Definition | Xylella fastidiosa M23 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010577 |
Length | 2,535,690 |
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The map label for this gene is 182682500
Identifier: 182682500
GI number: 182682500
Start: 2226592
End: 2228958
Strand: Reverse
Name: 182682500
Synonym: XfasM23_1987
Alternate gene names: NA
Gene position: 2228958-2226592 (Counterclockwise)
Preceding gene: 182682501
Following gene: 182682499
Centisome position: 87.9
GC content: 57.33
Gene sequence:
>2367_bases GTGGGTGATTGGATCTCTCGGTGTCGTATCGGTATTGCTGTGTTGTGGTTGTTGTTGTTAGTCGGTCTGGGCTGGTGGCT TGCGGGTCGGCTGCAACTCACGGGTGATCTGCGTCAGTTTATGCCTGAGGCACAGACTCCCGCACAAAAGTTGTTACTTG AGGAGCTGGGTGAGGGGCCGGGTTCACGGTTGTTGTTGATGTCGTTACGTGGGAGTGATCCAGCCATTTTGGCGCGGCAA TCGCAGGCATTACGGGAAGTGTTGGCAGGGCAGCCTCAGGTGTTTGAGTTGGTTGCTAATGGTGCGCATGTTGGGCTGGA GGCAATTCCGCCCCGATTATTGCCATACCGCTATCTGTTTAGTGACAGTTTTGATGCTGCGCCGCTGGATGTTGGGTATC TCAAGCAGGCGTTGCAGATGCGGGTACAGGATTTGGGGTCTCCAGCCGCGCGTGTGGTTGAGCCGCTGTTGCCTCGGGAT CCAACGTTGGAAGTGTTGCATGTGGCTGAGCGTTTGCAGCCGTTAGCGGCACCTGCAATGCGTGATGGGGTTTGGTTTGA TCGTGCTGGACGGCGTGCGTTATTGCTGGCGCAGACGCATGCTGCTGGTTTTGATCCGACGGGCCAGCAGCGCGCTTACG ATGCGGTGCAGGCGGCGTTTACTCGGGTGTCGGTGAATACGGCAACGCAGTTGGAACTCACGGGACCTGGTGCGTTTGCG GTGGAGATTGCTGCAAAGACTCAAGGGGAGGCGCAGTGGATCGGGATGTTGGATACGGTAGGACTGATTGTGCTGTTGCT GTTGGCGTATCGCAGTTGGAAGGTGCCGTTGTTGGGGGTGTTACCTCTTGCCAGTGCTGGTCTGGCTGGTTTGGTTGCGG TGGCATTGCTGTTTGATCGTGTGCATGGCATCACGGTGGCGTTTGGTTTTACCTTGATTGGTGTGGTGCAGGATTATCCG ATTCACTTATTTAGCCATCAACGGCCGGGGCTGGACCCGCGGGAAAATGCGCGCCATTTGTGGCCGGCTTTGGCGACGGG TGTTGTTTCTACCTGTATTGCTTACGTTACGTTTCTATTTTCAGGGGTGGATGGGCTACGTCAGCTTGCAACTTTCACGA TTGCAGGGTTGTTGGTCGCGGCAGTGACCACGCGTTGGTTGTTGCCGGGGTTGATTGATCCTGCGCCGCGTGATCCTGCC GATTCGGTCGTGCTCGCGCGGTTATGGCAGTGGACCGCGGGGGTGCGGTGTCCGCATTGGTCGCTAGCATTATTGAGTGT GGCCGCAGTCGCTGCGGTGCTGCTGGTGCCTGGTCCGTTCTGGGAGAATGATCTGTCTAAGTTGACTCCGGTACCGGTTG CTGCGTTGTTGCGTGATATGCGCTTGCGTCAGGAGTTGGGGGCGCCGGATGTGCGCTATGTGCTGGCACTGCATGCGGTT TCGGCCGAGCAGGCGTTGCAAGCTGCTGAGGCGTTGCGCCCACGTCTGGATGGTGCGGTTGCCCAGGGTATTGTTGCCGG TTACGACATGGCGGCGCGTTATTTGCCTAGCATCCAGACGCAGCGTCGGCGTCAACAGGCGTTACCCCCGCCGGAGCAAG TGCGCCGTTTGATCGCAGAGGCTGTGATCGCTTCGGGGTTTCGTGCTGATGTATTTGAGCCATTTCAGGCGGATGTGGAG ATGGCACGGCAGGCACCGCCAATGACGATGCAGATGTTGGGAGGGACTGCGTTGGCGATGCCGGTCAGTGGTTTGTTGTT GGTGGGTACTGACGGTGTCACCGCGCTGGTGTCGCTGATTGGTTTGCATGATCCGCAGGCGCTCGCTGTCGTGGTAGGTG GTAGTGGTGCACAGTTGATGGATTTGAAGGAGGCGTCTGAGTCACTGGTTGTGGCTTACCGTGGTCGTGTGCTGGGGGCG TTGGGTGTGGCTGGGTTTCTGTTGGTTGGCACGGTGGCTTTGGCATTGCGTCAGTGGCGACGGATGGTGCGTGTGCTCTT GCCTATGGCGATGACAACGTTATGGATTGTGGCATTGCAACGCATCTGTGGGGTGGAGTTGAATTTGTTTCACCTGATTG CGTTGATTCTTGCGGCTGGGTTGGGCCTGGACTATGCGTTGTTCTTTGAACACGCCGGTGATCATCGCGCCGAGCAATTG CGCACGTTGCATGCGTTGTTGGTGTGCAGTGTGATGACGTTGGTGGTGTTCGCTTTGTTGGCTGTCTCAAGTATTCCGGT GCTGAGTGCGATTGGGAGTACGGTGGCTCTGGGTGTGCTGCTTAACTTTGTTCTTGCGTTGTTGATCTCGCGTGTTCCGG TGTTGGAGAGGATTGCTGGGAGTGATGCTCTTGTCGCAGGGGGGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTCAGTTCCTTCACGTTTGATGATGGCTTCGGGGGTGATGGTTTGATGTTGTGGCAGTGGTATGCCGCTGGTGGTGTCTG CTGCACTATGGGGGTCGATC
Downstream 100 bases:
>100_bases AGAGATTGCCCAGCTGGTGCCTCACCAAGGCAGGATGTGTTTTTGGGAGCAGGTTGTGGAGTGGGATACGACGCGCATTG TGCTGTGTAGTGACATGCAC
Product: membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: Transmembrane Protein; Mmpl Exporter Transmembrane Protein; XanthomoNADin Exporter; MMPL Domain Protein; Exporter TRANSMEMBRANE PROTEIN; Phosphoglucomutase/Phosphomannomutase Alpha/Beta/Subunit
Number of amino acids: Translated: 788; Mature: 787
Protein sequence:
>788_residues MGDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQKLLLEELGEGPGSRLLLMSLRGSDPAILARQ SQALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIPPRLLPYRYLFSDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAARVVEPLLPRD PTLEVLHVAERLQPLAAPAMRDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQLELTGPGAFA VEIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAGLVAVALLFDRVHGITVAFGFTLIGVVQDYP IHLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVSTCIAYVTFLFSGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPGLIDPAPRDPA DSVVLARLWQWTAGVRCPHWSLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPDVRYVLALHAV SAEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPPPEQVRRLIAEAVIASGFRADVFEPFQADVE MARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGTDGVTALVSLIGLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLVVAYRGRVLGA LGVAGFLLVGTVALALRQWRRMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFEHAGDHRAEQL RTLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLISRVPVLERIAGSDALVAGG
Sequences:
