| Definition | Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010673 |
| Length | 922,307 |
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The map label for this gene is cheA [H]
Identifier: 187918525
GI number: 187918525
Start: 712829
End: 715399
Strand: Direct
Name: cheA [H]
Synonym: BH0669
Alternate gene names: 187918525
Gene position: 712829-715399 (Clockwise)
Preceding gene: 187918524
Following gene: 187918526
Centisome position: 77.29
GC content: 32.05
Gene sequence:
>2571_bases ATGCTAGATTCAGATAGTAAAGAGCTTTTAGAGATTTTTTTTGAGGAAGCTCAGAATCTTGTAGATACTCTTGAAGAGAA TATTATGTCATTAGAGGATGACCCTAATAATGCAGAAACTATTGATGAGATATTTAGGGCGGCACATACTCTTAAGGGCG GTTCAGCTTCTGTTGATATGATGGAACTCTCAGGTTTTACTCATGTTGTTGAGGATGTATTTGATGCTATTAGAGATAAT AAATTAAAGATATGCAATGATCTTGTTGATTTACTTTTAAATGCGCTTGATGTAATAAAAGGCATGCTTGATGCACGTCT TAATGGAGATGTTTATTTACAAGATGTAAGCGAGCTTAAAAATAAATTAAGAGGGTTTTTAGGAGACGAGCATCAGACAG CTTCTGTTGTATCTTTAGAGAATATAAATGATGATGAATTTTTGCTTTCTTCCCGTGAACTTAGTGATATGCGCGAAGTT GTAGGACTTGAGCAAAAGGTTTTAAGAGTTAGTATTTATTTTGATCAAGATAATCCTATGGCTACAATTGCTGGCATACA AATGTTTCAGGCTTTAAAAGACTTAGGACCAATTCTTTACACTGTTCCTAATTATGAGCAAATTATTGCAGATAAGTTTT TAAGCAGAGTAGATTATTATTTAATATCTTTAAATAATCGTAATGTTGCAGAAAAAATAGATTTGTCTGATGTTGCCTTA AGTTATGCAATTGATGAATTTGACATTGGTAGTGAATTGGCAAAGGCAAATTCAAGAGAGAAAAATGCTGTTGTTCATGA TACTGTATCTAAAGGCGAATTGCAGCTTTCTAATGATGAGCTTATAAGTTTAAGAGAGCATATTGGTGATGCTGAGTTAT TTGAGGTAAAGTTAAATTTCAATAAAGACAATCCTATGGCAACAATTTCTGGATTTCAAATGTTGCAGGCGTTAAAAAGT TTAGGTGAAGTTTATAAATCTATTCCTGATAGTGAAGATTTATTAACCGATAAGTTTTTTGATTCTATTGTATATTATTT AATATCAAATACCTCAGTGGAGAGTATTTCTAAAAAGGTAGATTTATCAGATGTTGTTATTAGTTTTGATATTAAGAAAA TCGATTTGGAGCATATTAAAGATGGGGATTTAAATACTGAAGTTGAGAGTTATACTCCTGTTAAGGAGCCAAAAAAGCCA GCTGTGAATGTCAATTTAATTAGGATCGATAGTAAAAGGATAGATTCTATATTAAATCTTGTAAGTGAAGCTGTTATAAG TAAGTCAGCTTATAATCAAATAAATTCTGATATAACATCTTTCCTTTATGGTTTTAATCATTTTTATGATTATCAAGAAA GTTTTCGCAATAGTTTCTTGGTAGATTTAAAGATGATTTTTAAGGATGTAGGTTTGGAATTGGAAAGTTCTCTTGAGAGT CAAATAGCAAATTTGGTGGAGCATAAAATTGATAAAACTTTACAAGATATGGTAGGTTTAAGAGATTTATTGCTTAAAAT TCTCCAAGATTCTAGATTTGCTTCTAATAGGCTCTCTAGGATCATTACTGATTTGCATGAGAGTGTTTTAAAGACAAGGA TGCTACCAGTTTCTGGTATTTTTTCAAGATTTACAAGAGTGGTAAGAGACCTTTCGAAGAAGCTAGGCAAAGTTGTAGAG CTTAGGACTGAAGGGGAGGATACGGAGGTTGATAAATCTGTCATAGATGATCTTGTAGATCCTTTAATGCATTGTATTAG GAATTCTATGGATCATGGACTTGAGACTGTTGATGAGAGACTTAGCAATGGTAAGGATAAAACTGGTCATATAGTTTTGC GTGCCAAGAATGAAGGTAATGTGATATCAATTGAGATTGAAGATGATGGGAGAGGTATAGATCCAAATATTATTAGGCGG AAGTCAATTGAGAGGGGTTTAATAAAGGAAAATACGGTTTTATCTGAGAGTGAGATTCTTAACTTAATTTTTGAACCTGG ATTTTCAACAGCTAGTCAAATTACAGATGTTTCTGGTAGAGGTGTAGGACTTGATGTTGTTAAGAGTAATGTTAAGAAAT TAAATGGAAATATTATAATAGATTCAAAGGTTAATGTTGGTACTACTTTTAAAATAAAGCTTCCTTTAACATTAGTGATT GTGCAGGGCCTTCTTGTAAAATCAGGCAGCGAGATTTATGTTATTCCTTTAAATAGTGTTCTTGAAACGCATAGAATTAG TGAGGAAAATATTAAGTTTCTTGAAAATGATCATGAGGTTTATAATTTAAGGGAAGAAGTTATATCTGTGCTTAGACTCG ATGAGCTTTTTAATATAAAAGACGATCAAACATTATATGAGAAGTTTTTGATAGTCATTAGTATTAATGATAAAAAGGCA GGGATCATTGTGGATTCTATTCTTGGAGAAGAAGATTTTGTTGTAAAGCCTATTAAAGATAAGTATGCGTCAAGTCCCGG AATAGTTGGAGCTACTACACTTGGTAATGGTAAGGTTGTCTTAATTATTGATGTATTTAGGCTTTTTGACCTAAAGGATA TGAAAGGATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CTGGGGCACGAACTGAAAAACAATAAATTTAATGATGTGTTAATAGGGTTTAAATCTTTAAGATTTTGCCCTATTAAGCT AAAATAGGAAAGATAGGCTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TCTTATGATGGAAATAAAAGAGATATATTCAGGTGAGCATAATTTAAGTAGACAGGTTAAAGGAATTAACCCTGTTAATT TGGATTTTAAAGTAGTATCT
Product: chemotaxis protein CheA
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 856; Mature: 856
Protein sequence:
>856_residues MLDSDSKELLEIFFEEAQNLVDTLEENIMSLEDDPNNAETIDEIFRAAHTLKGGSASVDMMELSGFTHVVEDVFDAIRDN KLKICNDLVDLLLNALDVIKGMLDARLNGDVYLQDVSELKNKLRGFLGDEHQTASVVSLENINDDEFLLSSRELSDMREV VGLEQKVLRVSIYFDQDNPMATIAGIQMFQALKDLGPILYTVPNYEQIIADKFLSRVDYYLISLNNRNVAEKIDLSDVAL SYAIDEFDIGSELAKANSREKNAVVHDTVSKGELQLSNDELISLREHIGDAELFEVKLNFNKDNPMATISGFQMLQALKS LGEVYKSIPDSEDLLTDKFFDSIVYYLISNTSVESISKKVDLSDVVISFDIKKIDLEHIKDGDLNTEVESYTPVKEPKKP AVNVNLIRIDSKRIDSILNLVSEAVISKSAYNQINSDITSFLYGFNHFYDYQESFRNSFLVDLKMIFKDVGLELESSLES QIANLVEHKIDKTLQDMVGLRDLLLKILQDSRFASNRLSRIITDLHESVLKTRMLPVSGIFSRFTRVVRDLSKKLGKVVE LRTEGEDTEVDKSVIDDLVDPLMHCIRNSMDHGLETVDERLSNGKDKTGHIVLRAKNEGNVISIEIEDDGRGIDPNIIRR KSIERGLIKENTVLSESEILNLIFEPGFSTASQITDVSGRGVGLDVVKSNVKKLNGNIIIDSKVNVGTTFKIKLPLTLVI VQGLLVKSGSEIYVIPLNSVLETHRISEENIKFLENDHEVYNLREEVISVLRLDELFNIKDDQTLYEKFLIVISINDKKA GIIVDSILGEEDFVVKPIKDKYASSPGIVGATTLGNGKVVLIIDVFRLFDLKDMKG
Sequences:
>Translated_856_residues MLDSDSKELLEIFFEEAQNLVDTLEENIMSLEDDPNNAETIDEIFRAAHTLKGGSASVDMMELSGFTHVVEDVFDAIRDN KLKICNDLVDLLLNALDVIKGMLDARLNGDVYLQDVSELKNKLRGFLGDEHQTASVVSLENINDDEFLLSSRELSDMREV VGLEQKVLRVSIYFDQDNPMATIAGIQMFQALKDLGPILYTVPNYEQIIADKFLSRVDYYLISLNNRNVAEKIDLSDVAL SYAIDEFDIGSELAKANSREKNAVVHDTVSKGELQLSNDELISLREHIGDAELFEVKLNFNKDNPMATISGFQMLQALKS LGEVYKSIPDSEDLLTDKFFDSIVYYLISNTSVESISKKVDLSDVVISFDIKKIDLEHIKDGDLNTEVESYTPVKEPKKP AVNVNLIRIDSKRIDSILNLVSEAVISKSAYNQINSDITSFLYGFNHFYDYQESFRNSFLVDLKMIFKDVGLELESSLES QIANLVEHKIDKTLQDMVGLRDLLLKILQDSRFASNRLSRIITDLHESVLKTRMLPVSGIFSRFTRVVRDLSKKLGKVVE LRTEGEDTEVDKSVIDDLVDPLMHCIRNSMDHGLETVDERLSNGKDKTGHIVLRAKNEGNVISIEIEDDGRGIDPNIIRR KSIERGLIKENTVLSESEILNLIFEPGFSTASQITDVSGRGVGLDVVKSNVKKLNGNIIIDSKVNVGTTFKIKLPLTLVI VQGLLVKSGSEIYVIPLNSVLETHRISEENIKFLENDHEVYNLREEVISVLRLDELFNIKDDQTLYEKFLIVISINDKKA GIIVDSILGEEDFVVKPIKDKYASSPGIVGATTLGNGKVVLIIDVFRLFDLKDMKG >Mature_856_residues MLDSDSKELLEIFFEEAQNLVDTLEENIMSLEDDPNNAETIDEIFRAAHTLKGGSASVDMMELSGFTHVVEDVFDAIRDN KLKICNDLVDLLLNALDVIKGMLDARLNGDVYLQDVSELKNKLRGFLGDEHQTASVVSLENINDDEFLLSSRELSDMREV VGLEQKVLRVSIYFDQDNPMATIAGIQMFQALKDLGPILYTVPNYEQIIADKFLSRVDYYLISLNNRNVAEKIDLSDVAL SYAIDEFDIGSELAKANSREKNAVVHDTVSKGELQLSNDELISLREHIGDAELFEVKLNFNKDNPMATISGFQMLQALKS LGEVYKSIPDSEDLLTDKFFDSIVYYLISNTSVESISKKVDLSDVVISFDIKKIDLEHIKDGDLNTEVESYTPVKEPKKP AVNVNLIRIDSKRIDSILNLVSEAVISKSAYNQINSDITSFLYGFNHFYDYQESFRNSFLVDLKMIFKDVGLELESSLES QIANLVEHKIDKTLQDMVGLRDLLLKILQDSRFASNRLSRIITDLHESVLKTRMLPVSGIFSRFTRVVRDLSKKLGKVVE LRTEGEDTEVDKSVIDDLVDPLMHCIRNSMDHGLETVDERLSNGKDKTGHIVLRAKNEGNVISIEIEDDGRGIDPNIIRR KSIERGLIKENTVLSESEILNLIFEPGFSTASQITDVSGRGVGLDVVKSNVKKLNGNIIIDSKVNVGTTFKIKLPLTLVI VQGLLVKSGSEIYVIPLNSVLETHRISEENIKFLENDHEVYNLREEVISVLRLDELFNIKDDQTLYEKFLIVISINDKKA GIIVDSILGEEDFVVKPIKDKYASSPGIVGATTLGNGKVVLIIDVFRLFDLKDMKG
Specific function: Involved in the transmission of sensory signals from the chemoreceptors to the flagellar motors. CheA is autophosphorylated; it can transfer its phosphate group to either CheB or CheY [H]
COG id: COG0643
COG function: function code NT; Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 HPt domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788197, Length=335, Percent_Identity=42.6865671641791, Blast_Score=288, Evalue=9e-79,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003594 - InterPro: IPR002545 - InterPro: IPR004358 - InterPro: IPR008207 - InterPro: IPR004105 - InterPro: IPR005467 - InterPro: IPR010808 [H]
Pfam domain/function: PF01584 CheW; PF02895 H-kinase_dim; PF02518 HATPase_c; PF01627 Hpt; PF07194 P2 [H]
EC number: =2.7.13.3 [H]
Molecular weight: Translated: 96182; Mature: 96182
Theoretical pI: Translated: 4.47; Mature: 4.47
Prosite motif: PS50851 CHEW ; PS50894 HPT ; PS50109 HIS_KIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLDSDSKELLEIFFEEAQNLVDTLEENIMSLEDDPNNAETIDEIFRAAHTLKGGSASVDM CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEH MELSGFTHVVEDVFDAIRDNKLKICNDLVDLLLNALDVIKGMLDARLNGDVYLQDVSELK HHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHH NKLRGFLGDEHQTASVVSLENINDDEFLLSSRELSDMREVVGLEQKVLRVSIYFDQDNPM HHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEEEEEECCCCC ATIAGIQMFQALKDLGPILYTVPNYEQIIADKFLSRVDYYLISLNNRNVAEKIDLSDVAL HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHCCHHHHHH SYAIDEFDIGSELAKANSREKNAVVHDTVSKGELQLSNDELISLREHIGDAELFEVKLNF HHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEE NKDNPMATISGFQMLQALKSLGEVYKSIPDSEDLLTDKFFDSIVYYLISNTSVESISKKV CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHC DLSDVVISFDIKKIDLEHIKDGDLNTEVESYTPVKEPKKPAVNVNLIRIDSKRIDSILNL CHHHEEEEECEEEECHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHH VSEAVISKSAYNQINSDITSFLYGFNHFYDYQESFRNSFLVDLKMIFKDVGLELESSLES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH QIANLVEHKIDKTLQDMVGLRDLLLKILQDSRFASNRLSRIITDLHESVLKTRMLPVSGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH FSRFTRVVRDLSKKLGKVVELRTEGEDTEVDKSVIDDLVDPLMHCIRNSMDHGLETVDER HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSNGKDKTGHIVLRAKNEGNVISIEIEDDGRGIDPNIIRRKSIERGLIKENTVLSESEIL HHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH NLIFEPGFSTASQITDVSGRGVGLDVVKSNVKKLNGNIIIDSKVNVGTTFKIKLPLTLVI HHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEEECCHHHHH VQGLLVKSGSEIYVIPLNSVLETHRISEENIKFLENDHEVYNLREEVISVLRLDELFNIK HHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DDQTLYEKFLIVISINDKKAGIIVDSILGEEDFVVKPIKDKYASSPGIVGATTLGNGKVV CCHHHHHCEEEEEEECCCCCCEEEHHHCCCCCCEECCCHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEE LIIDVFRLFDLKDMKG EEEEHHHHHCHHCCCC >Mature Secondary Structure MLDSDSKELLEIFFEEAQNLVDTLEENIMSLEDDPNNAETIDEIFRAAHTLKGGSASVDM CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEH MELSGFTHVVEDVFDAIRDNKLKICNDLVDLLLNALDVIKGMLDARLNGDVYLQDVSELK HHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHH NKLRGFLGDEHQTASVVSLENINDDEFLLSSRELSDMREVVGLEQKVLRVSIYFDQDNPM HHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEEEEEECCCCC ATIAGIQMFQALKDLGPILYTVPNYEQIIADKFLSRVDYYLISLNNRNVAEKIDLSDVAL HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHCCHHHHHH SYAIDEFDIGSELAKANSREKNAVVHDTVSKGELQLSNDELISLREHIGDAELFEVKLNF HHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEE NKDNPMATISGFQMLQALKSLGEVYKSIPDSEDLLTDKFFDSIVYYLISNTSVESISKKV CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHC DLSDVVISFDIKKIDLEHIKDGDLNTEVESYTPVKEPKKPAVNVNLIRIDSKRIDSILNL CHHHEEEEECEEEECHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHH VSEAVISKSAYNQINSDITSFLYGFNHFYDYQESFRNSFLVDLKMIFKDVGLELESSLES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH QIANLVEHKIDKTLQDMVGLRDLLLKILQDSRFASNRLSRIITDLHESVLKTRMLPVSGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH FSRFTRVVRDLSKKLGKVVELRTEGEDTEVDKSVIDDLVDPLMHCIRNSMDHGLETVDER HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSNGKDKTGHIVLRAKNEGNVISIEIEDDGRGIDPNIIRRKSIERGLIKENTVLSESEIL HHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH NLIFEPGFSTASQITDVSGRGVGLDVVKSNVKKLNGNIIIDSKVNVGTTFKIKLPLTLVI HHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEEECCHHHHH VQGLLVKSGSEIYVIPLNSVLETHRISEENIKFLENDHEVYNLREEVISVLRLDELFNIK HHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DDQTLYEKFLIVISINDKKAGIIVDSILGEEDFVVKPIKDKYASSPGIVGATTLGNGKVV CCHHHHHCEEEEEEECCCCCCEEEHHHCCCCCCEECCCHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEE LIIDVFRLFDLKDMKG EEEEHHHHHCHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9765799; 9403685; 8990312 [H]