Definition Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome.
Accession NC_010718
Length 3,165,557

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yeiH [C]

Identifier: 188585723

GI number: 188585723

Start: 1157720

End: 1159012

Strand: Direct

Name: yeiH [C]

Synonym: Nther_1096

Alternate gene names: 188585723

Gene position: 1157720-1159012 (Clockwise)

Preceding gene: 188585722

Following gene: 188585724

Centisome position: 36.57

GC content: 36.74

Gene sequence:

>1293_bases
GTGTTGAGAAAGGATGATTGGTGGGCCGTTTGGTTAGGTCTATTTTTAATACTTATTACAGGTCTGGGATTATTAACTGA
AATCCCTGGACTAGAGGAGTGGACCCACAATCCTCTAAACAGCTTATCGTTAAGTACAGTTTTAGAACTGACGGTTTTAG
GAACGGGCCTGGCATTGTTAACAGGGATTGCAGTTTATTATATACAAGGAAAGTCATTTGCCAATAATTATCTAAAAGCT
TTTCCTTGGGTATTTATGATTGCAGTAATTTCCTATGTGTTATCAGAACAATCTCTTGCTTCACATTATGGCCTGGGGTA
TGTAGTTTGGGCATTAGCTTTGGGTCTATTTATAAGCAATGTTATAGGAGTTCCAGAATTTATAAAACCTGCCATTAAGA
GTGAATTATTTATAAAAACTGGACTTGTACTTTTAGGTGCTGAAATTTTGTTTGACCGCTTGTTGGTTTTGGGTATTTAT
GGAATAGGTGTTGCTTGGATTGTCACACCAATTGTTCTAGTGTCTATGTATTTTATCGGAACTCGGCTTTTAGGAATTAA
TAATAAATCATTAGTCGTTACAATTAGTGCTGCCACTTCTGTATGTGGAGTTAGTGCTGCAATTGTAACAGGAGAAGCTT
CCAAGGCTACTGAAGAACAAATGTCTTTAGCTGTTACAATAACTTCAGTTATGACGGTATTGATGATAATTTTCATGCCG
CTATTGATTACTTTTCTTGGAATAGATCCATTGGTTGGTGGTGCGTGGGTCGGTGGTACCATTGATGCCACAGGTGCCGT
TGTTGTGGCTGCTTCAGTATTAGGTCAAGAGGCAGTAGAAATCGCTGCTACCATTAAGATGATCCAAAATGTTTTAATAG
GTGTTATCGGTTTTATAATTGCTTTTATCTGGGTGAAAAACTCAGAAGGAATTGAAAATTTACAACAAGAAGGGGAAAAG
TCTGTTTCTTGGACAAAGGTATGGACAAGATTTCCTAAATTTATAATAGGATTTGTTATAGCTTCTTTGTTATTTTCTTT
TGTTTTCACTCCTTATTTAGGGAGTTCTTGGGTTGATAGCACATTAGACTTAACTAGTGGGCTTCGAGGCTGGTTTTTTG
TACTGGCTTTTGTGAGTATTGGATTAAATGCCCGGTTATCTCGAATGAAATATTTGTTTGAGAAGGGGAACCCTTTAAAA
CTATATCTTGTTGGACAAACCTTGAATATTATTGCTACTTTTGTAATGGCTTGGATCTTATTTAGTGGGGTAATATTTCC
CCAACCATTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGACGAAGTTGAAATTATAACTTATATGGGAGGGGGCCATTAACAATGGCTCTTCTCCCTTCCTGATAAATAAAAGTTTC
TATGTAAAGGGGGAATACAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAGTCCACAATGACATAATATTAACTCATTCATTGATAAATAATAAATACTAACTACTCATAGCAGGAACATATCCCTA
TAATGTCAAATATTTATTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 430; Mature: 430

Protein sequence:

>430_residues
MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALLTGIAVYYIQGKSFANNYLKA
FPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISNVIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIY
GIGVAWIVTPIVLVSMYFIGTRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP
LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFIIAFIWVKNSEGIENLQQEGEK
SVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDSTLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLK
LYLVGQTLNIIATFVMAWILFSGVIFPQPF

Sequences:

>Translated_430_residues
MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALLTGIAVYYIQGKSFANNYLKA
FPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISNVIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIY
GIGVAWIVTPIVLVSMYFIGTRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP
LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFIIAFIWVKNSEGIENLQQEGEK
SVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDSTLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLK
LYLVGQTLNIIATFVMAWILFSGVIFPQPF
>Mature_430_residues
MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALLTGIAVYYIQGKSFANNYLKA
FPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISNVIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIY
GIGVAWIVTPIVLVSMYFIGTRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP
LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFIIAFIWVKNSEGIENLQQEGEK
SVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDSTLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLK
LYLVGQTLNIIATFVMAWILFSGVIFPQPF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0324 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018383 [H]

Pfam domain/function: PF03601 Cons_hypoth698 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46757; Mature: 46757

Theoretical pI: Translated: 5.87; Mature: 5.87

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGIAVYYIQGKSFANNYLKAFPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISN
HHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIYGIGVAWIVTPIVLVSMYFIG
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP
HHHEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFII
HHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFIWVKNSEGIENLQQEGEKSVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDS
HHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
TLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLKLYLVGQTLNIIATFVMAWIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
FSGVIFPQPF
HCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGIAVYYIQGKSFANNYLKAFPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISN
HHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIYGIGVAWIVTPIVLVSMYFIG
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP
HHHEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFII
HHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFIWVKNSEGIENLQQEGEKSVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDS
HHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
TLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLKLYLVGQTLNIIATFVMAWIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
FSGVIFPQPF
HCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12835416 [H]