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The map label for this gene is nuoL1 [H]

Identifier: 189184494

GI number: 189184494

Start: 1619589

End: 1621496

Strand: Reverse

Name: nuoL1 [H]

Synonym: OTT_1587

Alternate gene names: 189184494

Gene position: 1621496-1619589 (Counterclockwise)

Preceding gene: 189184495

Following gene: 189184493

Centisome position: 80.71

GC content: 27.62

Gene sequence:

>1908_bases
ATGTCATTTTTAATTACATTATTACCGTGTTTACCTTTAATTTCAGGTGTAATTAGTAGATTAAATAATAGTTTTGCGAC
AAAAATAATATCGTATATAACTGTTATGTTAATTGCTAGTACTAGCTTTGCTGCAATTTTAGTTTTTTGGAATATTAGTA
AGCATAATAGTGTTGAACATATAATATTATTTGAATGGATTGAGCTATTAAATTTAAAAGCCCATTGTGCTATTTACATC
GATAAATTAACAGCATTAATGTTAGTCATAGTGTCCTTAATTTCTACGATAGTTCATATTTATTCTATAGGTTATTTACA
TGACGATAAAGAATTACCTAAATTCATGTCATATTTATCTTTTTTTACTTTTTTCATGTTGATGTTAGTCTCATCAGATA
ATTTTTTACAGCTATTTTTGGGATGGGAAGGAGTAGGGGTAAGTTCTTACTTATTAATAGGATTTTGGCATAAAAAACAT
GCCGCAACAATTGCAGCATATAAAGCATTTATTGTTAATAGATTTGCTGACTGTGCGTTTCTTTTAGCAATTATTGCTAT
TATTTATAATTGTAACTCTGTAGAATTTAAGACAGTATTTAATCATGCTGAACAATTATCAAAAACAATAGTCTCAATTT
TTGATATTAAAATCAGTGTTTTAGACTTAATTTGTTGTTTGCTATTTATTGGATGTATGGGCAAATCTGCTCAAATTGGT
TTGCATATATGGTTACCAGATGCTATGGAAGGGCCTACTCCTGCATCAGCACTAATTCATGCTGCTACTATGGTAACAGC
TGGCATATTCTTATTGGCTAGATGTTCATTTATGTTTGAATATTCTACAGCAATATTAAATCTTATTGCTATTACTGGTG
GGTTTACTTGTATATTAACTTCAATAATTGCAGTTTGTCAAAGTGATATAAAAAAAATCATTGCATATTCTACCTGTAGT
CAATTAGGTTATATGGTAATAGCATGTGGATCATCTAGTTATAATGGAGCAATGTTTCATTTACTAACTCATGCTTTTTT
TAAAGCAATGTTATTTTTAGCTGCAGGAAATGTTATACATATGACTCATCAGCAAGATTTAAATAAAATGCCGCAGCAAT
TGTGGAGAGTGATGCCTTATACTTATGGGTTATTTTGGTTAGGAACATTAGCAATTGTTGGAATATTTCCTTTTTCAGGA
TTCTATTCAAAGGATATGATACTAGAATCTGTTTATCTTACAGACAATAAATTTGTTTATTATCTGGGGATTATTGCAGT
ATTTTTCACAGCTATGTATTCAATTAAATTAATTATAGGAATTTTTCATCAACATTCTTTTTCATCAACTAAACATTCGA
TTAAGGAAGTTTCGATAATTATGAATCTACCGTTATTAATCTTAGCAATTGGTAGTGCTATTTCTGGATGGTATTGTTAT
AACATCTTAACTATTGGAAAAGTTGAATATTTTGCTAATTCATTAGTTAATAATGGAATTTTAGAAAATTCACATATTAA
TTGCTTGATGATAAAAATACTTCCAATTTTAGCAGGAGTATTTGGCTTAATAATTGGTGGGTTAATTTATTATTGTAAAA
GTAACTTAAATATTAGCATAATCAAGAGTATTAGTTCTCCAGCTAGGAACAAGTTTTATTTTGATGAAATATATAATACT
TTACTAGTGAAAACCTTTAATATTGTTTCATACTACTTAAGTATATTTGATATTAAATGCATAAATAAATTTTTAGATGA
TAGCGTGATATTTTTAGTGCAAAGTGGGTTTTCAGGTATAAAAAAAATGCAATCAGGGTATGTATCTTACTATATACTAA
TAGCACTAGTTAGCATGACTGCATTCTTTACTTTAATTGTTATTAATTACTTTATAACTAGTAACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCAGCTGAATCTGCTATTGGATTAGCAATAATTGTGGTACATTTTCGTAATTGTTCTTCAATTTCAGTTAAGGATTTAA
ACAAATTGAAGGGATAAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGCCAATAATAGTAACTCAAGATATTCCTATATTATCAGTTTGTATTTCTTTGCCATTAAGTGCATTGATAATTTTGCT
GCTTATGAGATTAAGCAATT

Product: NADH dehydrogenase I chain L

Products: NA

Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit L; NDH-1 subunit L [H]

Number of amino acids: Translated: 635; Mature: 634

Protein sequence:

