Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010503 |
Length | 751,679 |
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The map label for this gene is 170761991
Identifier: 170761991
GI number: 170761991
Start: 57825
End: 59312
Strand: Direct
Name: 170761991
Synonym: UPA3_0047
Alternate gene names: NA
Gene position: 57825-59312 (Clockwise)
Preceding gene: 170762405
Following gene: 170762253
Centisome position: 7.69
GC content: 22.24
Gene sequence:
>1488_bases ATGAATACAAAAACATTTACTTCCGTTAATAGAGTAATTTATGATGATAACTATTCGCTAAAGCAACAACAAAAAAGTAG CTTTATCAATCAATTTTTAAAAGGATTGTTATCTGCTATTACTTTATTATTCTTTATTTTACTTTTAATCTTTGCTGAAA ATACGTTGTTTGGTTTAGGTTTTGGTGATGAGAATAAATCAATGATGATTTCAAAATCGCTAAATGCTTTTTTTGATTTA CACAGCCCTAAATATTTACAACTTAACTTTTTAATTGTATTTCGCTTTTTTATTTTAAGTTTTACACTGTTTTATACCTT AATCAAAAATTTCACAAATCTTTATTGGCATCGAGCAACCATTAAAAAATACTTACCATGATTCGTTTTATATTTAGTGA TTGCAACAATTAGTTTCTTACTATTTTTTACTTTTTTTAGTGTTTGACCAAAAGAAGTTTTTAATTTAGTATTTTTACTA TTAGTGTTATTTTTATTAAATTTAAGTTATGAAATATTTAATTATTTTATTTCTAAAAAAACTAACCCTTTATTATACGA TAATTATAAAAATTTAATTATTGCCATGGTTTTTCAAGCGTTATTACTATTATTTGTAATAATTACCCCCCTTGTATGAA TTAATACAGGTAAAAGTCCTAACTTTTTATTTGTTGATAATCGTTTCTACACACGCATAGTTGATATCTTCACTGTTCAA TCAGGTAAAAATTTTATTATTTTAATTGCTTTCTTCTTCTTTTTAATTACATTTATTGTTTTAGCAAATACTAATTTTTT CGCTTTAGTAATTAATAAACGTTACGATCGTAATTATGTTAAGAATAATTTATGATTTATTTTACTTTTATTTAGTGCTA TATTTATTTGATTATTAAGAGTTTTTGCATATAAGCACGAAAATGAAAATCTACCGGTTGGTAACAACCATTTATTATGA GTTTATATTTTACAAAGTTTTTTTGCAATAATCATATTAATACTATATATGGTATTCACTTTAAAAAAACGCTTAAGCGT AAAGAGTAGTTTAAATACTTTATTAAATTTAGTAGTCACTCAAACAATTCTAAGTTTAAGCTTGTTTTTAGTAACATTAT TTAATTCTAAGAGTGTGGTTTCTTTAATTAATGTTTTTATTACAATTACTGTACAAATGAGTGTGTTTGGAATCTACATA TTTCAAAATAAAAACATTTCAACTAAATTATTGGTGCTATTAAAGGTTATTATGATTTTAATTATTTTAACCGCAGCAAT TGTAGGTTTTGATTATTTATTAACATCTGATCATCATAATAACTATTTATTCTCAAACATTCAACCGAAAATGAATTTAG TACAAATCATGTTGTTATTAAATTTTAGTTTGAATTTTACTTTAATTAGTTATTTAACAATTAAATTTGCAATGGTAATT TTTAAAATCAATAAGCTAAATAAGGAGTTAAACAATGAAAAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAACCGCTTTATTCCCTAATGGTTTTGGTGAAGATCAAATCCCCAGTGCTTTTAAATTTAAAAATTAATTAACTTTTATA TTGAATTAGAAAATTATATG
Downstream 100 bases:
>100_bases ATCTAATCTGACACCTACAACAAATTATTTTGATGTATTTAATACTTATAAAGAGAAAAAAGCAAGTGTTGATTTAATTA CATATGAAGAATTAATGGCA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 495; Mature: 495
Protein sequence:
>495_residues MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFDL HSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLPWFVLYLVIATISFLLFFTFFSVWPKEVFNLVFLL LVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVWINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQ SGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLWFILLLFSAIFIWLLRVFAYKHENENLPVGNNHLLW VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYI FQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVI FKINKLNKELNNEKK
Sequences:
>Translated_495_residues MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFDL HSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLP*FVLYLVIATISFLLFFTFFSV*PKEVFNLVFLL LVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLV*INTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQ SGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNL*FILLLFSAIFI*LLRVFAYKHENENLPVGNNHLL* VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYI FQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVI FKINKLNKELNNEKK >Mature_495_residues MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFDL HSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLP*FVLYLVIATISFLLFFTFFSV*PKEVFNLVFLL LVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLV*INTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQ SGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNL*FILLLFSAIFI*LLRVFAYKHENENLPVGNNHLL* VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYI FQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVI FKINKLNKELNNEKK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56994; Mature: 56994
Theoretical pI: Translated: 10.38; Mature: 10.38
Prosite motif: PS00146 BETA_LACTAMASE_A
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLG CCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE FGDENKSMMISKSLNAFFDLHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRAT CCCCCCCEEHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKKYLPFVLYLVIATISFLLFFTFFSVPKEVFNLVFLLLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC PLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQSGK CCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHEECCCC NFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLFILLLFSAIFILLRVFAYK CEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HENENLPVGNNHLLVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSL CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYIFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAA HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVIFKINKL HHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NKELNNEKK HHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLG CCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE FGDENKSMMISKSLNAFFDLHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRAT CCCCCCCEEHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKKYLPFVLYLVIATISFLLFFTFFSVPKEVFNLVFLLLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC PLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQSGK CCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHEECCCC NFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLFILLLFSAIFILLRVFAYK CEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HENENLPVGNNHLLVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSL CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYIFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAA HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVIFKINKL HHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NKELNNEKK HHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11048724 [H]