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The map label for this gene is ykuC [H]

Identifier: 187932489

GI number: 187932489

Start: 2806623

End: 2807906

Strand: Reverse

Name: ykuC [H]

Synonym: CLL_A2692

Alternate gene names: 187932489

Gene position: 2807906-2806623 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187933610

Following gene: 187935167

Centisome position: 73.89

GC content: 25.23

Gene sequence:

>1284_bases
ATGGAAAATAAAATAAAACTTTTAAACAAAAATTTTATCTTAATGGTAATAGGACAAATAATATCTCTTTTTGGGAATGC
AATTCTAAGGTTTGCTTTACCACTATATCTTCTAGAGAAAACAGGGTCAGCTACAGTGTTTGGATTAGTATCAGCATGTG
CATTTATTCCTATGATTTTAATGACTCCATTTGGTGGAATTATAGCAGATAGGGTAAATAAAAAATATGTCATGGTTGTG
TTAGATTTAATTACAGCATTAATAATTATTGCTTTTACAATTTTTATTGGAAATACAAATTTGGTATTTTTGATAATTAT
AACTTTAATGATTTTATATGGGATACAGGGAGCATATCAACCATCAGTACAAGCTAGTTTACCTTTTTTAGTAGATAGAC
AAGATTTATTAAAGGGAAATGCAATTATTAATCAAGTTAATGCTTTAGCTAATTTAATTGGACCAATAATAGGTGGTTTT
CTATATGGAGTATATGGATTAACACCAATATTAATAGCAAGTATCGTTTGTTTTATTTTAGCTATAGTTATGGAAATGAT
TATGAAAATACCTTATACAAAAAATGAAACCAAAGATAGTATAGTTTCAATAGTAAAGGATGATATAAAATCCAGTATAA
ACTTTATTGTTAAAGAAAAGCCAGTGATATTTAAAACTATTATTATAATTTCACTTTTTAATTTAGTTTTAACTTCAATG
ATAATAATAGGAATACCAGTAATTATTACAATTACTTTGAATATGTCTAGCAAAGCTTATGGAATAACACAAGGAAGTAT
AGCATTAGGAGGATTATTTGGAGGCGCTTTAATAGGAGTAGTAGTTAAAAAGTTGAAAATGTCTAATAGTTATTTAATAC
TACTTTTTGATATATTAGCCTTAATTCCTATTAGCTTAACTCTTATGTTTAAAGTACCAGCTACAATATCATACATTATC
ATAACTGTTTGTTGCTTTTTTATTATGACTGTATCTACTATATTTAGTATTCAAATGATAACTTTTATACAAGGGGAAAC
ACCAGGATATTTAATAGGAAAAGTAATTTCAATTTGTTTAGCTATAGGAATGTGTGCACAACCAATAGGACAATTAATAT
ATGGATATATTTTTGAAATTTTAAAAGATAATACTTCATTAATAATTTTTGGTGCATTCATATTTGGTGGAATAATTGTA
TTTATATCAAAAAAAGTTTTTAGTAAATTAAAAGCTTTTGAAAAATCAGAAGTAGAACAATTTAAAATTATTGTTGAGGA
ATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAATTGAAGATAGTAAAAAGTAACTGCCTACATGGCAGTTTAATTTTAGAAAATTACATACCGCATGAATGTATGTAAT
TTATTTGTTAGGAGGACAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTAAGTTTTAAAGAGAGGGATGAAAAGATGGAAAGTGTACTGAAAATAATAAAATATATAATAATTAAAATATTAAATA
TTTTAGTAGGAATACCATTA

Product: macrolide-efflux protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 427; Mature: 427

Protein sequence:

>427_residues
MENKIKLLNKNFILMVIGQIISLFGNAILRFALPLYLLEKTGSATVFGLVSACAFIPMILMTPFGGIIADRVNKKYVMVV
LDLITALIIIAFTIFIGNTNLVFLIIITLMILYGIQGAYQPSVQASLPFLVDRQDLLKGNAIINQVNALANLIGPIIGGF
LYGVYGLTPILIASIVCFILAIVMEMIMKIPYTKNETKDSIVSIVKDDIKSSINFIVKEKPVIFKTIIIISLFNLVLTSM
IIIGIPVIITITLNMSSKAYGITQGSIALGGLFGGALIGVVVKKLKMSNSYLILLFDILALIPISLTLMFKVPATISYII
ITVCCFFIMTVSTIFSIQMITFIQGETPGYLIGKVISICLAIGMCAQPIGQLIYGYIFEILKDNTSLIIFGAFIFGGIIV
FISKKVFSKLKAFEKSEVEQFKIIVEE

