Definition | Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010673 |
Length | 922,307 |
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The map label for this gene is 187918541
Identifier: 187918541
GI number: 187918541
Start: 732478
End: 733752
Strand: Direct
Name: 187918541
Synonym: BH0685
Alternate gene names: NA
Gene position: 732478-733752 (Clockwise)
Preceding gene: 187918540
Following gene: 187918542
Centisome position: 79.42
GC content: 31.22
Gene sequence:
>1275_bases ATGTTAAGAGTTTTAAGGATTTTTATGAGACTTAGTGAGAATTTTAGAAATAAAAATATTTCAGATAAAAGACAAGAGAT AAAGAGTATTTTAAAATTGAATCCTTGCGATTTTTTTTATGATTCTGTTGATGAGAATTTTCTTTGTCACATGATAGAGA ATTATGTTGGGTATTTATCCTTGCCCATTGGCATTGTAAAAAATTTGAAGGTAAATGGAAAGTATTATGCTGTACCTATT GCTACAGAGGAATCTTCAGTTATTGCCGCATTAAATTTTGCAGCTAAGATTCTTGAGAGCGCTAATTTAAGTTATTCTGT GGGTGAAGTGTTAGGTATTGCTCAAGTTTATATAAGAACAGATAAAGATTTAAGTGATATGCTCCTTAGTCTTTTTGAAA AAATTGATCTTTGGTCTAAGCCTCTTTTGCATAATATGGAGCTTAGGGGTGGCGGATTTAGAAGGCTTTCGACTAAGTTT ATTAAGGAAATTGGTATTCAAAAATTAAATATTTATGTAGATGTTTGTGATGCTATGGGTTCAAATTTGCTGAATTCGGT AGCTGAAAGGGTGGCTCATCATATTACTTTGGAGTTTGGATATGAGTGTGTTTTAAAAATTTTAAGCAATGATTCAAATG ATTTTGTTATAAAAGCTAATTTTAAATTAAATGTTAATGCTTTGCTTAAAGATAATGAAGAATCTTTGGCTTTGGCTCAA AATATATCTCTTATTTCTAAGATAGGATTTTTTGAAGAGGAACGTGCTGTTACTAATAATAAAGGTATTATGAATGGCAT AACGGGTTTATGTGTCGCTACACTTAATGATACAAGGGCTCTTGCTGCATGCATACATAAGTTTGCCTCAAGAAGTGGTA GATATTTACCTCTTAGCAAATTTTATATTTCTGATGAAAATTTAATTGGAGAGATTGAATTGCCTTTACAAGTTGGAGTT AAAGGAGGTTCAGCTAGTTCTCATGAAGCAGCTATATTGAGCTTTAAGATTATGGGAATTGATTGCAAAGAGGAATTTAT GGGTATTCTCTCTTGTGTTGGTCTTGCAAGTAATTTTGCGGCTTTAAGAGCACTTGCTCTTGATGGAATTCAAAGAGGGC ATATGAAACTTCATGTTAATAAGATTTTATATCTTCTTAAAAGGGATTATAATCTTTCAAGTGATGAGATAGAAAAAATA TTATTGAAAATGAGTGACAGTGGAATTTATTCTCTTGATTTTGCTCTTAAACTTTTAAAGGATTTGCGAGTGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TATGAATATGTTTTAAAGATGTCTATGCTTTTAAGTAATAGTAAAAATTTGGTACAGTTTAGGTTAAATAAATATTTCTT AAGTCATCCGTTGTCGTTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTGAAGATTAGATGTAAGGCAAATCCTAGTTTGGCGTTAATTAAGTATTGGGGCAAGAGAGATAAATTTTTGAATATTC CAGCTACTTCAAGCATTGCC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: HMG-CoA reductase [H]
Number of amino acids: Translated: 424; Mature: 424
Protein sequence:
>424_residues MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLSLPIGIVKNLKVNGKYYAVPI ATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRTDKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKF IKEIGIQKLNIYVDVCDAMGSNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSKFYISDENLIGEIELPLQVGV KGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFAALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKI LLKMSDSGIYSLDFALKLLKDLRV
Sequences:
>Translated_424_residues MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLSLPIGIVKNLKVNGKYYAVPI ATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRTDKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKF IKEIGIQKLNIYVDVCDAMGSNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSKFYISDENLIGEIELPLQVGV KGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFAALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKI LLKMSDSGIYSLDFALKLLKDLRV >Mature_424_residues MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLSLPIGIVKNLKVNGKYYAVPI ATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRTDKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKF IKEIGIQKLNIYVDVCDAMGSNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSKFYISDENLIGEIELPLQVGV KGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFAALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKI LLKMSDSGIYSLDFALKLLKDLRV
Specific function: Converts HMG-CoA to mevalonate [H]
COG id: COG1257
COG function: function code I; Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the HMG-CoA reductase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002202 - InterPro: IPR004553 - InterPro: IPR023074 - InterPro: IPR009023 - InterPro: IPR009029 [H]
Pfam domain/function: PF00368 HMG-CoA_red [H]
EC number: =1.1.1.88 [H]
Molecular weight: Translated: 47418; Mature: 47418
Theoretical pI: Translated: 7.75; Mature: 7.75
Prosite motif: PS50065 HMG_COA_REDUCTASE_4
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.9 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.9 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLS CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LPIGIVKNLKVNGKYYAVPIATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRT HHHHHHHCEEECCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEC DKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKFIKEIGIQKLNIYVDVCDAMG CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEHHHHH SNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ HHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHH NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSK HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHE FYISDENLIGEIELPLQVGVKGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFA EEECCCCCEEEEEECEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKILLKMSDSGIYSLDFALKLLK HHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHH DLRV HHCC >Mature Secondary Structure MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLS CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LPIGIVKNLKVNGKYYAVPIATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRT HHHHHHHCEEECCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEC DKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKFIKEIGIQKLNIYVDVCDAMG CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEHHHHH SNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ HHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHH NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSK HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHE FYISDENLIGEIELPLQVGVKGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFA EEECCCCCEEEEEECEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKILLKMSDSGIYSLDFALKLLK HHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHH DLRV HHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9403685 [H]