>Translated_788_residues MGDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQKLLLEELGEGPGSRLLLMSLRGSDPAILARQ SQALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIPPRLLPYRYLFSDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAARVVEPLLPRD PTLEVLHVAERLQPLAAPAMRDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQLELTGPGAFA VEIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAGLVAVALLFDRVHGITVAFGFTLIGVVQDYP IHLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVSTCIAYVTFLFSGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPGLIDPAPRDPA DSVVLARLWQWTAGVRCPHWSLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPDVRYVLALHAV SAEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPPPEQVRRLIAEAVIASGFRADVFEPFQADVE MARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGTDGVTALVSLIGLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLVVAYRGRVLGA LGVAGFLLVGTVALALRQWRRMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFEHAGDHRAEQL RTLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLISRVPVLERIAGSDALVAGG >Mature_787_residues GDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQKLLLEELGEGPGSRLLLMSLRGSDPAILARQS QALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIPPRLLPYRYLFSDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAARVVEPLLPRDP TLEVLHVAERLQPLAAPAMRDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQLELTGPGAFAV EIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAGLVAVALLFDRVHGITVAFGFTLIGVVQDYPI HLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVSTCIAYVTFLFSGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPGLIDPAPRDPAD SVVLARLWQWTAGVRCPHWSLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPDVRYVLALHAVS AEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPPPEQVRRLIAEAVIASGFRADVFEPFQADVEM ARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGTDGVTALVSLIGLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLVVAYRGRVLGAL GVAGFLLVGTVALALRQWRRMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFEHAGDHRAEQLR TLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLISRVPVLERIAGSDALVAGG
Specific function: Unknown
COG id: COG4258
COG function: function code R; Predicted exporter
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 84425; Mature: 84293
Theoretical pI: Translated: 7.70; Mature: 7.70
Prosite motif: PS00435 PEROXIDASE_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQKLLLEELGEGP CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC GSRLLLMSLRGSDPAILARQSQALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIPPRLLPYRYLF CCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHH SDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAARVVEPLLPRDPTLEVLHVAERLQPLAAPAM CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHH RDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQLELTGPGAFA HCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEECCCCEE VEIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAGLVAVALLFDR EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH VHGITVAFGFTLIGVVQDYPIHLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVSTCIAYVTFLF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPGLIDPAPRDPADSVVLARLWQWTAGVRCPHW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH SLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPDVRYVLALHAV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH SAEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPPPEQVRRLIAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH AVIASGFRADVFEPFQADVEMARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGTDGVTALVSLI HHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHH GLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLVVAYRGRVLGALGVAGFLLVGTVALALRQWR HCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFEHAGDHRAEQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHH RTLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLISRVPVLERIAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCC SDALVAGG CCCEECCC >Mature Secondary Structure GDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQKLLLEELGEGP CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC GSRLLLMSLRGSDPAILARQSQALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIPPRLLPYRYLF CCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHH SDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAARVVEPLLPRDPTLEVLHVAERLQPLAAPAM CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHH RDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQLELTGPGAFA HCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEECCCCEE VEIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAGLVAVALLFDR EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH VHGITVAFGFTLIGVVQDYPIHLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVSTCIAYVTFLF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPGLIDPAPRDPADSVVLARLWQWTAGVRCPHW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH SLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPDVRYVLALHAV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH SAEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPPPEQVRRLIAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH AVIASGFRADVFEPFQADVEMARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGTDGVTALVSLI HHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHH GLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLVVAYRGRVLGALGVAGFLLVGTVALALRQWR HCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFEHAGDHRAEQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHH RTLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLISRVPVLERIAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCC SDALVAGG CCCEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA