| Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010718 |
| Length | 3,165,557 |
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The map label for this gene is yeiH [C]
Identifier: 188585723
GI number: 188585723
Start: 1157720
End: 1159012
Strand: Direct
Name: yeiH [C]
Synonym: Nther_1096
Alternate gene names: 188585723
Gene position: 1157720-1159012 (Clockwise)
Preceding gene: 188585722
Following gene: 188585724
Centisome position: 36.57
GC content: 36.74
Gene sequence:
>1293_bases GTGTTGAGAAAGGATGATTGGTGGGCCGTTTGGTTAGGTCTATTTTTAATACTTATTACAGGTCTGGGATTATTAACTGA AATCCCTGGACTAGAGGAGTGGACCCACAATCCTCTAAACAGCTTATCGTTAAGTACAGTTTTAGAACTGACGGTTTTAG GAACGGGCCTGGCATTGTTAACAGGGATTGCAGTTTATTATATACAAGGAAAGTCATTTGCCAATAATTATCTAAAAGCT TTTCCTTGGGTATTTATGATTGCAGTAATTTCCTATGTGTTATCAGAACAATCTCTTGCTTCACATTATGGCCTGGGGTA TGTAGTTTGGGCATTAGCTTTGGGTCTATTTATAAGCAATGTTATAGGAGTTCCAGAATTTATAAAACCTGCCATTAAGA GTGAATTATTTATAAAAACTGGACTTGTACTTTTAGGTGCTGAAATTTTGTTTGACCGCTTGTTGGTTTTGGGTATTTAT GGAATAGGTGTTGCTTGGATTGTCACACCAATTGTTCTAGTGTCTATGTATTTTATCGGAACTCGGCTTTTAGGAATTAA TAATAAATCATTAGTCGTTACAATTAGTGCTGCCACTTCTGTATGTGGAGTTAGTGCTGCAATTGTAACAGGAGAAGCTT CCAAGGCTACTGAAGAACAAATGTCTTTAGCTGTTACAATAACTTCAGTTATGACGGTATTGATGATAATTTTCATGCCG CTATTGATTACTTTTCTTGGAATAGATCCATTGGTTGGTGGTGCGTGGGTCGGTGGTACCATTGATGCCACAGGTGCCGT TGTTGTGGCTGCTTCAGTATTAGGTCAAGAGGCAGTAGAAATCGCTGCTACCATTAAGATGATCCAAAATGTTTTAATAG GTGTTATCGGTTTTATAATTGCTTTTATCTGGGTGAAAAACTCAGAAGGAATTGAAAATTTACAACAAGAAGGGGAAAAG TCTGTTTCTTGGACAAAGGTATGGACAAGATTTCCTAAATTTATAATAGGATTTGTTATAGCTTCTTTGTTATTTTCTTT TGTTTTCACTCCTTATTTAGGGAGTTCTTGGGTTGATAGCACATTAGACTTAACTAGTGGGCTTCGAGGCTGGTTTTTTG TACTGGCTTTTGTGAGTATTGGATTAAATGCCCGGTTATCTCGAATGAAATATTTGTTTGAGAAGGGGAACCCTTTAAAA CTATATCTTGTTGGACAAACCTTGAATATTATTGCTACTTTTGTAATGGCTTGGATCTTATTTAGTGGGGTAATATTTCC CCAACCATTTTAG
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TTAGTCCACAATGACATAATATTAACTCATTCATTGATAAATAATAAATACTAACTACTCATAGCAGGAACATATCCCTA TAATGTCAAATATTTATTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 430; Mature: 430
Protein sequence:
>430_residues MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALLTGIAVYYIQGKSFANNYLKA FPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISNVIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIY GIGVAWIVTPIVLVSMYFIGTRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFIIAFIWVKNSEGIENLQQEGEK SVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDSTLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLK LYLVGQTLNIIATFVMAWILFSGVIFPQPF
Sequences:
>Translated_430_residues MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALLTGIAVYYIQGKSFANNYLKA FPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISNVIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIY GIGVAWIVTPIVLVSMYFIGTRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFIIAFIWVKNSEGIENLQQEGEK SVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDSTLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLK LYLVGQTLNIIATFVMAWILFSGVIFPQPF >Mature_430_residues MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALLTGIAVYYIQGKSFANNYLKA FPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISNVIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIY GIGVAWIVTPIVLVSMYFIGTRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFIIAFIWVKNSEGIENLQQEGEK SVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDSTLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLK LYLVGQTLNIIATFVMAWILFSGVIFPQPF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the UPF0324 family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018383 [H]
Pfam domain/function: PF03601 Cons_hypoth698 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46757; Mature: 46757
Theoretical pI: Translated: 5.87; Mature: 5.87
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGIAVYYIQGKSFANNYLKAFPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISN HHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH VIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIYGIGVAWIVTPIVLVSMYFIG HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP HHHEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFII HHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFIWVKNSEGIENLQQEGEKSVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDS HHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH TLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLKLYLVGQTLNIIATFVMAWIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH FSGVIFPQPF HCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLRKDDWWAVWLGLFLILITGLGLLTEIPGLEEWTHNPLNSLSLSTVLELTVLGTGLALL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGIAVYYIQGKSFANNYLKAFPWVFMIAVISYVLSEQSLASHYGLGYVVWALALGLFISN HHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH VIGVPEFIKPAIKSELFIKTGLVLLGAEILFDRLLVLGIYGIGVAWIVTPIVLVSMYFIG HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRLLGINNKSLVVTISAATSVCGVSAAIVTGEASKATEEQMSLAVTITSVMTVLMIIFMP HHHEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLITFLGIDPLVGGAWVGGTIDATGAVVVAASVLGQEAVEIAATIKMIQNVLIGVIGFII HHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFIWVKNSEGIENLQQEGEKSVSWTKVWTRFPKFIIGFVIASLLFSFVFTPYLGSSWVDS HHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH TLDLTSGLRGWFFVLAFVSIGLNARLSRMKYLFEKGNPLKLYLVGQTLNIIATFVMAWIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH FSGVIFPQPF HCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12835416 [H]