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The map label for this gene is ylbJ [H]

Identifier: 187935311

GI number: 187935311

Start: 1260423

End: 1261598

Strand: Reverse

Name: ylbJ [H]

Synonym: CLL_A1231

Alternate gene names: 187935311

Gene position: 1261598-1260423 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187933262

Following gene: 187933458

Centisome position: 33.2

GC content: 24.23

Gene sequence:

>1176_bases
ATGAGTTATACTATTGTTGTCTTATGGTTATTCATAATATTATTAACTATTATTTTAATAAAATTATTAAATATAAAAAG
CAATATCCTATTTTGTATAATATGTTCTATATTTATAGTGTTATTTATATTAAATATAAAACAGTGTACAATTGCTGCTA
TTGATGGATGTAAATTATGGTATAGTGCTGTCTTACCTGTAACATTTCCATTTTTAGTTATTTGCAACCTATTGATTTCT
TATGATGGTATATCACTTTATTCAAAGTTATTGGGACCATTGATTTGCAAGCCTCTAGGTTTATCTAAAAATTGTTCCTT
CCCTATAGTCGCTAGTTTTTTATGTGGATATCCTCTAGGAGCAAAATATTCCATTGATTTATGGTCTCTAGGAAGTATAG
ATGATAAAGAATGTCAAAGACTTTTAAATATAGCTTCAAATGTAGGACCACTGTTTTTAATTGGTTCTGTAGGGACAGCA
CTTTTGAACAATACAGCTTTAGGTTATATACTACTTATAGCTAATTATCTTTCTGCTATATTTATTGGTTTAATAACAAA
AAAAAATAGAACCTTAAGAAAACCGTCTTCTAAAAGTTCTATAAATGAAAAAAATTTAAATTTTGGTCAAGCAATAAAAA
ATGCTATTGGAAATGGTGTAAACACAATATTATCAATTTGTGGATTCATCGTTATATTTTCCGTAATAATATCCCTTATA
AAAAATAATGCTTATATAAATAATATATTTGACTTTTTAGAAAATTTACTTCATATACAAAGTGGTACTTTGTTTTCTAT
ATTCTTAGGAAGTATAGAAATGACAAATGGTTGTAATCTAATTTCAGACTTAAATATTTCACTTCCATTAAAATTAGGAA
TTATAAGTTTTTTGTGTTCTTTTTCTGGATTATCCGTAATAGCACAAATAAGTTCATTTATGAATGACTTTAATATTTCC
TACTTTAAATATATATCTTTAAAGTTAATTCAAGGAATATTCAGTTTTGTAATAACATATTTATTAATAAAAATTATACC
TACAAGCATTGTTACCTCTAATTTTCCAGTAGCTTGTACCATAAATCCTTTTATGTATTTATTACCTATATTATTACTTT
TAACTTTAACAATAGTGCTTAAAATAATATATAAATTATTTTTTCATACCTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATATTTTTTAATAAATATAATATAAAACTTTATTTCTATTCTAAGATTTACGAGAGTATATTTTACTCTCGTATAAATC
TTTAAAATTGGAGTGATTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTCTTTTATATTTTCCCTTATAGTTACGCAAGCCGTACTTAAATTATCATCTATATCTTTAGCCACTACTTCAAAACTAT
TTTGAAGCCCTTTAATTAAA

Product: sporulation integral membrane protein YlbJ

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 391; Mature: 390

Protein sequence:

>391_residues
MSYTIVVLWLFIILLTIILIKLLNIKSNILFCIICSIFIVLFILNIKQCTIAAIDGCKLWYSAVLPVTFPFLVICNLLIS
YDGISLYSKLLGPLICKPLGLSKNCSFPIVASFLCGYPLGAKYSIDLWSLGSIDDKECQRLLNIASNVGPLFLIGSVGTA
LLNNTALGYILLIANYLSAIFIGLITKKNRTLRKPSSKSSINEKNLNFGQAIKNAIGNGVNTILSICGFIVIFSVIISLI
KNNAYINNIFDFLENLLHIQSGTLFSIFLGSIEMTNGCNLISDLNISLPLKLGIISFLCSFSGLSVIAQISSFMNDFNIS
YFKYISLKLIQGIFSFVITYLLIKIIPTSIVTSNFPVACTINPFMYLLPILLLLTLTIVLKIIYKLFFHTS

