Definition | Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010673 |
Length | 922,307 |
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The map label for this gene is 187918432
Identifier: 187918432
GI number: 187918432
Start: 590973
End: 592745
Strand: Direct
Name: 187918432
Synonym: BH0569
Alternate gene names: NA
Gene position: 590973-592745 (Clockwise)
Preceding gene: 187918431
Following gene: 187918433
Centisome position: 64.08
GC content: 26.73
Gene sequence:
>1773_bases ATGGAAAATGATGATAAGTTTTTGGATATTGATCCGCATATTAATAAAATATTTGCTGAACTTGAGGCTTTTGATAGCCG TTCAAGACAAGTTTATGCCAGTTTAAGTAAATCAATTCCTAAATTAATAGAGAAACTTTCCAAAGATATTAAAGATTTAT CTTTTAATATTGGATTTATTTCTAATCTTGATATTGATAATGATTATTCTTTAAATATTTTTATCTCTAAAGTAATAAGG GTATTGAATGATTTTGTCTCCTATTTTAATTCGTCAACTGAATTGCTTGAATCTCAGTTTGGTGTAATAAGGGATAAGGT CAAGGATATAGAGATTCTTGAAGATGTAATTGAAAAGATGAAAAAAAGTTCTATTGATATGGAGATAATGTCGATTAATA CATTGACTGTTGCCATGAGGGTTGGTAGAGCAGGAGGTGCTTTTTCTTATATTACAAATGAGATTAAGACTTTGACTCAA TCTATGATTAAGCAAGCAGATCAGCTTACTAGTAGGGGTAGAGATATTAAAGTTGGACTTGATCGTGCTAAAGATCAGGT ACTTGAAAATAATACGGCTGAGAATAAAATTCTTGAAGAATTTAAAGACCATTTGATGAAAAATATAGATGAATTTTCAG GAGGCATTGGAGAAGTTATTGCCTTTTATGATAACATCTTAGGTATACTTAATGAGTTTAAATTTAAGTTTGTAAATGCT GTGTCTTATCTACAGTTTCAAGATAGACTTACTCAGTCTTTGTATCATTTAAATATTATGTATTCAAGTATTGATGTTTT TAAGTTTAGGGATACGAGTGAACTTCAAAAGTTAAAAGTTTTGTCTGTTTTTACAGATTCATCTAAAATGATAGTTAAGG ATGTTATTGCTAAATTGGATGAAAATTTGATGGCTTTTGAAGGATTTATTGATACATCTATTTCTTCTATTCAGGTCATT AATGATTTAAAATCGGATAATTCTTTGTATATTGATATTTCAAGAGCAGTGGAATCTTTTTCTGTTATTTTATCGAATTT ACTTAAAAGGATTGATGATGTTGAAAAAAATAATTCTAACTTTTTAAATCTTTATTATGAACAGATTAAGCTTGTTAAAT CTTTAGAATTAATGTTTTCAAATATTTCAGCTATTTCTTCTAGGTTTCAGAATATTAATATAGCTTCCAAAATAGAGGTT GTCAAGAGAGTTGAACTTGAGGATATGGAAGGTAATATTTCTGAGATGTCAAAAATTATTAGTAATATTGAGTCAAATAT TACTAAAGGACGAGAGTTTTTATCTCAAATAATATTTTTCTTTGAAAAAGTTGTAAAAGATTGTGATAATAGATTTTATC TTGAGAGAAATTATTTTAATAAATTTAAGAAACTGTTTATGGAGATAAAGAATAATATTTTTGAGATAAAGAAGATTGCT CTTGATCATGTATTATCCTATGAAATATTTCCAGTTGATTTCTTAGAAATATTTGAAGAGATAAAGTTAGATATTCATAA TATTAAGAATTTAAGAAAGGATCTTTCAAATCTTGAAAAGACTTTAATTGAAATGGGCAATGATATTAATATCGCCCTTG AGTCAGAATTATTGAAAAATGGTCTTAAATATGTTGAAATTGAAGATAAGGAATTTGTTCGCAGAATTGCTAATAGGTTT ACTTTGTTTGTTCATAAGAAATATTTATTGTCTCTTATTGAAGATGAAAAAGATGTTCATTCATTTGATGAGGGTAGTGT AATTTTATTCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTGTAGTATTTGGTATGCCTATGGAGGCAATAAAAATAGGTGCTGTAGATAAGGTCCTTCCTTTAAATAAAATATCTGAA TATATTTTAAGGAGATCTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases CTTTTATATACTTTTTATATGGGTTTAGGAGTGCTACATGCAAAAAAGGATTTTGGTTATAGATGATAATAGAGCTATTA GGCAGAGCGTTGCTTACATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 590; Mature: 590
Protein sequence:
>590_residues MENDDKFLDIDPHINKIFAELEAFDSRSRQVYASLSKSIPKLIEKLSKDIKDLSFNIGFISNLDIDNDYSLNIFISKVIR VLNDFVSYFNSSTELLESQFGVIRDKVKDIEILEDVIEKMKKSSIDMEIMSINTLTVAMRVGRAGGAFSYITNEIKTLTQ SMIKQADQLTSRGRDIKVGLDRAKDQVLENNTAENKILEEFKDHLMKNIDEFSGGIGEVIAFYDNILGILNEFKFKFVNA VSYLQFQDRLTQSLYHLNIMYSSIDVFKFRDTSELQKLKVLSVFTDSSKMIVKDVIAKLDENLMAFEGFIDTSISSIQVI NDLKSDNSLYIDISRAVESFSVILSNLLKRIDDVEKNNSNFLNLYYEQIKLVKSLELMFSNISAISSRFQNINIASKIEV VKRVELEDMEGNISEMSKIISNIESNITKGREFLSQIIFFFEKVVKDCDNRFYLERNYFNKFKKLFMEIKNNIFEIKKIA LDHVLSYEIFPVDFLEIFEEIKLDIHNIKNLRKDLSNLEKTLIEMGNDINIALESELLKNGLKYVEIEDKEFVRRIANRF TLFVHKKYLLSLIEDEKDVHSFDEGSVILF
Sequences:
>Translated_590_residues MENDDKFLDIDPHINKIFAELEAFDSRSRQVYASLSKSIPKLIEKLSKDIKDLSFNIGFISNLDIDNDYSLNIFISKVIR VLNDFVSYFNSSTELLESQFGVIRDKVKDIEILEDVIEKMKKSSIDMEIMSINTLTVAMRVGRAGGAFSYITNEIKTLTQ SMIKQADQLTSRGRDIKVGLDRAKDQVLENNTAENKILEEFKDHLMKNIDEFSGGIGEVIAFYDNILGILNEFKFKFVNA VSYLQFQDRLTQSLYHLNIMYSSIDVFKFRDTSELQKLKVLSVFTDSSKMIVKDVIAKLDENLMAFEGFIDTSISSIQVI NDLKSDNSLYIDISRAVESFSVILSNLLKRIDDVEKNNSNFLNLYYEQIKLVKSLELMFSNISAISSRFQNINIASKIEV VKRVELEDMEGNISEMSKIISNIESNITKGREFLSQIIFFFEKVVKDCDNRFYLERNYFNKFKKLFMEIKNNIFEIKKIA LDHVLSYEIFPVDFLEIFEEIKLDIHNIKNLRKDLSNLEKTLIEMGNDINIALESELLKNGLKYVEIEDKEFVRRIANRF TLFVHKKYLLSLIEDEKDVHSFDEGSVILF >Mature_590_residues MENDDKFLDIDPHINKIFAELEAFDSRSRQVYASLSKSIPKLIEKLSKDIKDLSFNIGFISNLDIDNDYSLNIFISKVIR VLNDFVSYFNSSTELLESQFGVIRDKVKDIEILEDVIEKMKKSSIDMEIMSINTLTVAMRVGRAGGAFSYITNEIKTLTQ SMIKQADQLTSRGRDIKVGLDRAKDQVLENNTAENKILEEFKDHLMKNIDEFSGGIGEVIAFYDNILGILNEFKFKFVNA VSYLQFQDRLTQSLYHLNIMYSSIDVFKFRDTSELQKLKVLSVFTDSSKMIVKDVIAKLDENLMAFEGFIDTSISSIQVI NDLKSDNSLYIDISRAVESFSVILSNLLKRIDDVEKNNSNFLNLYYEQIKLVKSLELMFSNISAISSRFQNINIASKIEV VKRVELEDMEGNISEMSKIISNIESNITKGREFLSQIIFFFEKVVKDCDNRFYLERNYFNKFKKLFMEIKNNIFEIKKIA LDHVLSYEIFPVDFLEIFEEIKLDIHNIKNLRKDLSNLEKTLIEMGNDINIALESELLKNGLKYVEIEDKEFVRRIANRF TLFVHKKYLLSLIEDEKDVHSFDEGSVILF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 68437; Mature: 68437
