNNGLLKFAVHYSQLNGEEVENVI YFDYDQLGRLISTGKLTSPLPKKEELPTLAISSNNIEEYQQFYHSDFEREPILRGKVRRTITFNNKEPLIEESILNIDKE TLSKRILIPIKDNDEPLLIAINKRYTAGKLREIEYPIDVQGNSFKLTYSYNKLGKVTGIGVPGKQNLFVNFAHNSAGQVI SEQHLPESARNFTRQYSYNAPGFLTKLEDKFLTEKVYYTDRSYGGHGYGDGTVTRTEFKATWHEHCDNRELGLNEQSFVS ENITPKESELCFHKLKETGYLNEHNHQAKAYYPALEPKLPIVCSDGITGRQIAKTLGEKGFPTEYGHSYDYGNHQELTKA KYFVGNEAPLPLQPDTFAKEIRGINSTVSHDIWQILKSAGYLREDNAKVDISLSHAKRGKPFIRPTLFSDLKSINANYGG YKLPLERLLATAFSQGQNLSLLKSNLQNAFIKWNGGVGSNELQQTASKIIEMLERKQHLDNPLNEEFSNLLRKYESFIPD IVRLLSEHFARQLGEAEFDVESYDIDANGNHKHYYTGFDRYELSYSNNTNQVNSVKFKSYSSSKTEQKFAIKHDSRGNII QALHKGIEQIDYDSVSNHATKIRLTDGRALIFYYDAQGERILKRVTNSQGETTKEIHYIRDEFGRALVERQITYISQDLP PDILITAYIYGPRGLLGFIRRDEFYSVITDHEGSIRLVVKGDEVVAAYDYLPYGNLMREYGGNPEAHIAYRYTGQELDEE TGLYNYHARFYDPSIGRFYQIDPQGQYFSPYKYAGNSPVSIIDPDGEFAFLIPLIIAGAVAGGYLGGAAANKEWNPGKWK WDSGKTWLGIVGGGVGGALLPIGFGASVSAFTSIGLSSTASIAATTSLGGAGIYFSTAAANKEWDPSKWDFSSPETWNAA FQGFAIGSGAVGGIRSAGTFYKGLSSTWGKGAFIVGSTGTGGGLFVLNGFAANWDFSKPGVYFGFVDAITGAPDLAMFLR GAGRFLGKNGRNIVSTFDSFKSLNNQKGRYFGGTVFSNLNQAFQGIDASEALKRLASKQTWSNTATFLGDLSSHQFSKSV GKIAGGVAMAGSSAYLMGSAVSENGWDLTSAYTYHAIINGMLTGGQLASSGRAYYRGKIVKNQLKLPKEMERIAQNYAKE ALTIYQEILNKGGQIIIGGHISSKVITIDGKDFTILDPGNKINKKSIKDIESIDRDNGVKDWMIKNGEEKFIVATTKNGW VTIDPKGEIQGISRLHPIRTGQDPISYSRKVKVQIKKGEVPNTAISVAVTENLAVVTLSGTDSPGLVIFIDRKQGVTYTK PLARNKEFAGKEVTIDQSIENAINALRESGEDFPPWLPSNCAEPSALVALSSSKEAFPQSLNSRSYEIDDIDFLATYKVP KPFPDNIDFKKPLDPKFPDLVPFERCNYCKVTTGSVRNVITDPAWLKKIDDLIGLNEKLDYSKQRLYFLIPYHDITNRIV KMNTTNNGNRSLSNRQKRSSDKRIMVEVEHSAIDHSINETGRWSEPNTVKNKKITSSATSSSARTGSKINNLFSWIKSSI GGLLSSKSVGTSNTTSSISQVDAQIDVNSTIMLLDLLIRKVTGRKYISTADQSISPLEAQGYALNITKGFEKVVEQAGLK SGVSMHRLNIDYMGMQKEITRKVMSGKFNEISGILSSYVEKALPGREAGYPGKLSEKRFNEFMIKFNKGLDVTLNQSIEH NGDGRLEVDVVKEQKTNSGPQSYLSNASVQGHLTQNKVKLIS
Sequences:
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PDILITAYIYGPRGLLGFIRRDEFYSVITDHEGSIRLVVKGDEVVAAYDYLPYGNLMREYGGNPEAHIAYRYTGQELDEE TGLYNYHARFYDPSIGRFYQIDPQGQYFSPYKYAGNSPVSIIDPDGEFAFLIPLIIAGAVAGGYLGGAAANKEWNPGKWK WDSGKTWLGIVGGGVGGALLPIGFGASVSAFTSIGLSSTASIAATTSLGGAGIYFSTAAANKEWDPSKWDFSSPETWNAA FQGFAIGSGAVGGIRSAGTFYKGLSSTWGKGAFIVGSTGTGGGLFVLNGFAANWDFSKPGVYFGFVDAITGAPDLAMFLR GAGRFLGKNGRNIVSTFDSFKSLNNQKGRYFGGTVFSNLNQAFQGIDASEALKRLASKQTWSNTATFLGDLSSHQFSKSV