Sequences:

>Translated_391_residues
MSYTIVVLWLFIILLTIILIKLLNIKSNILFCIICSIFIVLFILNIKQCTIAAIDGCKLWYSAVLPVTFPFLVICNLLIS
YDGISLYSKLLGPLICKPLGLSKNCSFPIVASFLCGYPLGAKYSIDLWSLGSIDDKECQRLLNIASNVGPLFLIGSVGTA
LLNNTALGYILLIANYLSAIFIGLITKKNRTLRKPSSKSSINEKNLNFGQAIKNAIGNGVNTILSICGFIVIFSVIISLI
KNNAYINNIFDFLENLLHIQSGTLFSIFLGSIEMTNGCNLISDLNISLPLKLGIISFLCSFSGLSVIAQISSFMNDFNIS
YFKYISLKLIQGIFSFVITYLLIKIIPTSIVTSNFPVACTINPFMYLLPILLLLTLTIVLKIIYKLFFHTS
>Mature_390_residues
SYTIVVLWLFIILLTIILIKLLNIKSNILFCIICSIFIVLFILNIKQCTIAAIDGCKLWYSAVLPVTFPFLVICNLLISY
DGISLYSKLLGPLICKPLGLSKNCSFPIVASFLCGYPLGAKYSIDLWSLGSIDDKECQRLLNIASNVGPLFLIGSVGTAL
LNNTALGYILLIANYLSAIFIGLITKKNRTLRKPSSKSSINEKNLNFGQAIKNAIGNGVNTILSICGFIVIFSVIISLIK
NNAYINNIFDFLENLLHIQSGTLFSIFLGSIEMTNGCNLISDLNISLPLKLGIISFLCSFSGLSVIAQISSFMNDFNISY
FKYISLKLIQGIFSFVITYLLIKIIPTSIVTSNFPVACTINPFMYLLPILLLLTLTIVLKIIYKLFFHTS

Specific function: Required for spore cortex formation [H]

COG id: COG3314

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011642
- InterPro:   IPR014226 [H]

Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43209; Mature: 43078

Theoretical pI: Translated: 9.12; Mature: 9.12

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

3.3 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
3.3 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSYTIVVLWLFIILLTIILIKLLNIKSNILFCIICSIFIVLFILNIKQCTIAAIDGCKLW
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSAVLPVTFPFLVICNLLISYDGISLYSKLLGPLICKPLGLSKNCSFPIVASFLCGYPLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCC
AKYSIDLWSLGSIDDKECQRLLNIASNVGPLFLIGSVGTALLNNTALGYILLIANYLSAI
CCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIGLITKKNRTLRKPSSKSSINEKNLNFGQAIKNAIGNGVNTILSICGFIVIFSVIISLI
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNNAYINNIFDFLENLLHIQSGTLFSIFLGSIEMTNGCNLISDLNISLPLKLGIISFLCS
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCEEECCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
FSGLSVIAQISSFMNDFNISYFKYISLKLIQGIFSFVITYLLIKIIPTSIVTSNFPVACT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
INPFMYLLPILLLLTLTIVLKIIYKLFFHTS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SYTIVVLWLFIILLTIILIKLLNIKSNILFCIICSIFIVLFILNIKQCTIAAIDGCKLW
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSAVLPVTFPFLVICNLLISYDGISLYSKLLGPLICKPLGLSKNCSFPIVASFLCGYPLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCC
AKYSIDLWSLGSIDDKECQRLLNIASNVGPLFLIGSVGTALLNNTALGYILLIANYLSAI
CCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIGLITKKNRTLRKPSSKSSINEKNLNFGQAIKNAIGNGVNTILSICGFIVIFSVIISLI
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNNAYINNIFDFLENLLHIQSGTLFSIFLGSIEMTNGCNLISDLNISLPLKLGIISFLCS
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCEEECCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
FSGLSVIAQISSFMNDFNISYFKYISLKLIQGIFSFVITYLLIKIIPTSIVTSNFPVACT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
INPFMYLLPILLLLTLTIVLKIIYKLFFHTS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377; 12662922 [H]