>635_residues
MSFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEHIILFEWIELLNLKAHCAIYI
DKLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLSFFTFFMLMLVSSDNFLQLFLGWEGVGVSSYLLIGFWHKKH
AATIAAYKAFIVNRFADCAFLLAIIAIIYNCNSVEFKTVFNHAEQLSKTIVSIFDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIG
LHIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILTSIIAVCQSDIKKIIAYSTCS
QLGYMVIACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIHMTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSG
FYSKDMILESVYLTDNKFVYYLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQHSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCY
NILTIGKVEYFANSLVNNGILENSHINCLMIKILPILAGVFGLIIGGLIYYCKSNLNISIIKSISSPARNKFYFDEIYNT
LLVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSVIFLVQSGFSGIKKMQSGYVSYYILIALVSMTAFFTLIVINYFITSN

Sequences:

>Translated_635_residues
MSFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEHIILFEWIELLNLKAHCAIYI
DKLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLSFFTFFMLMLVSSDNFLQLFLGWEGVGVSSYLLIGFWHKKH
AATIAAYKAFIVNRFADCAFLLAIIAIIYNCNSVEFKTVFNHAEQLSKTIVSIFDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIG
LHIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILTSIIAVCQSDIKKIIAYSTCS
QLGYMVIACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIHMTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSG
FYSKDMILESVYLTDNKFVYYLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQHSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCY
NILTIGKVEYFANSLVNNGILENSHINCLMIKILPILAGVFGLIIGGLIYYCKSNLNISIIKSISSPARNKFYFDEIYNT
LLVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSVIFLVQSGFSGIKKMQSGYVSYYILIALVSMTAFFTLIVINYFITSN
>Mature_634_residues
SFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEHIILFEWIELLNLKAHCAIYID
KLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLSFFTFFMLMLVSSDNFLQLFLGWEGVGVSSYLLIGFWHKKHA
ATIAAYKAFIVNRFADCAFLLAIIAIIYNCNSVEFKTVFNHAEQLSKTIVSIFDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIGL
HIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILTSIIAVCQSDIKKIIAYSTCSQ
LGYMVIACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIHMTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSGF
YSKDMILESVYLTDNKFVYYLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQHSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCYN
ILTIGKVEYFANSLVNNGILENSHINCLMIKILPILAGVFGLIIGGLIYYCKSNLNISIIKSISSPARNKFYFDEIYNTL
LVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSVIFLVQSGFSGIKKMQSGYVSYYILIALVSMTAFFTLIVINYFITSN

Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cyto

COG id: COG1009

COG function: function code CP; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the complex I subunit 5 family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI251831117, Length=420, Percent_Identity=36.1904761904762, Blast_Score=248, Evalue=9e-66,
Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=564, Percent_Identity=33.8652482269504, Blast_Score=281, Evalue=1e-76,
Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=338, Percent_Identity=28.9940828402367, Blast_Score=126, Evalue=4e-30,
Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=352, Percent_Identity=29.2613636363636, Blast_Score=117, Evalue=2e-27,
Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=479, Percent_Identity=26.9311064718163, Blast_Score=104, Evalue=2e-23,
Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=364, Percent_Identity=26.9230769230769, Blast_Score=100, Evalue=3e-22,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001750
- InterPro:   IPR001516
- InterPro:   IPR003945
- InterPro:   IPR018393 [H]

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1; PF00662 Oxidored_q1_N [H]

EC number: =1.6.99.5 [H]

Molecular weight: Translated: 71130; Mature: 70998

Theoretical pI: Translated: 8.31; Mature: 8.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.5 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
6.0 %Cys+Met (Translated Protein)
2.5 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
5.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEH
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCH
IILFEWIELLNLKAHCAIYIDKLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLS
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
FFTFFMLMLVSSDNFLQLFLGWEGVGVSSYLLIGFWHKKHAATIAAYKAFIVNRFADCAF
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLAIIAIIYNCNSVEFKTVFNHAEQLSKTIVSIFDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIG
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
LHIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILT
EEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
SIIAVCQSDIKKIIAYSTCSQLGYMVIACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
MTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSGFYSKDMILESVYLTDNKFVY
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCHHH
YLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQHSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
NILTIGKVEYFANSLVNNGILENSHINCLMIKILPILAGVFGLIIGGLIYYCKSNLNISI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
IKSISSPARNKFYFDEIYNTLLVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSVIFLVQSGFSGI
EECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHCHHHH
KKMQSGYVSYYILIALVSMTAFFTLIVINYFITSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCH
IILFEWIELLNLKAHCAIYIDKLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLS
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
FFTFFMLMLVSSDNFLQLFLGWEGVGVSSYLLIGFWHKKHAATIAAYKAFIVNRFADCAF
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLAIIAIIYNCNSVEFKTVFNHAEQLSKTIVSIFDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIG
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
LHIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILT
EEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
SIIAVCQSDIKKIIAYSTCSQLGYMVIACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
MTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSGFYSKDMILESVYLTDNKFVY
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCHHH
YLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQHSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
NILTIGKVEYFANSLVNNGILENSHINCLMIKILPILAGVFGLIIGGLIYYCKSNLNISI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
IKSISSPARNKFYFDEIYNTLLVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSVIFLVQSGFSGI
EECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHCHHHH
KKMQSGYVSYYILIALVSMTAFFTLIVINYFITSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]