Definition Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome.
Accession NC_010673
Length 922,307

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The map label for this gene is 187918541

Identifier: 187918541

GI number: 187918541

Start: 732478

End: 733752

Strand: Direct

Name: 187918541

Synonym: BH0685

Alternate gene names: NA

Gene position: 732478-733752 (Clockwise)

Preceding gene: 187918540

Following gene: 187918542

Centisome position: 79.42

GC content: 31.22

Gene sequence:

>1275_bases
ATGTTAAGAGTTTTAAGGATTTTTATGAGACTTAGTGAGAATTTTAGAAATAAAAATATTTCAGATAAAAGACAAGAGAT
AAAGAGTATTTTAAAATTGAATCCTTGCGATTTTTTTTATGATTCTGTTGATGAGAATTTTCTTTGTCACATGATAGAGA
ATTATGTTGGGTATTTATCCTTGCCCATTGGCATTGTAAAAAATTTGAAGGTAAATGGAAAGTATTATGCTGTACCTATT
GCTACAGAGGAATCTTCAGTTATTGCCGCATTAAATTTTGCAGCTAAGATTCTTGAGAGCGCTAATTTAAGTTATTCTGT
GGGTGAAGTGTTAGGTATTGCTCAAGTTTATATAAGAACAGATAAAGATTTAAGTGATATGCTCCTTAGTCTTTTTGAAA
AAATTGATCTTTGGTCTAAGCCTCTTTTGCATAATATGGAGCTTAGGGGTGGCGGATTTAGAAGGCTTTCGACTAAGTTT
ATTAAGGAAATTGGTATTCAAAAATTAAATATTTATGTAGATGTTTGTGATGCTATGGGTTCAAATTTGCTGAATTCGGT
AGCTGAAAGGGTGGCTCATCATATTACTTTGGAGTTTGGATATGAGTGTGTTTTAAAAATTTTAAGCAATGATTCAAATG
ATTTTGTTATAAAAGCTAATTTTAAATTAAATGTTAATGCTTTGCTTAAAGATAATGAAGAATCTTTGGCTTTGGCTCAA
AATATATCTCTTATTTCTAAGATAGGATTTTTTGAAGAGGAACGTGCTGTTACTAATAATAAAGGTATTATGAATGGCAT
AACGGGTTTATGTGTCGCTACACTTAATGATACAAGGGCTCTTGCTGCATGCATACATAAGTTTGCCTCAAGAAGTGGTA
GATATTTACCTCTTAGCAAATTTTATATTTCTGATGAAAATTTAATTGGAGAGATTGAATTGCCTTTACAAGTTGGAGTT
AAAGGAGGTTCAGCTAGTTCTCATGAAGCAGCTATATTGAGCTTTAAGATTATGGGAATTGATTGCAAAGAGGAATTTAT
GGGTATTCTCTCTTGTGTTGGTCTTGCAAGTAATTTTGCGGCTTTAAGAGCACTTGCTCTTGATGGAATTCAAAGAGGGC
ATATGAAACTTCATGTTAATAAGATTTTATATCTTCTTAAAAGGGATTATAATCTTTCAAGTGATGAGATAGAAAAAATA
TTATTGAAAATGAGTGACAGTGGAATTTATTCTCTTGATTTTGCTCTTAAACTTTTAAAGGATTTGCGAGTGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGAATATGTTTTAAAGATGTCTATGCTTTTAAGTAATAGTAAAAATTTGGTACAGTTTAGGTTAAATAAATATTTCTT
AAGTCATCCGTTGTCGTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTGAAGATTAGATGTAAGGCAAATCCTAGTTTGGCGTTAATTAAGTATTGGGGCAAGAGAGATAAATTTTTGAATATTC
CAGCTACTTCAAGCATTGCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: HMG-CoA reductase [H]

Number of amino acids: Translated: 424; Mature: 424

Protein sequence:

>424_residues
MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLSLPIGIVKNLKVNGKYYAVPI
ATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRTDKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKF
IKEIGIQKLNIYVDVCDAMGSNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ
NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSKFYISDENLIGEIELPLQVGV
KGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFAALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKI
LLKMSDSGIYSLDFALKLLKDLRV

Sequences:

>Translated_424_residues
MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLSLPIGIVKNLKVNGKYYAVPI
ATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRTDKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKF
IKEIGIQKLNIYVDVCDAMGSNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ
NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSKFYISDENLIGEIELPLQVGV
KGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFAALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKI
LLKMSDSGIYSLDFALKLLKDLRV
>Mature_424_residues
MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLSLPIGIVKNLKVNGKYYAVPI
ATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRTDKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKF
IKEIGIQKLNIYVDVCDAMGSNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ
NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSKFYISDENLIGEIELPLQVGV
KGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFAALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKI
LLKMSDSGIYSLDFALKLLKDLRV

Specific function: Converts HMG-CoA to mevalonate [H]

COG id: COG1257

COG function: function code I; Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the HMG-CoA reductase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002202
- InterPro:   IPR004553
- InterPro:   IPR023074
- InterPro:   IPR009023
- InterPro:   IPR009029 [H]

Pfam domain/function: PF00368 HMG-CoA_red [H]

EC number: =1.1.1.88 [H]

Molecular weight: Translated: 47418; Mature: 47418

Theoretical pI: Translated: 7.75; Mature: 7.75

Prosite motif: PS50065 HMG_COA_REDUCTASE_4

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLS
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LPIGIVKNLKVNGKYYAVPIATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRT
HHHHHHHCEEECCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEC
DKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKFIKEIGIQKLNIYVDVCDAMG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEHHHHH
SNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ
HHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHH
NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSK
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHE
FYISDENLIGEIELPLQVGVKGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFA
EEECCCCCEEEEEECEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKILLKMSDSGIYSLDFALKLLK
HHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHH
DLRV
HHCC
>Mature Secondary Structure
MLRVLRIFMRLSENFRNKNISDKRQEIKSILKLNPCDFFYDSVDENFLCHMIENYVGYLS
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LPIGIVKNLKVNGKYYAVPIATEESSVIAALNFAAKILESANLSYSVGEVLGIAQVYIRT
HHHHHHHCEEECCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEC
DKDLSDMLLSLFEKIDLWSKPLLHNMELRGGGFRRLSTKFIKEIGIQKLNIYVDVCDAMG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEHHHHH
SNLLNSVAERVAHHITLEFGYECVLKILSNDSNDFVIKANFKLNVNALLKDNEESLALAQ
HHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHH
NISLISKIGFFEEERAVTNNKGIMNGITGLCVATLNDTRALAACIHKFASRSGRYLPLSK
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHE
FYISDENLIGEIELPLQVGVKGGSASSHEAAILSFKIMGIDCKEEFMGILSCVGLASNFA
EEECCCCCEEEEEECEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALRALALDGIQRGHMKLHVNKILYLLKRDYNLSSDEIEKILLKMSDSGIYSLDFALKLLK
HHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHH
DLRV
HHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9403685 [H]