Theoretical pI: Translated: 4.85; Mature: 4.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MENDDKFLDIDPHINKIFAELEAFDSRSRQVYASLSKSIPKLIEKLSKDIKDLSFNIGFI CCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCEE SNLDIDNDYSLNIFISKVIRVLNDFVSYFNSSTELLESQFGVIRDKVKDIEILEDVIEKM EECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKSSIDMEIMSINTLTVAMRVGRAGGAFSYITNEIKTLTQSMIKQADQLTSRGRDIKVGL HHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECH DRAKDQVLENNTAENKILEEFKDHLMKNIDEFSGGIGEVIAFYDNILGILNEFKFKFVNA HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSYLQFQDRLTQSLYHLNIMYSSIDVFKFRDTSELQKLKVLSVFTDSSKMIVKDVIAKLD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHC ENLMAFEGFIDTSISSIQVINDLKSDNSLYIDISRAVESFSVILSNLLKRIDDVEKNNSN CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC FLNLYYEQIKLVKSLELMFSNISAISSRFQNINIASKIEVVKRVELEDMEGNISEMSKII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH SNIESNITKGREFLSQIIFFFEKVVKDCDNRFYLERNYFNKFKKLFMEIKNNIFEIKKIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDHVLSYEIFPVDFLEIFEEIKLDIHNIKNLRKDLSNLEKTLIEMGNDINIALESELLKN HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHC GLKYVEIEDKEFVRRIANRFTLFVHKKYLLSLIEDEKDVHSFDEGSVILF CCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEC >Mature Secondary Structure MENDDKFLDIDPHINKIFAELEAFDSRSRQVYASLSKSIPKLIEKLSKDIKDLSFNIGFI CCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCEE SNLDIDNDYSLNIFISKVIRVLNDFVSYFNSSTELLESQFGVIRDKVKDIEILEDVIEKM EECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKSSIDMEIMSINTLTVAMRVGRAGGAFSYITNEIKTLTQSMIKQADQLTSRGRDIKVGL HHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECH DRAKDQVLENNTAENKILEEFKDHLMKNIDEFSGGIGEVIAFYDNILGILNEFKFKFVNA HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSYLQFQDRLTQSLYHLNIMYSSIDVFKFRDTSELQKLKVLSVFTDSSKMIVKDVIAKLD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHC ENLMAFEGFIDTSISSIQVINDLKSDNSLYIDISRAVESFSVILSNLLKRIDDVEKNNSN CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC FLNLYYEQIKLVKSLELMFSNISAISSRFQNINIASKIEVVKRVELEDMEGNISEMSKII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH SNIESNITKGREFLSQIIFFFEKVVKDCDNRFYLERNYFNKFKKLFMEIKNNIFEIKKIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDHVLSYEIFPVDFLEIFEEIKLDIHNIKNLRKDLSNLEKTLIEMGNDINIALESELLKN HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHC GLKYVEIEDKEFVRRIANRFTLFVHKKYLLSLIEDEKDVHSFDEGSVILF CCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA