| Definition | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010674 |
| Length | 3,800,327 |
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The map label for this gene is feoB2 [H]
Identifier: 187933829
GI number: 187933829
Start: 1863046
End: 1865196
Strand: Reverse
Name: feoB2 [H]
Synonym: CLL_A1781
Alternate gene names: 187933829
Gene position: 1865196-1863046 (Counterclockwise)
Preceding gene: 187934762
Following gene: 187934803
Centisome position: 49.08
GC content: 30.4
Gene sequence:
>2151_bases ATGGGGTTAACTAACCAGTCTACTGGCACTAATGCTTTAGATAAAGATTTAAATATTGTTAGAATCTCTAAAGATGATAA AGTAATTGCACTTGCTGGTAATCCTAATGTTGGTAAAAGTACAGTTTTTAATAATTTAACTGGATTAAATCAACATACAG GTAACTGGCCTGGAAAAACAGTAACTAATGCTACTGGGAAGTATATTCATAATAAAAAAGATTTTATTTTAGTTGATATT CCTGGCACATATTCTCTTATGGCCAATTCAGTTGAAGAAGAGGTAGCTAGAGATTTTATATGTTTTGGAAACCCTGATGC TACTGTTGTTATTGTTGATGCTACATGCCTTGAAAGAAACTTAAATCTAGTACTGCAAACACTTGAGATAACTGAAAATG TTTTAGTTTGTGTTAATTTAATGAATGAAGCTAAACGAAAAGGTATAGTGATAAATTTAGAAAAACTTTCGTCTTTATTA GGTGTTCCAGTAGTAGGCACAAGTGCAAATATTGGCAAAGGGCTTAAAGAGTTAAAAGATGAAATTTATAATTTATCTTT TAATAGTATAAATAAAAACACTATTAGTATTAAATATAATTCATTTATAGAAGAGTCTATATTATTAATTGAAAAATCAC TTCCAGATAACTTGAAAGATAAAATAAATACTAGATGGCTTTCTTTAAAACTATTAGAGGGTGATTTAACATTATTGTCT TCAATAGATAATTATATTGGATTTAATTTGTTAGATGATACTGGTATTTCAAAGGCTATTTATAATGCTAAAGAATATTT AAAAATTAATGGATTAGATGAAAATATGCTTAGAGATGATATTGTAACAACATTAGTACGTATCGCTGAGAAAGTAAGCA AAGATGTAGTGGCTTTTAGTCTTGAAAAATATAATGATTTCGATAGAAAAATAGATAAAGTTTTAACTTCTAAAAAATTT GGTATTCCTATAATGATATTACTTTTAGCTATAATATTTTGGATAACTATAACAGGAGCTAATATACCATCTGAAATGCT TGCTACTGGATTGTTTTGGATTCAAGATAAGCTTTCAGCTTTCCTATTTTCTTTAGGGGCTCCTGTATGGTTAGATGGTG TATTAATTCAAGGTGTGTATAGAACTCTTGCTTGGGTTGTTTCTGTAATGTTACCTCCTATGGCAATATTTTTTCCACTC TTTACTTTGCTTGAAGACTTAGGCTACTTGCCTAGGATTGCTTATAATTTAGATAATTTCTTTAAAAAATCATGTGCTTG TGGAAAACAAGCTCTTACAATGTGTATGGGATTTGGTTGTAATGCAGCAGGAATAATTGGATGTAGAATAATAGATTCCC CAAGAGAAAGATTAATTGCTATTATAACAAATAACTTTGTTCCATGTAACGGACGATTCCCTACTTTAATTGCTATTATT ACAATGTTTTTTGCAGGCATGTTTGTAGGACCATTTCAATCAATAGCATCTACCCTAATCTTAACTTGTGTAATACTTTT AGGGGTATTTATGACACTTACAATTTCTAAAATATTATCAAAAACTATTTTGAAAGGAATTCCTTCTTCATTTACTTTAG AATTACCACCTTATCGTAAACCACAAGTTGGTAAGATAATAGTTAGATCAATTTTTGATAGAACCTTATTCGTTCTTGGA AGAGCTATCGTTGTTGCCGCACCAGCTGGTTTAGTTATCTGGTTAATGGCAAACTTAAATGTTAATGGACTTAGTATATT AACTCACTGTGCTAATTTTCTTAATCCATTTGCTCACCTTATCGGATTGGATGGATATATACTTATGGCTTTTATATTAG GGTTTCCTGCCAATGAAATTGTAATTCCAATAATCATTATGAGCTATATGGCAACAGGAAGCATAATTGAATTGAGTAGT ACAGCACAGCTTCATAGCTTGCTTGTTGAAAATGGATGGACTTGGCTTACTGCTGTGTGTGTAATGCTTTTTTCTTTAAT GCATTGGCCTTGCAGTACCACATGTTTAACAATAAAAAAAGAAACTCAAAGTTTAAAATGGACAGCTATTTCATTTTTAG TTCCAACTATTACTGGAATCACTATATGTTTTATTGTTACATCGATAGTTAGACTGCTTGGACTCGCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CTAAAATTTTAGTGGAAACACTTTAATATTTAAGCTTATTTCTATCTAATCTATTAATTTTATAGATAAAATTTTAAGTA ATGTATAAAGGAGCTTTTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAAACAAATATAAACAATTACTTCTATAAACAAAAGAGAGGAAGGATTTTCACTGGTGAACAATACAGTGAAGATGCA ATAAAAATTAATAATATTAC
Product: ferrous iron transport protein B
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 716; Mature: 715
Protein sequence:
>716_residues MGLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKTVTNATGKYIHNKKDFILVDI PGTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERNLNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLL GVPVVGTSANIGKGLKELKDEIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLS SIDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFSLEKYNDFDRKIDKVLTSKKF GIPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSAFLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPL FTLLEDLGYLPRIAYNLDNFFKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAII TMFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRKPQVGKIIVRSIFDRTLFVLG RAIVVAAPAGLVIWLMANLNVNGLSILTHCANFLNPFAHLIGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSS TAQLHSLLVENGWTWLTAVCVMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA
Sequences:
>Translated_716_residues MGLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKTVTNATGKYIHNKKDFILVDI PGTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERNLNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLL GVPVVGTSANIGKGLKELKDEIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLS SIDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFSLEKYNDFDRKIDKVLTSKKF GIPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSAFLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPL FTLLEDLGYLPRIAYNLDNFFKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAII TMFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRKPQVGKIIVRSIFDRTLFVLG RAIVVAAPAGLVIWLMANLNVNGLSILTHCANFLNPFAHLIGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSS TAQLHSLLVENGWTWLTAVCVMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA >Mature_715_residues GLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKTVTNATGKYIHNKKDFILVDIP GTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERNLNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLLG VPVVGTSANIGKGLKELKDEIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLSS IDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFSLEKYNDFDRKIDKVLTSKKFG IPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSAFLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPLF TLLEDLGYLPRIAYNLDNFFKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAIIT MFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRKPQVGKIIVRSIFDRTLFVLGR AIVVAAPAGLVIWLMANLNVNGLSILTHCANFLNPFAHLIGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSST AQLHSLLVENGWTWLTAVCVMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA
Specific function: Not involved in Fe(2+) uptake but is involved in manganese uptake. Could be GTP-driven [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=555, Percent_Identity=30.0900900900901, Blast_Score=216, Evalue=4e-57,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011619 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR006073 - InterPro: IPR002917 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78845; Mature: 78714
Theoretical pI: Translated: 8.15; Mature: 8.15
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.1 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 4.7 %Cys+Met (Translated Protein) 2.1 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 4.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKT CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC VTNATGKYIHNKKDFILVDIPGTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERN CCCCCCHHEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEEEHHHHHCC LNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLLGVPVVGTSANIGKGLKELKD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH EIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLS HHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCEEEEEEEECCHHHHHH SIDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFS HHHHHHCCEEECCCCHHHHHHCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEKYNDFDRKIDKVLTSKKFGIPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPLFTLLEDLGYLPRIAYNLDNF HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH FKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAII HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHEEEEEECCEEECCCCCHHHHHHH TMFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCC PQVGKIIVRSIFDRTLFVLGRAIVVAAPAGLVIWLMANLNVNGLSILTHCANFLNPFAHL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSSTAQLHSLLVENGWTWLTAVC HCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH VMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure GLTNQSTGTNALDKDLNIVRISKDDKVIALAGNPNVGKSTVFNNLTGLNQHTGNWPGKT CCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC VTNATGKYIHNKKDFILVDIPGTYSLMANSVEEEVARDFICFGNPDATVVIVDATCLERN CCCCCCHHEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEEEHHHHHCC LNLVLQTLEITENVLVCVNLMNEAKRKGIVINLEKLSSLLGVPVVGTSANIGKGLKELKD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH EIYNLSFNSINKNTISIKYNSFIEESILLIEKSLPDNLKDKINTRWLSLKLLEGDLTLLS HHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCEEEEEEEECCHHHHHH SIDNYIGFNLLDDTGISKAIYNAKEYLKINGLDENMLRDDIVTTLVRIAEKVSKDVVAFS HHHHHHCCEEECCCCHHHHHHCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEKYNDFDRKIDKVLTSKKFGIPIMILLLAIIFWITITGANIPSEMLATGLFWIQDKLSA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FLFSLGAPVWLDGVLIQGVYRTLAWVVSVMLPPMAIFFPLFTLLEDLGYLPRIAYNLDNF HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH FKKSCACGKQALTMCMGFGCNAAGIIGCRIIDSPRERLIAIITNNFVPCNGRFPTLIAII HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHEEEEEECCEEECCCCCHHHHHHH TMFFAGMFVGPFQSIASTLILTCVILLGVFMTLTISKILSKTILKGIPSSFTLELPPYRK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCC PQVGKIIVRSIFDRTLFVLGRAIVVAAPAGLVIWLMANLNVNGLSILTHCANFLNPFAHL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGLDGYILMAFILGFPANEIVIPIIIMSYMATGSIIELSSTAQLHSLLVENGWTWLTAVC HCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH VMLFSLMHWPCSTTCLTIKKETQSLKWTAISFLVPTITGITICFIVTSIVRLLGLA HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12949112 [H]