| Definition | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010674 |
| Length | 3,800,327 |
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The map label for this gene is bceB [H]
Identifier: 187932416
GI number: 187932416
Start: 1153128
End: 1154672
Strand: Reverse
Name: bceB [H]
Synonym: CLL_A1123
Alternate gene names: 187932416
Gene position: 1154672-1153128 (Counterclockwise)
Preceding gene: 187933678
Following gene: 187935169
Centisome position: 30.38
GC content: 23.43
Gene sequence:
>1545_bases ATGATATTTAAGTTGGCTTTTATAAATAGTAAAAAATACATAAATAACTACATAGTTTACCTAACTTTTCTTTCTATAGA AACTGCCTTATTCTTCTTTTTTTCATCTCTACCTTATAGTAGTTCTATTTCATATTTGTCAAATGACTTTAAAGTAAGCA TGAAATTAATAATTCCCCTTATGTCATTTTGTGTATTTATCTCCATATTTTTACTCGTTAGACTTACAAATAAAGTTGTA TTAAAAAGAAGATATAGTGAATTTGCTCTATACATATCCCTAGGAATGGAGCTCTGGTATATTTCACTGATACTTTTAGT TGAAATCTTAATACTTGGAATGCTTTCATTGATTTTAGGGTTATTTTTAGGTTCTCTATTATGCCAAGGATGGGATTTTT TTCTTTGTTCATTATTTGATATAAATCCAATGTGGATTCATTTTTCCTTTTCATTTTCAACATTTAAAAATACCATTTTA TTATTTTTGCTTCTATTTATTGTAGTATGGTTACTAAACTGTTTTTCTCTTTACTTTTATACTCCACTTAAGCTAATACA CTTAAATAGTCAAAAAAAACTAAATAATGGAGTAATAAAAAAAATTAATATCAGCTTATGCTTTGTATCATTAATTTTAT TGCTTTGGATTTATACAAAATTATTTTCATTTCATTTTAATAAAGATATTTTAATTAAGCTTTTAACCTTTTCCCCATTT TTAATAGGTCTAACATACTTATTTTATTATTCGCTTTGTGATGTAGTTTTCCTAGTTTTCGAAAGATTTAATAAGCTTTA CTGTAAAGGAATTAATTTATTTACTGTTAAAAACCTTTGTAACAAAATTAAGAATACTTGGTTTTTTTTAGCTACTATAT CACTGCTTTTAGTATTTTCTTGTAGCACTATTTTTCTTGGTGCACTATTTAAAATTACAATAAAAAATACATACACTCTT AACTCAACAGATGACCTGGAATTTTATATTAATGAAGCATTAAAAAGAGAAGAAATAGAACATTACTTAATTGAAAATAA CATAAAAGACTTCTCCTTAACAGAAGTTTATATTGGTTTAAAAGAAAACGAACCCATGAGAAAAGATTCCCTAAAAAAAA TTTCAATTAAAATAAATTCTCCCTATAATAGGGAACAAATTATGAATTTAAGTAATAAAATTGAAGAACTCCATAAAAAT AGCCAAAATACTTTACAAGGAAAGCTTTATTTTATTGATGAGAATAAAATAAACAATCTAATAACTTTATTATTTTCCTT TTATATTGGTATAACCTCTCTACTTACTGCAATAAGCCTAATAGTAATGGAAATATTAATAGAAAAAATAGATAGAAAAA AAGACTATATAATATTAAATGATATTGGTATTGATAGCAGTTGTTTAAAAGCTTCATCTTACTTTATAAATACAATTTAT TTTTTTGTTCCATTTATTTTAGCTCTTCCACATATTATTTTAGCTATAATTTTCACTATAAAATATCTAACTTCATTATA TGGAACTATATTTTTTAATATGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGAAAGGTATTTACTGAAATATATAAGGGTGATTTAGATAATTCAATCTTTTTTAATAAAATTTTAAATGTAGTTTCACT TTTAGGAGGGAATACTTTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TCCTACAGAAATGTAGGATTTTTTTATCTAACAAAAATGTAATGTAAAAGACATCTTATTCAATGTTTTTTAAATCAAAA TTACTTTAAAGTATTACTTG
Product: ABC transporter permease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 514; Mature: 514
Protein sequence:
>514_residues MIFKLAFINSKKYINNYIVYLTFLSIETALFFFFSSLPYSSSISYLSNDFKVSMKLIIPLMSFCVFISIFLLVRLTNKVV LKRRYSEFALYISLGMELWYISLILLVEILILGMLSLILGLFLGSLLCQGWDFFLCSLFDINPMWIHFSFSFSTFKNTIL LFLLLFIVVWLLNCFSLYFYTPLKLIHLNSQKKLNNGVIKKINISLCFVSLILLLWIYTKLFSFHFNKDILIKLLTFSPF LIGLTYLFYYSLCDVVFLVFERFNKLYCKGINLFTVKNLCNKIKNTWFFLATISLLLVFSCSTIFLGALFKITIKNTYTL NSTDDLEFYINEALKREEIEHYLIENNIKDFSLTEVYIGLKENEPMRKDSLKKISIKINSPYNREQIMNLSNKIEELHKN SQNTLQGKLYFIDENKINNLITLLFSFYIGITSLLTAISLIVMEILIEKIDRKKDYIILNDIGIDSSCLKASSYFINTIY FFVPFILALPHIILAIIFTIKYLTSLYGTIFFNM
Sequences:
>Translated_514_residues MIFKLAFINSKKYINNYIVYLTFLSIETALFFFFSSLPYSSSISYLSNDFKVSMKLIIPLMSFCVFISIFLLVRLTNKVV LKRRYSEFALYISLGMELWYISLILLVEILILGMLSLILGLFLGSLLCQGWDFFLCSLFDINPMWIHFSFSFSTFKNTIL LFLLLFIVVWLLNCFSLYFYTPLKLIHLNSQKKLNNGVIKKINISLCFVSLILLLWIYTKLFSFHFNKDILIKLLTFSPF LIGLTYLFYYSLCDVVFLVFERFNKLYCKGINLFTVKNLCNKIKNTWFFLATISLLLVFSCSTIFLGALFKITIKNTYTL NSTDDLEFYINEALKREEIEHYLIENNIKDFSLTEVYIGLKENEPMRKDSLKKISIKINSPYNREQIMNLSNKIEELHKN SQNTLQGKLYFIDENKINNLITLLFSFYIGITSLLTAISLIVMEILIEKIDRKKDYIILNDIGIDSSCLKASSYFINTIY FFVPFILALPHIILAIIFTIKYLTSLYGTIFFNM >Mature_514_residues MIFKLAFINSKKYINNYIVYLTFLSIETALFFFFSSLPYSSSISYLSNDFKVSMKLIIPLMSFCVFISIFLLVRLTNKVV LKRRYSEFALYISLGMELWYISLILLVEILILGMLSLILGLFLGSLLCQGWDFFLCSLFDINPMWIHFSFSFSTFKNTIL LFLLLFIVVWLLNCFSLYFYTPLKLIHLNSQKKLNNGVIKKINISLCFVSLILLLWIYTKLFSFHFNKDILIKLLTFSPF LIGLTYLFYYSLCDVVFLVFERFNKLYCKGINLFTVKNLCNKIKNTWFFLATISLLLVFSCSTIFLGALFKITIKNTYTL NSTDDLEFYINEALKREEIEHYLIENNIKDFSLTEVYIGLKENEPMRKDSLKKISIKINSPYNREQIMNLSNKIEELHKN SQNTLQGKLYFIDENKINNLITLLFSFYIGITSLLTAISLIVMEILIEKIDRKKDYIILNDIGIDSSCLKASSYFINTIY FFVPFILALPHIILAIIFTIKYLTSLYGTIFFNM
Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60219; Mature: 60219
Theoretical pI: Translated: 9.19; Mature: 9.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.9 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.9 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIFKLAFINSKKYINNYIVYLTFLSIETALFFFFSSLPYSSSISYLSNDFKVSMKLIIPL CEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH MSFCVFISIFLLVRLTNKVVLKRRYSEFALYISLGMELWYISLILLVEILILGMLSLILG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFLGSLLCQGWDFFLCSLFDINPMWIHFSFSFSTFKNTILLFLLLFIVVWLLNCFSLYFY HHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TPLKLIHLNSQKKLNNGVIKKINISLCFVSLILLLWIYTKLFSFHFNKDILIKLLTFSPF CCCCEEEECCHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHH LIGLTYLFYYSLCDVVFLVFERFNKLYCKGINLFTVKNLCNKIKNTWFFLATISLLLVFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CSTIFLGALFKITIKNTYTLNSTDDLEFYINEALKREEIEHYLIENNIKDFSLTEVYIGL HHHHHHHHHHEEEEECEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHEEEEE KENEPMRKDSLKKISIKINSPYNREQIMNLSNKIEELHKNSQNTLQGKLYFIDENKINNL CCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCHHHHH ITLLFSFYIGITSLLTAISLIVMEILIEKIDRKKDYIILNDIGIDSSCLKASSYFINTIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH FFVPFILALPHIILAIIFTIKYLTSLYGTIFFNM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MIFKLAFINSKKYINNYIVYLTFLSIETALFFFFSSLPYSSSISYLSNDFKVSMKLIIPL CEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH MSFCVFISIFLLVRLTNKVVLKRRYSEFALYISLGMELWYISLILLVEILILGMLSLILG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFLGSLLCQGWDFFLCSLFDINPMWIHFSFSFSTFKNTILLFLLLFIVVWLLNCFSLYFY HHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TPLKLIHLNSQKKLNNGVIKKINISLCFVSLILLLWIYTKLFSFHFNKDILIKLLTFSPF CCCCEEEECCHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHH LIGLTYLFYYSLCDVVFLVFERFNKLYCKGINLFTVKNLCNKIKNTWFFLATISLLLVFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CSTIFLGALFKITIKNTYTLNSTDDLEFYINEALKREEIEHYLIENNIKDFSLTEVYIGL HHHHHHHHHHEEEEECEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHEEEEE KENEPMRKDSLKKISIKINSPYNREQIMNLSNKIEELHKNSQNTLQGKLYFIDENKINNL CCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCHHHHH ITLLFSFYIGITSLLTAISLIVMEILIEKIDRKKDYIILNDIGIDSSCLKASSYFINTIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH FFVPFILALPHIILAIIFTIKYLTSLYGTIFFNM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 10086842; 11058132 [H]