GKIAGGVAMAGSSAYLMGSAVSENGWDLTSAYTYHAIINGMLTGGQLASSGRAYYRGKIVKNQLKLPKEMERIAQNYAKE ALTIYQEILNKGGQIIIGGHISSKVITIDGKDFTILDPGNKINKKSIKDIESIDRDNGVKDWMIKNGEEKFIVATTKNGW VTIDPKGEIQGISRLHPIRTGQDPISYSRKVKVQIKKGEVPNTAISVAVTENLAVVTLSGTDSPGLVIFIDRKQGVTYTK PLARNKEFAGKEVTIDQSIENAINALRESGEDFPPWLPSNCAEPSALVALSSSKEAFPQSLNSRSYEIDDIDFLATYKVP KPFPDNIDFKKPLDPKFPDLVPFERCNYCKVTTGSVRNVITDPAWLKKIDDLIGLNEKLDYSKQRLYFLIPYHDITNRIV KMNTTNNGNRSLSNRQKRSSDKRIMVEVEHSAIDHSINETGRWSEPNTVKNKKITSSATSSSARTGSKINNLFSWIKSSI GGLLSSKSVGTSNTTSSISQVDAQIDVNSTIMLLDLLIRKVTGRKYISTADQSISPLEAQGYALNITKGFEKVVEQAGLK 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Specific function: Still unknown. Not involved in cell membrane metabolism, motility, secretion or differentiation [H]
COG id: COG3209
COG function: function code M; Rhs family protein
Gene ontology:
Cell location: Secreted, cell wall. Note=Released into the medium [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR008979 - InterPro: IPR022385 - InterPro: IPR006530 [H]
Pfam domain/function: PF05593 RHS_repeat [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 438980; Mature: 438980
Theoretical pI: Translated: 6.41; Mature: 6.41
Prosite motif: PS00012 PHOSPHOPANTETHEINE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKDELLAGEYPIWPLDTNLSILGNYSQADFFLSDLQRKGQENVIMRNREGLNIYEFNQRN CCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEECCCC GLEHLTQVPNGAKLGNSEEKLFFPDLTGQSYKDIVALNSSGLFIYQYGQNNYRSIHYNPL CHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCEEEECCHH FSKIKGWNTEHINSVQFEDIDLDGRQDMLFTGPRGIDILTFDNHTSQWRSLLDNSQLTIS HHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCEEEE ERHSNVIKVISSNPHVIEHPIIFTQYKDQLRWANIVEAEKSLEEEVGIQERNETSSQSVP CCCCCEEEEECCCCCEEECCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC PIVPQLLQLQSEEEKPILLLREQLDCSSVINAVDKNTGKPKFKLPLIDLSNLSSDIKLDF CHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEE FYDSNSKASDILGLGWSLPRNFIMMDHQSSIFPEDEKYYVILQDLPQQLIFDSSNSTDTV EECCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEHHHCCHHHHCCCCCCCCEE YCFKLSTDQPDLQIHYHKNEERWEINNSGIKQIYGRTDSVRSDSINWELAWENWRSVGSS EEEEECCCCCCEEEEEECCCCCEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHCCCCC STGQKKLATGWYLAEVRDENDNVVRYTYDIINVSVPNGESFTQEIYLKTVGDNQGNEVIF 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