Sequences:

>Translated_427_residues
MENKIKLLNKNFILMVIGQIISLFGNAILRFALPLYLLEKTGSATVFGLVSACAFIPMILMTPFGGIIADRVNKKYVMVV
LDLITALIIIAFTIFIGNTNLVFLIIITLMILYGIQGAYQPSVQASLPFLVDRQDLLKGNAIINQVNALANLIGPIIGGF
LYGVYGLTPILIASIVCFILAIVMEMIMKIPYTKNETKDSIVSIVKDDIKSSINFIVKEKPVIFKTIIIISLFNLVLTSM
IIIGIPVIITITLNMSSKAYGITQGSIALGGLFGGALIGVVVKKLKMSNSYLILLFDILALIPISLTLMFKVPATISYII
ITVCCFFIMTVSTIFSIQMITFIQGETPGYLIGKVISICLAIGMCAQPIGQLIYGYIFEILKDNTSLIIFGAFIFGGIIV
FISKKVFSKLKAFEKSEVEQFKIIVEE
>Mature_427_residues
MENKIKLLNKNFILMVIGQIISLFGNAILRFALPLYLLEKTGSATVFGLVSACAFIPMILMTPFGGIIADRVNKKYVMVV
LDLITALIIIAFTIFIGNTNLVFLIIITLMILYGIQGAYQPSVQASLPFLVDRQDLLKGNAIINQVNALANLIGPIIGGF
LYGVYGLTPILIASIVCFILAIVMEMIMKIPYTKNETKDSIVSIVKDDIKSSINFIVKEKPVIFKTIIIISLFNLVLTSM
IIIGIPVIITITLNMSSKAYGITQGSIALGGLFGGALIGVVVKKLKMSNSYLILLFDILALIPISLTLMFKVPATISYII
ITVCCFFIMTVSTIFSIQMITFIQGETPGYLIGKVISICLAIGMCAQPIGQLIYGYIFEILKDNTSLIIFGAFIFGGIIV
FISKKVFSKLKAFEKSEVEQFKIIVEE

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004751
- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46771; Mature: 46771

Theoretical pI: Translated: 9.47; Mature: 9.47

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
5.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MENKIKLLNKNFILMVIGQIISLFGNAILRFALPLYLLEKTGSATVFGLVSACAFIPMIL
CCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
MTPFGGIIADRVNKKYVMVVLDLITALIIIAFTIFIGNTNLVFLIIITLMILYGIQGAYQ
HCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PSVQASLPFLVDRQDLLKGNAIINQVNALANLIGPIIGGFLYGVYGLTPILIASIVCFIL
CCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIVMEMIMKIPYTKNETKDSIVSIVKDDIKSSINFIVKEKPVIFKTIIIISLFNLVLTSM
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIIGIPVIITITLNMSSKAYGITQGSIALGGLFGGALIGVVVKKLKMSNSYLILLFDILA
HHHCCHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
LIPISLTLMFKVPATISYIIITVCCFFIMTVSTIFSIQMITFIQGETPGYLIGKVISICL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
AIGMCAQPIGQLIYGYIFEILKDNTSLIIFGAFIFGGIIVFISKKVFSKLKAFEKSEVEQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKIIVEE
HHEEECC
>Mature Secondary Structure
MENKIKLLNKNFILMVIGQIISLFGNAILRFALPLYLLEKTGSATVFGLVSACAFIPMIL
CCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
MTPFGGIIADRVNKKYVMVVLDLITALIIIAFTIFIGNTNLVFLIIITLMILYGIQGAYQ
HCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PSVQASLPFLVDRQDLLKGNAIINQVNALANLIGPIIGGFLYGVYGLTPILIASIVCFIL
CCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIVMEMIMKIPYTKNETKDSIVSIVKDDIKSSINFIVKEKPVIFKTIIIISLFNLVLTSM
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIIGIPVIITITLNMSSKAYGITQGSIALGGLFGGALIGVVVKKLKMSNSYLILLFDILA
HHHCCHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
LIPISLTLMFKVPATISYIIITVCCFFIMTVSTIFSIQMITFIQGETPGYLIGKVISICL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
AIGMCAQPIGQLIYGYIFEILKDNTSLIIFGAFIFGGIIVFISKKVFSKLKAFEKSEVEQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKIIVEE
HHEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]