Definition Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome.
Accession NC_010674
Length 3,800,327

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The map label for this gene is feoB2 [H]

Identifier: 187933829

GI number: 187933829

Start: 1863046

End: 1865196

Strand: Reverse

Name: feoB2 [H]

Synonym: CLL_A1781

Alternate gene names: 187933829

Gene position: 1865196-1863046 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187934762

Following gene: 187934803

Centisome position: 49.08

GC content: 30.4

Gene sequence:

>2151_bases
ATGGGGTTAACTAACCAGTCTACTGGCACTAATGCTTTAGATAAAGATTTAAATATTGTTAGAATCTCTAAAGATGATAA
AGTAATTGCACTTGCTGGTAATCCTAATGTTGGTAAAAGTACAGTTTTTAATAATTTAACTGGATTAAATCAACATACAG
GTAACTGGCCTGGAAAAACAGTAACTAATGCTACTGGGAAGTATATTCATAATAAAAAAGATTTTATTTTAGTTGATATT
CCTGGCACATATTCTCTTATGGCCAATTCAGTTGAAGAAGAGGTAGCTAGAGATTTTATATGTTTTGGAAACCCTGATGC
TACTGTTGTTATTGTTGATGCTACATGCCTTGAAAGAAACTTAAATCTAGTACTGCAAACACTTGAGATAACTGAAAATG
TTTTAGTTTGTGTTAATTTAATGAATGAAGCTAAACGAAAAGGTATAGTGATAAATTTAGAAAAACTTTCGTCTTTATTA
GGTGTTCCAGTAGTAGGCACAAGTGCAAATATTGGCAAAGGGCTTAAAGAGTTAAAAGATGAAATTTATAATTTATCTTT
TAATAGTATAAATAAAAACACTATTAGTATTAAATATAATTCATTTATAGAAGAGTCTATATTATTAATTGAAAAATCAC
TTCCAGATAACTTGAAAGATAAAATAAATACTAGATGGCTTTCTTTAAAACTATTAGAGGGTGATTTAACATTATTGTCT
TCAATAGATAATTATATTGGATTTAATTTGTTAGATGATACTGGTATTTCAAAGGCTATTTATAATGCTAAAGAATATTT
AAAAATTAATGGATTAGATGAAAATATGCTTAGAGATGATATTGTAACAACATTAGTACGTATCGCTGAGAAAGTAAGCA
AAGATGTAGTGGCTTTTAGTCTTGAAAAATATAATGATTTCGATAGAAAAATAGATAAAGTTTTAACTTCTAAAAAATTT
GGTATTCCTATAATGATATTACTTTTAGCTATAATATTTTGGATAACTATAACAGGAGCTAATATACCATCTGAAATGCT
TGCTACTGGATTGTTTTGGATTCAAGATAAGCTTTCAGCTTTCCTATTTTCTTTAGGGGCTCCTGTATGGTTAGATGGTG
TATTAATTCAAGGTGTGTATAGAACTCTTGCTTGGGTTGTTTCTGTAATGTTACCTCCTATGGCAATATTTTTTCCACTC
TTTACTTTGCTTGAAGACTTAGGCTACTTGCCTAGGATTGCTTATAATTTAGATAATTTCTTTAAAAAATCATGTGCTTG
TGGAAAACAAGCTCTTACAATGTGTATGGGATTTGGTTGTAATGCAGCAGGAATAATTGGATGTAGAATAATAGATTCCC
CAAGAGAAAGATTAATTGCTATTATAACAAATAACTTTGTTCCATGTAACGGACGATTCCCTACTTTAATTGCTATTATT
ACAATGTTTTTTGCAGGCATGTTTGTAGGACCATTTCAATCAATAGCATCTACCCTAATCTTAACTTGTGTAATACTTTT
AGGGGTATTTATGACACTTACAATTTCTAAAATATTATCAAAAACTATTTTGAAAGGAATTCCTTCTTCATTTACTTTAG
AATTACCACCTTATCGTAAACCACAAGTTGGTAAGATAATAGTTAGATCAATTTTTGATAGAACCTTATTCGTTCTTGGA
AGAGCTATCGTTGTTGCCGCACCAGCTGGTTTAGTTATCTGGTTAATGGCAAACTTAAATGTTAATGGACTTAGTATATT
AACTCACTGTGCTAATTTTCTTAATCCATTTGCTCACCTTATCGGATTGGATGGATATATACTTATGGCTTTTATATTAG
GGTTTCCTGCCAATGAAATTGTAATTCCAATAATCATTATGAGCTATATGGCAACAGGAAGCATAATTGAATTGAGTAGT
ACAGCACAGCTTCATAGCTTGCTTGTTGAAAATGGATGGACTTGGCTTACTGCTGTGTGTGTAATGCTTTTTTCTTTAAT
GCATTGGCCTTGCAGTACCACATGTTTAACAATAAAAAAAGAAACTCAAAGTTTAAAATGGACAGCTATTTCATTTTTAG
TTCCAACTATTACTGGAATCACTATATGTTTTATTGTTACATCGATAGTTAGACTGCTTGGACTCGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTAAAATTTTAGTGGAAACACTTTAATATTTAAGCTTATTTCTATCTAATCTATTAATTTTATAGATAAAATTTTAAGTA
ATGTATAAAGGAGCTTTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAAACAAATATAAACAATTACTTCTATAAACAAAAGAGAGGAAGGATTTTCACTGGTGAACAATACAGTGAAGATGCA
ATAAAAATTAATAATATTAC

