Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome.
Accession NC_010503
Length 751,679

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The map label for this gene is 170761991

Identifier: 170761991

GI number: 170761991

Start: 57825

End: 59312

Strand: Direct

Name: 170761991

Synonym: UPA3_0047

Alternate gene names: NA

Gene position: 57825-59312 (Clockwise)

Preceding gene: 170762405

Following gene: 170762253

Centisome position: 7.69

GC content: 22.24

Gene sequence:

>1488_bases
ATGAATACAAAAACATTTACTTCCGTTAATAGAGTAATTTATGATGATAACTATTCGCTAAAGCAACAACAAAAAAGTAG
CTTTATCAATCAATTTTTAAAAGGATTGTTATCTGCTATTACTTTATTATTCTTTATTTTACTTTTAATCTTTGCTGAAA
ATACGTTGTTTGGTTTAGGTTTTGGTGATGAGAATAAATCAATGATGATTTCAAAATCGCTAAATGCTTTTTTTGATTTA
CACAGCCCTAAATATTTACAACTTAACTTTTTAATTGTATTTCGCTTTTTTATTTTAAGTTTTACACTGTTTTATACCTT
AATCAAAAATTTCACAAATCTTTATTGGCATCGAGCAACCATTAAAAAATACTTACCATGATTCGTTTTATATTTAGTGA
TTGCAACAATTAGTTTCTTACTATTTTTTACTTTTTTTAGTGTTTGACCAAAAGAAGTTTTTAATTTAGTATTTTTACTA
TTAGTGTTATTTTTATTAAATTTAAGTTATGAAATATTTAATTATTTTATTTCTAAAAAAACTAACCCTTTATTATACGA
TAATTATAAAAATTTAATTATTGCCATGGTTTTTCAAGCGTTATTACTATTATTTGTAATAATTACCCCCCTTGTATGAA
TTAATACAGGTAAAAGTCCTAACTTTTTATTTGTTGATAATCGTTTCTACACACGCATAGTTGATATCTTCACTGTTCAA
TCAGGTAAAAATTTTATTATTTTAATTGCTTTCTTCTTCTTTTTAATTACATTTATTGTTTTAGCAAATACTAATTTTTT
CGCTTTAGTAATTAATAAACGTTACGATCGTAATTATGTTAAGAATAATTTATGATTTATTTTACTTTTATTTAGTGCTA
TATTTATTTGATTATTAAGAGTTTTTGCATATAAGCACGAAAATGAAAATCTACCGGTTGGTAACAACCATTTATTATGA
GTTTATATTTTACAAAGTTTTTTTGCAATAATCATATTAATACTATATATGGTATTCACTTTAAAAAAACGCTTAAGCGT
AAAGAGTAGTTTAAATACTTTATTAAATTTAGTAGTCACTCAAACAATTCTAAGTTTAAGCTTGTTTTTAGTAACATTAT
TTAATTCTAAGAGTGTGGTTTCTTTAATTAATGTTTTTATTACAATTACTGTACAAATGAGTGTGTTTGGAATCTACATA
TTTCAAAATAAAAACATTTCAACTAAATTATTGGTGCTATTAAAGGTTATTATGATTTTAATTATTTTAACCGCAGCAAT
TGTAGGTTTTGATTATTTATTAACATCTGATCATCATAATAACTATTTATTCTCAAACATTCAACCGAAAATGAATTTAG
TACAAATCATGTTGTTATTAAATTTTAGTTTGAATTTTACTTTAATTAGTTATTTAACAATTAAATTTGCAATGGTAATT
TTTAAAATCAATAAGCTAAATAAGGAGTTAAACAATGAAAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAACCGCTTTATTCCCTAATGGTTTTGGTGAAGATCAAATCCCCAGTGCTTTTAAATTTAAAAATTAATTAACTTTTATA
TTGAATTAGAAAATTATATG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCTAATCTGACACCTACAACAAATTATTTTGATGTATTTAATACTTATAAAGAGAAAAAAGCAAGTGTTGATTTAATTA
CATATGAAGAATTAATGGCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 495; Mature: 495

Protein sequence:

>495_residues
MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFDL
HSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLPWFVLYLVIATISFLLFFTFFSVWPKEVFNLVFLL
LVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVWINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQ
SGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLWFILLLFSAIFIWLLRVFAYKHENENLPVGNNHLLW
VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYI
FQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVI
FKINKLNKELNNEKK

Sequences:

>Translated_495_residues
MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFDL
HSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLP*FVLYLVIATISFLLFFTFFSV*PKEVFNLVFLL
LVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLV*INTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQ
SGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNL*FILLLFSAIFI*LLRVFAYKHENENLPVGNNHLL*
VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYI
FQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVI
FKINKLNKELNNEKK
>Mature_495_residues
MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFDL
HSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLP*FVLYLVIATISFLLFFTFFSV*PKEVFNLVFLL
LVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLV*INTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQ
SGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNL*FILLLFSAIFI*LLRVFAYKHENENLPVGNNHLL*
VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYI
FQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVI
FKINKLNKELNNEKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56994; Mature: 56994

Theoretical pI: Translated: 10.38; Mature: 10.38

Prosite motif: PS00146 BETA_LACTAMASE_A

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLG
CCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
FGDENKSMMISKSLNAFFDLHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRAT
CCCCCCCEEHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKKYLPFVLYLVIATISFLLFFTFFSVPKEVFNLVFLLLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQSGK
CCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHEECCCC
NFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLFILLLFSAIFILLRVFAYK
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HENENLPVGNNHLLVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSL
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYIFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAA
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVIFKINKL
HHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKELNNEKK
HHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLG
CCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
FGDENKSMMISKSLNAFFDLHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRAT
CCCCCCCEEHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKKYLPFVLYLVIATISFLLFFTFFSVPKEVFNLVFLLLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQSGK
CCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHEECCCC
NFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLFILLLFSAIFILLRVFAYK
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HENENLPVGNNHLLVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSL
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYIFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAA
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVIFKINKL
HHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKELNNEKK
HHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11048724 [H]