Product: ferrous iron transport protein B

Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 716; Mature: 715

Protein sequence:

>716_residues
MGLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKTVTNATGKYIHNKKDFILVDI
PGTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERNLNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLL
GVPVVGTSANIGKGLKELKDEIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLS
SIDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFSLEKYNDFDRKIDKVLTSKKF
GIPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSAFLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPL
FTLLEDLGYLPRIAYNLDNFFKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAII
TMFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRKPQVGKIIVRSIFDRTLFVLG
RAIVVAAPAGLVIWLMANLNVNGLSILTHCANFLNPFAHLIGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSS
TAQLHSLLVENGWTWLTAVCVMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA

Sequences:

>Translated_716_residues
MGLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKTVTNATGKYIHNKKDFILVDI
PGTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERNLNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLL
GVPVVGTSANIGKGLKELKDEIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLS
SIDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFSLEKYNDFDRKIDKVLTSKKF
GIPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSAFLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPL
FTLLEDLGYLPRIAYNLDNFFKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAII
TMFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRKPQVGKIIVRSIFDRTLFVLG
RAIVVAAPAGLVIWLMANLNVNGLSILTHCANFLNPFAHLIGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSS
TAQLHSLLVENGWTWLTAVCVMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA
>Mature_715_residues
GLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKTVTNATGKYIHNKKDFILVDIP
GTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERNLNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLLG
VPVVGTSANIGKGLKELKDEIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLSS
IDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFSLEKYNDFDRKIDKVLTSKKFG
IPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSAFLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPLF
TLLEDLGYLPRIAYNLDNFFKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAIIT
MFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRKPQVGKIIVRSIFDRTLFVLGR
AIVVAAPAGLVIWLMANLNVNGLSILTHCANFLNPFAHLIGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSST
AQLHSLLVENGWTWLTAVCVMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA

Specific function: Not involved in Fe(2+) uptake but is involved in manganese uptake. Could be GTP-driven [H]

COG id: COG0370

COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=555, Percent_Identity=30.0900900900901, Blast_Score=216, Evalue=4e-57,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011640
- InterPro:   IPR011619
- InterPro:   IPR011642
- InterPro:   IPR006073
- InterPro:   IPR002917 [H]

Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78845; Mature: 78714

Theoretical pI: Translated: 8.15; Mature: 8.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.1 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
2.1 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKT
CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
VTNATGKYIHNKKDFILVDIPGTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERN
CCCCCCHHEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEEEHHHHHCC
LNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLLGVPVVGTSANIGKGLKELKD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
EIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLS
HHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCEEEEEEEECCHHHHHH
SIDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFS
HHHHHHCCEEECCCCHHHHHHCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEKYNDFDRKIDKVLTSKKFGIPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPLFTLLEDLGYLPRIAYNLDNF
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAII
HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHEEEEEECCEEECCCCCHHHHHHH
TMFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCC
PQVGKIIVRSIFDRTLFVLGRAIVVAAPAGLVIWLMANLNVNGLSILTHCANFLNPFAHL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSSTAQLHSLLVENGWTWLTAVC
HCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
VMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA
HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
GLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKT
CCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
VTNATGKYIHNKKDFILVDIPGTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERN
CCCCCCHHEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEEEHHHHHCC
LNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLLGVPVVGTSANIGKGLKELKD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
EIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLS
HHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCEEEEEEEECCHHHHHH
SIDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFS
HHHHHHCCEEECCCCHHHHHHCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEKYNDFDRKIDKVLTSKKFGIPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPLFTLLEDLGYLPRIAYNLDNF
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAII
HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHEEEEEECCEEECCCCCHHHHHHH
TMFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRK
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IGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSSTAQLHSLLVENGWTWLTAVC
HCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
VMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA
HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]

Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12949112 [H]